MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Microcystis aeruginosa NIES-843 chromosome

Total Repeats: 3741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010296	TTTTC	2	10	351	360	0 %	80 %	0 %	20 %	166362742
2	NC_010296	TCGAG	2	10	3488	3497	20 %	20 %	40 %	20 %	166362745
3	NC_010296	TTAAG	2	10	4546	4555	40 %	40 %	20 %	0 %	166362748
4	NC_010296	TTAGG	2	10	8679	8688	20 %	40 %	40 %	0 %	166362752
5	NC_010296	GGTTG	2	10	9452	9461	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010296	TAAAA	2	10	10467	10476	80 %	20 %	0 %	0 %	166362756
7	NC_010296	AATAA	2	10	10777	10786	80 %	20 %	0 %	0 %	166362757
8	NC_010296	AGCAT	2	10	11527	11536	40 %	20 %	20 %	20 %	166362758
9	NC_010296	TATGG	2	10	14159	14168	20 %	40 %	40 %	0 %	166362761
10	NC_010296	TCCCC	2	10	15567	15576	0 %	20 %	0 %	80 %	166362762
11	NC_010296	GGCCA	2	10	16456	16465	20 %	0 %	40 %	40 %	166362762
12	NC_010296	AATCG	2	10	16808	16817	40 %	20 %	20 %	20 %	166362763
13	NC_010296	CTAAT	2	10	17387	17396	40 %	40 %	0 %	20 %	166362764
14	NC_010296	AGGTG	2	10	18117	18126	20 %	20 %	60 %	0 %	166362764
15	NC_010296	AAAAT	2	10	19995	20004	80 %	20 %	0 %	0 %	166362766
16	NC_010296	AATTA	2	10	21099	21108	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010296	TACCC	2	10	22249	22258	20 %	20 %	0 %	60 %	166362768
18	NC_010296	TTCGA	2	10	27341	27350	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_010296	ATTTT	2	10	27572	27581	20 %	80 %	0 %	0 %	166362775
20	NC_010296	CATTA	2	10	27836	27845	40 %	40 %	0 %	20 %	166362776
21	NC_010296	TTACC	2	10	28060	28069	20 %	40 %	0 %	40 %	166362776
22	NC_010296	ATGCC	2	10	28509	28518	20 %	20 %	20 %	40 %	166362777
23	NC_010296	GCTTC	2	10	31086	31095	0 %	40 %	20 %	40 %	166362781
24	NC_010296	TCGAT	2	10	31797	31806	20 %	40 %	20 %	20 %	166362781
25	NC_010296	ATTTT	2	10	32027	32036	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010296	AGAGG	2	10	32353	32362	40 %	0 %	60 %	0 %	166362783
27	NC_010296	ATTAT	2	10	34817	34826	40 %	60 %	0 %	0 %	166362790
28	NC_010296	AAAGA	2	10	36329	36338	80 %	0 %	20 %	0 %	166362792
29	NC_010296	AAAGA	2	10	37369	37378	80 %	0 %	20 %	0 %	166362794
30	NC_010296	AATAT	2	10	37454	37463	60 %	40 %	0 %	0 %	166362794
31	NC_010296	TCTTT	2	10	38769	38778	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_010296	TTTGT	2	10	39001	39010	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010296	GAAAA	2	10	39368	39377	80 %	0 %	20 %	0 %	166362797
34	NC_010296	TTTGA	2	10	39562	39571	20 %	60 %	20 %	0 %	166362797
35	NC_010296	TATAA	2	10	42520	42529	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010296	GAAGC	2	10	42821	42830	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_010296	AAATT	2	10	43032	43041	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010296	GTCCT	2	10	44392	44401	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_010296	AACCG	2	10	48588	48597	40 %	0 %	20 %	40 %	166362807
40	NC_010296	CAACC	2	10	53189	53198	40 %	0 %	0 %	60 %	166362812
41	NC_010296	TTACT	2	10	56047	56056	20 %	60 %	0 %	20 %	166362816
42	NC_010296	TTAAA	2	10	58344	58353	60 %	40 %	0 %	0 %	166362819
43	NC_010296	AGAAT	2	10	58538	58547	60 %	20 %	20 %	0 %	166362820
44	NC_010296	GGAAA	2	10	58970	58979	60 %	0 %	40 %	0 %	166362820
45	NC_010296	ACTAT	2	10	60855	60864	40 %	40 %	0 %	20 %	166362822
46	NC_010296	TGATC	2	10	64835	64844	20 %	40 %	20 %	20 %	166362825
47	NC_010296	CCCTG	2	10	67654	67663	0 %	20 %	20 %	60 %	166362829
48	NC_010296	CCCTA	2	10	69047	69056	20 %	20 %	0 %	60 %	166362830
49	NC_010296	AAATT	2	10	70334	70343	60 %	40 %	0 %	0 %	166362830
50	NC_010296	GTTTT	2	10	71133	71142	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010296	CTGAT	2	10	71280	71289	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_010296	TGACT	2	10	72350	72359	20 %	40 %	20 %	20 %	166362833
53	NC_010296	AAACC	2	10	73327	73336	60 %	0 %	0 %	40 %	166362834
54	NC_010296	AAATT	2	10	73342	73351	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010296	TTGCT	2	10	75328	75337	0 %	60 %	20 %	20 %	166362838
56	NC_010296	AATTA	2	10	76469	76478	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010296	TTGAT	2	10	77800	77809	20 %	60 %	20 %	0 %	166362841
58	NC_010296	GGGTA	2	10	77904	77913	20 %	20 %	60 %	0 %	166362841
59	NC_010296	TGCAA	2	10	79432	79441	40 %	20 %	20 %	20 %	166362841
60	NC_010296	TACTG	2	10	81273	81282	20 %	40 %	20 %	20 %	166362841
61	NC_010296	CATAA	2	10	86139	86148	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_010296	TTGAT	2	10	86821	86830	20 %	60 %	20 %	0 %	166362847
63	NC_010296	ATCTT	2	10	86866	86875	20 %	60 %	0 %	20 %	166362847
64	NC_010296	AGGGT	2	10	88295	88304	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010296	TAATT	2	10	88358	88367	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010296	TCCAT	2	10	90156	90165	20 %	40 %	0 %	40 %	166362850
67	NC_010296	GGTTG	2	10	90962	90971	0 %	40 %	60 %	0 %	166362851
68	NC_010296	CTTGA	2	10	91964	91973	20 %	40 %	20 %	20 %	166362852
69	NC_010296	AGGTT	2	10	93255	93264	20 %	40 %	40 %	0 %	166362854
70	NC_010296	ATTAT	2	10	94284	94293	40 %	60 %	0 %	0 %	166362855
71	NC_010296	TCGAA	2	10	97144	97153	40 %	20 %	20 %	20 %	166362859
72	NC_010296	CTATC	2	10	98337	98346	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_010296	GGTAA	2	10	99134	99143	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010296	GGATC	2	10	99755	99764	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_010296	TAAAC	2	10	101083	101092	60 %	20 %	0 %	20 %	166362863
76	NC_010296	TTCGG	2	10	105079	105088	0 %	40 %	40 %	20 %	166362867
77	NC_010296	CAAAG	2	10	106813	106822	60 %	0 %	20 %	20 %	166362869
78	NC_010296	GTTTT	2	10	112457	112466	0 %	80 %	20 %	0 %	166362872
79	NC_010296	AAATT	2	10	112702	112711	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010296	GTTTT	2	10	113042	113051	0 %	80 %	20 %	0 %	166362873
81	NC_010296	TTAAA	2	10	113536	113545	60 %	40 %	0 %	0 %	166362874
82	NC_010296	TTGAG	2	10	115216	115225	20 %	40 %	40 %	0 %	166362879
83	NC_010296	CTTCG	2	10	115250	115259	0 %	40 %	20 %	40 %	166362879
84	NC_010296	CAAGA	2	10	116626	116635	60 %	0 %	20 %	20 %	166362881
85	NC_010296	TTAGT	3	15	117339	117353	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010296	GTTAA	2	10	119223	119232	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010296	TTTTG	2	10	120059	120068	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010296	GAACT	2	10	120165	120174	40 %	20 %	20 %	20 %	166362886
89	NC_010296	TTGAG	2	10	122112	122121	20 %	40 %	40 %	0 %	166362890
90	NC_010296	ATTAA	2	10	122258	122267	60 %	40 %	0 %	0 %	166362890
91	NC_010296	AGGAC	2	10	122547	122556	40 %	0 %	40 %	20 %	166362891
92	NC_010296	TTTGT	2	10	124274	124283	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010296	GAAAA	2	10	124641	124650	80 %	0 %	20 %	0 %	166362894
94	NC_010296	TTTGA	2	10	124835	124844	20 %	60 %	20 %	0 %	166362894
95	NC_010296	GTTAT	2	10	127400	127409	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010296	TCGAT	2	10	128568	128577	20 %	40 %	20 %	20 %	166362897
97	NC_010296	ATTTT	2	10	128798	128807	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010296	GTGAT	2	10	129420	129429	20 %	40 %	40 %	0 %	166362898
99	NC_010296	AAAAT	2	10	131407	131416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010296	AGATT	2	10	131630	131639	40 %	40 %	20 %	0 %	166362902
101	NC_010296	CGTCC	2	10	131666	131675	0 %	20 %	20 %	60 %	166362902
102	NC_010296	GAAAA	2	10	132828	132837	80 %	0 %	20 %	0 %	166362904
103	NC_010296	TTTGA	2	10	133022	133031	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010296	AAATC	2	10	133814	133823	60 %	20 %	0 %	20 %	166362906
105	NC_010296	ATTGG	2	10	134169	134178	20 %	40 %	40 %	0 %	166362906
106	NC_010296	TCGAA	2	10	136248	136257	40 %	20 %	20 %	20 %	166362908
107	NC_010296	TCGAT	2	10	138297	138306	20 %	40 %	20 %	20 %	166362911
108	NC_010296	ATTTT	2	10	138527	138536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010296	AAATT	2	10	138884	138893	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010296	CAATT	2	10	138976	138985	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_010296	AAATT	2	10	139641	139650	60 %	40 %	0 %	0 %	166362913
112	NC_010296	CCTAG	2	10	142232	142241	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_010296	GTTTA	2	10	146555	146564	20 %	60 %	20 %	0 %	166362918
114	NC_010296	GTTTA	2	10	147612	147621	20 %	60 %	20 %	0 %	166362919
115	NC_010296	GTTTA	2	10	148613	148622	20 %	60 %	20 %	0 %	166362920
116	NC_010296	TCAAC	2	10	150997	151006	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_010296	TTACA	2	10	151252	151261	40 %	40 %	0 %	20 %	166362922
118	NC_010296	GATCG	2	10	152797	152806	20 %	20 %	40 %	20 %	166362924
119	NC_010296	GTCAA	2	10	154574	154583	40 %	20 %	20 %	20 %	166362925
120	NC_010296	AATTT	2	10	156894	156903	40 %	60 %	0 %	0 %	166362928
121	NC_010296	GATAA	2	10	157644	157653	60 %	20 %	20 %	0 %	166362929
122	NC_010296	GACTG	2	10	158356	158365	20 %	20 %	40 %	20 %	166362929
123	NC_010296	GGTTG	2	10	160023	160032	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010296	CTATC	2	10	161268	161277	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_010296	AGAAA	2	10	162705	162714	80 %	0 %	20 %	0 %	166362932
126	NC_010296	AGAAA	2	10	162735	162744	80 %	0 %	20 %	0 %	166362932
127	NC_010296	GTATG	2	10	163032	163041	20 %	40 %	40 %	0 %	166362932
128	NC_010296	ACAGG	2	10	163075	163084	40 %	0 %	40 %	20 %	166362932
129	NC_010296	AGCTA	2	10	163481	163490	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_010296	CTTAA	2	10	163571	163580	40 %	40 %	0 %	20 %	166362933
131	NC_010296	ATAGG	2	10	165213	165222	40 %	20 %	40 %	0 %	166362933
132	NC_010296	TAGGG	2	10	166024	166033	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010296	CCTAT	3	15	166504	166518	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_010296	CCCTT	2	10	167032	167041	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
135	NC_010296	CAACT	2	10	171192	171201	40 %	20 %	0 %	40 %	166362940
136	NC_010296	AAAGA	2	10	172972	172981	80 %	0 %	20 %	0 %	166362942
137	NC_010296	ACTTC	2	10	175068	175077	20 %	40 %	0 %	40 %	166362945
138	NC_010296	TAACT	2	10	176090	176099	40 %	40 %	0 %	20 %	166362948
139	NC_010296	AATTT	2	10	176942	176951	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_010296	TCAAG	2	10	182929	182938	40 %	20 %	20 %	20 %	166362954
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403	NC_010296	GTTAA	2	10	581293	581302	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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