MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Thermoanaerobacter pseudethanolicus ATCC 33223 chromosome

Total Repeats: 997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010321	AGAGAT	2	12	2293	2304	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	167036433
2	NC_010321	AAAAGT	2	12	3509	3520	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	167036435
3	NC_010321	TATGGC	2	12	5613	5624	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167036437
4	NC_010321	TATATC	2	12	7212	7223	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	167036438
5	NC_010321	CAAATA	2	12	9129	9140	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	167036441
6	NC_010321	ACAAGC	2	12	12265	12276	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	167036442
7	NC_010321	GAGAAA	2	12	12975	12986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036442
8	NC_010321	TCATGC	2	12	15619	15630	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167036445
9	NC_010321	TGATAC	2	12	15765	15776	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167036445
10	NC_010321	ATATTG	2	12	23111	23122	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167036451
11	NC_010321	GGAGAA	2	12	23980	23991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010321	CCCAGC	2	12	28725	28736	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	167036456
13	NC_010321	TAAAAA	2	12	30455	30466	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010321	AAAAGC	2	12	38638	38649	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010321	GGATAT	2	12	42064	42075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036475
16	NC_010321	TCTTTT	2	12	43529	43540	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010321	TTATTT	2	12	43615	43626	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010321	TAAGAA	2	12	46604	46615	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	167036480
19	NC_010321	AGAAAG	2	12	48790	48801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167036482
20	NC_010321	AGCAGA	2	12	48808	48819	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	167036482
21	NC_010321	GAAAAA	2	12	49147	49158	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	167036483
22	NC_010321	AGGACA	2	12	49187	49198	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	167036483
23	NC_010321	CAGCCT	2	12	49846	49857	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	167036483
24	NC_010321	ATTTTA	2	12	51491	51502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036485
25	NC_010321	TTAATT	2	12	52234	52245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036487
26	NC_010321	AAAGAA	2	12	55827	55838	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	167036490
27	NC_010321	GAAAAA	2	12	58279	58290	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	167036492
28	NC_010321	GCATTT	2	12	58698	58709	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167036492
29	NC_010321	CAATAG	2	12	66972	66983	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	167036505
30	NC_010321	ACAACT	2	12	67388	67399	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	167036505
31	NC_010321	GGTAGT	2	12	67535	67546	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	167036505
32	NC_010321	AGATGG	2	12	69356	69367	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	167036506
33	NC_010321	TTCAGC	2	12	70413	70424	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167036506
34	NC_010321	TTCTTT	2	12	71154	71165	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	167036507
35	NC_010321	TAAAAA	2	12	73726	73737	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010321	AAAGAA	2	12	77427	77438	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	167036514
37	NC_010321	AAAAAT	2	12	79161	79172	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010321	AATAAG	2	12	84334	84345	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	167036520
39	NC_010321	AACAAA	2	12	84763	84774	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	167036521
40	NC_010321	TTTAGC	2	12	86199	86210	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167036522
41	NC_010321	ATTGGC	2	12	86812	86823	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167036523
42	NC_010321	GATAAG	2	12	87834	87845	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	167036524
43	NC_010321	AAATTA	2	12	92733	92744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036528
44	NC_010321	TAAGAA	2	12	92830	92841	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	167036528
45	NC_010321	AAATTA	2	12	95397	95408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036530
46	NC_010321	TATTTT	2	12	98591	98602	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	167036533
47	NC_010321	TTTGGC	2	12	100461	100472	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	167036534
48	NC_010321	GAAAAA	2	12	102288	102299	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	167036537
49	NC_010321	CATTAT	2	12	107162	107173	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	167036544
50	NC_010321	AAGGAG	2	12	111589	111600	50 %	0 %	50 %	0 %	167036548
51	NC_010321	AATAGA	2	12	111848	111859	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	167036548
52	NC_010321	ATTATA	2	12	115010	115021	50 %	50 %	0 %	0 %	167036552
53	NC_010321	TTACAT	2	12	118329	118340	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	167036554
54	NC_010321	ATTTTT	2	12	121524	121535	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010321	TTGCTT	2	12	125101	125112	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	167036557
56	NC_010321	CTCAAG	2	12	125977	125988	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	167036557
57	NC_010321	TTGCTT	2	12	128234	128245	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	167036558
58	NC_010321	CTCAAG	2	12	129110	129121	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	167036558
59	NC_010321	TTGCTT	2	12	129893	129904	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	167036559
60	NC_010321	CTCAAG	2	12	130769	130780	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	167036559
61	NC_010321	GTTCTT	2	12	131768	131779	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_010321	TTCAGC	2	12	134430	134441	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010321	TTGCTT	2	12	135819	135830	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	167036560
64	NC_010321	CTCAAG	2	12	136695	136706	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	167036560
65	NC_010321	TTGCTT	2	12	138345	138356	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	167036561
66	NC_010321	CTCAAG	2	12	139221	139232	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	167036561
67	NC_010321	TTGCTT	2	12	141672	141683	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	167036562
68	NC_010321	CTCAAG	2	12	142548	142559	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	167036562
69	NC_010321	AAATTA	2	12	150163	150174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036569
70	NC_010321	TAAGAA	2	12	150260	150271	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	167036569
71	NC_010321	GTAAAC	2	12	150824	150835	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_010321	CTTCTG	2	12	152899	152910	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	167036572
73	NC_010321	GGTAAA	2	12	153696	153707	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	167036573
74	NC_010321	AAAGTT	2	12	159258	159269	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	167036574
75	NC_010321	CATAAG	2	12	163400	163411	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	167036577
76	NC_010321	TTTCTT	2	12	163850	163861	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	167036577
77	NC_010321	TTGCTT	2	12	163910	163921	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	167036577
78	NC_010321	ATGTAG	2	12	165198	165209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036578
79	NC_010321	AAATTA	2	12	168957	168968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036580
80	NC_010321	TAAGAA	2	12	169054	169065	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	167036580
81	NC_010321	ATATAG	2	12	170400	170411	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	167036581
82	NC_010321	GTGCTT	2	12	170826	170837	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	167036582
83	NC_010321	GGAAAT	2	12	171370	171381	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	167036583
84	NC_010321	ACTTGC	2	12	172866	172877	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167036584
85	NC_010321	TGACAA	2	12	175651	175662	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	167036588
86	NC_010321	GTATTT	2	12	177258	177269	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	167036589
87	NC_010321	TAAGAA	2	12	182875	182886	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	167036594
88	NC_010321	TTTACT	2	12	185505	185516	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	167036596
89	NC_010321	AAAATT	2	12	187405	187416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167036598
90	NC_010321	GCAGAG	2	12	188933	188944	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	167036600
91	NC_010321	TTACAG	2	12	192110	192121	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167036601
92	NC_010321	CAAAAA	2	12	192145	192156	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	167036601
93	NC_010321	TACAGA	2	12	193053	193064	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	167036602
94	NC_010321	GTAGAT	2	12	197291	197302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036606
95	NC_010321	ATAGGC	2	12	200121	200132	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167036609
96	NC_010321	TTTAAT	2	12	205796	205807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036616
97	NC_010321	AAAGTG	2	12	206784	206795	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	167036616
98	NC_010321	GATAAA	2	12	207590	207601	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	167036618
99	NC_010321	TGACCT	2	12	210302	210313	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167036620
100	NC_010321	AATGAA	2	12	219735	219746	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010321	ATTTGC	2	12	220131	220142	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167036628
102	NC_010321	GTCTGG	2	12	221468	221479	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	167036629
103	NC_010321	CTATTC	2	12	221764	221775	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	167036629
104	NC_010321	GAATAG	2	12	222022	222033	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	167036629
105	NC_010321	TAAATT	2	12	225213	225224	50 %	50 %	0 %	0 %	167036632
106	NC_010321	TGATAA	2	12	228286	228297	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	167036634
107	NC_010321	GAAGCG	2	12	228311	228322	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	167036634
108	NC_010321	AAGGAG	2	12	229348	229359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010321	ACAAAT	2	12	236076	236087	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	167036640
110	NC_010321	TAATTC	2	12	237757	237768	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	167036641
111	NC_010321	AAATAC	2	12	239104	239115	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	167036641
112	NC_010321	GACAAA	2	12	240470	240481	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	167036643
113	NC_010321	TAGCTG	2	12	242502	242513	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167036644
114	NC_010321	GATATT	2	12	244956	244967	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167036645
115	NC_010321	AATTTG	2	12	245656	245667	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167036645
116	NC_010321	TGGTAC	2	12	252019	252030	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167036650
117	NC_010321	GTCGTA	2	12	253827	253838	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167036651
118	NC_010321	ATAAAT	2	12	256262	256273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010321	CAATGC	2	12	257645	257656	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	167036654
120	NC_010321	AAAAGA	2	12	258515	258526	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	167036654
121	NC_010321	CAAAAA	2	12	260757	260768	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	167036657
122	NC_010321	GAAAAA	2	12	263624	263635	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	167036658
123	NC_010321	GTAATG	2	12	263645	263656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167036658
124	NC_010321	GATTCC	2	12	265484	265495	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167036659
125	NC_010321	TTGATA	2	12	266804	266815	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167036660
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127	NC_010321	CTTTTG	2	12	270288	270299	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	167036661
128	NC_010321	GCTATG	2	12	273858	273869	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_010321	AGCAAA	2	12	277665	277676	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_010321	TTTATA	2	12	279858	279869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010321	AGGACT	2	12	281011	281022	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167036671
132	NC_010321	AAAGCT	2	12	283800	283811	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	167036673
133	NC_010321	GTCTTT	2	12	290825	290836	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	167036682
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135	NC_010321	AGATAT	2	12	294709	294720	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010321	TAATTA	2	12	295358	295369	50 %	50 %	0 %	0 %	167036687
137	NC_010321	TTAATA	2	12	299692	299703	50 %	50 %	0 %	0 %	167036691
138	NC_010321	TCAAAT	2	12	310253	310264	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	167036702
139	NC_010321	AAAATA	2	12	310286	310297	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	167036702
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156	NC_010321	TATTGA	2	12	361784	361795	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167036748
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167	NC_010321	TTTAGC	2	12	380899	380910	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167036764
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222	NC_010321	AATAGA	2	12	511833	511844	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	167036910
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224	NC_010321	GGTAGA	2	12	512685	512696	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	167036911
225	NC_010321	ATAATT	2	12	514163	514174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
226	NC_010321	AATAGA	2	12	515896	515907	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	167036915
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229	NC_010321	ACAGGG	2	12	522854	522865	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	167036922
230	NC_010321	ATATTT	2	12	526382	526393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
231	NC_010321	TTTTAT	2	12	531506	531517	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
232	NC_010321	ACTACA	2	12	531809	531820	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	167036929
233	NC_010321	TTTAAT	2	12	532875	532886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167036929
234	NC_010321	AGAAAA	2	12	533344	533355	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	167036929
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236	NC_010321	TATTGC	2	12	535674	535685	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167036929
237	NC_010321	AGGAAG	2	12	537024	537035	50 %	0 %	50 %	0 %	167036929
238	NC_010321	AGGAGA	2	12	539805	539816	50 %	0 %	50 %	0 %	167036929
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240	NC_010321	CTTTTG	2	12	544476	544487	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	167036933
241	NC_010321	TTTAAA	2	12	552915	552926	50 %	50 %	0 %	0 %	167036944
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351	NC_010321	AATTTA	2	12	809932	809943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
352	NC_010321	CTATTG	2	12	810826	810837	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167037177
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