MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus weihenstephanensis KBAB4 plasmid pBWB402

Total Repeats: 134

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010181	AGGA	2	8	36	43	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010181	GATA	2	8	61	68	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010181	GTAT	2	8	1062	1069	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010181	CCTT	2	8	1400	1407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010181	TAAA	2	8	1596	1603	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010181	ACGA	2	8	1669	1676	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_010181	ATGA	2	8	2086	2093	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010181	ATAA	2	8	2191	2198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010181	AAAT	2	8	2255	2262	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010181	ATTT	2	8	2402	2409	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010181	TTTA	2	8	2510	2517	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010181	GAAA	2	8	2850	2857	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010181	ATTT	2	8	2907	2914	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010181	TTAC	2	8	2960	2967	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_010181	TATT	2	8	3501	3508	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010181	TTTA	2	8	4601	4608	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010181	TAGT	2	8	4632	4639	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010181	AATG	2	8	5947	5954	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010181	TTCT	2	8	6002	6009	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_010181	TTGT	2	8	6010	6017	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010181	GTTT	2	8	6021	6028	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010181	ATGT	2	8	6220	6227	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010181	AATT	2	8	6323	6330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010181	TTTC	2	8	6333	6340	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010181	TAAA	2	8	6992	6999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010181	AAAT	2	8	7115	7122	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010181	ATTT	3	12	7199	7210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010181	TATT	2	8	7261	7268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010181	GAAA	2	8	7354	7361	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010181	TCGT	2	8	7859	7866	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010181	ATTT	2	8	9957	9964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010181	TCCT	2	8	11557	11564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010181	TAAA	2	8	11686	11693	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010181	TATC	2	8	12015	12022	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010181	AAAC	2	8	12030	12037	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_010181	TTCT	2	8	12102	12109	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010181	TTAC	2	8	12274	12281	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010181	ATTA	2	8	12806	12813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010181	AAAG	2	8	14071	14078	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010181	AAGT	2	8	14254	14261	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010181	TCCC	2	8	14304	14311	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_010181	ACTT	2	8	15017	15024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_010181	TCTT	2	8	15277	15284	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010181	ATTT	2	8	16821	16828	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010181	TATT	2	8	16883	16890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010181	GAAA	2	8	16976	16983	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010181	TTAA	2	8	17052	17059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010181	TCGT	2	8	17468	17475	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_010181	TAAT	2	8	17587	17594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010181	GTTT	2	8	17724	17731	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010181	TCTT	2	8	17821	17828	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010181	CATA	2	8	18634	18641	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_010181	CATT	2	8	18953	18960	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010181	TATT	2	8	18970	18977	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010181	ATTA	2	8	18978	18985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010181	GAAT	2	8	19256	19263	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010181	GATA	2	8	19563	19570	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010181	TAAA	2	8	19590	19597	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010181	TTTA	2	8	19637	19644	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010181	AACA	2	8	19933	19940	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010181	TAAA	2	8	20121	20128	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010181	TTGA	2	8	20247	20254	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010181	TAAA	2	8	20574	20581	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010181	CATA	2	8	20677	20684	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_010181	TCCA	2	8	21103	21110	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010181	CTAA	2	8	21353	21360	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_010181	AATG	2	8	22179	22186	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010181	TGTT	2	8	22187	22194	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010181	TGGG	2	8	22996	23003	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010181	ATGA	2	8	24892	24899	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010181	ATTA	2	8	27454	27461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010181	TATT	2	8	29533	29540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010181	TAAT	2	8	31121	31128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010181	ACAA	2	8	31222	31229	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_010181	TATT	2	8	31673	31680	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010181	AGCT	2	8	33362	33369	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_010181	CATT	2	8	34275	34282	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_010181	AAAT	2	8	34721	34728	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010181	GAAT	2	8	34773	34780	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010181	CTTG	2	8	34860	34867	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_010181	ATTC	2	8	34913	34920	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_010181	GAAT	2	8	34935	34942	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010181	TGTT	2	8	35410	35417	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010181	ATTA	2	8	36192	36199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010181	TAAA	2	8	36243	36250	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010181	AGAT	2	8	36522	36529	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010181	AATT	2	8	36759	36766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010181	ATCC	2	8	37104	37111	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010181	CTTC	2	8	37879	37886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_010181	CTAC	2	8	40387	40394	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_010181	ATTC	2	8	40539	40546	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_010181	TTTA	2	8	41057	41064	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010181	CAAT	2	8	42995	43002	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_010181	TAAA	2	8	44057	44064	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010181	CTTT	2	8	44192	44199	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_010181	ATCA	2	8	44283	44290	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_010181	ATCT	2	8	44358	44365	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_010181	TACT	2	8	44992	44999	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_010181	AGAA	2	8	45144	45151	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010181	AATG	2	8	45306	45313	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010181	TAAA	2	8	50721	50728	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010181	TTAA	2	8	51039	51046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010181	ACTA	2	8	51890	51897	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_010181	AAGG	2	8	52111	52118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010181	TTTA	2	8	52697	52704	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010181	AATG	2	8	52783	52790	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010181	ATTT	2	8	52844	52851	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010181	AGAA	2	8	52868	52875	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010181	ATGG	2	8	53166	53173	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010181	TAAA	2	8	53207	53214	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010181	GATT	2	8	53302	53309	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010181	TCTT	2	8	53347	53354	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_010181	GTAA	2	8	54438	54445	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010181	AACC	2	8	54466	54473	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_010181	AATA	2	8	55584	55591	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010181	AAAT	2	8	56024	56031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010181	AATG	2	8	56211	56218	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010181	CTTA	2	8	56563	56570	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_010181	ATAA	2	8	57185	57192	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010181	AGAA	2	8	57847	57854	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010181	TGAT	2	8	57921	57928	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010181	AATC	2	8	57988	57995	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_010181	TAAA	2	8	57998	58005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010181	ACAA	2	8	63014	63021	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_010181	AATT	2	8	63127	63134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010181	TGTT	2	8	63265	63272	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010181	TAAA	2	8	63850	63857	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010181	AACA	2	8	68741	68748	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_010181	CCTA	2	8	68778	68785	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_010181	AGGA	2	8	68819	68826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010181	CTCC	2	8	74093	74100	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_010181	CAAA	2	8	74673	74680	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_010181	GAAT	2	8	74775	74782	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010181	CAAC	2	8	75014	75021	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.