MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus weihenstephanensis KBAB4 plasmid pBWB401

Total Repeats: 172

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010180	AAGTAA	2	12	2998	3009	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	163943172
2	NC_010180	ATTGGT	2	12	4021	4032	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	163943172
3	NC_010180	TCAAAA	2	12	10208	10219	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	163943174
4	NC_010180	ATGAAG	2	12	10690	10701	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	163943174
5	NC_010180	ACAAGA	2	12	13574	13585	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	163943175
6	NC_010180	AAATAG	2	12	30584	30595	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	163943180
7	NC_010180	ATTTGA	2	12	35511	35522	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	163943186
8	NC_010180	ACTATG	2	12	38528	38539	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	163943187
9	NC_010180	AAAAGA	2	12	41482	41493	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010180	TCTTTT	2	12	41510	41521	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_010180	AGAAGG	2	12	45742	45753	50 %	0 %	50 %	0 %	163943192
12	NC_010180	GGAAAT	2	12	45758	45769	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	163943192
13	NC_010180	TAAAGT	2	12	45991	46002	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	163943192
14	NC_010180	TTGAAA	2	12	46029	46040	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	163943192
15	NC_010180	ATCTGG	2	12	46953	46964	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	163943193
16	NC_010180	TTAACA	2	12	49208	49219	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010180	GTTTTT	2	12	53283	53294	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010180	CCGAAT	2	12	53768	53779	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	163943201
19	NC_010180	TGAAGG	2	12	55930	55941	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010180	TCGACA	2	12	62243	62254	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	163943206
21	NC_010180	TAAAAA	2	12	62909	62920	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010180	TATCAA	2	12	67081	67092	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_010180	ATTTTT	2	12	67269	67280	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010180	TATCAA	2	12	68914	68925	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	163943210
25	NC_010180	ATGTAT	2	12	70004	70015	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010180	TTATGT	2	12	72149	72160	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010180	AGAAAA	2	12	75018	75029	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	163943217
28	NC_010180	AATTCA	2	12	78423	78434	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	163943220
29	NC_010180	AAAATC	2	12	79683	79694	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	163943221
30	NC_010180	ACCATT	2	12	81544	81555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163943222
31	NC_010180	AAACGA	2	12	89804	89815	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	163943223
32	NC_010180	TTAATG	2	12	90724	90735	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	163943223
33	NC_010180	TGAAAT	2	12	92202	92213	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	163943224
34	NC_010180	AAGTTT	2	12	93665	93676	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	163943226
35	NC_010180	AAAATA	2	12	95474	95485	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010180	TACTGA	2	12	99200	99211	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	163943231
37	NC_010180	GAACAA	2	12	99576	99587	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	163943231
38	NC_010180	GGTATA	2	12	100535	100546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010180	GCTCCT	2	12	101312	101323	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	163943233
40	NC_010180	AAAATT	2	12	101428	101439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163943233
41	NC_010180	GAAAAT	2	12	103542	103553	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	163943235
42	NC_010180	AAATGT	2	12	103882	103893	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010180	AAATAT	2	12	104321	104332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010180	ACAACT	2	12	104952	104963	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010180	AAAAAT	2	12	110433	110444	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	163943241
46	NC_010180	ATGCAA	2	12	110570	110581	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	163943241
47	NC_010180	TCAAGT	2	12	115481	115492	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	163943244
48	NC_010180	ACTTGT	2	12	120533	120544	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	163943247
49	NC_010180	AAATTT	2	12	123713	123724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010180	AAAAGA	2	12	124245	124256	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010180	AATATA	2	12	132084	132095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010180	ATTCAA	2	12	132907	132918	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	163943258
53	NC_010180	TGAAGA	2	12	134041	134052	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	163943259
54	NC_010180	TTTAAT	2	12	134996	135007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010180	TTTTCT	2	12	135458	135469	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	163943260
56	NC_010180	AATACT	2	12	135683	135694	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_010180	CTGTTA	2	12	140691	140702	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	163943266
58	NC_010180	TATTTA	2	12	141669	141680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163943266
59	NC_010180	AAAGAA	2	12	143865	143876	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010180	TGTTAA	2	12	148763	148774	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	163943271
61	NC_010180	GCAAAT	2	12	149939	149950	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_010180	GAAATT	2	12	152365	152376	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	163943274
63	NC_010180	ATACTC	2	12	152410	152421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163943274
64	NC_010180	CTAATC	2	12	153290	153301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010180	ACTTAC	2	12	156720	156731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163943279
66	NC_010180	TTTTGT	2	12	157203	157214	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	163943279
67	NC_010180	AATATA	2	12	159095	159106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010180	TGGGAT	2	12	159889	159900	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	163943281
69	NC_010180	AAGTTT	2	12	160576	160587	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	163943282
70	NC_010180	TGGCAA	2	12	163717	163728	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	163943285
71	NC_010180	AATTAT	2	12	164379	164390	50 %	50 %	0 %	0 %	163943286
72	NC_010180	TTTGCA	2	12	165474	165485	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_010180	TCCTGT	2	12	171438	171449	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	163943291
74	NC_010180	ATACTT	2	12	174453	174464	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_010180	GGATTA	2	12	177934	177945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163943296
76	NC_010180	TTAACA	2	12	184558	184569	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	163943305
77	NC_010180	CCAATT	2	12	186223	186234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163943305
78	NC_010180	AAAGCA	2	12	186943	186954	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	163943306
79	NC_010180	TTCCAA	2	12	190679	190690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010180	TTTAAT	2	12	191167	191178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163943310
81	NC_010180	GTCAAT	2	12	191807	191818	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	163943310
82	NC_010180	TTTCGC	2	12	192018	192029	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	163943311
83	NC_010180	CAATTG	3	18	192584	192601	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	163943311
84	NC_010180	TTTTTC	2	12	195253	195264	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	163943313
85	NC_010180	AGAACA	2	12	197831	197842	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	163943314
86	NC_010180	AGCTGA	2	12	198010	198021	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	163943314
87	NC_010180	TGCACC	2	12	201511	201522	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	163943317
88	NC_010180	TCTGCA	2	12	202157	202168	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	163943317
89	NC_010180	AAAGTA	2	12	207108	207119	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010180	TATTCT	2	12	208785	208796	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	163943320
91	NC_010180	AAAAAG	2	12	209526	209537	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	163943321
92	NC_010180	GCTATG	2	12	211724	211735	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	163943322
93	NC_010180	AAGTTT	2	12	214196	214207	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010180	AAATAT	2	12	215394	215405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010180	GGAAAA	2	12	217532	217543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163943327
96	NC_010180	TCAATA	2	12	219459	219470	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	163943329
97	NC_010180	CATATT	2	12	223134	223145	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	163943330
98	NC_010180	TTCTCT	2	12	228409	228420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163943330
99	NC_010180	CGATCA	2	12	236623	236634	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	163943331
100	NC_010180	TCAGCA	2	12	241629	241640	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	163943332
101	NC_010180	ATGCAT	2	12	243475	243486	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	163943332
102	NC_010180	GGAAAA	2	12	247807	247818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163943334
103	NC_010180	ATTTAA	2	12	254955	254966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010180	ATTTAG	2	12	256923	256934	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	163943340
105	NC_010180	TTTTTA	2	12	257647	257658	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	163943341
106	NC_010180	TTTTAT	2	12	261323	261334	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010180	ATATAG	2	12	261739	261750	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010180	TATCGG	2	12	262762	262773	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	163943343
109	NC_010180	AACATA	2	12	263084	263095	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_010180	TGAGTT	2	12	264059	264070	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	163943344
111	NC_010180	ATACGT	2	12	264563	264574	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	163943344
112	NC_010180	GTTGAT	2	12	271831	271842	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	163943349
113	NC_010180	GCCCTT	2	12	273910	273921	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_010180	TAGAAA	2	12	279277	279288	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	163943354
115	NC_010180	CAGCCT	2	12	279725	279736	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
116	NC_010180	TACAAG	2	12	281291	281302	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_010180	AACAAG	2	12	281658	281669	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	163943355
118	NC_010180	TACAAT	2	12	282103	282114	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	163943355
119	NC_010180	TAAAAT	2	12	282238	282249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163943355
120	NC_010180	AGAAAA	2	12	282736	282747	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	163943355
121	NC_010180	TAACAT	2	12	288703	288714	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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126	NC_010180	TAGTAA	2	12	296691	296702	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.