MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Microcystis aeruginosa NIES-843 chromosome

Total Repeats: 1044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010296	GGTTG	2	10	9452	9461	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010296	AATTA	2	10	21099	21108	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010296	TTCGA	2	10	27341	27350	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_010296	ATTTT	2	10	32027	32036	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010296	TCTTT	2	10	38769	38778	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_010296	TTTGT	2	10	39001	39010	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010296	TATAA	2	10	42520	42529	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010296	GAAGC	2	10	42821	42830	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_010296	AAATT	2	10	43032	43041	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010296	GTCCT	2	10	44392	44401	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_010296	GTTTT	2	10	71133	71142	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010296	CTGAT	2	10	71280	71289	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_010296	AAATT	2	10	73342	73351	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010296	AATTA	2	10	76469	76478	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010296	CATAA	2	10	86139	86148	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_010296	AGGGT	2	10	88295	88304	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010296	TAATT	2	10	88358	88367	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010296	CTATC	2	10	98337	98346	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_010296	GGTAA	2	10	99134	99143	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010296	GGATC	2	10	99755	99764	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_010296	AAATT	2	10	112702	112711	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010296	TTAGT	3	15	117339	117353	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010296	GTTAA	2	10	119223	119232	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010296	TTTTG	2	10	120059	120068	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010296	TTTGT	2	10	124274	124283	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010296	GTTAT	2	10	127400	127409	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010296	ATTTT	2	10	128798	128807	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010296	AAAAT	2	10	131407	131416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010296	TTTGA	2	10	133022	133031	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010296	ATTTT	2	10	138527	138536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010296	AAATT	2	10	138884	138893	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010296	CAATT	2	10	138976	138985	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_010296	CCTAG	2	10	142232	142241	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_010296	TCAAC	2	10	150997	151006	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_010296	GGTTG	2	10	160023	160032	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010296	CTATC	2	10	161268	161277	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_010296	AGCTA	2	10	163481	163490	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_010296	TAGGG	2	10	166024	166033	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010296	CCTAT	3	15	166504	166518	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_010296	CCCTT	2	10	167032	167041	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
41	NC_010296	AATTT	2	10	176942	176951	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010296	CTAAA	2	10	210559	210568	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_010296	AATTA	2	10	215147	215156	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010296	AATTA	2	10	227276	227285	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010296	TAAAA	2	10	229987	229996	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010296	TAATT	2	10	237911	237920	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010296	GAATC	2	10	240940	240949	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_010296	AAGCA	2	10	252974	252983	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_010296	TAATC	2	10	259345	259354	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_010296	GTTTG	2	10	274434	274443	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010296	AAACA	2	10	276517	276526	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_010296	ACAAA	2	10	285621	285630	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_010296	CGGAA	2	10	295177	295186	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_010296	ACACT	2	10	306411	306420	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_010296	CAACC	2	10	309057	309066	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
56	NC_010296	AATTA	2	10	316500	316509	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010296	AATTA	2	10	318854	318863	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010296	CAACC	2	10	323012	323021	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
59	NC_010296	GGTTG	2	10	330742	330751	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010296	AATTA	2	10	330859	330868	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010296	AGACT	2	10	333090	333099	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_010296	CAACC	2	10	347070	347079	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_010296	TCCCC	2	10	359114	359123	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
64	NC_010296	ATGGA	2	10	359172	359181	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010296	TCACT	2	10	378205	378214	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_010296	CCCAA	2	10	379787	379796	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
67	NC_010296	AAATT	2	10	382100	382109	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010296	TGATA	2	10	382147	382156	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010296	CCCAA	2	10	386100	386109	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
70	NC_010296	CCCAA	2	10	390355	390364	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
71	NC_010296	TCCTC	2	10	399559	399568	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
72	NC_010296	ATAAA	2	10	399672	399681	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010296	TAATT	2	10	403710	403719	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010296	TTTCC	2	10	404341	404350	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_010296	TAATT	2	10	405234	405243	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010296	GGACC	2	10	409171	409180	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_010296	ATAAA	2	10	417516	417525	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010296	GTCCT	2	10	419348	419357	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_010296	AGGCT	2	10	420555	420564	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_010296	GTCCT	2	10	421959	421968	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_010296	GTCCT	2	10	422844	422853	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_010296	TTTGT	2	10	423480	423489	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010296	GTCCT	2	10	425769	425778	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_010296	GTCCT	2	10	426553	426562	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_010296	TTCTT	2	10	430228	430237	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_010296	TGCTT	2	10	430275	430284	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_010296	TCAAG	2	10	432375	432384	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_010296	GGTTG	2	10	435833	435842	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010296	TTTGT	2	10	440610	440619	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010296	ACAAA	2	10	445765	445774	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_010296	TATGT	2	10	450916	450925	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010296	AAGCA	2	10	456353	456362	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_010296	ACTAA	2	10	457709	457718	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_010296	TTTGT	2	10	460393	460402	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010296	GCAAG	2	10	466270	466279	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_010296	AACCT	2	10	470340	470349	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_010296	AGATT	2	10	470473	470482	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010296	AAATA	2	10	473890	473899	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010296	AATTA	2	10	475200	475209	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010296	GCTAA	2	10	481379	481388	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_010296	AAACT	2	10	481701	481710	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_010296	CAACC	2	10	485498	485507	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
103	NC_010296	TAAAA	2	10	489893	489902	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010296	TGGGT	2	10	491608	491617	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010296	AGGAC	2	10	502570	502579	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_010296	AGGAC	2	10	506940	506949	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_010296	TCAAC	2	10	509499	509508	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_010296	GGGAG	2	10	513345	513354	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010296	TTTGT	2	10	538944	538953	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010296	CAACC	2	10	542421	542430	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
111	NC_010296	AGGGT	2	10	565827	565836	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010296	TAATT	2	10	567283	567292	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010296	GAAAA	2	10	570541	570550	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010296	GTTAA	2	10	581293	581302	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010296	AGGAC	2	10	583154	583163	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_010296	ATTTT	2	10	587496	587505	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010296	CAACC	2	10	587696	587705	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
118	NC_010296	ACTTA	2	10	589977	589986	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_010296	AAGTC	2	10	606630	606639	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_010296	CAAAA	2	10	612547	612556	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_010296	ACTTT	2	10	618460	618469	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_010296	ACAAA	2	10	632444	632453	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_010296	TAAAA	2	10	634196	634205	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010296	TCAGA	2	10	637715	637724	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_010296	ATGCA	2	10	637735	637744	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_010296	AATTA	2	10	646357	646366	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010296	AAGCA	2	10	649179	649188	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_010296	AACCG	2	10	653315	653324	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_010296	TACCG	2	10	662808	662817	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_010296	CAACC	2	10	667126	667135	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
131	NC_010296	AACCC	2	10	673674	673683	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
132	NC_010296	TATAA	2	10	679452	679461	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010296	TCAAG	2	10	680425	680434	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_010296	TATTG	2	10	684312	684321	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010296	GAATT	2	10	692512	692521	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010296	ACAAA	2	10	699373	699382	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_010296	AATTA	2	10	726010	726019	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010296	ATTTT	2	10	727406	727415	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010296	AAATT	2	10	727972	727981	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010296	ACAAA	2	10	729911	729920	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_010296	AATTG	2	10	732069	732078	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010296	TACCT	2	10	738775	738784	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_010296	AATTA	2	10	744975	744984	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010296	AAATC	2	10	755440	755449	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_010296	AGGAC	2	10	762337	762346	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_010296	GTTGA	2	10	763787	763796	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010296	ACTGG	2	10	778151	778160	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_010296	TATAA	2	10	778612	778621	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010296	TCAAG	2	10	779585	779594	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
150	NC_010296	TCCTT	2	10	790382	790391	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
151	NC_010296	TATAA	2	10	803504	803513	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010296	TCAAG	2	10	804477	804486	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
153	NC_010296	AATTA	2	10	806726	806735	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_010296	AAAAT	2	10	817888	817897	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_010296	CAACC	2	10	825406	825415	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
157	NC_010296	ATAAA	2	10	832733	832742	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_010296	TCCTC	2	10	843412	843421	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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168	NC_010296	GAATG	2	10	907548	907557	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_010296	CTTGA	2	10	933500	933509	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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182	NC_010296	TTAGG	2	10	970262	970271	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_010296	TGTCT	2	10	975431	975440	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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187	NC_010296	TTTTC	2	10	984078	984087	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
188	NC_010296	GGGTT	2	10	986985	986994	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
189	NC_010296	TTCTT	2	10	989351	989360	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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195	NC_010296	TTCTT	2	10	1018132	1018141	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
196	NC_010296	TAATT	2	10	1018715	1018724	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_010296	GAATC	2	10	1032054	1032063	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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263	NC_010296	GATAA	3	15	1435319	1435333	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_010296	AACCC	2	10	1480825	1480834	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
273	NC_010296	GCTTT	2	10	1497115	1497124	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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277	NC_010296	AACTC	2	10	1505635	1505644	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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450	NC_010296	TAAAA	2	10	2414285	2414294	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_010296	GTCCT	2	10	2424779	2424788	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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457	NC_010296	TTATA	2	10	2449429	2449438	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_010296	CAGTT	2	10	2458038	2458047	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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486	NC_010296	TTTAC	2	10	2558131	2558140	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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488	NC_010296	AGGGT	2	10	2571710	2571719	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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