MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 3 str. JL03 chromosome

Total Repeats: 975

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010278	CTCGTC	2	12	1293	1304	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	165975458
2	NC_010278	TAATTT	2	12	2734	2745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975460
3	NC_010278	TTTTCG	2	12	3430	3441	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	165975460
4	NC_010278	ACCGCC	2	12	3834	3845	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	165975461
5	NC_010278	ATGATC	2	12	4296	4307	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	165975461
6	NC_010278	GGTGCG	2	12	5057	5068	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	165975462
7	NC_010278	AAAGCG	2	12	8531	8542	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	165975466
8	NC_010278	TGGCGA	2	12	12460	12471	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	165975470
9	NC_010278	TACGGT	2	12	12888	12899	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	165975470
10	NC_010278	AAGGCG	2	12	13069	13080	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	165975470
11	NC_010278	CACCGA	2	12	13340	13351	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	165975470
12	NC_010278	ATTTAG	2	12	16306	16317	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	165975472
13	NC_010278	ATAAAG	2	12	17813	17824	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	165975474
14	NC_010278	ATGAAT	2	12	18251	18262	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	165975474
15	NC_010278	TATCGG	2	12	21620	21631	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	165975477
16	NC_010278	TTGCGG	2	12	21913	21924	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	165975477
17	NC_010278	CTTACA	2	12	22094	22105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165975477
18	NC_010278	TTCCGT	2	12	24582	24593	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	165975479
19	NC_010278	CAAGCG	2	12	25277	25288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165975480
20	NC_010278	TTCAGG	2	12	29288	29299	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	165975483
21	NC_010278	TAAACT	2	12	31597	31608	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	165975484
22	NC_010278	CCCATT	2	12	31948	31959	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	165975485
23	NC_010278	TTTCCA	2	12	36674	36685	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	165975488
24	NC_010278	GTATCG	2	12	38596	38607	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	165975491
25	NC_010278	CTTCCG	2	12	50416	50427	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	165975502
26	NC_010278	TCATAT	2	12	52602	52613	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	165975504
27	NC_010278	AGCAAA	2	12	52766	52777	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	165975504
28	NC_010278	ATTTGG	2	12	52934	52945	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	165975504
29	NC_010278	TCCGCA	2	12	54134	54145	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	165975505
30	NC_010278	TTAGCA	2	12	55303	55314	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	165975507
31	NC_010278	GGCGTA	2	12	55366	55377	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	165975507
32	NC_010278	GGTTAC	2	12	55660	55671	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	165975507
33	NC_010278	ATCGGT	2	12	58039	58050	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	165975510
34	NC_010278	AACGGT	2	12	58083	58094	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	165975510
35	NC_010278	TTTAAT	2	12	59668	59679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010278	AACCGT	2	12	60074	60085	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	165975512
37	NC_010278	TCCGGA	2	12	62495	62506	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	165975515
38	NC_010278	AGATAA	2	12	62725	62736	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010278	GTTTAC	2	12	64724	64735	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	165975517
40	NC_010278	CGAAGG	2	12	68647	68658	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_010278	TGAAAT	2	12	72032	72043	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010278	GCGAAA	2	12	73207	73218	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_010278	CCTTAT	2	12	73314	73325	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010278	GAAAGC	2	12	74639	74650	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	165975520
45	NC_010278	AAAGCC	2	12	76408	76419	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	165975521
46	NC_010278	TTTAAT	2	12	77522	77533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975522
47	NC_010278	ATTGCG	2	12	78641	78652	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	165975523
48	NC_010278	TGCCGG	2	12	78739	78750	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	165975523
49	NC_010278	TTACCG	2	12	85590	85601	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	165975533
50	NC_010278	TTTTTC	2	12	85988	85999	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	165975533
51	NC_010278	GGTTTT	2	12	86022	86033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165975533
52	NC_010278	TCGACT	2	12	86121	86132	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	165975533
53	NC_010278	TCCGGC	2	12	86136	86147	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	165975533
54	NC_010278	GCGTTA	2	12	88491	88502	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	165975537
55	NC_010278	CTGCGA	2	12	89019	89030	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	165975538
56	NC_010278	AAAGGC	2	12	91379	91390	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	165975541
57	NC_010278	CGGTTG	2	12	91437	91448	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	165975541
58	NC_010278	TGTTTT	2	12	93392	93403	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010278	TTTTTC	2	12	94257	94268	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	165975545
60	NC_010278	TCGCTT	2	12	94487	94498	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	165975545
61	NC_010278	ACCGAT	2	12	100012	100023	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	165975553
62	NC_010278	TAAATG	2	12	100213	100224	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	165975553
63	NC_010278	AAATCC	2	12	103492	103503	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	165975556
64	NC_010278	CAATAT	3	18	103628	103645	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	165975556
65	NC_010278	GTAGAT	2	12	105644	105655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975557
66	NC_010278	AGTAAA	2	12	109095	109106	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010278	CTATTG	2	12	109729	109740	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_010278	ATACTA	2	12	109909	109920	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_010278	CTGCTA	2	12	110239	110250	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010278	CGATTG	2	12	110785	110796	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_010278	GTTAGC	2	12	111462	111473	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_010278	AAAGTG	2	12	113146	113157	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010278	TGTAAA	2	12	113954	113965	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010278	CAAATG	3	18	114275	114292	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_010278	TGCGAT	2	12	114468	114479	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_010278	GTGAAT	2	12	115828	115839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010278	ATACGG	2	12	116327	116338	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_010278	GACGGT	2	12	119086	119097	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_010278	AAAACC	2	12	119251	119262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010278	AATTGC	2	12	121691	121702	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	165975561
81	NC_010278	CGCAAT	2	12	123085	123096	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	165975562
82	NC_010278	AAACCG	2	12	123548	123559	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	165975562
83	NC_010278	GTTTCC	2	12	126260	126271	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	165975562
84	NC_010278	TTGCCG	2	12	126459	126470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010278	TCCGGA	2	12	131600	131611	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	165975568
86	NC_010278	CAGAAA	2	12	134988	134999	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	165975572
87	NC_010278	AGCAAA	2	12	140239	140250	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	165975577
88	NC_010278	CGGCAA	2	12	140271	140282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165975577
89	NC_010278	CTGTTG	2	12	142572	142583	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	165975580
90	NC_010278	ATATGG	2	12	143614	143625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975582
91	NC_010278	CGGTAA	2	12	150869	150880	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	165975590
92	NC_010278	TTACCG	2	12	151355	151366	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	165975591
93	NC_010278	CGTCAC	2	12	153865	153876	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	165975592
94	NC_010278	AACCCG	2	12	155638	155649	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	165975595
95	NC_010278	GTAACA	2	12	158369	158380	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	165975597
96	NC_010278	GCATTA	2	12	158744	158755	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	165975597
97	NC_010278	GATTGC	2	12	160352	160363	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	165975598
98	NC_010278	TATCGA	2	12	166921	166932	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	165975604
99	NC_010278	GCGATT	2	12	169228	169239	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_010278	TGCGTA	2	12	172914	172925	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	165975609
101	NC_010278	CTTATT	2	12	173178	173189	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	165975609
102	NC_010278	TAATTT	2	12	175241	175252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010278	TAAGTG	2	12	175782	175793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975612
104	NC_010278	TTATTT	2	12	184597	184608	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010278	GATTGC	2	12	185242	185253	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	165975622
106	NC_010278	AAAAAG	2	12	187240	187251	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	165975623
107	NC_010278	CGGAAG	2	12	188035	188046	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	165975623
108	NC_010278	AGCGAA	2	12	188084	188095	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	165975623
109	NC_010278	AATTTA	2	12	188740	188751	50 %	50 %	0 %	0 %	165975624
110	NC_010278	TTTCTT	2	12	192594	192605	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	165975629
111	NC_010278	GCGGAA	2	12	193879	193890	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	165975630
112	NC_010278	ACCGTG	2	12	195040	195051	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	165975631
113	NC_010278	TTTGCG	2	12	198180	198191	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	165975635
114	NC_010278	TCGCTT	2	12	198417	198428	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	165975635
115	NC_010278	ATCGTG	2	12	201237	201248	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_010278	CGAAAG	2	12	201495	201506	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	165975637
117	NC_010278	ATTGAT	2	12	202139	202150	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	165975638
118	NC_010278	TTATTT	2	12	210062	210073	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010278	AGCTGA	2	12	210144	210155	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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