MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 2884

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010263	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	165932550
2	NC_010263	TC	3	6	1521	1526	0 %	50 %	0 %	50 %	165932552
3	NC_010263	AT	3	6	1646	1651	50 %	50 %	0 %	0 %	165932552
4	NC_010263	TA	3	6	1764	1769	50 %	50 %	0 %	0 %	165932552
5	NC_010263	GA	3	6	2332	2337	50 %	0 %	50 %	0 %	165932553
6	NC_010263	TA	3	6	2496	2501	50 %	50 %	0 %	0 %	165932553
7	NC_010263	TG	3	6	2612	2617	0 %	50 %	50 %	0 %	165932553
8	NC_010263	AT	3	6	2756	2761	50 %	50 %	0 %	0 %	165932553
9	NC_010263	TC	3	6	3069	3074	0 %	50 %	0 %	50 %	165932554
10	NC_010263	TG	3	6	3437	3442	0 %	50 %	50 %	0 %	165932554
11	NC_010263	GA	3	6	3544	3549	50 %	0 %	50 %	0 %	165932554
12	NC_010263	AT	3	6	4006	4011	50 %	50 %	0 %	0 %	165932554
13	NC_010263	AT	3	6	4316	4321	50 %	50 %	0 %	0 %	165932554
14	NC_010263	AG	3	6	4335	4340	50 %	0 %	50 %	0 %	165932554
15	NC_010263	TA	3	6	4423	4428	50 %	50 %	0 %	0 %	165932554
16	NC_010263	TA	3	6	4675	4680	50 %	50 %	0 %	0 %	165932554
17	NC_010263	AT	3	6	4867	4872	50 %	50 %	0 %	0 %	165932554
18	NC_010263	AT	3	6	5901	5906	50 %	50 %	0 %	0 %	165932554
19	NC_010263	TA	3	6	6247	6252	50 %	50 %	0 %	0 %	165932555
20	NC_010263	TA	3	6	8519	8524	50 %	50 %	0 %	0 %	165932558
21	NC_010263	TA	3	6	8947	8952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010263	GT	3	6	9627	9632	0 %	50 %	50 %	0 %	165932560
23	NC_010263	TA	3	6	9728	9733	50 %	50 %	0 %	0 %	165932560
24	NC_010263	TA	3	6	11523	11528	50 %	50 %	0 %	0 %	165932564
25	NC_010263	AC	3	6	12239	12244	50 %	0 %	0 %	50 %	165932566
26	NC_010263	TA	3	6	12276	12281	50 %	50 %	0 %	0 %	165932566
27	NC_010263	TA	3	6	12542	12547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010263	TA	3	6	14117	14122	50 %	50 %	0 %	0 %	165932568
29	NC_010263	AG	3	6	14891	14896	50 %	0 %	50 %	0 %	165932569
30	NC_010263	AT	3	6	15304	15309	50 %	50 %	0 %	0 %	165932570
31	NC_010263	AT	3	6	15718	15723	50 %	50 %	0 %	0 %	165932571
32	NC_010263	TA	3	6	15746	15751	50 %	50 %	0 %	0 %	165932571
33	NC_010263	AT	3	6	17219	17224	50 %	50 %	0 %	0 %	165932572
34	NC_010263	TG	3	6	17758	17763	0 %	50 %	50 %	0 %	165932572
35	NC_010263	AT	3	6	18969	18974	50 %	50 %	0 %	0 %	165932574
36	NC_010263	TA	3	6	19600	19605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010263	AT	3	6	19830	19835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010263	AT	3	6	20115	20120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010263	AG	3	6	22720	22725	50 %	0 %	50 %	0 %	165932577
40	NC_010263	CA	3	6	22752	22757	50 %	0 %	0 %	50 %	165932577
41	NC_010263	TC	3	6	23035	23040	0 %	50 %	0 %	50 %	165932577
42	NC_010263	TA	3	6	23278	23283	50 %	50 %	0 %	0 %	165932577
43	NC_010263	TA	3	6	23414	23419	50 %	50 %	0 %	0 %	165932577
44	NC_010263	AT	3	6	23457	23462	50 %	50 %	0 %	0 %	165932577
45	NC_010263	TA	3	6	24141	24146	50 %	50 %	0 %	0 %	165932577
46	NC_010263	TA	3	6	24240	24245	50 %	50 %	0 %	0 %	165932577
47	NC_010263	TA	3	6	25405	25410	50 %	50 %	0 %	0 %	165932577
48	NC_010263	AT	3	6	25462	25467	50 %	50 %	0 %	0 %	165932577
49	NC_010263	TA	3	6	25818	25823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010263	AT	3	6	26672	26677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010263	AG	3	6	27070	27075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010263	AT	3	6	28015	28020	50 %	50 %	0 %	0 %	165932580
53	NC_010263	AT	4	8	28239	28246	50 %	50 %	0 %	0 %	165932581
54	NC_010263	CT	3	6	28332	28337	0 %	50 %	0 %	50 %	165932581
55	NC_010263	AT	4	8	28587	28594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010263	GT	3	6	29013	29018	0 %	50 %	50 %	0 %	165932582
57	NC_010263	AG	3	6	29816	29821	50 %	0 %	50 %	0 %	165932584
58	NC_010263	AT	3	6	29826	29831	50 %	50 %	0 %	0 %	165932584
59	NC_010263	AT	3	6	31637	31642	50 %	50 %	0 %	0 %	165932587
60	NC_010263	TG	3	6	31812	31817	0 %	50 %	50 %	0 %	165932587
61	NC_010263	AT	3	6	32447	32452	50 %	50 %	0 %	0 %	165932588
62	NC_010263	AT	3	6	33177	33182	50 %	50 %	0 %	0 %	165932589
63	NC_010263	AT	3	6	33735	33740	50 %	50 %	0 %	0 %	165932589
64	NC_010263	AT	3	6	33884	33889	50 %	50 %	0 %	0 %	165932589
65	NC_010263	AT	3	6	34635	34640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010263	TC	3	6	35602	35607	0 %	50 %	0 %	50 %	165932591
67	NC_010263	TG	3	6	35724	35729	0 %	50 %	50 %	0 %	165932591
68	NC_010263	GT	3	6	36452	36457	0 %	50 %	50 %	0 %	165932593
69	NC_010263	AT	3	6	37465	37470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010263	AT	3	6	37475	37480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010263	TA	3	6	37582	37587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010263	AG	3	6	38020	38025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010263	AT	3	6	38674	38679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010263	GA	3	6	38807	38812	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010263	AT	3	6	40138	40143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010263	AT	3	6	40290	40295	50 %	50 %	0 %	0 %	165932598
77	NC_010263	TA	3	6	40497	40502	50 %	50 %	0 %	0 %	165932598
78	NC_010263	AT	3	6	40621	40626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010263	TA	5	10	40875	40884	50 %	50 %	0 %	0 %	165932599
80	NC_010263	TA	3	6	41327	41332	50 %	50 %	0 %	0 %	165932600
81	NC_010263	AT	3	6	41396	41401	50 %	50 %	0 %	0 %	165932600
82	NC_010263	AT	3	6	42541	42546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010263	AT	3	6	43547	43552	50 %	50 %	0 %	0 %	165932606
84	NC_010263	GT	3	6	43662	43667	0 %	50 %	50 %	0 %	165932606
85	NC_010263	TA	3	6	43787	43792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010263	AT	3	6	43793	43798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010263	AT	3	6	43977	43982	50 %	50 %	0 %	0 %	165932607
88	NC_010263	AT	3	6	44001	44006	50 %	50 %	0 %	0 %	165932607
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90	NC_010263	AT	3	6	46699	46704	50 %	50 %	0 %	0 %	165932611
91	NC_010263	AT	3	6	46895	46900	50 %	50 %	0 %	0 %	165932611
92	NC_010263	TA	4	8	46968	46975	50 %	50 %	0 %	0 %	165932611
93	NC_010263	TC	3	6	47204	47209	0 %	50 %	0 %	50 %	165932611
94	NC_010263	AT	3	6	47851	47856	50 %	50 %	0 %	0 %	165932611
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99	NC_010263	TA	3	6	49560	49565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010263	AT	3	6	49711	49716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010263	TA	3	6	50007	50012	50 %	50 %	0 %	0 %	165932615
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103	NC_010263	AT	3	6	51093	51098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010263	TA	3	6	51965	51970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010263	AT	3	6	52549	52554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010263	AT	3	6	53527	53532	50 %	50 %	0 %	0 %	165932618
107	NC_010263	AT	3	6	54466	54471	50 %	50 %	0 %	0 %	165932618
108	NC_010263	AT	3	6	55651	55656	50 %	50 %	0 %	0 %	165932619
109	NC_010263	GA	3	6	56022	56027	50 %	0 %	50 %	0 %	165932620
110	NC_010263	AT	3	6	58421	58426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010263	CT	3	6	58599	58604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_010263	CT	4	8	59060	59067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_010263	TA	3	6	59333	59338	50 %	50 %	0 %	0 %	165932623
114	NC_010263	AT	3	6	60343	60348	50 %	50 %	0 %	0 %	165932625
115	NC_010263	AT	3	6	61190	61195	50 %	50 %	0 %	0 %	165932627
116	NC_010263	TA	3	6	61331	61336	50 %	50 %	0 %	0 %	165932627
117	NC_010263	AG	3	6	61495	61500	50 %	0 %	50 %	0 %	165932627
118	NC_010263	TA	3	6	61935	61940	50 %	50 %	0 %	0 %	165932627
119	NC_010263	AT	3	6	62198	62203	50 %	50 %	0 %	0 %	165932627
120	NC_010263	CT	3	6	62343	62348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_010263	TA	3	6	64604	64609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010263	AT	4	8	64667	64674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010263	AG	3	6	65069	65074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010263	AG	3	6	65128	65133	50 %	0 %	50 %	0 %	165932630
125	NC_010263	GT	3	6	65861	65866	0 %	50 %	50 %	0 %	165932630
126	NC_010263	CT	3	6	66636	66641	0 %	50 %	0 %	50 %	165932633
127	NC_010263	AT	3	6	67156	67161	50 %	50 %	0 %	0 %	165932633
128	NC_010263	CT	3	6	67446	67451	0 %	50 %	0 %	50 %	165932633
129	NC_010263	TA	3	6	68182	68187	50 %	50 %	0 %	0 %	165932634
130	NC_010263	TA	3	6	68950	68955	50 %	50 %	0 %	0 %	165932636
131	NC_010263	AT	4	8	69116	69123	50 %	50 %	0 %	0 %	165932636
132	NC_010263	AG	3	6	69427	69432	50 %	0 %	50 %	0 %	165932636
133	NC_010263	TA	3	6	69504	69509	50 %	50 %	0 %	0 %	165932636
134	NC_010263	TA	3	6	69583	69588	50 %	50 %	0 %	0 %	165932636
135	NC_010263	AT	4	8	69687	69694	50 %	50 %	0 %	0 %	165932636
136	NC_010263	AT	3	6	69815	69820	50 %	50 %	0 %	0 %	165932636
137	NC_010263	AT	3	6	70621	70626	50 %	50 %	0 %	0 %	165932637
138	NC_010263	AT	3	6	70647	70652	50 %	50 %	0 %	0 %	165932637
139	NC_010263	TA	3	6	71027	71032	50 %	50 %	0 %	0 %	165932637
140	NC_010263	TA	3	6	71259	71264	50 %	50 %	0 %	0 %	165932637
141	NC_010263	AT	3	6	71624	71629	50 %	50 %	0 %	0 %	165932637
142	NC_010263	AT	3	6	72266	72271	50 %	50 %	0 %	0 %	165932639
143	NC_010263	TA	3	6	73127	73132	50 %	50 %	0 %	0 %	165932640
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145	NC_010263	TC	3	6	74149	74154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_010263	GT	3	6	74454	74459	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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