MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 13558

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010175	TCAT	2	8	286	293	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010175	GAAG	2	8	482	489	50 %	0 %	50 %	0 %	163845604
3	NC_010175	GCCT	2	8	816	823	0 %	25 %	25 %	50 %	163845604
4	NC_010175	TTCA	2	8	1129	1136	25 %	50 %	0 %	25 %	163845604
5	NC_010175	GAGC	2	8	1511	1518	25 %	0 %	50 %	25 %	163845604
6	NC_010175	TCGC	2	8	1556	1563	0 %	25 %	25 %	50 %	163845604
7	NC_010175	AACG	2	8	1791	1798	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_010175	CTGT	2	8	1830	1837	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010175	TGCG	2	8	2324	2331	0 %	25 %	50 %	25 %	163845605
10	NC_010175	GGCC	2	8	2867	2874	0 %	0 %	50 %	50 %	163845605
11	NC_010175	TGGC	2	8	3118	3125	0 %	25 %	50 %	25 %	163845605
12	NC_010175	CCAA	2	8	3179	3186	50 %	0 %	0 %	50 %	163845605
13	NC_010175	GGCA	2	8	3863	3870	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010175	GCCA	2	8	4236	4243	25 %	0 %	25 %	50 %	163845606
15	NC_010175	AAAG	2	8	4487	4494	75 %	0 %	25 %	0 %	163845606
16	NC_010175	ACCA	2	8	4761	4768	50 %	0 %	0 %	50 %	163845606
17	NC_010175	GTAC	2	8	4951	4958	25 %	25 %	25 %	25 %	163845606
18	NC_010175	TGTT	2	8	6053	6060	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010175	GGTA	2	8	6214	6221	25 %	25 %	50 %	0 %	163845607
20	NC_010175	CAGG	2	8	6471	6478	25 %	0 %	50 %	25 %	163845607
21	NC_010175	CCCA	2	8	6554	6561	25 %	0 %	0 %	75 %	163845607
22	NC_010175	GTCC	2	8	7507	7514	0 %	25 %	25 %	50 %	163845607
23	NC_010175	GATC	2	8	7516	7523	25 %	25 %	25 %	25 %	163845607
24	NC_010175	CGCC	2	8	7643	7650	0 %	0 %	25 %	75 %	163845607
25	NC_010175	GCGT	2	8	8470	8477	0 %	25 %	50 %	25 %	163845608
26	NC_010175	GCGG	2	8	8602	8609	0 %	0 %	75 %	25 %	163845608
27	NC_010175	GATA	2	8	9338	9345	50 %	25 %	25 %	0 %	163845609
28	NC_010175	CCAG	2	8	9406	9413	25 %	0 %	25 %	50 %	163845609
29	NC_010175	CAAC	2	8	9954	9961	50 %	0 %	0 %	50 %	163845609
30	NC_010175	CAAT	2	8	10229	10236	50 %	25 %	0 %	25 %	163845609
31	NC_010175	CGAA	2	8	10426	10433	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010175	AGCC	2	8	11200	11207	25 %	0 %	25 %	50 %	163845611
33	NC_010175	ATCA	2	8	11225	11232	50 %	25 %	0 %	25 %	163845611
34	NC_010175	GATC	2	8	11269	11276	25 %	25 %	25 %	25 %	163845611
35	NC_010175	TGCC	2	8	11363	11370	0 %	25 %	25 %	50 %	163845611
36	NC_010175	CATC	2	8	11610	11617	25 %	25 %	0 %	50 %	163845612
37	NC_010175	AACC	2	8	11974	11981	50 %	0 %	0 %	50 %	163845612
38	NC_010175	GATC	2	8	12103	12110	25 %	25 %	25 %	25 %	163845612
39	NC_010175	GGGC	2	8	12586	12593	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010175	GCGG	2	8	13014	13021	0 %	0 %	75 %	25 %	163845613
41	NC_010175	GGTT	2	8	13176	13183	0 %	50 %	50 %	0 %	163845613
42	NC_010175	AATG	2	8	13906	13913	50 %	25 %	25 %	0 %	163845613
43	NC_010175	TGGT	2	8	14548	14555	0 %	50 %	50 %	0 %	163845614
44	NC_010175	CTGG	2	8	14741	14748	0 %	25 %	50 %	25 %	163845614
45	NC_010175	CGGA	2	8	14845	14852	25 %	0 %	50 %	25 %	163845614
46	NC_010175	TGGC	2	8	14865	14872	0 %	25 %	50 %	25 %	163845614
47	NC_010175	GATC	2	8	15353	15360	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010175	CAGT	2	8	16175	16182	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_010175	CAGA	2	8	16457	16464	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_010175	ACTG	2	8	16586	16593	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_010175	TGGC	2	8	17880	17887	0 %	25 %	50 %	25 %	163845617
52	NC_010175	ACCC	2	8	18740	18747	25 %	0 %	0 %	75 %	163845618
53	NC_010175	GACA	2	8	19204	19211	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010175	GAGC	2	8	19936	19943	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_010175	CATC	2	8	19982	19989	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010175	CCAC	2	8	20088	20095	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
57	NC_010175	CTCA	2	8	20109	20116	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_010175	GTTT	2	8	20233	20240	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010175	ATTT	2	8	20391	20398	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010175	CAAC	2	8	20484	20491	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010175	CCGA	2	8	21159	21166	25 %	0 %	25 %	50 %	163845619
62	NC_010175	CAGG	2	8	21531	21538	25 %	0 %	50 %	25 %	163845619
63	NC_010175	ACAG	2	8	21852	21859	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_010175	GCGT	2	8	22140	22147	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_010175	GGTG	2	8	22653	22660	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010175	AGCC	2	8	23209	23216	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010175	CGCT	2	8	23400	23407	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_010175	ACGA	2	8	23807	23814	50 %	0 %	25 %	25 %	163845620
69	NC_010175	CGGT	2	8	24830	24837	0 %	25 %	50 %	25 %	163845621
70	NC_010175	ACAG	2	8	24987	24994	50 %	0 %	25 %	25 %	163845621
71	NC_010175	TCAG	2	8	25139	25146	25 %	25 %	25 %	25 %	163845621
72	NC_010175	TGAG	2	8	25205	25212	25 %	25 %	50 %	0 %	163845621
73	NC_010175	GTGC	2	8	25720	25727	0 %	25 %	50 %	25 %	163845621
74	NC_010175	CATC	2	8	26284	26291	25 %	25 %	0 %	50 %	163845622
75	NC_010175	GAGC	2	8	26362	26369	25 %	0 %	50 %	25 %	163845622
76	NC_010175	CAAC	2	8	26722	26729	50 %	0 %	0 %	50 %	163845623
77	NC_010175	CAGG	2	8	26812	26819	25 %	0 %	50 %	25 %	163845623
78	NC_010175	TGAT	2	8	27020	27027	25 %	50 %	25 %	0 %	163845623
79	NC_010175	ACCG	2	8	27104	27111	25 %	0 %	25 %	50 %	163845623
80	NC_010175	CACG	2	8	27430	27437	25 %	0 %	25 %	50 %	163845623
81	NC_010175	TGCA	2	8	27487	27494	25 %	25 %	25 %	25 %	163845623
82	NC_010175	ATGC	2	8	27768	27775	25 %	25 %	25 %	25 %	163845624
83	NC_010175	GGCC	2	8	28995	29002	0 %	0 %	50 %	50 %	163845625
84	NC_010175	GATC	2	8	29553	29560	25 %	25 %	25 %	25 %	163845625
85	NC_010175	CAAT	2	8	29589	29596	50 %	25 %	0 %	25 %	163845625
86	NC_010175	GAGC	2	8	29736	29743	25 %	0 %	50 %	25 %	163845625
87	NC_010175	ACCA	2	8	29836	29843	50 %	0 %	0 %	50 %	163845625
88	NC_010175	CTGG	2	8	30120	30127	0 %	25 %	50 %	25 %	163845625
89	NC_010175	CAGC	2	8	30410	30417	25 %	0 %	25 %	50 %	163845625
90	NC_010175	CGAC	2	8	30642	30649	25 %	0 %	25 %	50 %	163845625
91	NC_010175	TGGT	2	8	30977	30984	0 %	50 %	50 %	0 %	163845625
92	NC_010175	GAAG	2	8	31296	31303	50 %	0 %	50 %	0 %	163845625
93	NC_010175	GCTC	2	8	32515	32522	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_010175	GGCC	2	8	32792	32799	0 %	0 %	50 %	50 %	163845626
95	NC_010175	GGCA	2	8	33368	33375	25 %	0 %	50 %	25 %	163845627
96	NC_010175	ACCG	2	8	34082	34089	25 %	0 %	25 %	50 %	163845628
97	NC_010175	AATC	2	8	34213	34220	50 %	25 %	0 %	25 %	163845628
98	NC_010175	GCCT	2	8	34539	34546	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_010175	AGCC	2	8	35101	35108	25 %	0 %	25 %	50 %	163845629
100	NC_010175	TGCG	2	8	35837	35844	0 %	25 %	50 %	25 %	163845629
101	NC_010175	AGAA	2	8	36088	36095	75 %	0 %	25 %	0 %	163845629
102	NC_010175	CCAT	2	8	36992	36999	25 %	25 %	0 %	50 %	163845631
103	NC_010175	AACG	2	8	37570	37577	50 %	0 %	25 %	25 %	163845631
104	NC_010175	CAAT	2	8	38088	38095	50 %	25 %	0 %	25 %	163845632
105	NC_010175	CCGA	2	8	38320	38327	25 %	0 %	25 %	50 %	163845632
106	NC_010175	AGGC	2	8	38496	38503	25 %	0 %	50 %	25 %	163845632
107	NC_010175	GCAG	2	8	38511	38518	25 %	0 %	50 %	25 %	163845632
108	NC_010175	GGAT	2	8	38674	38681	25 %	25 %	50 %	0 %	163845632
109	NC_010175	GACC	2	8	39614	39621	25 %	0 %	25 %	50 %	163845633
110	NC_010175	CATC	3	12	39829	39840	25 %	25 %	0 %	50 %	163845633
111	NC_010175	CTGG	2	8	40402	40409	0 %	25 %	50 %	25 %	163845633
112	NC_010175	ACCC	2	8	40469	40476	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
113	NC_010175	TCCA	2	8	40512	40519	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_010175	AACC	2	8	40785	40792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_010175	CGGC	2	8	40870	40877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_010175	CTTA	2	8	42567	42574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_010175	TCGT	2	8	42823	42830	0 %	50 %	25 %	25 %	163845636
118	NC_010175	GCCA	2	8	43204	43211	25 %	0 %	25 %	50 %	163845636
119	NC_010175	CAGC	2	8	43462	43469	25 %	0 %	25 %	50 %	163845637
120	NC_010175	GCCA	2	8	43503	43510	25 %	0 %	25 %	50 %	163845637
121	NC_010175	CAAG	2	8	43719	43726	50 %	0 %	25 %	25 %	163845637
122	NC_010175	GAAC	2	8	43744	43751	50 %	0 %	25 %	25 %	163845637
123	NC_010175	TCGG	2	8	43948	43955	0 %	25 %	50 %	25 %	163845638
124	NC_010175	GATA	2	8	44078	44085	50 %	25 %	25 %	0 %	163845638
125	NC_010175	GCCG	2	8	44256	44263	0 %	0 %	50 %	50 %	163845638
126	NC_010175	CAAT	2	8	44435	44442	50 %	25 %	0 %	25 %	163845638
127	NC_010175	GCCA	2	8	44598	44605	25 %	0 %	25 %	50 %	163845639
128	NC_010175	CAGC	2	8	44656	44663	25 %	0 %	25 %	50 %	163845639
129	NC_010175	TCGT	2	8	44774	44781	0 %	50 %	25 %	25 %	163845639
130	NC_010175	CGCC	2	8	44820	44827	0 %	0 %	25 %	75 %	163845639
131	NC_010175	AAGC	2	8	44899	44906	50 %	0 %	25 %	25 %	163845639
132	NC_010175	CAGC	2	8	45191	45198	25 %	0 %	25 %	50 %	163845639
133	NC_010175	AAAT	2	8	45346	45353	75 %	25 %	0 %	0 %	163845639
134	NC_010175	CCAT	2	8	45516	45523	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_010175	GCCG	2	8	45683	45690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_010175	ACTG	2	8	45950	45957	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_010175	ACGA	2	8	46633	46640	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_010175	TGCG	2	8	46945	46952	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_010175	TTGA	2	8	47448	47455	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010175	GCGA	2	8	48198	48205	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_010175	TTTG	2	8	48975	48982	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010175	TGAC	2	8	49127	49134	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_010175	GGTG	2	8	49568	49575	0 %	25 %	75 %	0 %	163845640
144	NC_010175	CTCG	2	8	50359	50366	0 %	25 %	25 %	50 %	163845640
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