MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Francisella philomiragia subsp. philomiragia ATCC 25017 plasmid pFPHI01

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010331	TTA	2	6	23	28	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010331	AAG	2	6	45	50	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010331	AGA	2	6	63	68	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010331	AGA	2	6	87	92	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010331	ATT	4	12	137	148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010331	GAT	2	6	172	177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010331	TGA	2	6	180	185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010331	GAA	2	6	190	195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010331	CAA	2	6	283	288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010331	TCA	2	6	303	308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010331	ATA	2	6	401	406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010331	TGG	2	6	459	464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010331	GTG	2	6	575	580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010331	CAT	2	6	616	621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010331	GCA	2	6	784	789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010331	AGT	2	6	801	806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010331	TGA	2	6	987	992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010331	ATA	2	6	1014	1019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010331	TTC	2	6	1158	1163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010331	GTT	2	6	1238	1243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010331	ATA	2	6	1465	1470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626222
22	NC_010331	AAT	2	6	1512	1517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626222
23	NC_010331	ATT	2	6	1535	1540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626222
24	NC_010331	CAG	2	6	1621	1626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626222
25	NC_010331	ATT	2	6	1687	1692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626222
26	NC_010331	CAA	2	6	1740	1745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167626222
27	NC_010331	ATT	2	6	1795	1800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626222
28	NC_010331	ACT	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626222
29	NC_010331	ACT	2	6	1992	1997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626222
30	NC_010331	AGA	2	6	2252	2257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167626222
31	NC_010331	ATT	2	6	2304	2309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626222
32	NC_010331	TAC	2	6	2316	2321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626222
33	NC_010331	CAT	2	6	2343	2348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626222
34	NC_010331	GTT	2	6	2461	2466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167626224
35	NC_010331	ATG	2	6	2510	2515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626224
36	NC_010331	TTA	2	6	2571	2576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626224
37	NC_010331	TGA	2	6	2577	2582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626224
38	NC_010331	AAG	2	6	2633	2638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167626224
39	NC_010331	TGA	2	6	2941	2946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010331	ATC	2	6	3078	3083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010331	TTC	2	6	3170	3175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167626223
42	NC_010331	TAT	2	6	3212	3217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626223
43	NC_010331	TCT	2	6	3267	3272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167626223
44	NC_010331	TCA	2	6	3324	3329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626223
45	NC_010331	TGA	2	6	3542	3547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010331	TAA	2	6	3567	3572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010331	ATT	2	6	3587	3592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010331	TTA	2	6	3617	3622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010331	ATT	2	6	3751	3756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010331	TAA	2	6	3858	3863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010331	AGA	2	6	3870	3875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010331	TAA	2	6	3927	3932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.