MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis 434/Bu chromosome

Total Repeats: 759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010287	GCGTA	2	10	1071	1080	20 %	20 %	40 %	20 %	166153975
2	NC_010287	TATGG	2	10	1436	1445	20 %	40 %	40 %	0 %	166153975
3	NC_010287	TTTCG	2	10	1720	1729	0 %	60 %	20 %	20 %	166153975
4	NC_010287	GAGAA	2	10	3215	3224	60 %	0 %	40 %	0 %	166153977
5	NC_010287	TGCTT	2	10	3396	3405	0 %	60 %	20 %	20 %	166153977
6	NC_010287	ACTGT	2	10	5098	5107	20 %	40 %	20 %	20 %	166153977
7	NC_010287	ATTCT	2	10	5382	5391	20 %	60 %	0 %	20 %	166153978
8	NC_010287	TTGAA	2	10	6264	6273	40 %	40 %	20 %	0 %	166153978
9	NC_010287	ATGGA	2	10	9092	9101	40 %	20 %	40 %	0 %	166153980
10	NC_010287	TAAGA	2	10	10093	10102	60 %	20 %	20 %	0 %	166153980
11	NC_010287	TTCAT	2	10	10276	10285	20 %	60 %	0 %	20 %	166153980
12	NC_010287	CTTCT	2	10	14934	14943	0 %	60 %	0 %	40 %	166153982
13	NC_010287	CTGAA	2	10	15308	15317	40 %	20 %	20 %	20 %	166153982
14	NC_010287	GAAGA	2	10	16687	16696	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010287	GAAGG	2	10	17243	17252	40 %	0 %	60 %	0 %	166153984
16	NC_010287	CGGAA	2	10	20263	20272	40 %	0 %	40 %	20 %	166153985
17	NC_010287	GATAC	2	10	20844	20853	40 %	20 %	20 %	20 %	166153986
18	NC_010287	TTTCT	2	10	26200	26209	0 %	80 %	0 %	20 %	532524909
19	NC_010287	TTTTG	2	10	26711	26720	0 %	80 %	20 %	0 %	166153992
20	NC_010287	TGCTC	2	10	28648	28657	0 %	40 %	20 %	40 %	166153993
21	NC_010287	ATGTC	2	10	29550	29559	20 %	40 %	20 %	20 %	166153993
22	NC_010287	AATAA	2	10	31089	31098	80 %	20 %	0 %	0 %	166153996
23	NC_010287	GTTTT	2	10	34290	34299	0 %	80 %	20 %	0 %	166154000
24	NC_010287	TTTCT	2	10	34963	34972	0 %	80 %	0 %	20 %	166154002
25	NC_010287	GAATC	2	10	35472	35481	40 %	20 %	20 %	20 %	166154002
26	NC_010287	TTTGG	2	10	37137	37146	0 %	60 %	40 %	0 %	166154003
27	NC_010287	AGAAT	2	10	39498	39507	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010287	AGGGG	2	10	39729	39738	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010287	AGAGA	2	10	42126	42135	60 %	0 %	40 %	0 %	166154006
30	NC_010287	GCTCT	2	10	42193	42202	0 %	40 %	20 %	40 %	166154006
31	NC_010287	GGATC	2	10	45996	46005	20 %	20 %	40 %	20 %	166154011
32	NC_010287	TAAAT	2	10	46037	46046	60 %	40 %	0 %	0 %	166154011
33	NC_010287	CAGAG	2	10	46200	46209	40 %	0 %	40 %	20 %	166154012
34	NC_010287	GCGAT	2	10	46352	46361	20 %	20 %	40 %	20 %	166154012
35	NC_010287	AGATG	2	10	46587	46596	40 %	20 %	40 %	0 %	166154012
36	NC_010287	TTTTC	2	10	47605	47614	0 %	80 %	0 %	20 %	166154014
37	NC_010287	GAGCA	2	10	49296	49305	40 %	0 %	40 %	20 %	166154015
38	NC_010287	CAATT	2	10	51687	51696	40 %	40 %	0 %	20 %	166154016
39	NC_010287	GGCGT	2	10	54323	54332	0 %	20 %	60 %	20 %	166154017
40	NC_010287	GGATA	2	10	54616	54625	40 %	20 %	40 %	0 %	166154018
41	NC_010287	CCATT	2	10	56283	56292	20 %	40 %	0 %	40 %	166154020
42	NC_010287	CAATT	2	10	57888	57897	40 %	40 %	0 %	20 %	166154022
43	NC_010287	AAAAG	2	10	60304	60313	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010287	GAAAA	2	10	60430	60439	80 %	0 %	20 %	0 %	166154024
45	NC_010287	GAGGT	2	10	61398	61407	20 %	20 %	60 %	0 %	166154024
46	NC_010287	ATTTT	2	10	61740	61749	20 %	80 %	0 %	0 %	166154024
47	NC_010287	AGGTA	2	10	63703	63712	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010287	TTTGG	2	10	63919	63928	0 %	60 %	40 %	0 %	166154025
49	NC_010287	GTTAT	2	10	64393	64402	20 %	60 %	20 %	0 %	166154025
50	NC_010287	TCCTT	2	10	64886	64895	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_010287	CTCCA	2	10	65040	65049	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
52	NC_010287	CGTTT	2	10	65249	65258	0 %	60 %	20 %	20 %	166154026
53	NC_010287	TTCTA	2	10	66073	66082	20 %	60 %	0 %	20 %	166154026
54	NC_010287	TTAGT	2	10	66422	66431	20 %	60 %	20 %	0 %	166154026
55	NC_010287	TAGGT	2	10	67163	67172	20 %	40 %	40 %	0 %	166154027
56	NC_010287	AGGGA	2	10	67793	67802	40 %	0 %	60 %	0 %	166154028
57	NC_010287	CTTAA	2	10	70665	70674	40 %	40 %	0 %	20 %	166154030
58	NC_010287	ACAAA	2	10	71764	71773	80 %	0 %	0 %	20 %	166154032
59	NC_010287	TCCGG	2	10	81552	81561	0 %	20 %	40 %	40 %	166154040
60	NC_010287	TGGCT	2	10	83902	83911	0 %	40 %	40 %	20 %	166154042
61	NC_010287	TTTCT	2	10	84311	84320	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_010287	AAGAA	2	10	85073	85082	80 %	0 %	20 %	0 %	166154043
63	NC_010287	ATAGG	2	10	90208	90217	40 %	20 %	40 %	0 %	166154046
64	NC_010287	AAAGC	2	10	90366	90375	60 %	0 %	20 %	20 %	166154046
65	NC_010287	ACAAT	2	10	91226	91235	60 %	20 %	0 %	20 %	166154047
66	NC_010287	AGAAA	2	10	92843	92852	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010287	ACACA	2	10	94204	94213	60 %	0 %	0 %	40 %	166154049
68	NC_010287	TGTTT	2	10	95147	95156	0 %	80 %	20 %	0 %	166154050
69	NC_010287	CTTTG	2	10	95566	95575	0 %	60 %	20 %	20 %	166154050
70	NC_010287	GCATC	2	10	96215	96224	20 %	20 %	20 %	40 %	166154050
71	NC_010287	AAAGT	2	10	101710	101719	60 %	20 %	20 %	0 %	166154053
72	NC_010287	CGATG	2	10	101786	101795	20 %	20 %	40 %	20 %	166154053
73	NC_010287	CGAAG	2	10	102626	102635	40 %	0 %	40 %	20 %	166154053
74	NC_010287	GGAAG	2	10	104407	104416	40 %	0 %	60 %	0 %	166154054
75	NC_010287	AAGAG	2	10	104683	104692	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010287	ACTCC	2	10	104983	104992	20 %	20 %	0 %	60 %	166154055
77	NC_010287	TGTCT	2	10	110020	110029	0 %	60 %	20 %	20 %	166154060
78	NC_010287	GGAAA	2	10	112772	112781	60 %	0 %	40 %	0 %	166154063
79	NC_010287	TGGCA	2	10	114642	114651	20 %	20 %	40 %	20 %	166154065
80	NC_010287	TTAGA	2	10	115368	115377	40 %	40 %	20 %	0 %	166154065
81	NC_010287	CGTGG	2	10	118348	118357	0 %	20 %	60 %	20 %	166154069
82	NC_010287	AACGT	2	10	118475	118484	40 %	20 %	20 %	20 %	166154069
83	NC_010287	AAGAG	2	10	120128	120137	60 %	0 %	40 %	0 %	166154070
84	NC_010287	ATGGC	2	10	124199	124208	20 %	20 %	40 %	20 %	166154073
85	NC_010287	ATGCA	2	10	125905	125914	40 %	20 %	20 %	20 %	166154075
86	NC_010287	GCTGA	2	10	127306	127315	20 %	20 %	40 %	20 %	166154076
87	NC_010287	CTCAC	2	10	128883	128892	20 %	20 %	0 %	60 %	166154078
88	NC_010287	AGAAA	2	10	130012	130021	80 %	0 %	20 %	0 %	166154080
89	NC_010287	GATAA	2	10	132640	132649	60 %	20 %	20 %	0 %	166154081
90	NC_010287	AGAAA	2	10	132941	132950	80 %	0 %	20 %	0 %	166154081
91	NC_010287	CTTTT	2	10	139008	139017	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_010287	GGTCG	2	10	139988	139997	0 %	20 %	60 %	20 %	166154082
93	NC_010287	TGGGA	2	10	142398	142407	20 %	20 %	60 %	0 %	166154084
94	NC_010287	GCTTT	2	10	142900	142909	0 %	60 %	20 %	20 %	166154085
95	NC_010287	AGAAA	2	10	143359	143368	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010287	TCCCA	2	10	146606	146615	20 %	20 %	0 %	60 %	166154087
97	NC_010287	AAAAC	2	10	147048	147057	80 %	0 %	0 %	20 %	166154087
98	NC_010287	CAGCC	2	10	150936	150945	20 %	0 %	20 %	60 %	166154090
99	NC_010287	AGACA	2	10	152996	153005	60 %	0 %	20 %	20 %	166154091
100	NC_010287	GAAAT	2	10	153039	153048	60 %	20 %	20 %	0 %	166154091
101	NC_010287	GTATC	2	10	154062	154071	20 %	40 %	20 %	20 %	166154091
102	NC_010287	GAAGA	2	10	155533	155542	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010287	CTTTT	2	10	161052	161061	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_010287	CGATT	2	10	162601	162610	20 %	40 %	20 %	20 %	166154092
105	NC_010287	CTTTT	2	10	165061	165070	0 %	80 %	0 %	20 %	166154095
106	NC_010287	GAAGA	2	10	165548	165557	60 %	0 %	40 %	0 %	166154096
107	NC_010287	TAGAA	2	10	169521	169530	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010287	CTATT	2	10	169909	169918	20 %	60 %	0 %	20 %	166154099
109	NC_010287	TGGAT	2	10	170192	170201	20 %	40 %	40 %	0 %	166154099
110	NC_010287	ATCCT	2	10	171157	171166	20 %	40 %	0 %	40 %	166154100
111	NC_010287	CAAGC	2	10	171242	171251	40 %	0 %	20 %	40 %	166154100
112	NC_010287	ATTGT	2	10	171812	171821	20 %	60 %	20 %	0 %	166154100
113	NC_010287	CATTG	2	10	172542	172551	20 %	40 %	20 %	20 %	166154101
114	NC_010287	GTCGT	2	10	176975	176984	0 %	40 %	40 %	20 %	166154104
115	NC_010287	ATGGA	2	10	178780	178789	40 %	20 %	40 %	0 %	166154107
116	NC_010287	TGCAG	2	10	179433	179442	20 %	20 %	40 %	20 %	166154108
117	NC_010287	AAGGG	2	10	181641	181650	40 %	0 %	60 %	0 %	166154110
118	NC_010287	AAGAA	2	10	182103	182112	80 %	0 %	20 %	0 %	166154110
119	NC_010287	AGCAG	2	10	182499	182508	40 %	0 %	40 %	20 %	166154110
120	NC_010287	AATCA	2	10	182674	182683	60 %	20 %	0 %	20 %	166154110
121	NC_010287	GTTTT	2	10	184476	184485	0 %	80 %	20 %	0 %	166154112
122	NC_010287	CTTTT	2	10	185555	185564	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_010287	TTTTA	2	10	186300	186309	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010287	AGAGC	2	10	188588	188597	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_010287	TCTGT	2	10	191656	191665	0 %	60 %	20 %	20 %	166154119
126	NC_010287	AAAGA	2	10	194764	194773	80 %	0 %	20 %	0 %	166154121
127	NC_010287	CCCTA	2	10	195701	195710	20 %	20 %	0 %	60 %	166154122
128	NC_010287	TCTTT	2	10	196451	196460	0 %	80 %	0 %	20 %	166154123
129	NC_010287	ATCCA	2	10	200369	200378	40 %	20 %	0 %	40 %	166154125
130	NC_010287	TGTAT	2	10	203436	203445	20 %	60 %	20 %	0 %	166154132
131	NC_010287	GTTTT	2	10	203807	203816	0 %	80 %	20 %	0 %	166154133
132	NC_010287	TTAAA	2	10	204332	204341	60 %	40 %	0 %	0 %	166154133
133	NC_010287	TTTCA	2	10	204951	204960	20 %	60 %	0 %	20 %	166154133
134	NC_010287	CTGTC	2	10	206989	206998	0 %	40 %	20 %	40 %	166154134
135	NC_010287	AAGAG	2	10	208258	208267	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010287	GCTAG	2	10	208284	208293	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_010287	CGATA	2	10	208732	208741	40 %	20 %	20 %	20 %	166154135
138	NC_010287	AGAGG	2	10	209354	209363	40 %	0 %	60 %	0 %	166154135
139	NC_010287	CTTTC	2	10	209369	209378	0 %	60 %	0 %	40 %	166154135
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142	NC_010287	CACAT	2	10	213615	213624	40 %	20 %	0 %	40 %	166154138
143	NC_010287	TGTCG	2	10	215915	215924	0 %	40 %	40 %	20 %	166154140
144	NC_010287	TCGTT	2	10	216670	216679	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_010287	CAATC	2	10	218169	218178	40 %	20 %	0 %	40 %	166154142
146	NC_010287	ATGAT	2	10	219390	219399	40 %	40 %	20 %	0 %	166154145
147	NC_010287	TTCTT	2	10	219627	219636	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_010287	TAATT	2	10	220927	220936	40 %	60 %	0 %	0 %	166154147
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151	NC_010287	GATCC	2	10	225827	225836	20 %	20 %	20 %	40 %	166154149
152	NC_010287	TAGCT	2	10	226382	226391	20 %	40 %	20 %	20 %	166154150
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154	NC_010287	ATCAA	2	10	227757	227766	60 %	20 %	0 %	20 %	166154150
155	NC_010287	TGATT	2	10	228600	228609	20 %	60 %	20 %	0 %	532524915
156	NC_010287	CGTTC	2	10	229342	229351	0 %	40 %	20 %	40 %	166154154
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159	NC_010287	TGTCT	2	10	234027	234036	0 %	60 %	20 %	20 %	166154155
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165	NC_010287	CTTCA	2	10	241467	241476	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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252	NC_010287	GGAAA	2	10	346055	346064	60 %	0 %	40 %	0 %	166154240
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258	NC_010287	CCTAT	2	10	351867	351876	20 %	40 %	0 %	40 %	166154245
259	NC_010287	GAAGG	2	10	352666	352675	40 %	0 %	60 %	0 %	166154246
260	NC_010287	GAGCT	2	10	353706	353715	20 %	20 %	40 %	20 %	166154247
261	NC_010287	AAAGA	2	10	355339	355348	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
262	NC_010287	CTATT	2	10	358380	358389	20 %	60 %	0 %	20 %	166154253
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264	NC_010287	ACGAT	2	10	360342	360351	40 %	20 %	20 %	20 %	166154254
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381	NC_010287	TGAGT	2	10	504610	504619	20 %	40 %	40 %	0 %	166154376
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