MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Thermoanaerobacter pseudethanolicus ATCC 33223 chromosome

Total Repeats: 1948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010321	TACGT	2	10	604	613	20 %	40 %	20 %	20 %	167036432
2	NC_010321	CTTAT	2	10	1584	1593	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_010321	GTCAA	2	10	1764	1773	40 %	20 %	20 %	20 %	167036433
4	NC_010321	AAGCA	2	10	2861	2870	60 %	0 %	20 %	20 %	167036434
5	NC_010321	AATAA	2	10	3293	3302	80 %	20 %	0 %	0 %	167036435
6	NC_010321	GAAAG	2	10	4501	4510	60 %	0 %	40 %	0 %	167036437
7	NC_010321	AAGAA	2	10	4536	4545	80 %	0 %	20 %	0 %	167036437
8	NC_010321	ACTGG	2	10	6206	6215	20 %	20 %	40 %	20 %	167036437
9	NC_010321	TTTTA	2	10	7505	7514	20 %	80 %	0 %	0 %	167036439
10	NC_010321	TATAG	2	10	7945	7954	40 %	40 %	20 %	0 %	167036439
11	NC_010321	ATCTC	2	10	8181	8190	20 %	40 %	0 %	40 %	167036439
12	NC_010321	TATAT	2	10	8920	8929	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010321	TATAT	2	10	8936	8945	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010321	ATTTT	2	10	9023	9032	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010321	ATAAA	2	10	9058	9067	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010321	ATGAA	2	10	11058	11067	60 %	20 %	20 %	0 %	167036442
17	NC_010321	CTATG	2	10	11161	11170	20 %	40 %	20 %	20 %	167036442
18	NC_010321	GGAAT	2	10	11901	11910	40 %	20 %	40 %	0 %	167036442
19	NC_010321	GCTAT	2	10	13008	13017	20 %	40 %	20 %	20 %	167036442
20	NC_010321	ATGAA	2	10	16221	16230	60 %	20 %	20 %	0 %	167036445
21	NC_010321	ATACA	2	10	17348	17357	60 %	20 %	0 %	20 %	167036446
22	NC_010321	TTGAA	2	10	17560	17569	40 %	40 %	20 %	0 %	167036446
23	NC_010321	CCTTG	2	10	18812	18821	0 %	40 %	20 %	40 %	167036447
24	NC_010321	TTTAG	2	10	21320	21329	20 %	60 %	20 %	0 %	167036450
25	NC_010321	TAAGT	2	10	21451	21460	40 %	40 %	20 %	0 %	167036450
26	NC_010321	ACAGG	2	10	22507	22516	40 %	0 %	40 %	20 %	167036451
27	NC_010321	GTAAA	2	10	23171	23180	60 %	20 %	20 %	0 %	167036451
28	NC_010321	AAAAG	2	10	23256	23265	80 %	0 %	20 %	0 %	167036451
29	NC_010321	ATAGA	2	10	25112	25121	60 %	20 %	20 %	0 %	167036452
30	NC_010321	GATAG	2	10	25836	25845	40 %	20 %	40 %	0 %	167036454
31	NC_010321	CAAAA	2	10	26975	26984	80 %	0 %	0 %	20 %	167036454
32	NC_010321	AATAA	2	10	27553	27562	80 %	20 %	0 %	0 %	167036455
33	NC_010321	TTATT	2	10	27575	27584	20 %	80 %	0 %	0 %	167036456
34	NC_010321	CTTTT	2	10	29874	29883	0 %	80 %	0 %	20 %	167036457
35	NC_010321	TGAAA	2	10	31817	31826	60 %	20 %	20 %	0 %	167036460
36	NC_010321	TATAA	2	10	36347	36356	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010321	TTTTA	2	10	37486	37495	20 %	80 %	0 %	0 %	167036467
38	NC_010321	TAAAA	2	10	38258	38267	80 %	20 %	0 %	0 %	167036468
39	NC_010321	AAAAT	2	10	38369	38378	80 %	20 %	0 %	0 %	167036468
40	NC_010321	ATTTT	2	10	38518	38527	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010321	TTTTA	2	10	39177	39186	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010321	GAGAT	2	10	41052	41061	40 %	20 %	40 %	0 %	167036472
43	NC_010321	TCTTT	2	10	41468	41477	0 %	80 %	0 %	20 %	167036473
44	NC_010321	AATAA	2	10	42295	42304	80 %	20 %	0 %	0 %	167036475
45	NC_010321	AAGCA	2	10	43600	43609	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_010321	TAAAA	2	10	44319	44328	80 %	20 %	0 %	0 %	167036478
47	NC_010321	TTTGT	2	10	44925	44934	0 %	80 %	20 %	0 %	167036479
48	NC_010321	GATGG	2	10	45850	45859	20 %	20 %	60 %	0 %	167036480
49	NC_010321	AATAA	2	10	47078	47087	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010321	AGGCA	2	10	50512	50521	40 %	0 %	40 %	20 %	167036483
51	NC_010321	GTAAA	2	10	53998	54007	60 %	20 %	20 %	0 %	167036488
52	NC_010321	CTTCT	2	10	55034	55043	0 %	60 %	0 %	40 %	167036489
53	NC_010321	AGAAA	2	10	55453	55462	80 %	0 %	20 %	0 %	167036490
54	NC_010321	GATTT	2	10	55503	55512	20 %	60 %	20 %	0 %	167036490
55	NC_010321	GTGAG	2	10	56019	56028	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010321	AGCAA	2	10	58108	58117	60 %	0 %	20 %	20 %	167036492
57	NC_010321	TAATT	2	10	59796	59805	40 %	60 %	0 %	0 %	167036494
58	NC_010321	AGAGT	2	10	59971	59980	40 %	20 %	40 %	0 %	167036495
59	NC_010321	CTCTT	2	10	60777	60786	0 %	60 %	0 %	40 %	167036496
60	NC_010321	CAAAA	2	10	65352	65361	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_010321	AAAGA	2	10	67046	67055	80 %	0 %	20 %	0 %	167036505
62	NC_010321	CAAAA	2	10	67247	67256	80 %	0 %	0 %	20 %	167036505
63	NC_010321	ACAAT	2	10	69369	69378	60 %	20 %	0 %	20 %	167036506
64	NC_010321	TGATA	2	10	70109	70118	40 %	40 %	20 %	0 %	167036506
65	NC_010321	CAAAG	2	10	71305	71314	60 %	0 %	20 %	20 %	167036507
66	NC_010321	AGATA	2	10	72151	72160	60 %	20 %	20 %	0 %	167036509
67	NC_010321	AGATA	2	10	72730	72739	60 %	20 %	20 %	0 %	167036509
68	NC_010321	ACTAT	2	10	73976	73985	40 %	40 %	0 %	20 %	167036511
69	NC_010321	CATAA	2	10	75632	75641	60 %	20 %	0 %	20 %	167036512
70	NC_010321	ATTAA	2	10	76018	76027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010321	TCGCC	2	10	76172	76181	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_010321	TAAAA	2	10	76312	76321	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010321	GCAGG	2	10	76412	76421	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_010321	CTGTT	2	10	76426	76435	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_010321	GTAAA	2	10	79076	79085	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010321	CAAAA	2	10	79410	79419	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_010321	GTTTT	2	10	79618	79627	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010321	ACTTG	2	10	81863	81872	20 %	40 %	20 %	20 %	167036518
79	NC_010321	TAGGT	2	10	82353	82362	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010321	AAGGA	2	10	83428	83437	60 %	0 %	40 %	0 %	167036520
81	NC_010321	TAGGG	2	10	85119	85128	20 %	20 %	60 %	0 %	167036521
82	NC_010321	TATAA	2	10	86349	86358	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010321	TCCCT	2	10	86876	86885	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
84	NC_010321	TTATG	2	10	86978	86987	20 %	60 %	20 %	0 %	167036524
85	NC_010321	AAGAT	2	10	87273	87282	60 %	20 %	20 %	0 %	167036524
86	NC_010321	AAGAT	2	10	88894	88903	60 %	20 %	20 %	0 %	167036525
87	NC_010321	TGATA	2	10	90084	90093	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010321	CTTTT	2	10	91396	91405	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_010321	GATGG	2	10	92076	92085	20 %	20 %	60 %	0 %	167036528
90	NC_010321	AATAA	2	10	93304	93313	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010321	AAAAT	2	10	93535	93544	80 %	20 %	0 %	0 %	167036529
92	NC_010321	AGCAG	2	10	94157	94166	40 %	0 %	40 %	20 %	167036529
93	NC_010321	TTTCA	2	10	95786	95795	20 %	60 %	0 %	20 %	167036530
94	NC_010321	GTTTT	2	10	96313	96322	0 %	80 %	20 %	0 %	167036531
95	NC_010321	TCAAT	2	10	96434	96443	40 %	40 %	0 %	20 %	167036531
96	NC_010321	TTTAA	2	10	96553	96562	40 %	60 %	0 %	0 %	167036531
97	NC_010321	TTAAA	2	10	96892	96901	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010321	TTTTA	2	10	98625	98634	20 %	80 %	0 %	0 %	167036533
99	NC_010321	TAATT	2	10	99494	99503	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010321	AGAAA	2	10	99717	99726	80 %	0 %	20 %	0 %	167036534
101	NC_010321	ACTAT	2	10	100199	100208	40 %	40 %	0 %	20 %	167036534
102	NC_010321	TTTAC	2	10	103783	103792	20 %	60 %	0 %	20 %	167036539
103	NC_010321	TCAAT	2	10	106693	106702	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_010321	AATAA	2	10	107049	107058	80 %	20 %	0 %	0 %	167036544
105	NC_010321	TATAA	2	10	108620	108629	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010321	CAAAG	2	10	109024	109033	60 %	0 %	20 %	20 %	167036545
107	NC_010321	AAGCT	2	10	109298	109307	40 %	20 %	20 %	20 %	167036545
108	NC_010321	GAAAA	2	10	110351	110360	80 %	0 %	20 %	0 %	167036547
109	NC_010321	ATAGG	2	10	112065	112074	40 %	20 %	40 %	0 %	167036548
110	NC_010321	TTTAG	2	10	113005	113014	20 %	60 %	20 %	0 %	167036549
111	NC_010321	CTTTT	2	10	114792	114801	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_010321	CAAAA	2	10	115778	115787	80 %	0 %	0 %	20 %	167036553
113	NC_010321	AAGAA	2	10	116563	116572	80 %	0 %	20 %	0 %	167036553
114	NC_010321	AAGAG	2	10	116983	116992	60 %	0 %	40 %	0 %	167036553
115	NC_010321	GATAG	2	10	117737	117746	40 %	20 %	40 %	0 %	167036554
116	NC_010321	TTGAT	2	10	118053	118062	20 %	60 %	20 %	0 %	167036554
117	NC_010321	AAAAC	2	10	118276	118285	80 %	0 %	0 %	20 %	167036554
118	NC_010321	AAAAT	2	10	118292	118301	80 %	20 %	0 %	0 %	167036554
119	NC_010321	ATACT	2	10	118471	118480	40 %	40 %	0 %	20 %	167036555
120	NC_010321	AAAGA	2	10	118991	119000	80 %	0 %	20 %	0 %	167036555
121	NC_010321	ATTGA	2	10	121215	121224	40 %	40 %	20 %	0 %	167036556
122	NC_010321	TTAAA	2	10	124966	124975	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010321	ATTTT	2	10	125609	125618	20 %	80 %	0 %	0 %	167036557
124	NC_010321	TTAAA	2	10	128099	128108	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010321	ATTTT	2	10	128742	128751	20 %	80 %	0 %	0 %	167036558
126	NC_010321	TTAAA	2	10	129758	129767	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010321	ATTTT	2	10	130401	130410	20 %	80 %	0 %	0 %	167036559
128	NC_010321	ATATA	2	10	133034	133043	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010321	TTAAA	2	10	135684	135693	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010321	ATTTT	2	10	136327	136336	20 %	80 %	0 %	0 %	167036560
131	NC_010321	TTAAA	2	10	138210	138219	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010321	ATTTT	2	10	138853	138862	20 %	80 %	0 %	0 %	167036561
133	NC_010321	CGCTT	2	10	140021	140030	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_010321	GCTTT	2	10	140949	140958	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_010321	TTAAA	2	10	141537	141546	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010321	ATTTT	2	10	142180	142189	20 %	80 %	0 %	0 %	167036562
137	NC_010321	GATTT	2	10	143166	143175	20 %	60 %	20 %	0 %	167036563
138	NC_010321	TTTTA	2	10	144233	144242	20 %	80 %	0 %	0 %	167036564
139	NC_010321	AAAGC	2	10	144255	144264	60 %	0 %	20 %	20 %	167036564
140	NC_010321	GATGG	2	10	149506	149515	20 %	20 %	60 %	0 %	167036569
141	NC_010321	AATAA	2	10	150734	150743	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010321	AAATA	2	10	151808	151817	80 %	20 %	0 %	0 %	167036571
143	NC_010321	ATGGG	2	10	152637	152646	20 %	20 %	60 %	0 %	167036572
144	NC_010321	TAAAA	2	10	152681	152690	80 %	20 %	0 %	0 %	167036572
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271	NC_010321	TATTT	2	10	320714	320723	20 %	80 %	0 %	0 %	167036710
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