MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bacillus weihenstephanensis KBAB4 plasmid pBWB404

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010183	ATAG	2	8	336	343	50 %	25 %	25 %	0 %	163937942
2	NC_010183	GATA	2	8	1065	1072	50 %	25 %	25 %	0 %	163937943
3	NC_010183	AATG	2	8	2186	2193	50 %	25 %	25 %	0 %	163937944
4	NC_010183	GGGT	2	8	2494	2501	0 %	25 %	75 %	0 %	163937946
5	NC_010183	GATT	2	8	2567	2574	25 %	50 %	25 %	0 %	163937946
6	NC_010183	GTAA	2	8	2593	2600	50 %	25 %	25 %	0 %	163937946
7	NC_010183	CATT	2	8	2854	2861	25 %	50 %	0 %	25 %	163937946
8	NC_010183	CTGG	2	8	3103	3110	0 %	25 %	50 %	25 %	163937946
9	NC_010183	ATTA	2	8	3339	3346	50 %	50 %	0 %	0 %	163937947
10	NC_010183	GTAT	2	8	3437	3444	25 %	50 %	25 %	0 %	163937947
11	NC_010183	GTAA	2	8	3795	3802	50 %	25 %	25 %	0 %	163937947
12	NC_010183	ATTT	2	8	3848	3855	25 %	75 %	0 %	0 %	163937948
13	NC_010183	ATAA	2	8	3945	3952	75 %	25 %	0 %	0 %	163937948
14	NC_010183	TAGT	2	8	4516	4523	25 %	50 %	25 %	0 %	163937949
15	NC_010183	AACA	2	8	4736	4743	75 %	0 %	0 %	25 %	163937949
16	NC_010183	TTTG	2	8	4952	4959	0 %	75 %	25 %	0 %	163937949
17	NC_010183	TAAT	2	8	5104	5111	50 %	50 %	0 %	0 %	163937949
18	NC_010183	CCAA	2	8	5119	5126	50 %	0 %	0 %	50 %	163937949
19	NC_010183	TTGT	2	8	5355	5362	0 %	75 %	25 %	0 %	163937950
20	NC_010183	TTTG	2	8	5464	5471	0 %	75 %	25 %	0 %	163937950
21	NC_010183	TTGT	2	8	5597	5604	0 %	75 %	25 %	0 %	163937950
22	NC_010183	TTTC	2	8	6998	7005	0 %	75 %	0 %	25 %	163937952
23	NC_010183	AAAC	2	8	7726	7733	75 %	0 %	0 %	25 %	163937954
24	NC_010183	CTTC	2	8	7824	7831	0 %	50 %	0 %	50 %	163937954
25	NC_010183	GAAA	2	8	7931	7938	75 %	0 %	25 %	0 %	163937954
26	NC_010183	CAGC	2	8	8142	8149	25 %	0 %	25 %	50 %	163937954
27	NC_010183	TATG	2	8	8326	8333	25 %	50 %	25 %	0 %	163937955
28	NC_010183	ATCA	2	8	8994	9001	50 %	25 %	0 %	25 %	163937957
29	NC_010183	CTTC	2	8	9011	9018	0 %	50 %	0 %	50 %	163937957
30	NC_010183	TCTA	2	8	9246	9253	25 %	50 %	0 %	25 %	163937958
31	NC_010183	ATTG	2	8	9821	9828	25 %	50 %	25 %	0 %	163937958
32	NC_010183	CAAA	2	8	11094	11101	75 %	0 %	0 %	25 %	163937960
33	NC_010183	TGAT	2	8	12281	12288	25 %	50 %	25 %	0 %	163937964
34	NC_010183	ATAA	2	8	12345	12352	75 %	25 %	0 %	0 %	163937964
35	NC_010183	AAGA	2	8	13818	13825	75 %	0 %	25 %	0 %	163937965
36	NC_010183	CAGT	2	8	14180	14187	25 %	25 %	25 %	25 %	163937966
37	NC_010183	ACAG	2	8	14299	14306	50 %	0 %	25 %	25 %	163937966
38	NC_010183	AACA	2	8	14756	14763	75 %	0 %	0 %	25 %	163937968
39	NC_010183	TTTA	2	8	16645	16652	25 %	75 %	0 %	0 %	163937970
40	NC_010183	TATT	2	8	16789	16796	25 %	75 %	0 %	0 %	163937970
41	NC_010183	TTTG	2	8	16971	16978	0 %	75 %	25 %	0 %	163937971
42	NC_010183	GAAG	2	8	17005	17012	50 %	0 %	50 %	0 %	163937971
43	NC_010183	CAGA	2	8	17973	17980	50 %	0 %	25 %	25 %	163937973
44	NC_010183	ACTA	2	8	18207	18214	50 %	25 %	0 %	25 %	163937974
45	NC_010183	GTAA	2	8	19071	19078	50 %	25 %	25 %	0 %	163937975
46	NC_010183	AAAG	2	8	19354	19361	75 %	0 %	25 %	0 %	163937976
47	NC_010183	CAAA	2	8	19789	19796	75 %	0 %	0 %	25 %	163937977
48	NC_010183	TTTA	2	8	20086	20093	25 %	75 %	0 %	0 %	163937977
49	NC_010183	TTAC	2	8	20679	20686	25 %	50 %	0 %	25 %	163937977
50	NC_010183	GAAT	2	8	22472	22479	50 %	25 %	25 %	0 %	163937978
51	NC_010183	AGAA	2	8	23129	23136	75 %	0 %	25 %	0 %	163937979
52	NC_010183	ACTT	2	8	23164	23171	25 %	50 %	0 %	25 %	163937979
53	NC_010183	TGAT	2	8	23562	23569	25 %	50 %	25 %	0 %	163937980
54	NC_010183	CAAG	2	8	24256	24263	50 %	0 %	25 %	25 %	163937980
55	NC_010183	AAAG	2	8	24400	24407	75 %	0 %	25 %	0 %	163937981
56	NC_010183	AAGA	2	8	24495	24502	75 %	0 %	25 %	0 %	163937981
57	NC_010183	TTAA	2	8	24829	24836	50 %	50 %	0 %	0 %	163937982
58	NC_010183	TGAA	2	8	25358	25365	50 %	25 %	25 %	0 %	163937984
59	NC_010183	CCAA	2	8	25674	25681	50 %	0 %	0 %	50 %	163937985
60	NC_010183	TGGA	2	8	25717	25724	25 %	25 %	50 %	0 %	163937985
61	NC_010183	ATGA	2	8	25929	25936	50 %	25 %	25 %	0 %	163937986
62	NC_010183	AACT	2	8	26041	26048	50 %	25 %	0 %	25 %	163937986
63	NC_010183	CGTT	2	8	26559	26566	0 %	50 %	25 %	25 %	163937987
64	NC_010183	AAGT	2	8	26682	26689	50 %	25 %	25 %	0 %	163937987
65	NC_010183	AAGA	2	8	27088	27095	75 %	0 %	25 %	0 %	163937988
66	NC_010183	TAAA	2	8	28014	28021	75 %	25 %	0 %	0 %	163937989
67	NC_010183	AATT	2	8	28104	28111	50 %	50 %	0 %	0 %	163937989
68	NC_010183	TAAT	2	8	29939	29946	50 %	50 %	0 %	0 %	163937990
69	NC_010183	AATT	2	8	29969	29976	50 %	50 %	0 %	0 %	163937990
70	NC_010183	TTGA	2	8	30136	30143	25 %	50 %	25 %	0 %	163937990
71	NC_010183	AATT	2	8	30542	30549	50 %	50 %	0 %	0 %	163937990
72	NC_010183	GAAG	2	8	31072	31079	50 %	0 %	50 %	0 %	163937990
73	NC_010183	ATTT	2	8	31550	31557	25 %	75 %	0 %	0 %	163937991
74	NC_010183	AGAT	2	8	32503	32510	50 %	25 %	25 %	0 %	163937991
75	NC_010183	AAGT	2	8	32862	32869	50 %	25 %	25 %	0 %	163937992
76	NC_010183	CGGT	2	8	33252	33259	0 %	25 %	50 %	25 %	163937992
77	NC_010183	AAAT	2	8	33363	33370	75 %	25 %	0 %	0 %	163937992
78	NC_010183	TTCT	2	8	33777	33784	0 %	75 %	0 %	25 %	163937992
79	NC_010183	CTAA	2	8	33824	33831	50 %	25 %	0 %	25 %	163937992
80	NC_010183	TAAT	2	8	34137	34144	50 %	50 %	0 %	0 %	163937992
81	NC_010183	AAGT	2	8	34188	34195	50 %	25 %	25 %	0 %	163937992
82	NC_010183	CAAG	2	8	34336	34343	50 %	0 %	25 %	25 %	163937992
83	NC_010183	ACGT	2	8	34874	34881	25 %	25 %	25 %	25 %	163937992
84	NC_010183	AGTA	2	8	34951	34958	50 %	25 %	25 %	0 %	163937992
85	NC_010183	TGGA	2	8	35512	35519	25 %	25 %	50 %	0 %	163937992
86	NC_010183	ATCT	2	8	36255	36262	25 %	50 %	0 %	25 %	163937992
87	NC_010183	CAGT	2	8	36389	36396	25 %	25 %	25 %	25 %	163937992
88	NC_010183	TCAA	2	8	36719	36726	50 %	25 %	0 %	25 %	163937992
89	NC_010183	TCAA	2	8	37197	37204	50 %	25 %	0 %	25 %	163937992
90	NC_010183	ACTT	2	8	37915	37922	25 %	50 %	0 %	25 %	163937992
91	NC_010183	AGAA	2	8	39097	39104	75 %	0 %	25 %	0 %	163937994
92	NC_010183	GATA	2	8	39382	39389	50 %	25 %	25 %	0 %	163937994
93	NC_010183	ATGC	2	8	39554	39561	25 %	25 %	25 %	25 %	163937994
94	NC_010183	AACT	2	8	39894	39901	50 %	25 %	0 %	25 %	163937994
95	NC_010183	TGGT	2	8	39960	39967	0 %	50 %	50 %	0 %	163937994
96	NC_010183	CCAT	2	8	40993	41000	25 %	25 %	0 %	50 %	163937996
97	NC_010183	TCGC	2	8	41580	41587	0 %	25 %	25 %	50 %	163937997
98	NC_010183	ATTT	2	8	42674	42681	25 %	75 %	0 %	0 %	163937999
99	NC_010183	GTTT	2	8	42810	42817	0 %	75 %	25 %	0 %	163937999
100	NC_010183	GGAA	2	8	43514	43521	50 %	0 %	50 %	0 %	163938000
101	NC_010183	AAAG	2	8	43890	43897	75 %	0 %	25 %	0 %	163938000
102	NC_010183	GACG	2	8	44721	44728	25 %	0 %	50 %	25 %	163938002
103	NC_010183	AGCA	2	8	44902	44909	50 %	0 %	25 %	25 %	163938002
104	NC_010183	TGAG	2	8	46556	46563	25 %	25 %	50 %	0 %	163938005
105	NC_010183	AAAT	2	8	46583	46590	75 %	25 %	0 %	0 %	163938005
106	NC_010183	TTGT	2	8	46998	47005	0 %	75 %	25 %	0 %	163938006
107	NC_010183	TCCA	2	8	47838	47845	25 %	25 %	0 %	50 %	163938007
108	NC_010183	AATT	2	8	48237	48244	50 %	50 %	0 %	0 %	163938007
109	NC_010183	ACAA	2	8	48352	48359	75 %	0 %	0 %	25 %	163938007
110	NC_010183	AATG	2	8	52401	52408	50 %	25 %	25 %	0 %	163938012

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.