MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-1/proctitis chromosome

Total Repeats: 1415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010280	GCA	2	6	1028	1033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010280	TAA	3	9	2920	2928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010280	CAA	2	6	5196	5201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010280	TTG	2	6	5207	5212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010280	GAA	2	6	5243	5248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010280	ACA	2	6	5278	5283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010280	AGC	2	6	5315	5320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010280	TGA	2	6	16296	16301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010280	TTC	2	6	16522	16527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010280	CGG	2	6	16541	16546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010280	GAA	2	6	16630	16635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010280	TTC	2	6	16672	16677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010280	TCA	2	6	16707	16712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010280	TTC	2	6	16851	16856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010280	TGC	2	6	16865	16870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010280	GAA	2	6	16897	16902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010280	TGT	2	6	24974	24979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010280	TCT	2	6	25048	25053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010280	CAA	2	6	25062	25067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010280	AAG	2	6	26170	26175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010280	TCT	2	6	26180	26185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010280	TGT	2	6	26218	26223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010280	CTT	2	6	26335	26340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010280	TAT	2	6	30022	30027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010280	TCT	2	6	32159	32164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010280	GAA	2	6	32233	32238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010280	CGG	2	6	32293	32298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010280	AGA	2	6	32330	32335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010280	CTT	2	6	32492	32497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010280	AGG	2	6	33274	33279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010280	AAG	2	6	34304	34309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010280	TCT	2	6	34697	34702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010280	AAT	2	6	38156	38161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010280	GTA	2	6	38169	38174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010280	TCT	2	6	38185	38190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010280	ATG	2	6	38408	38413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010280	AGA	2	6	38434	38439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010280	ATG	2	6	39697	39702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010280	GAA	2	6	39767	39772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010280	GCT	2	6	39880	39885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010280	TTC	2	6	43088	43093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010280	TAG	2	6	46140	46145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010280	GTC	2	6	53192	53197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010280	AGG	2	6	53294	53299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010280	TGA	2	6	54980	54985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010280	TCT	2	6	58458	58463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010280	TTG	2	6	58483	58488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010280	AGG	2	6	58500	58505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010280	TTA	2	6	58584	58589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010280	TTA	2	6	58593	58598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010280	GGC	2	6	59879	59884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010280	AGC	2	6	59957	59962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010280	GAA	2	6	60051	60056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010280	CCT	2	6	60068	60073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_010280	TTG	2	6	60193	60198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010280	GTT	2	6	60247	60252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010280	TAC	2	6	60374	60379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010280	TTG	2	6	64761	64766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010280	TGT	2	6	64821	64826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010280	CAA	2	6	64859	64864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010280	ATA	2	6	65023	65028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010280	TGA	2	6	65071	65076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010280	AGG	2	6	65080	65085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010280	CTA	2	6	72474	72479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010280	AGG	2	6	72569	72574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010280	TTC	2	6	74623	74628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010280	AGG	2	6	75982	75987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010280	AAG	2	6	76113	76118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010280	TAA	2	6	76130	76135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010280	CGG	2	6	76164	76169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010280	ATA	2	6	78431	78436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010280	GAA	2	6	78447	78452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010280	AGC	2	6	81634	81639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010280	GAT	2	6	81685	81690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010280	AAG	2	6	81701	81706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010280	GAA	2	6	81715	81720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010280	GTT	2	6	81727	81732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010280	CTT	2	6	81814	81819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010280	AAG	2	6	81857	81862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010280	TTG	2	6	84390	84395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010280	TAT	2	6	88021	88026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010280	TAA	2	6	88030	88035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010280	AAT	2	6	89557	89562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010280	GAA	2	6	89566	89571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010280	ATG	2	6	92884	92889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010280	TGA	2	6	94311	94316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010280	AGA	2	6	94378	94383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010280	GGT	2	6	94479	94484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010280	GAA	2	6	94536	94541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010280	ATT	2	6	101040	101045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010280	GAT	2	6	101122	101127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010280	TCT	2	6	104647	104652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010280	GAA	3	9	105844	105852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010280	CTT	3	9	111609	111617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010280	AAG	2	6	111624	111629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010280	AAG	2	6	111653	111658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010280	TCT	2	6	111694	111699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010280	GAT	2	6	114364	114369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010280	CTT	2	6	114475	114480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010280	ATG	2	6	114506	114511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010280	GTT	2	6	114557	114562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010280	TTA	2	6	114591	114596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010280	CTA	2	6	119815	119820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010280	CTC	2	6	120585	120590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_010280	AGA	2	6	124910	124915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010280	CTT	2	6	126324	126329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010280	AAG	2	6	126437	126442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010280	TAA	2	6	126624	126629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010280	TAC	2	6	126644	126649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010280	AGT	2	6	127447	127452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010280	AGT	2	6	133343	133348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010280	AAG	2	6	133366	133371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010280	ACG	2	6	133377	133382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010280	TAA	2	6	133953	133958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010280	GGC	2	6	134010	134015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010280	AAG	2	6	134177	134182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010280	TGG	2	6	134234	134239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010280	GCC	2	6	134287	134292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_010280	CGC	2	6	134379	134384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_010280	AAG	2	6	134476	134481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010280	CAG	2	6	134500	134505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_010280	GAA	2	6	134692	134697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010280	GCC	2	6	134860	134865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_010280	GAG	2	6	134867	134872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010280	TGC	2	6	135030	135035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010280	GTC	2	6	135042	135047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010280	AGG	2	6	135154	135159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010280	CAT	2	6	135390	135395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010280	TGA	2	6	135461	135466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010280	CCT	2	6	135518	135523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_010280	TGT	2	6	135610	135615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010280	GTG	2	6	135626	135631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010280	AAT	2	6	135676	135681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010280	ATA	3	9	135706	135714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010280	TAA	2	6	135782	135787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010280	TGG	2	6	135795	135800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010280	GAA	2	6	135821	135826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010280	GCG	2	6	136018	136023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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