MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus weihenstephanensis KBAB4 plasmid pBWB402

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010181	CTATT	2	10	95	104	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_010181	ATATA	2	10	501	510	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010181	TTTGG	2	10	1189	1198	0 %	60 %	40 %	0 %	163943461
4	NC_010181	ATTAA	2	10	1442	1451	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010181	ACTGA	2	10	2179	2188	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_010181	ATAAA	2	10	2311	2320	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010181	TTAAT	2	10	2445	2454	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010181	ACATA	2	10	2457	2466	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_010181	ATAAG	2	10	2485	2494	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010181	AAATC	2	10	3409	3418	60 %	20 %	0 %	20 %	163943464
11	NC_010181	AGGTA	2	10	5183	5192	40 %	20 %	40 %	0 %	163943466
12	NC_010181	GGAAA	2	10	5916	5925	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010181	CTTAT	2	10	7033	7042	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_010181	GTTCA	2	10	7334	7343	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_010181	AAAGG	2	10	7413	7422	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010181	TGAAT	2	10	8322	8331	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010181	GGAGT	2	10	8355	8364	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010181	AATTA	3	15	8543	8557	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010181	AAATT	2	10	9886	9895	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010181	TTAAT	2	10	10004	10013	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010181	TTAAA	2	10	10104	10113	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010181	AAAGG	2	10	10339	10348	60 %	0 %	40 %	0 %	163943471
23	NC_010181	ATGGA	2	10	10916	10925	40 %	20 %	40 %	0 %	163943471
24	NC_010181	ACTAA	2	10	14652	14661	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_010181	ATTAG	2	10	14714	14723	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010181	GATAA	2	10	16475	16484	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010181	GTTCA	2	10	16956	16965	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_010181	TTGAA	2	10	18152	18161	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010181	ACATA	2	10	18846	18855	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_010181	AAAGC	2	10	19139	19148	60 %	0 %	20 %	20 %	163943478
31	NC_010181	AAAGA	2	10	19284	19293	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010181	TTCTG	2	10	19754	19763	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_010181	TATGC	2	10	19955	19964	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_010181	CGTTA	2	10	21145	21154	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_010181	TTATC	2	10	21508	21517	20 %	60 %	0 %	20 %	163943480
36	NC_010181	CACAA	2	10	21899	21908	60 %	0 %	0 %	40 %	163943480
37	NC_010181	TCTAT	2	10	22688	22697	20 %	60 %	0 %	20 %	163943482
38	NC_010181	CATAC	2	10	25316	25325	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_010181	TTTCT	2	10	25437	25446	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_010181	AAACA	2	10	25637	25646	80 %	0 %	0 %	20 %	163943486
41	NC_010181	AATTG	2	10	26805	26814	40 %	40 %	20 %	0 %	163943486
42	NC_010181	AATAA	2	10	27512	27521	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010181	GATAA	2	10	30757	30766	60 %	20 %	20 %	0 %	163943490
44	NC_010181	AATTT	2	10	31097	31106	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010181	TACAG	2	10	31754	31763	40 %	20 %	20 %	20 %	163943491
46	NC_010181	AAGTG	2	10	32669	32678	40 %	20 %	40 %	0 %	163943491
47	NC_010181	GTTTG	2	10	34474	34483	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010181	AACTT	2	10	34501	34510	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_010181	TTTCG	2	10	35785	35794	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_010181	TAGAA	2	10	36000	36009	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010181	GATAT	2	10	36148	36157	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010181	AAAAT	2	10	37978	37987	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010181	ATTTT	2	10	38002	38011	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010181	TGAAA	2	10	39720	39729	60 %	20 %	20 %	0 %	163943495
55	NC_010181	TCACT	2	10	41651	41660	20 %	40 %	0 %	40 %	163943497
56	NC_010181	TTCAT	2	10	42469	42478	20 %	60 %	0 %	20 %	163943499
57	NC_010181	TCACC	2	10	43200	43209	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
58	NC_010181	TTCTC	2	10	43745	43754	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_010181	TATTT	2	10	45593	45602	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010181	TGCAT	2	10	46493	46502	20 %	40 %	20 %	20 %	163943501
61	NC_010181	GTTTT	2	10	46539	46548	0 %	80 %	20 %	0 %	163943501
62	NC_010181	AAAGG	2	10	49364	49373	60 %	0 %	40 %	0 %	163943503
63	NC_010181	TCCTT	2	10	52293	52302	0 %	60 %	0 %	40 %	163943505
64	NC_010181	TAAAA	2	10	54525	54534	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010181	AAAGA	2	10	56195	56204	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010181	ATAGA	2	10	56494	56503	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010181	TTCAT	2	10	59521	59530	20 %	60 %	0 %	20 %	163943511
68	NC_010181	TGTAA	2	10	60336	60345	40 %	40 %	20 %	0 %	163943512
69	NC_010181	TATAT	2	10	60624	60633	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010181	AATTT	2	10	61624	61633	40 %	60 %	0 %	0 %	163943513
71	NC_010181	TAATT	2	10	61650	61659	40 %	60 %	0 %	0 %	163943513
72	NC_010181	AATAT	2	10	63254	63263	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010181	AGAGA	2	10	63313	63322	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010181	TCTTG	2	10	63838	63847	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_010181	TGTTT	2	10	64009	64018	0 %	80 %	20 %	0 %	163943514
76	NC_010181	TCCTT	2	10	65595	65604	0 %	60 %	0 %	40 %	163943515
77	NC_010181	GGAAT	2	10	66171	66180	40 %	20 %	40 %	0 %	163943515
78	NC_010181	GAATT	2	10	66462	66471	40 %	40 %	20 %	0 %	163943516
79	NC_010181	AAGAT	2	10	67723	67732	60 %	20 %	20 %	0 %	163943517
80	NC_010181	TCCCA	2	10	70473	70482	20 %	20 %	0 %	60 %	163943519
81	NC_010181	CATTA	2	10	73466	73475	40 %	40 %	0 %	20 %	163943522

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.