MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis 434/Bu chromosome

Total Repeats: 349

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010287	AG	3	6	5331	5336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010287	AG	3	6	16350	16355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010287	GC	3	6	16666	16671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010287	GA	3	6	17039	17044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010287	TC	3	6	32522	32527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_010287	GC	3	6	34673	34678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010287	GT	3	6	38074	38079	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010287	CT	3	6	38145	38150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010287	AG	3	6	38317	38322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010287	GA	3	6	38372	38377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010287	GT	3	6	39472	39477	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010287	AG	3	6	39771	39776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010287	AG	3	6	43371	43376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010287	AG	3	6	48653	48658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010287	GA	3	6	58290	58295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010287	GC	3	6	58403	58408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_010287	AG	3	6	58487	58492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010287	CT	3	6	59847	59852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010287	AG	3	6	60085	60090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010287	CT	4	8	64771	64778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_010287	GA	3	6	64905	64910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010287	AG	3	6	69710	69715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010287	AT	5	10	72551	72560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010287	CT	3	6	74579	74584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010287	TG	3	6	81842	81847	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010287	AG	4	8	82843	82850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010287	TC	3	6	84204	84209	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010287	GA	3	6	84339	84344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010287	AG	3	6	84419	84424	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010287	AG	3	6	87418	87423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010287	TG	3	6	92780	92785	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010287	TC	3	6	105811	105816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010287	TC	3	6	109942	109947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010287	AG	3	6	114352	114357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010287	AG	3	6	114469	114474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010287	CT	3	6	114491	114496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010287	AG	3	6	114548	114553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010287	GA	3	6	114571	114576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010287	TG	3	6	126379	126384	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010287	GA	3	6	126477	126482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010287	AG	3	6	126556	126561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010287	AG	3	6	126565	126570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010287	CT	4	8	133191	133198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010287	TA	3	6	133960	133965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010287	GA	3	6	134272	134277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010287	GT	3	6	134379	134384	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010287	AC	3	6	135200	135205	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_010287	AC	3	6	135369	135374	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010287	GA	3	6	135432	135437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010287	GA	3	6	136150	136155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010287	TC	3	6	136632	136637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_010287	GT	3	6	136981	136986	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010287	GC	3	6	137459	137464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_010287	AG	3	6	138751	138756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010287	GA	3	6	138837	138842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010287	TC	3	6	139031	139036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010287	TA	3	6	156004	156009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010287	GA	3	6	156316	156321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010287	GT	3	6	156423	156428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010287	AC	3	6	157244	157249	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010287	AC	3	6	157413	157418	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_010287	GA	3	6	157476	157481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010287	GA	3	6	158194	158199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010287	TC	3	6	158676	158681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010287	GT	3	6	159025	159030	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010287	GC	3	6	159503	159508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010287	AG	3	6	160795	160800	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010287	GA	3	6	160881	160886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010287	TC	3	6	161075	161080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010287	GA	3	6	177217	177222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010287	TC	3	6	183358	183363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010287	CT	3	6	186211	186216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_010287	AG	3	6	188568	188573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010287	AG	3	6	195194	195199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010287	AG	3	6	195309	195314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010287	CG	3	6	195819	195824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_010287	CT	4	8	195934	195941	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010287	AG	3	6	201298	201303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010287	AG	3	6	202966	202971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010287	CA	3	6	208141	208146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_010287	TC	3	6	210574	210579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_010287	AG	3	6	214355	214360	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010287	GA	3	6	214456	214461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010287	AG	3	6	214507	214512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010287	GA	3	6	217014	217019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010287	CT	3	6	222272	222277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_010287	AC	3	6	226291	226296	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_010287	CT	3	6	240180	240185	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010287	CT	3	6	240246	240251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_010287	GA	3	6	245784	245789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010287	TG	3	6	248394	248399	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010287	AG	3	6	253806	253811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010287	TA	3	6	253957	253962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010287	CT	4	8	254059	254066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_010287	TA	3	6	261620	261625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010287	AT	3	6	269734	269739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010287	GA	3	6	272545	272550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010287	CT	3	6	272566	272571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_010287	GT	3	6	272579	272584	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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101	NC_010287	GA	3	6	278575	278580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010287	TA	3	6	282336	282341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010287	CA	3	6	282394	282399	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_010287	AG	3	6	284317	284322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010287	TC	3	6	284556	284561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_010287	GT	3	6	285631	285636	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010287	AG	3	6	287568	287573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010287	CT	3	6	287582	287587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_010287	AG	3	6	287869	287874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010287	TA	3	6	288150	288155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010287	AT	3	6	297631	297636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010287	GT	3	6	298003	298008	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010287	TC	3	6	303950	303955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_010287	TC	3	6	311525	311530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_010287	TG	3	6	311537	311542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010287	CT	3	6	317756	317761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_010287	AG	3	6	317770	317775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010287	TC	3	6	323843	323848	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_010287	TC	3	6	323915	323920	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_010287	GA	3	6	329243	329248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010287	AG	3	6	331598	331603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010287	TA	3	6	333496	333501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010287	TA	3	6	335587	335592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010287	TA	4	8	335811	335818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010287	AG	3	6	339763	339768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010287	GA	3	6	339776	339781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010287	CT	3	6	340698	340703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_010287	AG	3	6	342764	342769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010287	GA	3	6	342922	342927	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010287	AG	3	6	343439	343444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010287	CT	3	6	343508	343513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_010287	GA	3	6	348759	348764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010287	CT	3	6	348766	348771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_010287	TC	3	6	350134	350139	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_010287	AG	3	6	350217	350222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010287	GA	3	6	358631	358636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_010287	CT	3	6	360999	361004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_010287	CT	3	6	362369	362374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_010287	AG	3	6	364495	364500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010287	CT	3	6	364561	364566	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_010287	AG	3	6	364891	364896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010287	TC	3	6	365983	365988	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_010287	AG	3	6	370219	370224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010287	TG	3	6	373570	373575	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010287	GA	3	6	377838	377843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010287	GA	3	6	383035	383040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010287	AG	4	8	387054	387061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_010287	CT	3	6	394109	394114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_010287	TA	3	6	407473	407478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010287	GA	3	6	412826	412831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010287	CT	3	6	415176	415181	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_010287	GA	3	6	415704	415709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.