MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus weihenstephanensis KBAB4 plasmid pBWB403

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010182	TTGCT	2	10	517	526	0 %	60 %	20 %	20 %	163937867
2	NC_010182	CGTAG	2	10	1758	1767	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_010182	TTGCG	2	10	2453	2462	0 %	40 %	40 %	20 %	163937870
4	NC_010182	TTTGA	2	10	2800	2809	20 %	60 %	20 %	0 %	163937871
5	NC_010182	GTACA	2	10	10771	10780	40 %	20 %	20 %	20 %	163937884
6	NC_010182	TTCGT	2	10	11714	11723	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_010182	TTTAA	2	10	12753	12762	40 %	60 %	0 %	0 %	163937886
8	NC_010182	AAAAG	2	10	14723	14732	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010182	TAGTT	2	10	15927	15936	20 %	60 %	20 %	0 %	163937890
10	NC_010182	TAGAT	2	10	16746	16755	40 %	40 %	20 %	0 %	163937891
11	NC_010182	TTTTC	2	10	18656	18665	0 %	80 %	0 %	20 %	163937892
12	NC_010182	GTAGA	2	10	18919	18928	40 %	20 %	40 %	0 %	163937892
13	NC_010182	TGTAG	2	10	22171	22180	20 %	40 %	40 %	0 %	163937896
14	NC_010182	TCCAC	2	10	23867	23876	20 %	20 %	0 %	60 %	163937898
15	NC_010182	TGAAT	2	10	26025	26034	40 %	40 %	20 %	0 %	163937900
16	NC_010182	AATCG	2	10	26707	26716	40 %	20 %	20 %	20 %	163937900
17	NC_010182	GTTTC	2	10	27794	27803	0 %	60 %	20 %	20 %	163937903
18	NC_010182	TTTGC	2	10	27875	27884	0 %	60 %	20 %	20 %	163937903
19	NC_010182	CTGCT	2	10	28106	28115	0 %	40 %	20 %	40 %	163937904
20	NC_010182	ACGCC	2	10	30019	30028	20 %	0 %	20 %	60 %	163937905
21	NC_010182	CGAAT	2	10	31589	31598	40 %	20 %	20 %	20 %	163937908
22	NC_010182	AGAAA	2	10	33028	33037	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010182	CCATA	2	10	33952	33961	40 %	20 %	0 %	40 %	163937911
24	NC_010182	CGTTG	2	10	37551	37560	0 %	40 %	40 %	20 %	163937911
25	NC_010182	TCGCT	2	10	38199	38208	0 %	40 %	20 %	40 %	163937911
26	NC_010182	CTCCG	2	10	39129	39138	0 %	20 %	20 %	60 %	163937911
27	NC_010182	CGAAT	2	10	40994	41003	40 %	20 %	20 %	20 %	163937912
28	NC_010182	CTTCT	2	10	45504	45513	0 %	60 %	0 %	40 %	163937914
29	NC_010182	TCCAA	2	10	45807	45816	40 %	20 %	0 %	40 %	163937915
30	NC_010182	TTGCT	2	10	46066	46075	0 %	60 %	20 %	20 %	163937915
31	NC_010182	CATCG	2	10	46938	46947	20 %	20 %	20 %	40 %	163937917
32	NC_010182	ATCTT	2	10	49669	49678	20 %	60 %	0 %	20 %	163937922
33	NC_010182	TCGAC	2	10	49988	49997	20 %	20 %	20 %	40 %	163937922
34	NC_010182	TCGTT	2	10	50039	50048	0 %	60 %	20 %	20 %	163937922
35	NC_010182	CTGAC	2	10	50623	50632	20 %	20 %	20 %	40 %	163937923
36	NC_010182	CTTCT	2	10	51440	51449	0 %	60 %	0 %	40 %	163937924
37	NC_010182	AACCG	2	10	53366	53375	40 %	0 %	20 %	40 %	163937925
38	NC_010182	CTTTG	2	10	53594	53603	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_010182	GATTT	2	10	54646	54655	20 %	60 %	20 %	0 %	163937926
40	NC_010182	CCATG	2	10	55462	55471	20 %	20 %	20 %	40 %	163937926
41	NC_010182	GAAGA	2	10	56206	56215	60 %	0 %	40 %	0 %	163937928
42	NC_010182	ATTCG	2	10	57508	57517	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_010182	GTATA	2	10	58287	58296	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010182	GTCCA	2	10	59946	59955	20 %	20 %	20 %	40 %	163937933
45	NC_010182	ATCTC	2	10	60515	60524	20 %	40 %	0 %	40 %	163937935
46	NC_010182	GCTTC	2	10	61350	61359	0 %	40 %	20 %	40 %	163937935
47	NC_010182	TTACG	2	10	61380	61389	20 %	40 %	20 %	20 %	163937935
48	NC_010182	ATTGC	2	10	63343	63352	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_010182	AATTT	2	10	64956	64965	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.