MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus weihenstephanensis KBAB4 plasmid pBWB404

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010183	TGG	2	6	8	13	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010183	AGA	2	6	44	49	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010183	TGT	2	6	537	542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010183	TCC	2	6	703	708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_010183	TAT	2	6	723	728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010183	TAA	2	6	731	736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010183	TCC	2	6	1364	1369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_010183	TGT	2	6	1395	1400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010183	AAG	2	6	1409	1414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010183	ATC	2	6	1452	1457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010183	TTA	2	6	1466	1471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010183	TAT	2	6	1582	1587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010183	ATT	2	6	1644	1649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010183	TCT	2	6	1672	1677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010183	ATT	2	6	1702	1707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010183	GAC	2	6	1713	1718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010183	AGT	2	6	1783	1788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010183	TTA	2	6	1909	1914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010183	TCC	2	6	2444	2449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_010183	TCC	2	6	3822	3827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_010183	ATA	2	6	4323	4328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010183	AAT	3	9	5787	5795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010183	ATA	3	9	5821	5829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010183	ATT	2	6	5838	5843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010183	TAA	2	6	6048	6053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010183	CTT	2	6	6151	6156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010183	TCA	2	6	7071	7076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010183	CTT	2	6	7129	7134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010183	GTA	2	6	7144	7149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010183	CTA	2	6	7188	7193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010183	TAA	2	6	8578	8583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010183	CTT	2	6	8616	8621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010183	CAT	2	6	8779	8784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010183	GTT	2	6	8812	8817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010183	TAT	2	6	8932	8937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010183	AGG	2	6	8965	8970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010183	AGG	2	6	10749	10754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010183	TTA	2	6	11929	11934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010183	TCA	2	6	12024	12029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010183	TGT	2	6	12035	12040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010183	TAC	2	6	12382	12387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010183	AAG	2	6	12457	12462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010183	AGA	2	6	12596	12601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010183	TAT	2	6	12641	12646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010183	GAA	2	6	12694	12699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010183	AAC	2	6	12778	12783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010183	ATA	2	6	13021	13026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010183	ACA	2	6	13260	13265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010183	ATA	3	9	13543	13551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010183	AGA	2	6	13634	13639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010183	GAA	2	6	15066	15071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010183	AGA	2	6	15085	15090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010183	TAA	2	6	15119	15124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010183	ATT	2	6	15171	15176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010183	GTA	2	6	15235	15240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010183	GAT	2	6	15303	15308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010183	TTA	2	6	15360	15365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010183	TTC	2	6	15406	15411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010183	GAA	2	6	15510	15515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010183	TCT	2	6	15613	15618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010183	TAA	2	6	15800	15805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010183	TAA	2	6	16227	16232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010183	ACG	2	6	16239	16244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010183	ATA	2	6	16547	16552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010183	TGG	2	6	16886	16891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010183	ATA	2	6	17155	17160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010183	CCT	2	6	17569	17574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_010183	GAA	2	6	17618	17623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010183	GGT	2	6	17667	17672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010183	AAC	2	6	17786	17791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010183	AAT	2	6	17802	17807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010183	TTC	2	6	17894	17899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010183	GAG	3	9	18444	18452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010183	GGT	2	6	18483	18488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010183	AAG	2	6	18514	18519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010183	GAA	2	6	18540	18545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010183	TTA	2	6	18558	18563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010183	CAT	2	6	18721	18726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010183	GAA	2	6	18729	18734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010183	TGA	2	6	18762	18767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010183	AGG	2	6	18784	18789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010183	AGG	2	6	24379	24384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010183	AAT	3	9	26877	26885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010183	CAA	2	6	26889	26894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010183	ATT	2	6	38640	38645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010183	ATT	2	6	40593	40598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010183	ATT	2	6	40604	40609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010183	ATA	2	6	40658	40663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010183	GGC	2	6	40714	40719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010183	TAT	2	6	40723	40728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010183	ATT	2	6	41237	41242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010183	TAT	2	6	41248	41253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010183	TGG	2	6	41369	41374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010183	AGC	2	6	41401	41406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010183	ATA	2	6	41431	41436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010183	ATT	2	6	42003	42008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010183	TAT	2	6	42014	42019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010183	AGC	2	6	42559	42564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010183	GAT	2	6	44084	44089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010183	ATT	2	6	44090	44095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010183	AGG	2	6	44701	44706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010183	TGT	2	6	44707	44712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010183	ACG	2	6	45312	45317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010183	ATT	2	6	46366	46371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010183	AAG	2	6	46402	46407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010183	ACC	2	6	47089	47094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_010183	CTG	3	9	47342	47350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010183	AGA	2	6	47357	47362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010183	GTG	2	6	47370	47375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010183	AAT	2	6	48418	48423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010183	CCT	2	6	48889	48894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_010183	CTC	2	6	49736	49741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_010183	TTG	2	6	50209	50214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010183	TAA	2	6	50220	50225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010183	ACA	2	6	50226	50231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010183	AGT	2	6	50430	50435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010183	CTT	2	6	50476	50481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010183	ATT	2	6	50540	50545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010183	ACG	2	6	51021	51026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010183	ATT	2	6	51236	51241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010183	TAA	2	6	51343	51348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010183	TAT	2	6	51368	51373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010183	AAG	2	6	51658	51663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010183	TAA	2	6	51677	51682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010183	TAA	2	6	51698	51703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010183	CCG	3	9	51723	51731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_010183	ACC	2	6	51749	51754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_010183	AGG	2	6	51783	51788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010183	ATA	2	6	51961	51966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010183	ATT	2	6	51991	51996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010183	TCC	2	6	52027	52032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_010183	ATT	3	9	52087	52095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010183	GTT	2	6	52214	52219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010183	TGA	2	6	52247	52252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010183	AGC	2	6	52293	52298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.