MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus weihenstephanensis KBAB4 chromosome

Total Repeats: 359

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010184	CTATTA	2	12	1556	1567	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_010184	ATTTTT	2	12	8988	8999	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010184	TTTCGT	2	12	10617	10628	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_010184	ATGAAG	2	12	28267	28278	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010184	ATTTTT	2	12	28822	28833	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010184	TTTCGT	2	12	30451	30462	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_010184	CTTTTT	2	12	74289	74300	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010184	ATTTTT	2	12	82249	82260	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010184	ATTTTT	2	12	87961	87972	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010184	AGTCAA	2	12	92963	92974	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_010184	TGACAT	2	12	109271	109282	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_010184	ATTTTT	2	12	151066	151077	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010184	GTATGT	2	12	175578	175589	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010184	TGCGCA	2	12	183494	183505	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010184	ACAAGT	2	12	183821	183832	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_010184	TGGGTG	2	12	193669	193680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010184	TAAAAA	2	12	195812	195823	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010184	AAAATA	2	12	209591	209602	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010184	AAGGGG	2	12	209673	209684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010184	AGAGGT	2	12	212997	213008	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010184	TTTCAT	2	12	229414	229425	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_010184	ATTTTT	2	12	247769	247780	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010184	ATTTTT	2	12	268334	268345	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010184	ATTTTT	2	12	275595	275606	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010184	ATTTTT	2	12	288886	288897	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010184	ATTTTT	2	12	299750	299761	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010184	TTTATT	2	12	304603	304614	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010184	ATTTTT	2	12	307014	307025	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010184	TTTATT	2	12	311867	311878	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010184	AATAGA	2	12	359889	359900	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010184	ATTTGA	2	12	361520	361531	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010184	ATAATT	2	12	388117	388128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010184	TTCTTT	2	12	424058	424069	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_010184	AAAAAT	2	12	431631	431642	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010184	TGTTTT	2	12	451046	451057	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010184	ATTTTT	2	12	456890	456901	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010184	GTTTCA	2	12	470489	470500	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_010184	TTTTCT	2	12	478721	478732	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_010184	AAAGTG	2	12	514281	514292	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010184	ATTTTT	2	12	515915	515926	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010184	ATTTTT	2	12	521894	521905	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010184	ATCATT	2	12	536150	536161	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_010184	AAGATA	2	12	547317	547328	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010184	CTTTTT	2	12	650752	650763	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_010184	ACTTAA	2	12	701058	701069	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_010184	CTTTTT	2	12	711581	711592	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_010184	TAGTTT	2	12	720969	720980	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010184	ACTTAA	2	12	721333	721344	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_010184	ATTTTT	2	12	728294	728305	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010184	ATCAAT	2	12	772587	772598	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_010184	AAATAT	2	12	779326	779337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010184	ACTTTT	2	12	794739	794750	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_010184	GGAGAA	2	12	797516	797527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010184	ATGTAA	2	12	802813	802824	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010184	AAATGT	2	12	843612	843623	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010184	GTTTTT	2	12	849247	849258	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010184	TGTATA	2	12	862781	862792	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010184	TTTATT	2	12	890209	890220	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010184	AGATAA	2	12	903809	903820	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010184	TTAATT	2	12	905029	905040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010184	TGAATT	2	12	923021	923032	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010184	TATTTT	2	12	923211	923222	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010184	CCCTAT	2	12	933549	933560	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010184	AATTCC	2	12	942402	942413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010184	TTTGTA	2	12	952357	952368	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010184	TATTTA	2	12	953922	953933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010184	ATTAAG	2	12	963205	963216	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010184	ATGATT	2	12	973958	973969	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010184	AAATGC	2	12	976493	976504	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_010184	ATCAAA	2	12	984082	984093	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_010184	TACTTT	2	12	993513	993524	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_010184	TCTTTT	2	12	1023156	1023167	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_010184	AAATTT	2	12	1038253	1038264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010184	TAATAT	2	12	1082419	1082430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010184	TCCATT	2	12	1083712	1083723	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010184	TAAAAA	2	12	1095005	1095016	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010184	AATAAA	2	12	1095039	1095050	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010184	TTTTCA	2	12	1097341	1097352	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_010184	ATTTTT	2	12	1144681	1144692	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010184	AAATAT	2	12	1170521	1170532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010184	AAGTAT	2	12	1199919	1199930	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010184	TAAAAA	2	12	1202770	1202781	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010184	TTTAAA	2	12	1244191	1244202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010184	AGTGAG	2	12	1246938	1246949	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010184	CATTTC	2	12	1255063	1255074	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010184	GGAGAG	2	12	1263010	1263021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010184	AAATAA	2	12	1266861	1266872	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010184	AAAATT	2	12	1272716	1272727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010184	ATCATT	2	12	1315433	1315444	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_010184	AGGATA	2	12	1321062	1321073	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010184	AAAGGA	2	12	1322665	1322676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010184	GATATA	2	12	1332025	1332036	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010184	TCTTTT	2	12	1338850	1338861	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_010184	AATAAA	2	12	1351781	1351792	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010184	TCAATT	2	12	1362019	1362030	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_010184	AATTGA	2	12	1362044	1362055	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010184	TTTTGT	2	12	1371956	1371967	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010184	ATACAA	2	12	1401010	1401021	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_010184	TTTATT	2	12	1424410	1424421	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010184	ATTTCT	2	12	1428240	1428251	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_010184	TGTCTT	2	12	1434434	1434445	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_010184	TTATCA	2	12	1438759	1438770	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_010184	TTTTAT	2	12	1468118	1468129	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010184	CTTTTT	2	12	1525551	1525562	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_010184	CTTTTT	2	12	1551931	1551942	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_010184	TGTAAT	2	12	1552894	1552905	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010184	GTAATT	2	12	1553174	1553185	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010184	AGTTAC	2	12	1553380	1553391	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_010184	TATTCA	2	12	1553720	1553731	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_010184	TTGTAA	2	12	1558305	1558316	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010184	TTGGAT	2	12	1562478	1562489	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010184	ATTTGC	2	12	1562971	1562982	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_010184	TAGGAT	2	12	1564062	1564073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010184	AGAATT	2	12	1564372	1564383	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010184	GATATA	2	12	1581746	1581757	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010184	ACGAAA	2	12	1594711	1594722	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_010184	CTCATG	2	12	1615943	1615954	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010184	TAGATT	2	12	1620209	1620220	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010184	GTTTTA	2	12	1625334	1625345	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010184	TTTTAG	2	12	1628622	1628633	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010184	GTAAAA	2	12	1630049	1630060	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010184	ATCATT	2	12	1643736	1643747	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_010184	ATGAAT	2	12	1649497	1649508	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010184	AGTAAT	2	12	1649512	1649523	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010184	TTTATT	2	12	1666264	1666275	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010184	TTATAT	2	12	1669124	1669135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010184	TGATAT	2	12	1669830	1669841	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010184	GAAAAA	2	12	1669882	1669893	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010184	ATAATC	2	12	1675548	1675559	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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131	NC_010184	TTATAA	2	12	1709763	1709774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010184	AGTATT	2	12	1727407	1727418	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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254	NC_010184	TCAATG	2	12	3336319	3336330	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
255	NC_010184	TACTAT	2	12	3362705	3362716	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
256	NC_010184	CCTAAT	2	12	3377181	3377192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_010184	TAAAAA	2	12	3382185	3382196	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_010184	TACTTG	2	12	3400308	3400319	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
259	NC_010184	TCTTAT	2	12	3402585	3402596	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
260	NC_010184	AGGGAT	2	12	3413942	3413953	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.