MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 3 str. JL03 chromosome

Total Repeats: 6315

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010278	ACTC	2	8	250	257	25 %	25 %	0 %	50 %	165975458
2	NC_010278	CCAA	2	8	516	523	50 %	0 %	0 %	50 %	165975458
3	NC_010278	CGGT	2	8	633	640	0 %	25 %	50 %	25 %	165975458
4	NC_010278	CGCT	2	8	761	768	0 %	25 %	25 %	50 %	165975458
5	NC_010278	GTTA	2	8	1796	1803	25 %	50 %	25 %	0 %	165975459
6	NC_010278	TGAT	2	8	1918	1925	25 %	50 %	25 %	0 %	165975459
7	NC_010278	ACGG	2	8	2019	2026	25 %	0 %	50 %	25 %	165975459
8	NC_010278	GTGA	2	8	2130	2137	25 %	25 %	50 %	0 %	165975459
9	NC_010278	TGCG	2	8	2308	2315	0 %	25 %	50 %	25 %	165975459
10	NC_010278	GCGT	2	8	2344	2351	0 %	25 %	50 %	25 %	165975459
11	NC_010278	CGGT	2	8	2809	2816	0 %	25 %	50 %	25 %	165975460
12	NC_010278	GGTC	2	8	2907	2914	0 %	25 %	50 %	25 %	165975460
13	NC_010278	TGCG	2	8	3237	3244	0 %	25 %	50 %	25 %	165975460
14	NC_010278	TAAA	2	8	3742	3749	75 %	25 %	0 %	0 %	165975460
15	NC_010278	ATTT	2	8	3789	3796	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010278	TTTC	2	8	4094	4101	0 %	75 %	0 %	25 %	165975461
17	NC_010278	AAAT	2	8	4514	4521	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010278	ACGA	2	8	4793	4800	50 %	0 %	25 %	25 %	165975462
19	NC_010278	CCGA	2	8	5201	5208	25 %	0 %	25 %	50 %	165975462
20	NC_010278	CGGT	2	8	5547	5554	0 %	25 %	50 %	25 %	165975462
21	NC_010278	ATTA	2	8	5677	5684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010278	TTAT	2	8	5735	5742	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010278	CGTT	2	8	6102	6109	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_010278	GATT	2	8	6120	6127	25 %	50 %	25 %	0 %	165975464
25	NC_010278	GTTT	2	8	6495	6502	0 %	75 %	25 %	0 %	165975464
26	NC_010278	TTTA	2	8	6737	6744	25 %	75 %	0 %	0 %	165975464
27	NC_010278	TCAA	2	8	6984	6991	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010278	AGCG	2	8	7409	7416	25 %	0 %	50 %	25 %	165975465
29	NC_010278	TTGG	2	8	7665	7672	0 %	50 %	50 %	0 %	165975465
30	NC_010278	TTGG	2	8	7976	7983	0 %	50 %	50 %	0 %	165975465
31	NC_010278	AATT	2	8	8053	8060	50 %	50 %	0 %	0 %	165975465
32	NC_010278	GAAA	2	8	8293	8300	75 %	0 %	25 %	0 %	165975466
33	NC_010278	GTTT	2	8	8598	8605	0 %	75 %	25 %	0 %	165975466
34	NC_010278	CAAA	2	8	9022	9029	75 %	0 %	0 %	25 %	165975466
35	NC_010278	CCGC	2	8	9088	9095	0 %	0 %	25 %	75 %	165975466
36	NC_010278	AAGC	2	8	9353	9360	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010278	CAAA	2	8	9422	9429	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010278	GCAC	2	8	9877	9884	25 %	0 %	25 %	50 %	165975467
39	NC_010278	TAAA	2	8	9918	9925	75 %	25 %	0 %	0 %	165975467
40	NC_010278	CTTT	2	8	10025	10032	0 %	75 %	0 %	25 %	165975467
41	NC_010278	ATAA	2	8	10038	10045	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010278	TGGC	2	8	10479	10486	0 %	25 %	50 %	25 %	165975468
43	NC_010278	CTCG	2	8	10675	10682	0 %	25 %	25 %	50 %	165975468
44	NC_010278	TAAA	2	8	10888	10895	75 %	25 %	0 %	0 %	165975468
45	NC_010278	GTTG	2	8	12431	12438	0 %	50 %	50 %	0 %	165975470
46	NC_010278	GTTT	2	8	14118	14125	0 %	75 %	25 %	0 %	165975471
47	NC_010278	AATT	2	8	14415	14422	50 %	50 %	0 %	0 %	165975471
48	NC_010278	CTTT	2	8	14928	14935	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_010278	AAAG	2	8	14944	14951	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010278	AAAG	2	8	14957	14964	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010278	GCAA	2	8	15033	15040	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010278	AATA	2	8	15108	15115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010278	AGAT	2	8	15122	15129	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010278	GCAA	2	8	15746	15753	50 %	0 %	25 %	25 %	165975472
55	NC_010278	CTTA	2	8	15985	15992	25 %	50 %	0 %	25 %	165975472
56	NC_010278	TCGC	2	8	16029	16036	0 %	25 %	25 %	50 %	165975472
57	NC_010278	CGGT	2	8	16042	16049	0 %	25 %	50 %	25 %	165975472
58	NC_010278	ATTG	2	8	16139	16146	25 %	50 %	25 %	0 %	165975472
59	NC_010278	CTTT	2	8	16506	16513	0 %	75 %	0 %	25 %	165975472
60	NC_010278	GGTT	2	8	16963	16970	0 %	50 %	50 %	0 %	165975473
61	NC_010278	ACGG	2	8	17213	17220	25 %	0 %	50 %	25 %	165975473
62	NC_010278	AAGC	2	8	17884	17891	50 %	0 %	25 %	25 %	165975474
63	NC_010278	GACT	2	8	18449	18456	25 %	25 %	25 %	25 %	165975474
64	NC_010278	GCGT	2	8	18728	18735	0 %	25 %	50 %	25 %	165975474
65	NC_010278	CCGC	2	8	18984	18991	0 %	0 %	25 %	75 %	165975474
66	NC_010278	CCGA	2	8	19352	19359	25 %	0 %	25 %	50 %	165975475
67	NC_010278	TACG	2	8	19535	19542	25 %	25 %	25 %	25 %	165975475
68	NC_010278	CCAA	2	8	20147	20154	50 %	0 %	0 %	50 %	165975475
69	NC_010278	CTTT	2	8	20338	20345	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_010278	GTGC	2	8	21831	21838	0 %	25 %	50 %	25 %	165975477
71	NC_010278	GTCG	2	8	22275	22282	0 %	25 %	50 %	25 %	165975477
72	NC_010278	GTTG	2	8	22574	22581	0 %	50 %	50 %	0 %	165975477
73	NC_010278	CCGA	2	8	22599	22606	25 %	0 %	25 %	50 %	165975477
74	NC_010278	AAAC	2	8	22646	22653	75 %	0 %	0 %	25 %	165975477
75	NC_010278	ATTT	2	8	22699	22706	25 %	75 %	0 %	0 %	165975477
76	NC_010278	GTCC	2	8	24030	24037	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_010278	ATTA	2	8	24090	24097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010278	GTTG	2	8	24158	24165	0 %	50 %	50 %	0 %	165975479
79	NC_010278	ATTG	2	8	24381	24388	25 %	50 %	25 %	0 %	165975479
80	NC_010278	ATCG	2	8	24673	24680	25 %	25 %	25 %	25 %	165975479
81	NC_010278	GGAA	2	8	24714	24721	50 %	0 %	50 %	0 %	165975479
82	NC_010278	CGGT	2	8	25251	25258	0 %	25 %	50 %	25 %	165975480
83	NC_010278	GAGC	2	8	25340	25347	25 %	0 %	50 %	25 %	165975480
84	NC_010278	AATT	2	8	25797	25804	50 %	50 %	0 %	0 %	165975480
85	NC_010278	ATTA	2	8	26625	26632	50 %	50 %	0 %	0 %	165975481
86	NC_010278	AGTA	2	8	26931	26938	50 %	25 %	25 %	0 %	165975481
87	NC_010278	TATT	2	8	27713	27720	25 %	75 %	0 %	0 %	165975482
88	NC_010278	TCAA	2	8	27982	27989	50 %	25 %	0 %	25 %	165975482
89	NC_010278	TGAA	2	8	28050	28057	50 %	25 %	25 %	0 %	165975482
90	NC_010278	TTAT	2	8	28118	28125	25 %	75 %	0 %	0 %	165975482
91	NC_010278	TGAA	2	8	28517	28524	50 %	25 %	25 %	0 %	165975483
92	NC_010278	TTAT	2	8	28686	28693	25 %	75 %	0 %	0 %	165975483
93	NC_010278	GTGA	2	8	29314	29321	25 %	25 %	50 %	0 %	165975483
94	NC_010278	GCTG	2	8	29541	29548	0 %	25 %	50 %	25 %	165975483
95	NC_010278	AAAT	2	8	29808	29815	75 %	25 %	0 %	0 %	165975483
96	NC_010278	TGCT	2	8	30092	30099	0 %	50 %	25 %	25 %	165975483
97	NC_010278	AAAC	2	8	30276	30283	75 %	0 %	0 %	25 %	165975484
98	NC_010278	TCAA	2	8	30317	30324	50 %	25 %	0 %	25 %	165975484
99	NC_010278	ATTG	2	8	30372	30379	25 %	50 %	25 %	0 %	165975484
100	NC_010278	CGGT	2	8	30633	30640	0 %	25 %	50 %	25 %	165975484
101	NC_010278	GCAA	2	8	30983	30990	50 %	0 %	25 %	25 %	165975484
102	NC_010278	CGTG	2	8	31074	31081	0 %	25 %	50 %	25 %	165975484
103	NC_010278	GCTT	2	8	31495	31502	0 %	50 %	25 %	25 %	165975484
104	NC_010278	CCAC	2	8	32030	32037	25 %	0 %	0 %	75 %	165975485
105	NC_010278	AGCA	2	8	32277	32284	50 %	0 %	25 %	25 %	165975485
106	NC_010278	AGCA	2	8	32334	32341	50 %	0 %	25 %	25 %	165975485
107	NC_010278	GCAG	2	8	32907	32914	25 %	0 %	50 %	25 %	165975486
108	NC_010278	CCGA	2	8	33354	33361	25 %	0 %	25 %	50 %	165975486
109	NC_010278	GTTT	2	8	33648	33655	0 %	75 %	25 %	0 %	165975487
110	NC_010278	TTTG	2	8	34051	34058	0 %	75 %	25 %	0 %	165975487
111	NC_010278	CATC	2	8	34240	34247	25 %	25 %	0 %	50 %	165975487
112	NC_010278	ACGA	2	8	34599	34606	50 %	0 %	25 %	25 %	165975487
113	NC_010278	CTTT	2	8	34980	34987	0 %	75 %	0 %	25 %	165975487
114	NC_010278	ACCG	2	8	35538	35545	25 %	0 %	25 %	50 %	165975488
115	NC_010278	ACGG	2	8	35573	35580	25 %	0 %	50 %	25 %	165975488
116	NC_010278	TACG	2	8	35858	35865	25 %	25 %	25 %	25 %	165975488
117	NC_010278	CGTA	2	8	36000	36007	25 %	25 %	25 %	25 %	165975488
118	NC_010278	GACG	2	8	36642	36649	25 %	0 %	50 %	25 %	165975488
119	NC_010278	ATTT	2	8	36991	36998	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010278	ATTT	2	8	37102	37109	25 %	75 %	0 %	0 %	165975489
121	NC_010278	TATT	2	8	37307	37314	25 %	75 %	0 %	0 %	165975489
122	NC_010278	ATTT	2	8	37421	37428	25 %	75 %	0 %	0 %	165975489
123	NC_010278	GCAA	2	8	37485	37492	50 %	0 %	25 %	25 %	165975489
124	NC_010278	GGTT	2	8	37620	37627	0 %	50 %	50 %	0 %	165975490
125	NC_010278	TAAT	2	8	37633	37640	50 %	50 %	0 %	0 %	165975490
126	NC_010278	AGAA	2	8	37873	37880	75 %	0 %	25 %	0 %	165975490
127	NC_010278	TTTA	2	8	37970	37977	25 %	75 %	0 %	0 %	165975490
128	NC_010278	CGGT	2	8	38416	38423	0 %	25 %	50 %	25 %	165975491
129	NC_010278	ATTT	2	8	38837	38844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010278	TGAA	2	8	39508	39515	50 %	25 %	25 %	0 %	165975492
131	NC_010278	ACTT	2	8	39726	39733	25 %	50 %	0 %	25 %	165975492
132	NC_010278	GTGC	2	8	39753	39760	0 %	25 %	50 %	25 %	165975492
133	NC_010278	TATT	2	8	40077	40084	25 %	75 %	0 %	0 %	165975493
134	NC_010278	CAAA	2	8	40244	40251	75 %	0 %	0 %	25 %	165975493
135	NC_010278	TATG	2	8	40812	40819	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010278	ACCG	2	8	41034	41041	25 %	0 %	25 %	50 %	165975495
137	NC_010278	TAAA	2	8	41273	41280	75 %	25 %	0 %	0 %	165975495
138	NC_010278	TGAA	2	8	41348	41355	50 %	25 %	25 %	0 %	165975496
139	NC_010278	CTGA	2	8	41471	41478	25 %	25 %	25 %	25 %	165975496
140	NC_010278	CCGT	2	8	41699	41706	0 %	25 %	25 %	50 %	165975496
141	NC_010278	CTTT	2	8	41715	41722	0 %	75 %	0 %	25 %	165975496
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