MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Thermoanaerobacter sp. X514 chromosome

Total Repeats: 30395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010320	ATC	2	6	205	210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167038676
2	NC_010320	CCA	2	6	259	264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167038676
3	NC_010320	ACA	2	6	268	273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167038676
4	NC_010320	ATT	2	6	303	308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038676
5	NC_010320	GAT	2	6	309	314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167038676
6	NC_010320	TAA	2	6	355	360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167038676
7	NC_010320	ACG	2	6	385	390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167038676
8	NC_010320	AGA	2	6	437	442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038676
9	NC_010320	GAA	3	9	444	452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038676
10	NC_010320	ACT	2	6	501	506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167038676
11	NC_010320	GGA	2	6	636	641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167038676
12	NC_010320	GAC	2	6	768	773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167038676
13	NC_010320	GAA	2	6	780	785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038676
14	NC_010320	TTC	2	6	814	819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167038676
15	NC_010320	GAT	2	6	825	830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167038676
16	NC_010320	AAG	2	6	862	867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038676
17	NC_010320	CAA	2	6	902	907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167038676
18	NC_010320	ACC	2	6	932	937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167038676
19	NC_010320	AGA	2	6	956	961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038676
20	NC_010320	CCA	2	6	1008	1013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167038676
21	NC_010320	CGA	2	6	1076	1081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167038676
22	NC_010320	TAA	2	6	1141	1146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167038676
23	NC_010320	TAA	2	6	1226	1231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167038676
24	NC_010320	GAA	2	6	1263	1268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038676
25	NC_010320	AGA	2	6	1295	1300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038676
26	NC_010320	GAA	2	6	1401	1406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038676
27	NC_010320	TAC	2	6	1421	1426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167038676
28	NC_010320	ATT	2	6	1788	1793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038677
29	NC_010320	ACT	2	6	1834	1839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167038677
30	NC_010320	TTC	2	6	1847	1852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167038677
31	NC_010320	AGA	3	9	1944	1952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038677
32	NC_010320	TAG	2	6	1961	1966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167038677
33	NC_010320	TAA	2	6	2171	2176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167038677
34	NC_010320	AGA	2	6	2373	2378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038677
35	NC_010320	AAT	2	6	2605	2610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167038677
36	NC_010320	TTA	2	6	2639	2644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038677
37	NC_010320	TCT	2	6	2650	2655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167038677
38	NC_010320	GAT	2	6	2673	2678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167038677
39	NC_010320	TTA	2	6	2740	2745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038677
40	NC_010320	GAA	3	9	2767	2775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038677
41	NC_010320	TAA	3	9	2810	2818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167038677
42	NC_010320	GGA	2	6	2970	2975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167038678
43	NC_010320	TTA	2	6	3226	3231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038679
44	NC_010320	TAA	2	6	3290	3295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167038679
45	NC_010320	ATT	2	6	3308	3313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038679
46	NC_010320	ATA	2	6	3481	3486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167038679
47	NC_010320	AAG	2	6	3488	3493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038679
48	NC_010320	TGT	2	6	3534	3539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167038679
49	NC_010320	TGA	2	6	3651	3656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167038679
50	NC_010320	TAG	2	6	3662	3667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167038679
51	NC_010320	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167038679
52	NC_010320	ATT	2	6	3701	3706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038679
53	NC_010320	CAG	2	6	3761	3766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167038679
54	NC_010320	GAA	2	6	3811	3816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038679
55	NC_010320	ACA	2	6	3880	3885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167038679
56	NC_010320	ATT	2	6	3916	3921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038679
57	NC_010320	TTC	2	6	3948	3953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167038679
58	NC_010320	TAC	2	6	4131	4136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167038679
59	NC_010320	GTT	2	6	4183	4188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167038679
60	NC_010320	GGC	2	6	4227	4232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167038680
61	NC_010320	ACT	2	6	4287	4292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167038680
62	NC_010320	GAA	3	9	4326	4334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038680
63	NC_010320	TAT	2	6	4403	4408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038680
64	NC_010320	AAG	2	6	4442	4447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038680
65	NC_010320	TTG	2	6	4507	4512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167038681
66	NC_010320	AAG	2	6	4527	4532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038681
67	NC_010320	ATT	2	6	4560	4565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038681
68	NC_010320	GGA	2	6	4773	4778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167038681
69	NC_010320	AGA	2	6	4823	4828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038681
70	NC_010320	TAT	2	6	5052	5057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038681
71	NC_010320	ATT	2	6	5083	5088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038681
72	NC_010320	CAG	2	6	5184	5189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167038681
73	NC_010320	AGC	2	6	5356	5361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167038681
74	NC_010320	AGT	2	6	5381	5386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167038681
75	NC_010320	GAG	2	6	5448	5453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167038681
76	NC_010320	ATT	2	6	5455	5460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038681
77	NC_010320	AAG	3	9	5536	5544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038681
78	NC_010320	TGG	2	6	5553	5558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167038681
79	NC_010320	CTA	2	6	5641	5646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167038681
80	NC_010320	ATA	2	6	5662	5667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167038681
81	NC_010320	AAG	2	6	5701	5706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038681
82	NC_010320	GCT	2	6	5799	5804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167038681
83	NC_010320	ACA	2	6	5845	5850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167038681
84	NC_010320	CTT	2	6	5868	5873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167038681
85	NC_010320	ATG	3	9	5874	5882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167038681
86	NC_010320	GAA	2	6	5961	5966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038681
87	NC_010320	AAG	2	6	6193	6198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038681
88	NC_010320	TAT	2	6	6354	6359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038681
89	NC_010320	ATA	2	6	6381	6386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167038681
90	NC_010320	AGG	2	6	6404	6409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167038681
91	NC_010320	ATT	2	6	6413	6418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038681
92	NC_010320	AGA	2	6	6443	6448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038681
93	NC_010320	ATA	2	6	6465	6470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167038681
94	NC_010320	GAA	2	6	6489	6494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038681
95	NC_010320	TTG	2	6	6797	6802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167038682
96	NC_010320	TCT	2	6	6960	6965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167038682
97	NC_010320	ATT	2	6	6984	6989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038682
98	NC_010320	CCA	2	6	7048	7053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167038682
99	NC_010320	TAC	2	6	7088	7093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167038682
100	NC_010320	ATC	2	6	7101	7106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167038682
101	NC_010320	ATA	2	6	7178	7183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167038682
102	NC_010320	CCA	2	6	7203	7208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167038682
103	NC_010320	GTC	2	6	7277	7282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167038682
104	NC_010320	CCT	2	6	7314	7319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167038682
105	NC_010320	CTT	3	9	7404	7412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167038682
106	NC_010320	TAA	2	6	7451	7456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167038682
107	NC_010320	TCC	2	6	7496	7501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167038683
108	NC_010320	CAT	2	6	7524	7529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167038683
109	NC_010320	TTC	2	6	7564	7569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167038683
110	NC_010320	TTA	2	6	7628	7633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038683
111	NC_010320	TTA	2	6	7692	7697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038683
112	NC_010320	TCT	2	6	7727	7732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167038683
113	NC_010320	TAT	2	6	7873	7878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038683
114	NC_010320	CAA	2	6	7972	7977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167038683
115	NC_010320	GCT	2	6	7994	7999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167038683
116	NC_010320	TAG	2	6	8106	8111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167038683
117	NC_010320	TCT	2	6	8185	8190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167038683
118	NC_010320	AGA	2	6	8236	8241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038683
119	NC_010320	TGT	2	6	8259	8264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167038683
120	NC_010320	TCA	2	6	8327	8332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167038683
121	NC_010320	TTA	3	9	8445	8453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038683
122	NC_010320	GCT	2	6	8516	8521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167038683
123	NC_010320	GCT	2	6	8548	8553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167038683
124	NC_010320	TTA	2	6	8556	8561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038683
125	NC_010320	CTT	2	6	8595	8600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167038683
126	NC_010320	TAT	2	6	8601	8606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038683
127	NC_010320	ATC	2	6	8684	8689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167038683
128	NC_010320	GCA	2	6	9292	9297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167038684
129	NC_010320	GTA	2	6	9324	9329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167038684
130	NC_010320	ATA	2	6	9331	9336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167038684
131	NC_010320	TAG	2	6	9373	9378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167038684
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136	NC_010320	GTT	2	6	9591	9596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167038684
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256	NC_010320	TCT	2	6	19841	19846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167038692
257	NC_010320	CTG	2	6	19888	19893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167038692
258	NC_010320	TCC	2	6	19901	19906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167038692
259	NC_010320	AAG	2	6	19912	19917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038692
260	NC_010320	TTA	2	6	19938	19943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038692
261	NC_010320	TGG	2	6	19982	19987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167038692
262	NC_010320	TTC	2	6	20156	20161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167038692
263	NC_010320	AGA	2	6	20183	20188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038692
264	NC_010320	AGA	2	6	20375	20380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038692
265	NC_010320	AAG	2	6	20436	20441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038692
266	NC_010320	ATG	2	6	20475	20480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167038692
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270	NC_010320	GTG	2	6	20616	20621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167038692
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272	NC_010320	AGG	2	6	20836	20841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167038693
273	NC_010320	GTA	2	6	20919	20924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167038693
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275	NC_010320	CTT	2	6	21378	21383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167038693
276	NC_010320	TGA	2	6	21505	21510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167038693
277	NC_010320	ATG	2	6	21714	21719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167038693
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280	NC_010320	CTG	2	6	21813	21818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167038693
281	NC_010320	GAA	2	6	21869	21874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167038693
282	NC_010320	TAA	2	6	21927	21932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167038693
283	NC_010320	CAA	2	6	22053	22058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167038693
284	NC_010320	ATT	2	6	22115	22120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038693
285	NC_010320	ATT	2	6	22133	22138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167038693
286	NC_010320	TGA	2	6	22180	22185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167038693
287	NC_010320	AGG	2	6	22386	22391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167038694
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377	NC_010320	TGT	2	6	29649	29654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167038700
378	NC_010320	TTC	3	9	29719	29727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167038700
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