MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 74921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010175	GAT	2	6	86	91	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010175	ACC	2	6	110	115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_010175	TTG	2	6	155	160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010175	ATG	2	6	186	191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010175	ACA	2	6	192	197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010175	AGA	2	6	205	210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010175	TGC	2	6	213	218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010175	CAC	2	6	226	231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_010175	CAA	2	6	249	254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010175	AGG	2	6	324	329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010175	TGA	2	6	634	639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845604
12	NC_010175	TCG	2	6	784	789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845604
13	NC_010175	CGG	2	6	872	877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845604
14	NC_010175	CTG	2	6	900	905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845604
15	NC_010175	GTC	2	6	962	967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845604
16	NC_010175	TCG	2	6	1001	1006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845604
17	NC_010175	GCA	2	6	1007	1012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845604
18	NC_010175	TTG	2	6	1231	1236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845604
19	NC_010175	CGG	2	6	1476	1481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845604
20	NC_010175	TAC	2	6	1664	1669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845604
21	NC_010175	TGC	2	6	1762	1767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845604
22	NC_010175	TAA	2	6	1878	1883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010175	AGG	2	6	1928	1933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010175	CCG	2	6	1960	1965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845605
25	NC_010175	CGC	2	6	2002	2007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845605
26	NC_010175	ATA	2	6	2046	2051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163845605
27	NC_010175	TGG	2	6	2080	2085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845605
28	NC_010175	GGC	2	6	2129	2134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845605
29	NC_010175	GCC	2	6	2147	2152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845605
30	NC_010175	ATC	3	9	2273	2281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845605
31	NC_010175	GTC	2	6	2351	2356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845605
32	NC_010175	CGG	2	6	2359	2364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845605
33	NC_010175	TGA	2	6	2395	2400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845605
34	NC_010175	TTG	2	6	2472	2477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845605
35	NC_010175	GAA	2	6	2557	2562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845605
36	NC_010175	GCG	2	6	2757	2762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845605
37	NC_010175	TCT	2	6	2772	2777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845605
38	NC_010175	GGT	2	6	2800	2805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845605
39	NC_010175	CAC	2	6	2829	2834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845605
40	NC_010175	GTC	2	6	2855	2860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845605
41	NC_010175	TGG	2	6	2897	2902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845605
42	NC_010175	GCC	2	6	3026	3031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845605
43	NC_010175	ACT	2	6	3099	3104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845605
44	NC_010175	GTT	2	6	3154	3159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845605
45	NC_010175	ACC	2	6	3238	3243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845605
46	NC_010175	CCG	2	6	3281	3286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845605
47	NC_010175	ACG	2	6	3309	3314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845605
48	NC_010175	CTC	2	6	3359	3364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163845605
49	NC_010175	GGT	2	6	3481	3486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845605
50	NC_010175	CGA	2	6	3532	3537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845605
51	NC_010175	GTT	2	6	3560	3565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845605
52	NC_010175	CTC	2	6	3588	3593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163845605
53	NC_010175	GAC	2	6	3602	3607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845605
54	NC_010175	CGA	2	6	3719	3724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845605
55	NC_010175	GAC	2	6	3779	3784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845605
56	NC_010175	TGC	2	6	3819	3824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845605
57	NC_010175	GCG	2	6	3825	3830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845605
58	NC_010175	CGC	2	6	4028	4033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_010175	AGG	2	6	4048	4053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010175	GAG	2	6	4215	4220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163845606
61	NC_010175	CGA	2	6	4277	4282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845606
62	NC_010175	CAA	2	6	4286	4291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845606
63	NC_010175	TAC	2	6	4428	4433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845606
64	NC_010175	TGC	2	6	4568	4573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845606
65	NC_010175	CTG	2	6	4654	4659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845606
66	NC_010175	GAA	2	6	4694	4699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845606
67	NC_010175	GGA	2	6	4865	4870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163845606
68	NC_010175	GAC	2	6	4898	4903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845606
69	NC_010175	GCC	2	6	5010	5015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845606
70	NC_010175	TGG	2	6	5124	5129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845606
71	NC_010175	TGG	2	6	5337	5342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845606
72	NC_010175	CCG	2	6	5380	5385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845606
73	NC_010175	TGT	2	6	5438	5443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845606
74	NC_010175	ATG	2	6	5514	5519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845606
75	NC_010175	TAC	2	6	5580	5585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845606
76	NC_010175	GCC	2	6	5586	5591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845606
77	NC_010175	GAC	2	6	5646	5651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845606
78	NC_010175	CCG	2	6	5683	5688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845606
79	NC_010175	GAG	2	6	5988	5993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163845606
80	NC_010175	TGT	2	6	6068	6073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010175	GGC	2	6	6127	6132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010175	AGC	2	6	6351	6356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845607
83	NC_010175	TGT	2	6	6578	6583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845607
84	NC_010175	TGG	2	6	6590	6595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845607
85	NC_010175	TGG	2	6	6620	6625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845607
86	NC_010175	GGC	2	6	6653	6658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845607
87	NC_010175	GGA	2	6	6681	6686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163845607
88	NC_010175	TGG	2	6	6698	6703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845607
89	NC_010175	GTG	2	6	6712	6717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845607
90	NC_010175	AGC	2	6	6728	6733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845607
91	NC_010175	AGC	3	9	6758	6766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845607
92	NC_010175	GCA	2	6	6771	6776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845607
93	NC_010175	GTG	2	6	6784	6789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845607
94	NC_010175	GCC	2	6	6846	6851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845607
95	NC_010175	GCA	2	6	6912	6917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845607
96	NC_010175	TCG	2	6	6934	6939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845607
97	NC_010175	CGG	2	6	6956	6961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845607
98	NC_010175	AGG	2	6	7073	7078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163845607
99	NC_010175	ATC	2	6	7176	7181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845607
100	NC_010175	GCT	2	6	7273	7278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845607
101	NC_010175	GAT	2	6	7301	7306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845607
102	NC_010175	AAT	2	6	7413	7418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163845607
103	NC_010175	CCA	2	6	7545	7550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845607
104	NC_010175	TGT	2	6	7715	7720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010175	CAT	2	6	7739	7744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010175	ATA	2	6	7785	7790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010175	TTC	2	6	7827	7832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845608
108	NC_010175	ATC	2	6	7865	7870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845608
109	NC_010175	GCA	2	6	7947	7952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845608
110	NC_010175	TTC	2	6	7962	7967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845608
111	NC_010175	ACC	3	9	7973	7981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845608
112	NC_010175	AGA	2	6	8113	8118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845608
113	NC_010175	TGC	2	6	8151	8156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845608
114	NC_010175	GTG	2	6	8191	8196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845608
115	NC_010175	CTG	2	6	8390	8395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845608
116	NC_010175	ATC	2	6	8400	8405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845608
117	NC_010175	CAA	2	6	8636	8641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845608
118	NC_010175	TTC	2	6	8741	8746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845608
119	NC_010175	ATC	2	6	8762	8767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845608
120	NC_010175	CGG	2	6	8780	8785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845608
121	NC_010175	TCG	2	6	8823	8828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845608
122	NC_010175	ATC	4	12	8915	8926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845608
123	NC_010175	TCG	2	6	9072	9077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845608
124	NC_010175	CCG	2	6	9418	9423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845609
125	NC_010175	GAT	2	6	9525	9530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845609
126	NC_010175	CAA	2	6	9864	9869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845609
127	NC_010175	GAT	2	6	10074	10079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845609
128	NC_010175	TGC	2	6	10111	10116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845609
129	NC_010175	CGG	2	6	10213	10218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845609
130	NC_010175	TGA	2	6	10256	10261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845609
131	NC_010175	GGC	2	6	10276	10281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845609
132	NC_010175	ACA	2	6	10301	10306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845609
133	NC_010175	GAC	2	6	10320	10325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845609
134	NC_010175	ACT	2	6	10335	10340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845609
135	NC_010175	TTC	2	6	10396	10401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010175	TCG	2	6	10450	10455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_010175	TAT	2	6	10461	10466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010175	CGG	2	6	10499	10504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845610
139	NC_010175	GCG	2	6	10517	10522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845610
140	NC_010175	CAT	2	6	10649	10654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845610
141	NC_010175	GTC	2	6	10676	10681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845610
142	NC_010175	TCG	2	6	10787	10792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845611
143	NC_010175	TTG	2	6	10829	10834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845611
144	NC_010175	CAC	2	6	11035	11040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845611
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153	NC_010175	CAC	2	6	11488	11493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845611
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160	NC_010175	GCC	2	6	11991	11996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845612
161	NC_010175	TGC	2	6	12042	12047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845612
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164	NC_010175	TAC	2	6	12259	12264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845612
165	NC_010175	ACA	2	6	12339	12344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_010175	GCA	2	6	12471	12476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_010175	GCA	2	6	12554	12559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_010175	GCC	2	6	12565	12570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
169	NC_010175	GCA	2	6	12633	12638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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171	NC_010175	GCA	2	6	12718	12723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_010175	GCA	2	6	12780	12785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_010175	CTC	2	6	12857	12862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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249	NC_010175	ATG	2	6	19320	19325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
250	NC_010175	TGA	2	6	19393	19398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
251	NC_010175	CAG	2	6	19497	19502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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253	NC_010175	CAG	2	6	19533	19538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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256	NC_010175	GTA	2	6	19668	19673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
257	NC_010175	CCA	2	6	19748	19753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
258	NC_010175	ATG	2	6	19846	19851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
259	NC_010175	TGA	2	6	19881	19886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
260	NC_010175	AGG	2	6	20047	20052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
261	NC_010175	CCT	2	6	20121	20126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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263	NC_010175	TGC	2	6	20191	20196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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265	NC_010175	TGC	2	6	20245	20250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_010175	AAT	2	6	20445	20450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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268	NC_010175	GTA	2	6	20634	20639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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