MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Microcystis aeruginosa NIES-843 chromosome

Total Repeats: 288

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010296	ACACAT	2	12	19281	19292	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010296	CTCAAA	2	12	27668	27679	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010296	ATATTT	2	12	42798	42809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010296	TCAAGC	2	12	50678	50689	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010296	AACAGA	2	12	54360	54371	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_010296	AACAGA	2	12	59621	59632	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_010296	AAATAG	2	12	116133	116144	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010296	ATGTTT	2	12	121841	121852	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010296	CCTTTT	2	12	129698	129709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010296	TGCGGT	2	12	135922	135933	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_010296	TTTTTA	2	12	138572	138583	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010296	TTATTT	2	12	160177	160188	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010296	CTAATT	2	12	193075	193086	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_010296	TTTACG	2	12	227597	227608	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010296	GTATCG	2	12	235302	235313	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_010296	TCATTA	2	12	241693	241704	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010296	ATCGCT	2	12	248056	248067	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010296	AACCCC	2	12	258390	258401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_010296	AAAAAC	2	12	290756	290767	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_010296	CTATTT	2	12	295049	295060	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_010296	ATTTTT	2	12	304444	304455	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010296	TTCTCC	2	12	316777	316788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010296	TTTTCT	2	12	330244	330255	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010296	CCCCCA	2	12	344618	344629	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
25	NC_010296	TCTCGC	2	12	355806	355817	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010296	AAAAAG	2	12	377392	377403	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010296	TTATCA	2	12	379677	379688	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_010296	ATAGTT	2	12	391959	391970	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010296	CCTAAC	2	12	401299	401310	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010296	TTTTGC	2	12	413825	413836	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_010296	AACAAA	2	12	430388	430399	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_010296	GACAAC	2	12	484767	484778	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010296	TTGCCA	2	12	518188	518199	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010296	GATCGG	2	12	525180	525191	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_010296	TTTTTA	2	12	531567	531578	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010296	GTTCTG	2	12	536811	536822	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_010296	CGGCAC	2	12	555671	555682	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010296	ATTCCC	2	12	634625	634636	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010296	TACAGA	2	12	642249	642260	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010296	ATAACT	2	12	645744	645755	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_010296	GCCACC	2	12	648640	648651	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_010296	AGTCTC	2	12	733680	733691	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010296	TTTATT	2	12	736156	736167	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010296	TTGATC	2	12	744910	744921	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_010296	TCCTAT	2	12	811981	811992	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010296	CTACGG	2	12	814851	814862	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010296	CTACGG	2	12	816263	816274	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010296	AAATAA	2	12	849729	849740	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010296	AAATAG	2	12	856708	856719	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010296	CGCAAT	2	12	862800	862811	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010296	CTTTAT	2	12	863941	863952	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_010296	ACAGAC	2	12	872736	872747	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010296	AAGAGA	2	12	895787	895798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010296	CATTAC	2	12	897605	897616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010296	AAGCAA	2	12	907307	907318	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_010296	GAAATG	2	12	934924	934935	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010296	AATGGT	2	12	952772	952783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010296	CGTCCC	2	12	957221	957232	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_010296	CGAAAA	2	12	973384	973395	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_010296	GTAGGG	2	12	979975	979986	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010296	GAGAAC	2	12	990365	990376	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_010296	CATTAC	2	12	995212	995223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010296	TCAAAA	2	12	1036621	1036632	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_010296	TTAATC	2	12	1049101	1049112	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_010296	TGTCCT	2	12	1064464	1064475	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010296	TCTCAA	2	12	1081282	1081293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010296	TGGCTA	2	12	1093464	1093475	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_010296	GAGAAA	2	12	1108788	1108799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010296	TAGCTG	2	12	1120177	1120188	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_010296	TACATA	2	12	1121227	1121238	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_010296	TGATAA	2	12	1132740	1132751	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010296	ATTTTT	2	12	1164168	1164179	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010296	CAACCG	2	12	1174776	1174787	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_010296	ACCCTC	2	12	1179158	1179169	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_010296	AACAAA	2	12	1208412	1208423	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_010296	CCTAAC	2	12	1216203	1216214	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_010296	ATAACT	2	12	1286868	1286879	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_010296	TAAGAT	2	12	1317474	1317485	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010296	ACAGAC	2	12	1324768	1324779	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010296	AGCCAT	2	12	1333916	1333927	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010296	TTTTAA	2	12	1351588	1351599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010296	AATCCC	2	12	1452166	1452177	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_010296	CCTAAC	2	12	1453673	1453684	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_010296	TTTAAT	2	12	1462962	1462973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010296	TCTGCT	2	12	1473751	1473762	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010296	AAATAG	2	12	1476347	1476358	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010296	AAATAG	2	12	1477534	1477545	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010296	CTATTT	2	12	1484485	1484496	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_010296	TTATCT	2	12	1486570	1486581	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_010296	GCTTTG	2	12	1490831	1490842	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_010296	TAAAAT	2	12	1502944	1502955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010296	TAGGAA	2	12	1546111	1546122	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010296	TTTTGA	2	12	1592907	1592918	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010296	GCAAAA	2	12	1616839	1616850	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_010296	TTAATT	2	12	1643548	1643559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010296	ATTAAA	2	12	1675590	1675601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010296	CCCACA	2	12	1678306	1678317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_010296	CCTAAC	2	12	1702490	1702501	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_010296	ATATCA	2	12	1715005	1715016	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_010296	GAGATC	2	12	1741989	1742000	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_010296	AAGGGA	2	12	1798186	1798197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010296	GAACTA	2	12	1805640	1805651	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_010296	GCACTC	2	12	1816402	1816413	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_010296	TTAGGA	2	12	1816536	1816547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010296	TTCTGG	2	12	1827209	1827220	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_010296	TTTGTT	2	12	1875284	1875295	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010296	AAACAA	2	12	1898273	1898284	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_010296	GTAACT	2	12	1900111	1900122	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_010296	GGATTG	2	12	1913621	1913632	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010296	AGAAAT	2	12	1933302	1933313	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010296	GTGGCG	2	12	1933322	1933333	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_010296	TAAATA	2	12	1957737	1957748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010296	CTATTT	2	12	1990331	1990342	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_010296	AACAAA	2	12	1995115	1995126	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_010296	TATCAA	2	12	2013288	2013299	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_010296	CCTAAC	2	12	2020945	2020956	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_010296	ACATTA	2	12	2025720	2025731	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_010296	TAAAAA	2	12	2046626	2046637	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010296	TCCCTA	2	12	2075682	2075693	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_010296	CCTAAC	2	12	2087189	2087200	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_010296	TATAGA	2	12	2139907	2139918	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010296	AAGACT	2	12	2206265	2206276	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_010296	AGCCAG	2	12	2257355	2257366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_010296	CACACC	3	18	2268303	2268320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_010296	CACACC	2	12	2268329	2268340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_010296	GGGGTT	2	12	2331501	2331512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010296	TCACCC	2	12	2350459	2350470	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_010296	CTATTT	2	12	2400817	2400828	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_010296	GTTAAG	2	12	2447946	2447957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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131	NC_010296	TTTGTT	2	12	2500644	2500655	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010296	TTATAT	2	12	2504275	2504286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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248	NC_010296	TTTCCC	2	12	4887977	4887988	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
249	NC_010296	CCCACT	2	12	4893143	4893154	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
250	NC_010296	GAGGGT	2	12	4926344	4926355	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
251	NC_010296	AACAAT	2	12	4943795	4943806	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
252	NC_010296	GTTATC	2	12	4946967	4946978	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
253	NC_010296	TTAATA	2	12	4947766	4947777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_010296	GGGGTT	2	12	4952171	4952182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
255	NC_010296	AAAATA	2	12	5033567	5033578	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_010296	GATTTA	2	12	5047560	5047571	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
257	NC_010296	TAATTT	2	12	5095731	5095742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_010296	AAATAT	2	12	5107702	5107713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_010296	ACAAAT	2	12	5136951	5136962	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
260	NC_010296	GGTGAT	2	12	5138073	5138084	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
261	NC_010296	AAAGGA	2	12	5149399	5149410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
262	NC_010296	GCGTTA	2	12	5177644	5177655	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
263	NC_010296	AGTTCT	2	12	5208351	5208362	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
264	NC_010296	TATCAG	2	12	5285815	5285826	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
265	NC_010296	TCTTTA	2	12	5292280	5292291	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
266	NC_010296	CGTGGC	2	12	5292313	5292324	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_010296	GTCGCT	2	12	5296177	5296188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_010296	ATAGAG	2	12	5331839	5331850	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
269	NC_010296	ATTACC	2	12	5372091	5372102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_010296	AGTAAC	2	12	5419946	5419957	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
271	NC_010296	ACTATG	2	12	5455655	5455666	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
272	NC_010296	TCGCTA	2	12	5484296	5484307	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_010296	TCTAGC	2	12	5564671	5564682	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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278	NC_010296	GGATTA	2	12	5618078	5618089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
279	NC_010296	TTCAGA	2	12	5681823	5681834	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
280	NC_010296	TGAGTT	2	12	5683873	5683884	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_010296	TAAAGT	2	12	5688732	5688743	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
282	NC_010296	TCAGCA	2	12	5740525	5740536	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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285	NC_010296	ATTTAA	2	12	5837840	5837851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_010296	TGACAA	2	12	5842530	5842541	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
287	NC_010296	AACCCC	2	12	5842681	5842692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
288	NC_010296	CTTCCC	2	12	5842709	5842720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.