MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 3168

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010175	TGATT	2	10	983	992	20 %	60 %	20 %	0 %	163845604
2	NC_010175	AGCGC	2	10	3068	3077	20 %	0 %	40 %	40 %	163845605
3	NC_010175	CCGTG	2	10	3730	3739	0 %	20 %	40 %	40 %	163845605
4	NC_010175	TCGGT	2	10	5248	5257	0 %	40 %	40 %	20 %	163845606
5	NC_010175	CTGCC	2	10	6743	6752	0 %	20 %	20 %	60 %	163845607
6	NC_010175	GATCA	2	10	12239	12248	40 %	20 %	20 %	20 %	163845612
7	NC_010175	ACGGT	2	10	18008	18017	20 %	20 %	40 %	20 %	163845617
8	NC_010175	TGTAT	2	10	21269	21278	20 %	60 %	20 %	0 %	163845619
9	NC_010175	GCCCG	2	10	23964	23973	0 %	0 %	40 %	60 %	163845620
10	NC_010175	CTACG	2	10	24763	24772	20 %	20 %	20 %	40 %	163845621
11	NC_010175	TCGGT	2	10	28018	28027	0 %	40 %	40 %	20 %	163845624
12	NC_010175	ACCTC	2	10	28252	28261	20 %	20 %	0 %	60 %	163845624
13	NC_010175	TGCAA	2	10	29075	29084	40 %	20 %	20 %	20 %	163845625
14	NC_010175	TTCGG	2	10	29665	29674	0 %	40 %	40 %	20 %	163845625
15	NC_010175	GATTG	2	10	30174	30183	20 %	40 %	40 %	0 %	163845625
16	NC_010175	ACTGA	2	10	30358	30367	40 %	20 %	20 %	20 %	163845625
17	NC_010175	CGTAC	2	10	32719	32728	20 %	20 %	20 %	40 %	163845626
18	NC_010175	GCGCC	2	10	33385	33394	0 %	0 %	40 %	60 %	163845627
19	NC_010175	AACCG	2	10	35010	35019	40 %	0 %	20 %	40 %	163845629
20	NC_010175	GTAAA	3	15	37449	37463	60 %	20 %	20 %	0 %	163845631
21	NC_010175	TATTT	2	10	39520	39529	20 %	80 %	0 %	0 %	163845633
22	NC_010175	AGACG	2	10	43446	43455	40 %	0 %	40 %	20 %	163845637
23	NC_010175	TTGCG	2	10	43520	43529	0 %	40 %	40 %	20 %	163845637
24	NC_010175	CAAGG	2	10	50303	50312	40 %	0 %	40 %	20 %	163845640
25	NC_010175	CACTG	2	10	51181	51190	20 %	20 %	20 %	40 %	163845642
26	NC_010175	GCCTT	2	10	54098	54107	0 %	40 %	20 %	40 %	163845644
27	NC_010175	GGCCC	2	10	57028	57037	0 %	0 %	40 %	60 %	163845646
28	NC_010175	CGACC	2	10	58217	58226	20 %	0 %	20 %	60 %	163845648
29	NC_010175	CCTGG	2	10	58631	58640	0 %	20 %	40 %	40 %	163845649
30	NC_010175	ATTCA	2	10	61649	61658	40 %	40 %	0 %	20 %	163845652
31	NC_010175	CAACC	2	10	61747	61756	40 %	0 %	0 %	60 %	163845652
32	NC_010175	TCCAA	2	10	62628	62637	40 %	20 %	0 %	40 %	163845652
33	NC_010175	TTCCG	3	15	65257	65271	0 %	40 %	20 %	40 %	163845654
34	NC_010175	GATCA	2	10	67561	67570	40 %	20 %	20 %	20 %	163845656
35	NC_010175	ATGGT	2	10	68030	68039	20 %	40 %	40 %	0 %	163845656
36	NC_010175	CGCTC	2	10	68372	68381	0 %	20 %	20 %	60 %	163845657
37	NC_010175	TCCGC	2	10	68618	68627	0 %	20 %	20 %	60 %	163845657
38	NC_010175	GCTGG	2	10	69721	69730	0 %	20 %	60 %	20 %	163845658
39	NC_010175	TTCAT	2	10	71557	71566	20 %	60 %	0 %	20 %	163845659
40	NC_010175	CTGAT	2	10	72278	72287	20 %	40 %	20 %	20 %	163845660
41	NC_010175	GCTGG	2	10	73964	73973	0 %	20 %	60 %	20 %	163845661
42	NC_010175	CCCAG	2	10	78142	78151	20 %	0 %	20 %	60 %	163845665
43	NC_010175	CGCAG	2	10	80471	80480	20 %	0 %	40 %	40 %	163845667
44	NC_010175	CCAGT	2	10	80560	80569	20 %	20 %	20 %	40 %	163845667
45	NC_010175	CAACC	2	10	80641	80650	40 %	0 %	0 %	60 %	163845667
46	NC_010175	AAAAG	2	10	81167	81176	80 %	0 %	20 %	0 %	163845668
47	NC_010175	TTCAG	2	10	83048	83057	20 %	40 %	20 %	20 %	163845669
48	NC_010175	GCCGG	2	10	83172	83181	0 %	0 %	60 %	40 %	163845669
49	NC_010175	GGCCA	2	10	83311	83320	20 %	0 %	40 %	40 %	163845669
50	NC_010175	TTTCA	2	10	84796	84805	20 %	60 %	0 %	20 %	163845670
51	NC_010175	ATCAG	2	10	85829	85838	40 %	20 %	20 %	20 %	163845671
52	NC_010175	AGCGC	2	10	87118	87127	20 %	0 %	40 %	40 %	163845672
53	NC_010175	CAGGC	2	10	87794	87803	20 %	0 %	40 %	40 %	163845672
54	NC_010175	CTCAC	2	10	89562	89571	20 %	20 %	0 %	60 %	163845673
55	NC_010175	GGGTG	3	15	89854	89868	0 %	20 %	80 %	0 %	163845673
56	NC_010175	AGTGC	2	10	90385	90394	20 %	20 %	40 %	20 %	163845673
57	NC_010175	ATGAG	2	10	91859	91868	40 %	20 %	40 %	0 %	163845674
58	NC_010175	ACCGG	2	10	93936	93945	20 %	0 %	40 %	40 %	163845676
59	NC_010175	GGGGT	2	10	97791	97800	0 %	20 %	80 %	0 %	163845678
60	NC_010175	GTAGC	2	10	101912	101921	20 %	20 %	40 %	20 %	163845679
61	NC_010175	GTTCG	2	10	104875	104884	0 %	40 %	40 %	20 %	163845680
62	NC_010175	TGTTC	2	10	107881	107890	0 %	60 %	20 %	20 %	163845683
63	NC_010175	CTTTT	2	10	111010	111019	0 %	80 %	0 %	20 %	163845685
64	NC_010175	CGGCC	2	10	112141	112150	0 %	0 %	40 %	60 %	163845685
65	NC_010175	AAACA	2	10	113125	113134	80 %	0 %	0 %	20 %	163845685
66	NC_010175	TGATC	2	10	113622	113631	20 %	40 %	20 %	20 %	163845686
67	NC_010175	GCATA	2	10	115293	115302	40 %	20 %	20 %	20 %	163845688
68	NC_010175	CCAGC	2	10	115707	115716	20 %	0 %	20 %	60 %	163845689
69	NC_010175	CAGCA	2	10	115810	115819	40 %	0 %	20 %	40 %	163845689
70	NC_010175	TCCTG	2	10	118317	118326	0 %	40 %	20 %	40 %	163845690
71	NC_010175	GCCAG	2	10	118468	118477	20 %	0 %	40 %	40 %	163845690
72	NC_010175	CGCAG	2	10	118659	118668	20 %	0 %	40 %	40 %	163845690
73	NC_010175	CAGCA	2	10	119616	119625	40 %	0 %	20 %	40 %	163845691
74	NC_010175	CCTGG	2	10	124927	124936	0 %	20 %	40 %	40 %	163845694
75	NC_010175	CTGCG	2	10	126407	126416	0 %	20 %	40 %	40 %	163845695
76	NC_010175	ACCCG	2	10	126880	126889	20 %	0 %	20 %	60 %	163845695
77	NC_010175	CCACA	2	10	133307	133316	40 %	0 %	0 %	60 %	163845698
78	NC_010175	TCGCC	2	10	136850	136859	0 %	20 %	20 %	60 %	163845701
79	NC_010175	CATCG	2	10	137937	137946	20 %	20 %	20 %	40 %	163845701
80	NC_010175	TGGGT	2	10	142355	142364	0 %	40 %	60 %	0 %	163845704
81	NC_010175	GCAAC	2	10	145263	145272	40 %	0 %	20 %	40 %	163845708
82	NC_010175	CCTGG	2	10	146589	146598	0 %	20 %	40 %	40 %	163845709
83	NC_010175	AGATC	2	10	149742	149751	40 %	20 %	20 %	20 %	163845712
84	NC_010175	CCGGC	2	10	152492	152501	0 %	0 %	40 %	60 %	163845715
85	NC_010175	AACAC	2	10	154859	154868	60 %	0 %	0 %	40 %	163845716
86	NC_010175	TGGTC	2	10	155291	155300	0 %	40 %	40 %	20 %	163845716
87	NC_010175	GGGTC	2	10	156550	156559	0 %	20 %	60 %	20 %	163845717
88	NC_010175	TCACG	2	10	161017	161026	20 %	20 %	20 %	40 %	163845723
89	NC_010175	GATCC	2	10	164170	164179	20 %	20 %	20 %	40 %	163845726
90	NC_010175	TGATG	2	10	164349	164358	20 %	40 %	40 %	0 %	163845726
91	NC_010175	AAATC	2	10	164499	164508	60 %	20 %	0 %	20 %	163845726
92	NC_010175	GCACC	2	10	164773	164782	20 %	0 %	20 %	60 %	163845726
93	NC_010175	TCCGC	2	10	164895	164904	0 %	20 %	20 %	60 %	163845726
94	NC_010175	ATGCG	2	10	165941	165950	20 %	20 %	40 %	20 %	163845727
95	NC_010175	CACCG	2	10	167153	167162	20 %	0 %	20 %	60 %	163845728
96	NC_010175	ATTCC	2	10	168652	168661	20 %	40 %	0 %	40 %	163845729
97	NC_010175	CGGTG	2	10	169268	169277	0 %	20 %	60 %	20 %	163845730
98	NC_010175	GCTAC	2	10	169553	169562	20 %	20 %	20 %	40 %	163845730
99	NC_010175	CTCGA	2	10	170613	170622	20 %	20 %	20 %	40 %	163845731
100	NC_010175	ACGTG	2	10	172118	172127	20 %	20 %	40 %	20 %	163845733
101	NC_010175	TGCCC	2	10	174274	174283	0 %	20 %	20 %	60 %	163845736
102	NC_010175	GGCTA	2	10	175039	175048	20 %	20 %	40 %	20 %	163845737
103	NC_010175	GGATT	2	10	175906	175915	20 %	40 %	40 %	0 %	163845739
104	NC_010175	GCCAC	2	10	177333	177342	20 %	0 %	20 %	60 %	163845740
105	NC_010175	CGCAG	2	10	178087	178096	20 %	0 %	40 %	40 %	163845741
106	NC_010175	CGTGC	2	10	183427	183436	0 %	20 %	40 %	40 %	163845745
107	NC_010175	AATAC	2	10	186273	186282	60 %	20 %	0 %	20 %	163845747
108	NC_010175	TGGGG	2	10	187518	187527	0 %	20 %	80 %	0 %	163845748
109	NC_010175	CTGAC	2	10	198885	198894	20 %	20 %	20 %	40 %	163845760
110	NC_010175	CGATG	2	10	201986	201995	20 %	20 %	40 %	20 %	163845762
111	NC_010175	ATGCA	2	10	202216	202225	40 %	20 %	20 %	20 %	163845762
112	NC_010175	CGCTG	2	10	205471	205480	0 %	20 %	40 %	40 %	163845765
113	NC_010175	TCGCT	2	10	207440	207449	0 %	40 %	20 %	40 %	163845766
114	NC_010175	TGGCG	2	10	207883	207892	0 %	20 %	60 %	20 %	163845766
115	NC_010175	CCGAC	2	10	208104	208113	20 %	0 %	20 %	60 %	163845767
116	NC_010175	GATCA	2	10	209439	209448	40 %	20 %	20 %	20 %	163845768
117	NC_010175	GCGCG	2	10	211890	211899	0 %	0 %	60 %	40 %	163845769
118	NC_010175	TTCCC	2	10	216751	216760	0 %	40 %	0 %	60 %	163845771
119	NC_010175	CATCG	2	10	216836	216845	20 %	20 %	20 %	40 %	163845771
120	NC_010175	ACACC	2	10	219165	219174	40 %	0 %	0 %	60 %	163845772
121	NC_010175	GCACA	2	10	220441	220450	40 %	0 %	20 %	40 %	163845773
122	NC_010175	CGGGC	2	10	222246	222255	0 %	0 %	60 %	40 %	163845775
123	NC_010175	GGGCC	2	10	222524	222533	0 %	0 %	60 %	40 %	163845776
124	NC_010175	CGGGC	2	10	222805	222814	0 %	0 %	60 %	40 %	163845776
125	NC_010175	GCACA	2	10	223956	223965	40 %	0 %	20 %	40 %	163845777
126	NC_010175	GCCAG	2	10	225531	225540	20 %	0 %	40 %	40 %	163845778
127	NC_010175	TTGAT	2	10	229649	229658	20 %	60 %	20 %	0 %	163845780
128	NC_010175	GGGTC	2	10	231685	231694	0 %	20 %	60 %	20 %	163845782
129	NC_010175	GACGA	2	10	231765	231774	40 %	0 %	40 %	20 %	163845782
130	NC_010175	ACCGA	2	10	232553	232562	40 %	0 %	20 %	40 %	163845783
131	NC_010175	CCAAT	2	10	233745	233754	40 %	20 %	0 %	40 %	163845783
132	NC_010175	GCAGT	2	10	235614	235623	20 %	20 %	40 %	20 %	163845784
133	NC_010175	TGAGT	2	10	238829	238838	20 %	40 %	40 %	0 %	163845787
134	NC_010175	GAAAC	2	10	238871	238880	60 %	0 %	20 %	20 %	163845787
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261	NC_010175	CGCGC	2	10	452375	452384	0 %	0 %	40 %	60 %	163845953
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384	NC_010175	GCTTG	2	10	659946	659955	0 %	40 %	40 %	20 %	163846108
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388	NC_010175	TGCAT	2	10	667618	667627	20 %	40 %	20 %	20 %	163846117
389	NC_010175	GGCCG	2	10	668371	668380	0 %	0 %	60 %	40 %	163846117
390	NC_010175	GATGA	2	10	668615	668624	40 %	20 %	40 %	0 %	163846117
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