MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus weihenstephanensis KBAB4 plasmid pBWB401

Total Repeats: 412

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010180	AGGAC	2	10	5594	5603	40 %	0 %	40 %	20 %	163943173
2	NC_010180	ATCAA	2	10	6404	6413	60 %	20 %	0 %	20 %	163943173
3	NC_010180	AATGC	2	10	7356	7365	40 %	20 %	20 %	20 %	163943173
4	NC_010180	ATGGA	2	10	7531	7540	40 %	20 %	40 %	0 %	163943173
5	NC_010180	TTAAA	2	10	7642	7651	60 %	40 %	0 %	0 %	163943173
6	NC_010180	TAGTT	2	10	8274	8283	20 %	60 %	20 %	0 %	163943173
7	NC_010180	CTTCT	2	10	11244	11253	0 %	60 %	0 %	40 %	163943175
8	NC_010180	AGGCA	2	10	14529	14538	40 %	0 %	40 %	20 %	163943175
9	NC_010180	CATTT	2	10	14715	14724	20 %	60 %	0 %	20 %	163943175
10	NC_010180	AATTC	2	10	14968	14977	40 %	40 %	0 %	20 %	163943175
11	NC_010180	TCATG	2	10	15963	15972	20 %	40 %	20 %	20 %	163943176
12	NC_010180	TGGAT	2	10	23195	23204	20 %	40 %	40 %	0 %	163943178
13	NC_010180	TGACA	2	10	24285	24294	40 %	20 %	20 %	20 %	163943178
14	NC_010180	AGTTG	2	10	25401	25410	20 %	40 %	40 %	0 %	163943178
15	NC_010180	TGGAA	2	10	25462	25471	40 %	20 %	40 %	0 %	163943178
16	NC_010180	TGGTT	2	10	25821	25830	0 %	60 %	40 %	0 %	163943178
17	NC_010180	AAACC	2	10	27740	27749	60 %	0 %	0 %	40 %	163943179
18	NC_010180	ATTCA	2	10	29910	29919	40 %	40 %	0 %	20 %	163943179
19	NC_010180	TGGCA	2	10	29930	29939	20 %	20 %	40 %	20 %	163943179
20	NC_010180	TTATT	2	10	31451	31460	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010180	AGAAA	2	10	32003	32012	80 %	0 %	20 %	0 %	163943183
22	NC_010180	AAAGA	2	10	32279	32288	80 %	0 %	20 %	0 %	163943183
23	NC_010180	ACAAT	2	10	34289	34298	60 %	20 %	0 %	20 %	163943185
24	NC_010180	TATTC	2	10	35710	35719	20 %	60 %	0 %	20 %	163943186
25	NC_010180	CGTTA	2	10	36112	36121	20 %	40 %	20 %	20 %	163943186
26	NC_010180	ACAGA	2	10	36571	36580	60 %	0 %	20 %	20 %	163943186
27	NC_010180	AGAGG	2	10	37579	37588	40 %	0 %	60 %	0 %	163943187
28	NC_010180	ACCTA	2	10	37764	37773	40 %	20 %	0 %	40 %	163943187
29	NC_010180	AGAAA	2	10	38836	38845	80 %	0 %	20 %	0 %	163943188
30	NC_010180	CGATA	2	10	39591	39600	40 %	20 %	20 %	20 %	163943188
31	NC_010180	AAACA	2	10	40090	40099	80 %	0 %	0 %	20 %	163943189
32	NC_010180	TTACC	2	10	40827	40836	20 %	40 %	0 %	40 %	163943189
33	NC_010180	AGGTA	2	10	41542	41551	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010180	ATTAT	2	10	42389	42398	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010180	AAGAA	2	10	43063	43072	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010180	AGAAA	2	10	43483	43492	80 %	0 %	20 %	0 %	163943191
37	NC_010180	AAGCA	2	10	44659	44668	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_010180	ACAGA	2	10	45914	45923	60 %	0 %	20 %	20 %	163943192
39	NC_010180	AACAA	2	10	45966	45975	80 %	0 %	0 %	20 %	163943192
40	NC_010180	ACGAA	2	10	46053	46062	60 %	0 %	20 %	20 %	163943192
41	NC_010180	TTTTC	2	10	46912	46921	0 %	80 %	0 %	20 %	163943193
42	NC_010180	CTTAG	2	10	46978	46987	20 %	40 %	20 %	20 %	163943193
43	NC_010180	CGAAA	2	10	47234	47243	60 %	0 %	20 %	20 %	163943193
44	NC_010180	AGAGT	2	10	49228	49237	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010180	GGATT	2	10	50099	50108	20 %	40 %	40 %	0 %	163943196
46	NC_010180	ATTTT	2	10	51303	51312	20 %	80 %	0 %	0 %	163943197
47	NC_010180	TATCT	2	10	53468	53477	20 %	60 %	0 %	20 %	163943201
48	NC_010180	TTTTG	2	10	54647	54656	0 %	80 %	20 %	0 %	163943201
49	NC_010180	TCCCT	2	10	55224	55233	0 %	40 %	0 %	60 %	163943202
50	NC_010180	CATGG	2	10	55512	55521	20 %	20 %	40 %	20 %	163943202
51	NC_010180	GTAAT	2	10	55681	55690	40 %	40 %	20 %	0 %	163943202
52	NC_010180	TCCTT	2	10	56097	56106	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_010180	CTATT	2	10	58270	58279	20 %	60 %	0 %	20 %	163943203
54	NC_010180	ACAAA	2	10	59178	59187	80 %	0 %	0 %	20 %	163943204
55	NC_010180	GAAAA	2	10	60261	60270	80 %	0 %	20 %	0 %	163943204
56	NC_010180	AATTC	2	10	60415	60424	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_010180	TTTTG	2	10	60814	60823	0 %	80 %	20 %	0 %	163943205
58	NC_010180	AATCA	2	10	62509	62518	60 %	20 %	0 %	20 %	163943206
59	NC_010180	AAAGA	2	10	63493	63502	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010180	AAACA	2	10	63671	63680	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_010180	GAAGG	2	10	64345	64354	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010180	AGTGA	2	10	64717	64726	40 %	20 %	40 %	0 %	163943207
63	NC_010180	ATCTT	2	10	64983	64992	20 %	60 %	0 %	20 %	163943207
64	NC_010180	TAGAG	2	10	66786	66795	40 %	20 %	40 %	0 %	163943207
65	NC_010180	TAAAT	2	10	67215	67224	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010180	AATTT	2	10	68562	68571	40 %	60 %	0 %	0 %	163943209
67	NC_010180	AATAA	2	10	68965	68974	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010180	TATTT	2	10	69160	69169	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010180	ATTTT	2	10	72030	72039	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010180	TTAAA	2	10	75540	75549	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010180	AACTA	2	10	77697	77706	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_010180	TTGTT	2	10	78594	78603	0 %	80 %	20 %	0 %	163943220
73	NC_010180	ATTTA	2	10	80194	80203	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010180	AAGCA	2	10	81330	81339	60 %	0 %	20 %	20 %	163943222
75	NC_010180	TTTTA	2	10	81925	81934	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010180	TAAAG	2	10	82049	82058	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010180	ATTTA	2	10	84024	84033	40 %	60 %	0 %	0 %	163943223
78	NC_010180	CAAAT	2	10	85118	85127	60 %	20 %	0 %	20 %	163943223
79	NC_010180	TCAAA	2	10	85180	85189	60 %	20 %	0 %	20 %	163943223
80	NC_010180	GAATA	2	10	85340	85349	60 %	20 %	20 %	0 %	163943223
81	NC_010180	AATTT	2	10	85601	85610	40 %	60 %	0 %	0 %	163943223
82	NC_010180	ATTTG	2	10	86937	86946	20 %	60 %	20 %	0 %	163943223
83	NC_010180	GAGTG	2	10	87037	87046	20 %	20 %	60 %	0 %	163943223
84	NC_010180	GAATT	2	10	89231	89240	40 %	40 %	20 %	0 %	163943223
85	NC_010180	TTAAA	2	10	89657	89666	60 %	40 %	0 %	0 %	163943223
86	NC_010180	ATTTT	2	10	90021	90030	20 %	80 %	0 %	0 %	163943223
87	NC_010180	TCAAT	2	10	90489	90498	40 %	40 %	0 %	20 %	163943223
88	NC_010180	CATGC	2	10	91336	91345	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_010180	TGAGA	2	10	92561	92570	40 %	20 %	40 %	0 %	163943225
90	NC_010180	TTATT	2	10	92642	92651	20 %	80 %	0 %	0 %	163943225
91	NC_010180	AAACA	2	10	93880	93889	80 %	0 %	0 %	20 %	163943226
92	NC_010180	TATTT	2	10	96142	96151	20 %	80 %	0 %	0 %	163943229
93	NC_010180	GAAGA	2	10	97680	97689	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010180	GGAAT	2	10	97955	97964	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010180	TGCTT	2	10	99283	99292	0 %	60 %	20 %	20 %	163943231
96	NC_010180	CGTAA	2	10	99471	99480	40 %	20 %	20 %	20 %	163943231
97	NC_010180	TTTCT	2	10	100039	100048	0 %	80 %	0 %	20 %	163943231
98	NC_010180	AAAGA	2	10	100112	100121	80 %	0 %	20 %	0 %	163943231
99	NC_010180	TTCTA	2	10	101598	101607	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_010180	TGAGG	2	10	102496	102505	20 %	20 %	60 %	0 %	163943234
101	NC_010180	AAGAA	2	10	103324	103333	80 %	0 %	20 %	0 %	163943235
102	NC_010180	GTGAA	2	10	103399	103408	40 %	20 %	40 %	0 %	163943235
103	NC_010180	TGCAA	2	10	103643	103652	40 %	20 %	20 %	20 %	163943235
104	NC_010180	AGATA	2	10	103933	103942	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010180	TTTGA	2	10	104264	104273	20 %	60 %	20 %	0 %	163943236
106	NC_010180	TTCGG	2	10	105373	105382	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_010180	AAAGT	2	10	106452	106461	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010180	CATTA	2	10	106560	106569	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_010180	GTAAT	2	10	106597	106606	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010180	AAAAT	2	10	106869	106878	80 %	20 %	0 %	0 %	163943237
111	NC_010180	CAATC	2	10	108053	108062	40 %	20 %	0 %	40 %	163943238
112	NC_010180	TGTCA	2	10	109048	109057	20 %	40 %	20 %	20 %	163943239
113	NC_010180	CAGTA	2	10	111297	111306	40 %	20 %	20 %	20 %	163943241
114	NC_010180	CATCA	2	10	115203	115212	40 %	20 %	0 %	40 %	163943243
115	NC_010180	GAAAA	2	10	115325	115334	80 %	0 %	20 %	0 %	163943244
116	NC_010180	AAAAC	2	10	115461	115470	80 %	0 %	0 %	20 %	163943244
117	NC_010180	AAGTG	2	10	116121	116130	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010180	AGAGA	2	10	117467	117476	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010180	TTGGA	2	10	118565	118574	20 %	40 %	40 %	0 %	163943246
120	NC_010180	TATCA	2	10	118612	118621	40 %	40 %	0 %	20 %	163943246
121	NC_010180	AATCC	2	10	119587	119596	40 %	20 %	0 %	40 %	163943246
122	NC_010180	AACTT	2	10	119644	119653	40 %	40 %	0 %	20 %	163943246
123	NC_010180	TGAAT	2	10	122209	122218	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010180	CAAAA	2	10	122604	122613	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_010180	ATTAC	2	10	123314	123323	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_010180	CTCTC	2	10	124938	124947	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
127	NC_010180	CTTAC	2	10	125590	125599	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_010180	ATCTT	2	10	125681	125690	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_010180	GATTT	2	10	126329	126338	20 %	60 %	20 %	0 %	163943253
130	NC_010180	AGAAA	2	10	129251	129260	80 %	0 %	20 %	0 %	163943256
131	NC_010180	AACAA	2	10	129531	129540	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_010180	TCTTA	2	10	129782	129791	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_010180	ATTAA	2	10	130423	130432	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010180	TTTTA	2	10	130508	130517	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010180	TAATT	2	10	130646	130655	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010180	AAATG	2	10	130802	130811	60 %	20 %	20 %	0 %	163943257
137	NC_010180	TACCT	2	10	131088	131097	20 %	40 %	0 %	40 %	163943257
138	NC_010180	CATTT	2	10	132045	132054	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_010180	ATTAT	2	10	133112	133121	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010180	CAAAT	2	10	134226	134235	60 %	20 %	0 %	20 %	163943259
141	NC_010180	ACATG	2	10	134351	134360	40 %	20 %	20 %	20 %	163943259
142	NC_010180	TTTTC	2	10	135329	135338	0 %	80 %	0 %	20 %	163943260
143	NC_010180	ATACT	2	10	135865	135874	40 %	40 %	0 %	20 %	163943261
144	NC_010180	AATTA	2	10	137265	137274	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010180	CAATC	2	10	138831	138840	40 %	20 %	0 %	40 %	163943265
146	NC_010180	TTTAG	2	10	143647	143656	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010180	TTTAA	2	10	144009	144018	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010180	CTATT	2	10	144065	144074	20 %	60 %	0 %	20 %	163943268
149	NC_010180	TTAAC	2	10	144229	144238	40 %	40 %	0 %	20 %	163943268
150	NC_010180	CTATT	2	10	150241	150250	20 %	60 %	0 %	20 %	163943272
151	NC_010180	TAAAA	2	10	150545	150554	80 %	20 %	0 %	0 %	163943272
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154	NC_010180	TAAAA	2	10	152430	152439	80 %	20 %	0 %	0 %	163943274
155	NC_010180	TTATC	2	10	153014	153023	20 %	60 %	0 %	20 %	163943274
156	NC_010180	TAAAA	2	10	153176	153185	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_010180	TTTTC	2	10	154947	154956	0 %	80 %	0 %	20 %	163943276
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162	NC_010180	TTGTA	2	10	157770	157779	20 %	60 %	20 %	0 %	163943279
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165	NC_010180	CTAAA	2	10	158990	158999	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
166	NC_010180	ACTTA	2	10	159714	159723	40 %	40 %	0 %	20 %	163943281
167	NC_010180	GAATT	2	10	160195	160204	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_010180	TTTAG	2	10	160474	160483	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_010180	CTTTT	2	10	164203	164212	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
174	NC_010180	AATTG	2	10	164534	164543	40 %	40 %	20 %	0 %	163943286
175	NC_010180	TATTT	2	10	164814	164823	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_010180	AAGTT	2	10	165916	165925	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
177	NC_010180	TGATT	2	10	166041	166050	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
178	NC_010180	ATTTT	2	10	168781	168790	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_010180	AAAAT	2	10	174057	174066	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_010180	TTTAT	2	10	175118	175127	20 %	80 %	0 %	0 %	163943294
183	NC_010180	ACTTA	2	10	175161	175170	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
184	NC_010180	GTTCA	2	10	175218	175227	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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189	NC_010180	TATTT	2	10	182549	182558	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_010180	TGTAA	2	10	185787	185796	40 %	40 %	20 %	0 %	163943305
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196	NC_010180	GATGA	2	10	191008	191017	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
197	NC_010180	TTTCA	2	10	192213	192222	20 %	60 %	0 %	20 %	163943311
198	NC_010180	TTTAT	2	10	192704	192713	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_010180	AAATT	2	10	194241	194250	60 %	40 %	0 %	0 %	163943312
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202	NC_010180	TGATT	2	10	196254	196263	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
203	NC_010180	AAATT	2	10	197140	197149	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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215	NC_010180	CGCAT	2	10	207013	207022	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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222	NC_010180	AAATC	2	10	210955	210964	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
223	NC_010180	TAATA	2	10	212226	212235	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_010180	TATTG	2	10	254229	254238	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
254	NC_010180	TTATA	2	10	254508	254517	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_010180	CTTTT	2	10	254914	254923	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
256	NC_010180	ATGGT	2	10	255785	255794	20 %	40 %	40 %	0 %	163943339
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258	NC_010180	TTTTG	2	10	256418	256427	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
259	NC_010180	AATTC	2	10	260037	260046	40 %	40 %	0 %	20 %	163943342
260	NC_010180	ATGAA	2	10	261032	261041	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
261	NC_010180	ATTAT	2	10	261042	261051	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_010180	ACTTC	2	10	261490	261499	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
263	NC_010180	AAGAT	2	10	261842	261851	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
264	NC_010180	ATCTT	2	10	261863	261872	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
265	NC_010180	ACCGT	2	10	262359	262368	20 %	20 %	20 %	40 %	163943343
266	NC_010180	ATTGA	2	10	262397	262406	40 %	40 %	20 %	0 %	163943343
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270	NC_010180	TTTTG	2	10	266631	266640	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
271	NC_010180	GTTCT	2	10	270046	270055	0 %	60 %	20 %	20 %	163943348
272	NC_010180	TTATA	2	10	271244	271253	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_010180	CTTTT	2	10	273332	273341	0 %	80 %	0 %	20 %	163943350
274	NC_010180	TAATT	2	10	276693	276702	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.