MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus weihenstephanensis KBAB4 plasmid pBWB401

Total Repeats: 435

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010180	AGTA	2	8	31127	31134	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010180	GAAA	2	8	38668	38675	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010180	TAAA	2	8	38801	38808	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010180	ATTT	2	8	41320	41327	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010180	GTTT	2	8	41455	41462	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010180	ATGT	2	8	42312	42319	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010180	ATTA	2	8	42895	42902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010180	AGTA	2	8	42986	42993	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010180	GCAA	2	8	43023	43030	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010180	GTCT	2	8	43048	43055	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010180	CAAG	2	8	44545	44552	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_010180	TTCT	2	8	44931	44938	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010180	TTTA	2	8	45090	45097	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010180	TATG	2	8	45171	45178	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010180	AGGA	2	8	45257	45264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010180	GTTT	2	8	47643	47650	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010180	ATTA	2	8	48086	48093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010180	GGTT	2	8	48366	48373	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010180	ACGG	2	8	48508	48515	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_010180	AGTT	2	8	48676	48683	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010180	TAAA	2	8	49300	49307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010180	ATTA	2	8	49356	49363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010180	AGTA	2	8	50717	50724	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010180	CAAA	2	8	50809	50816	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010180	TATG	2	8	52881	52888	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010180	ATAA	2	8	52965	52972	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010180	AATC	2	8	56685	56692	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010180	TACC	2	8	58508	58515	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010180	AAGA	2	8	62808	62815	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010180	TTCT	2	8	62852	62859	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010180	TGGG	2	8	63224	63231	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010180	GAAA	2	8	63419	63426	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010180	TGAG	2	8	63535	63542	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010180	ATAA	2	8	63592	63599	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010180	TTAT	2	8	64219	64226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010180	TTAT	2	8	64461	64468	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010180	AATT	2	8	67294	67301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010180	GAAA	2	8	67683	67690	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010180	CAAT	2	8	69754	69761	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010180	AAGG	2	8	70118	70125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010180	TCCT	2	8	70131	70138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_010180	ATTT	2	8	71478	71485	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010180	AATT	2	8	71495	71502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010180	TATT	2	8	71516	71523	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010180	AAAT	2	8	71645	71652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010180	TTAT	2	8	72123	72130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010180	ATTC	2	8	72243	72250	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010180	TATT	2	8	72277	72284	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010180	AAGG	2	8	72286	72293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010180	TGGA	2	8	73250	73257	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010180	ACAT	2	8	73365	73372	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010180	CTAT	2	8	73376	73383	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_010180	TTCG	2	8	76023	76030	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010180	TGTT	2	8	77078	77085	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010180	CTTA	2	8	78005	78012	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_010180	TATT	2	8	78905	78912	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010180	GTTT	2	8	79014	79021	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010180	GAAA	2	8	79105	79112	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010180	AAAT	2	8	79311	79318	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010180	TAGG	2	8	79332	79339	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010180	AATT	2	8	82125	82132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010180	TTTA	2	8	82134	82141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010180	ATCT	2	8	82581	82588	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_010180	AAGG	2	8	82725	82732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010180	TTTA	2	8	82750	82757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010180	AGAA	2	8	83065	83072	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010180	CCTG	2	8	83079	83086	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_010180	ATTG	2	8	83182	83189	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010180	ATTT	2	8	83376	83383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010180	GTTG	2	8	91133	91140	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010180	AATT	2	8	91457	91464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010180	AAAT	2	8	95044	95051	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010180	TAAT	2	8	95130	95137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010180	CATT	2	8	95180	95187	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_010180	AAAT	2	8	95271	95278	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010180	TATG	2	8	95301	95308	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010180	AATC	2	8	96976	96983	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_010180	TTTA	2	8	96996	97003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010180	ATAA	2	8	97415	97422	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010180	TTTG	2	8	97634	97641	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010180	GTAC	2	8	97822	97829	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_010180	CTTA	2	8	98046	98053	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_010180	CATA	2	8	100265	100272	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_010180	ATCG	2	8	100348	100355	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_010180	CAAA	2	8	102053	102060	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_010180	ACAG	2	8	102154	102161	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_010180	TTTA	2	8	104411	104418	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010180	TTAC	2	8	105063	105070	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_010180	TTAT	2	8	105188	105195	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010180	ATTT	2	8	105481	105488	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010180	CAAA	2	8	105662	105669	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_010180	ATTT	2	8	106280	106287	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010180	AAAC	2	8	108404	108411	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_010180	ACAA	2	8	108421	108428	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_010180	AGAA	2	8	108716	108723	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010180	TCAT	2	8	110197	110204	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_010180	AATT	2	8	116236	116243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010180	CATT	2	8	116368	116375	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_010180	TATT	2	8	117262	117269	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010180	GATA	2	8	118193	118200	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010180	AAGT	2	8	118377	118384	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010180	TATG	2	8	121300	121307	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010180	TTTA	2	8	121484	121491	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010180	CGTT	2	8	121647	121654	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_010180	ACAT	2	8	121944	121951	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_010180	AATA	2	8	122431	122438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010180	TAAA	2	8	124059	124066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010180	ATAG	2	8	124179	124186	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010180	CAAA	2	8	124221	124228	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_010180	AAGG	2	8	125019	125026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010180	ATAA	2	8	125695	125702	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010180	GTTC	2	8	127537	127544	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_010180	TGAA	2	8	127548	127555	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010180	TTTG	2	8	127669	127676	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010180	GAAA	2	8	128076	128083	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010180	TATT	2	8	128753	128760	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010180	TTGT	2	8	128891	128898	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010180	ATCT	2	8	128964	128971	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_010180	ATTA	2	8	129045	129052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010180	GCTA	2	8	130024	130031	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_010180	ATAA	2	8	130221	130228	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010180	TAGC	2	8	130576	130583	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_010180	GATA	2	8	131979	131986	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010180	TAAA	2	8	131987	131994	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010180	ATCT	2	8	134397	134404	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_010180	TAGA	2	8	134457	134464	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010180	ATTA	2	8	135695	135702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010180	TACT	2	8	135763	135770	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_010180	AGGG	2	8	137291	137298	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010180	TTTA	2	8	139686	139693	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010180	AAAT	2	8	142999	143006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010180	AATT	2	8	143049	143056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010180	GATT	2	8	143168	143175	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010180	AATC	2	8	143181	143188	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_010180	TAAT	2	8	143508	143515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010180	TATT	2	8	146638	146645	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010180	AAAT	2	8	148824	148831	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010180	CCCT	2	8	149013	149020	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
139	NC_010180	TTAA	2	8	149188	149195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010180	TATT	2	8	149210	149217	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010180	AAAG	2	8	149466	149473	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010180	TATG	2	8	149542	149549	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010180	CAAA	2	8	149734	149741	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_010180	ACTC	2	8	153222	153229	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_010180	ATTT	2	8	153802	153809	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010180	CAAC	2	8	154051	154058	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_010180	CAAT	2	8	154078	154085	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_010180	CTCC	2	8	154265	154272	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
149	NC_010180	GTTG	2	8	156120	156127	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010180	GTTT	2	8	158118	158125	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010180	ATTA	2	8	158505	158512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010180	TAAA	2	8	158630	158637	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010180	TTGG	2	8	158971	158978	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.