MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis 434/Bu chromosome

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010287	TCTGCA	2	12	24857	24868	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010287	TATTTT	2	12	34334	34345	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010287	GAGAAA	2	12	81807	81818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010287	TTTTCT	2	12	84265	84276	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_010287	ATTTTT	2	12	88044	88055	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010287	TTTTTA	2	12	114524	114535	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010287	TAAGGA	2	12	135520	135531	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010287	CCGGAG	2	12	136438	136449	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010287	CCTCTA	2	12	149583	149594	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010287	TAAGGA	2	12	157564	157575	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010287	CCGGAG	2	12	158482	158493	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010287	AAACAA	2	12	202589	202600	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_010287	AATTTT	2	12	321593	321604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010287	TAAAAT	2	12	321605	321616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010287	CAAAAA	2	12	328497	328508	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_010287	AAAAAT	2	12	383170	383181	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010287	ATCTAG	2	12	398881	398892	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_010287	TTTTAG	2	12	438162	438173	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010287	TAAAAA	2	12	442834	442845	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010287	AGAAAA	2	12	505041	505052	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010287	ATTTGC	2	12	510953	510964	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_010287	TATGAA	3	18	513975	513992	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010287	TTTTAC	2	12	539297	539308	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010287	TTTTTA	2	12	573829	573840	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010287	AGGAGA	2	12	588929	588940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010287	ATATTA	2	12	597825	597836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010287	AAAAAG	2	12	641996	642007	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010287	AGAATA	2	12	679477	679488	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010287	TTTTAA	2	12	727636	727647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010287	ACATCA	2	12	744940	744951	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010287	TAACTA	2	12	821172	821183	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_010287	AAGAAA	2	12	821185	821196	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010287	AGAATA	2	12	827160	827171	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010287	AACTAA	2	12	832892	832903	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_010287	TCCCTC	2	12	866916	866927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_010287	AAAAAT	2	12	884886	884897	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010287	TAGGGG	2	12	924054	924065	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010287	TCTTTT	2	12	936049	936060	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.