MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis 434/Bu chromosome

Total Repeats: 647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010287	GCGTA	2	10	1071	1080	20 %	20 %	40 %	20 %	166153975
2	NC_010287	TATGG	2	10	1436	1445	20 %	40 %	40 %	0 %	166153975
3	NC_010287	TTTCG	2	10	1720	1729	0 %	60 %	20 %	20 %	166153975
4	NC_010287	GAGAA	2	10	3215	3224	60 %	0 %	40 %	0 %	166153977
5	NC_010287	TGCTT	2	10	3396	3405	0 %	60 %	20 %	20 %	166153977
6	NC_010287	ACTGT	2	10	5098	5107	20 %	40 %	20 %	20 %	166153977
7	NC_010287	ATTCT	2	10	5382	5391	20 %	60 %	0 %	20 %	166153978
8	NC_010287	TTGAA	2	10	6264	6273	40 %	40 %	20 %	0 %	166153978
9	NC_010287	ATGGA	2	10	9092	9101	40 %	20 %	40 %	0 %	166153980
10	NC_010287	TAAGA	2	10	10093	10102	60 %	20 %	20 %	0 %	166153980
11	NC_010287	TTCAT	2	10	10276	10285	20 %	60 %	0 %	20 %	166153980
12	NC_010287	CTTCT	2	10	14934	14943	0 %	60 %	0 %	40 %	166153982
13	NC_010287	CTGAA	2	10	15308	15317	40 %	20 %	20 %	20 %	166153982
14	NC_010287	GAAGG	2	10	17243	17252	40 %	0 %	60 %	0 %	166153984
15	NC_010287	CGGAA	2	10	20263	20272	40 %	0 %	40 %	20 %	166153985
16	NC_010287	GATAC	2	10	20844	20853	40 %	20 %	20 %	20 %	166153986
17	NC_010287	TTTCT	2	10	26200	26209	0 %	80 %	0 %	20 %	532524909
18	NC_010287	TTTTG	2	10	26711	26720	0 %	80 %	20 %	0 %	166153992
19	NC_010287	TGCTC	2	10	28648	28657	0 %	40 %	20 %	40 %	166153993
20	NC_010287	ATGTC	2	10	29550	29559	20 %	40 %	20 %	20 %	166153993
21	NC_010287	AATAA	2	10	31089	31098	80 %	20 %	0 %	0 %	166153996
22	NC_010287	GTTTT	2	10	34290	34299	0 %	80 %	20 %	0 %	166154000
23	NC_010287	TTTCT	2	10	34963	34972	0 %	80 %	0 %	20 %	166154002
24	NC_010287	GAATC	2	10	35472	35481	40 %	20 %	20 %	20 %	166154002
25	NC_010287	TTTGG	2	10	37137	37146	0 %	60 %	40 %	0 %	166154003
26	NC_010287	AGAGA	2	10	42126	42135	60 %	0 %	40 %	0 %	166154006
27	NC_010287	GCTCT	2	10	42193	42202	0 %	40 %	20 %	40 %	166154006
28	NC_010287	GGATC	2	10	45996	46005	20 %	20 %	40 %	20 %	166154011
29	NC_010287	TAAAT	2	10	46037	46046	60 %	40 %	0 %	0 %	166154011
30	NC_010287	CAGAG	2	10	46200	46209	40 %	0 %	40 %	20 %	166154012
31	NC_010287	GCGAT	2	10	46352	46361	20 %	20 %	40 %	20 %	166154012
32	NC_010287	AGATG	2	10	46587	46596	40 %	20 %	40 %	0 %	166154012
33	NC_010287	TTTTC	2	10	47605	47614	0 %	80 %	0 %	20 %	166154014
34	NC_010287	GAGCA	2	10	49296	49305	40 %	0 %	40 %	20 %	166154015
35	NC_010287	CAATT	2	10	51687	51696	40 %	40 %	0 %	20 %	166154016
36	NC_010287	GGCGT	2	10	54323	54332	0 %	20 %	60 %	20 %	166154017
37	NC_010287	GGATA	2	10	54616	54625	40 %	20 %	40 %	0 %	166154018
38	NC_010287	CCATT	2	10	56283	56292	20 %	40 %	0 %	40 %	166154020
39	NC_010287	CAATT	2	10	57888	57897	40 %	40 %	0 %	20 %	166154022
40	NC_010287	GAAAA	2	10	60430	60439	80 %	0 %	20 %	0 %	166154024
41	NC_010287	GAGGT	2	10	61398	61407	20 %	20 %	60 %	0 %	166154024
42	NC_010287	ATTTT	2	10	61740	61749	20 %	80 %	0 %	0 %	166154024
43	NC_010287	TTTGG	2	10	63919	63928	0 %	60 %	40 %	0 %	166154025
44	NC_010287	GTTAT	2	10	64393	64402	20 %	60 %	20 %	0 %	166154025
45	NC_010287	CGTTT	2	10	65249	65258	0 %	60 %	20 %	20 %	166154026
46	NC_010287	TTCTA	2	10	66073	66082	20 %	60 %	0 %	20 %	166154026
47	NC_010287	TTAGT	2	10	66422	66431	20 %	60 %	20 %	0 %	166154026
48	NC_010287	TAGGT	2	10	67163	67172	20 %	40 %	40 %	0 %	166154027
49	NC_010287	AGGGA	2	10	67793	67802	40 %	0 %	60 %	0 %	166154028
50	NC_010287	CTTAA	2	10	70665	70674	40 %	40 %	0 %	20 %	166154030
51	NC_010287	ACAAA	2	10	71764	71773	80 %	0 %	0 %	20 %	166154032
52	NC_010287	TCCGG	2	10	81552	81561	0 %	20 %	40 %	40 %	166154040
53	NC_010287	TGGCT	2	10	83902	83911	0 %	40 %	40 %	20 %	166154042
54	NC_010287	AAGAA	2	10	85073	85082	80 %	0 %	20 %	0 %	166154043
55	NC_010287	ATAGG	2	10	90208	90217	40 %	20 %	40 %	0 %	166154046
56	NC_010287	AAAGC	2	10	90366	90375	60 %	0 %	20 %	20 %	166154046
57	NC_010287	ACAAT	2	10	91226	91235	60 %	20 %	0 %	20 %	166154047
58	NC_010287	ACACA	2	10	94204	94213	60 %	0 %	0 %	40 %	166154049
59	NC_010287	TGTTT	2	10	95147	95156	0 %	80 %	20 %	0 %	166154050
60	NC_010287	CTTTG	2	10	95566	95575	0 %	60 %	20 %	20 %	166154050
61	NC_010287	GCATC	2	10	96215	96224	20 %	20 %	20 %	40 %	166154050
62	NC_010287	AAAGT	2	10	101710	101719	60 %	20 %	20 %	0 %	166154053
63	NC_010287	CGATG	2	10	101786	101795	20 %	20 %	40 %	20 %	166154053
64	NC_010287	CGAAG	2	10	102626	102635	40 %	0 %	40 %	20 %	166154053
65	NC_010287	GGAAG	2	10	104407	104416	40 %	0 %	60 %	0 %	166154054
66	NC_010287	ACTCC	2	10	104983	104992	20 %	20 %	0 %	60 %	166154055
67	NC_010287	TGTCT	2	10	110020	110029	0 %	60 %	20 %	20 %	166154060
68	NC_010287	GGAAA	2	10	112772	112781	60 %	0 %	40 %	0 %	166154063
69	NC_010287	TGGCA	2	10	114642	114651	20 %	20 %	40 %	20 %	166154065
70	NC_010287	TTAGA	2	10	115368	115377	40 %	40 %	20 %	0 %	166154065
71	NC_010287	CGTGG	2	10	118348	118357	0 %	20 %	60 %	20 %	166154069
72	NC_010287	AACGT	2	10	118475	118484	40 %	20 %	20 %	20 %	166154069
73	NC_010287	AAGAG	2	10	120128	120137	60 %	0 %	40 %	0 %	166154070
74	NC_010287	ATGGC	2	10	124199	124208	20 %	20 %	40 %	20 %	166154073
75	NC_010287	ATGCA	2	10	125905	125914	40 %	20 %	20 %	20 %	166154075
76	NC_010287	GCTGA	2	10	127306	127315	20 %	20 %	40 %	20 %	166154076
77	NC_010287	CTCAC	2	10	128883	128892	20 %	20 %	0 %	60 %	166154078
78	NC_010287	AGAAA	2	10	130012	130021	80 %	0 %	20 %	0 %	166154080
79	NC_010287	GATAA	2	10	132640	132649	60 %	20 %	20 %	0 %	166154081
80	NC_010287	AGAAA	2	10	132941	132950	80 %	0 %	20 %	0 %	166154081
81	NC_010287	GGTCG	2	10	139988	139997	0 %	20 %	60 %	20 %	166154082
82	NC_010287	TGGGA	2	10	142398	142407	20 %	20 %	60 %	0 %	166154084
83	NC_010287	GCTTT	2	10	142900	142909	0 %	60 %	20 %	20 %	166154085
84	NC_010287	TCCCA	2	10	146606	146615	20 %	20 %	0 %	60 %	166154087
85	NC_010287	AAAAC	2	10	147048	147057	80 %	0 %	0 %	20 %	166154087
86	NC_010287	CAGCC	2	10	150936	150945	20 %	0 %	20 %	60 %	166154090
87	NC_010287	AGACA	2	10	152996	153005	60 %	0 %	20 %	20 %	166154091
88	NC_010287	GAAAT	2	10	153039	153048	60 %	20 %	20 %	0 %	166154091
89	NC_010287	GTATC	2	10	154062	154071	20 %	40 %	20 %	20 %	166154091
90	NC_010287	CGATT	2	10	162601	162610	20 %	40 %	20 %	20 %	166154092
91	NC_010287	CTTTT	2	10	165061	165070	0 %	80 %	0 %	20 %	166154095
92	NC_010287	GAAGA	2	10	165548	165557	60 %	0 %	40 %	0 %	166154096
93	NC_010287	CTATT	2	10	169909	169918	20 %	60 %	0 %	20 %	166154099
94	NC_010287	TGGAT	2	10	170192	170201	20 %	40 %	40 %	0 %	166154099
95	NC_010287	ATCCT	2	10	171157	171166	20 %	40 %	0 %	40 %	166154100
96	NC_010287	CAAGC	2	10	171242	171251	40 %	0 %	20 %	40 %	166154100
97	NC_010287	ATTGT	2	10	171812	171821	20 %	60 %	20 %	0 %	166154100
98	NC_010287	CATTG	2	10	172542	172551	20 %	40 %	20 %	20 %	166154101
99	NC_010287	GTCGT	2	10	176975	176984	0 %	40 %	40 %	20 %	166154104
100	NC_010287	ATGGA	2	10	178780	178789	40 %	20 %	40 %	0 %	166154107
101	NC_010287	TGCAG	2	10	179433	179442	20 %	20 %	40 %	20 %	166154108
102	NC_010287	AAGGG	2	10	181641	181650	40 %	0 %	60 %	0 %	166154110
103	NC_010287	AAGAA	2	10	182103	182112	80 %	0 %	20 %	0 %	166154110
104	NC_010287	AGCAG	2	10	182499	182508	40 %	0 %	40 %	20 %	166154110
105	NC_010287	AATCA	2	10	182674	182683	60 %	20 %	0 %	20 %	166154110
106	NC_010287	GTTTT	2	10	184476	184485	0 %	80 %	20 %	0 %	166154112
107	NC_010287	TCTGT	2	10	191656	191665	0 %	60 %	20 %	20 %	166154119
108	NC_010287	AAAGA	2	10	194764	194773	80 %	0 %	20 %	0 %	166154121
109	NC_010287	CCCTA	2	10	195701	195710	20 %	20 %	0 %	60 %	166154122
110	NC_010287	TCTTT	2	10	196451	196460	0 %	80 %	0 %	20 %	166154123
111	NC_010287	ATCCA	2	10	200369	200378	40 %	20 %	0 %	40 %	166154125
112	NC_010287	TGTAT	2	10	203436	203445	20 %	60 %	20 %	0 %	166154132
113	NC_010287	GTTTT	2	10	203807	203816	0 %	80 %	20 %	0 %	166154133
114	NC_010287	TTAAA	2	10	204332	204341	60 %	40 %	0 %	0 %	166154133
115	NC_010287	TTTCA	2	10	204951	204960	20 %	60 %	0 %	20 %	166154133
116	NC_010287	CTGTC	2	10	206989	206998	0 %	40 %	20 %	40 %	166154134
117	NC_010287	CGATA	2	10	208732	208741	40 %	20 %	20 %	20 %	166154135
118	NC_010287	AGAGG	2	10	209354	209363	40 %	0 %	60 %	0 %	166154135
119	NC_010287	CTTTC	2	10	209369	209378	0 %	60 %	0 %	40 %	166154135
120	NC_010287	TGGGG	2	10	210358	210367	0 %	20 %	80 %	0 %	166154136
121	NC_010287	TCTAT	2	10	211848	211857	20 %	60 %	0 %	20 %	166154138
122	NC_010287	CACAT	2	10	213615	213624	40 %	20 %	0 %	40 %	166154138
123	NC_010287	TGTCG	2	10	215915	215924	0 %	40 %	40 %	20 %	166154140
124	NC_010287	CAATC	2	10	218169	218178	40 %	20 %	0 %	40 %	166154142
125	NC_010287	ATGAT	2	10	219390	219399	40 %	40 %	20 %	0 %	166154145
126	NC_010287	TAATT	2	10	220927	220936	40 %	60 %	0 %	0 %	166154147
127	NC_010287	GGTAG	2	10	223809	223818	20 %	20 %	60 %	0 %	166154148
128	NC_010287	AGATA	2	10	223820	223829	60 %	20 %	20 %	0 %	166154148
129	NC_010287	GATCC	2	10	225827	225836	20 %	20 %	20 %	40 %	166154149
130	NC_010287	TAGCT	2	10	226382	226391	20 %	40 %	20 %	20 %	166154150
131	NC_010287	AGAGA	2	10	227173	227182	60 %	0 %	40 %	0 %	166154150
132	NC_010287	ATCAA	2	10	227757	227766	60 %	20 %	0 %	20 %	166154150
133	NC_010287	TGATT	2	10	228600	228609	20 %	60 %	20 %	0 %	532524915
134	NC_010287	CGTTC	2	10	229342	229351	0 %	40 %	20 %	40 %	166154154
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