MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 13599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010175	GAT	2	6	86	91	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010175	ACC	2	6	110	115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_010175	TTG	2	6	155	160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010175	ATG	2	6	186	191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010175	ACA	2	6	192	197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010175	AGA	2	6	205	210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010175	TGC	2	6	213	218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010175	CAC	2	6	226	231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_010175	CAA	2	6	249	254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010175	AGG	2	6	324	329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010175	TAA	2	6	1878	1883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010175	AGG	2	6	1928	1933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010175	CGC	2	6	4028	4033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_010175	AGG	2	6	4048	4053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010175	TGT	2	6	6068	6073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010175	GGC	2	6	6127	6132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010175	TGT	2	6	7715	7720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010175	CAT	2	6	7739	7744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010175	ATA	2	6	7785	7790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010175	TTC	2	6	10396	10401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010175	TCG	2	6	10450	10455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010175	TAT	2	6	10461	10466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010175	ACA	2	6	12339	12344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010175	GCA	2	6	12471	12476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010175	GCA	2	6	12554	12559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010175	GCC	2	6	12565	12570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_010175	GCA	2	6	12633	12638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010175	ACA	2	6	12683	12688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010175	GCA	2	6	12718	12723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010175	GCA	2	6	12780	12785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010175	CTC	2	6	12857	12862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_010175	CGC	2	6	15455	15460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_010175	AGC	2	6	15480	15485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010175	CGG	2	6	15585	15590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010175	CAT	2	6	15672	15677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010175	GAT	2	6	15729	15734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010175	CAC	2	6	16021	16026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_010175	GGA	2	6	16035	16040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010175	TGC	2	6	16066	16071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010175	GGC	2	6	16206	16211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010175	GCT	2	6	16324	16329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010175	GCA	2	6	16333	16338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010175	GTC	2	6	16428	16433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010175	ACC	2	6	16621	16626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_010175	GAT	2	6	16654	16659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010175	TCA	2	6	17310	17315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010175	CCT	2	6	18880	18885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_010175	GTT	2	6	18911	18916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010175	TCC	2	6	18990	18995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_010175	ATG	2	6	19320	19325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010175	TGA	2	6	19393	19398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010175	CAG	2	6	19497	19502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010175	ATG	2	6	19508	19513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010175	CAG	2	6	19533	19538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010175	GAT	2	6	19602	19607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010175	GAC	2	6	19622	19627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010175	GTA	2	6	19668	19673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010175	CCA	2	6	19748	19753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_010175	ATG	2	6	19846	19851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010175	TGA	2	6	19881	19886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010175	AGG	2	6	20047	20052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010175	CCT	2	6	20121	20126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_010175	ATA	2	6	20152	20157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010175	TGC	2	6	20191	20196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010175	GCT	2	6	20223	20228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010175	TGC	2	6	20245	20250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010175	AAT	2	6	20445	20450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010175	GTG	2	6	20473	20478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010175	GTA	2	6	20634	20639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010175	GTT	2	6	20672	20677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010175	AAG	2	6	20688	20693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010175	CGC	2	6	20694	20699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_010175	ATC	2	6	20759	20764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010175	TGA	2	6	20868	20873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010175	GGA	2	6	20902	20907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010175	GGA	2	6	21746	21751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010175	GTC	2	6	21758	21763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010175	TGA	2	6	21816	21821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010175	GAG	2	6	21986	21991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010175	AGG	2	6	22001	22006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010175	ACG	2	6	22016	22021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010175	ACC	2	6	22158	22163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_010175	GCG	2	6	22206	22211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010175	GAC	2	6	22235	22240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010175	GAT	2	6	22262	22267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010175	CAG	2	6	22487	22492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010175	TCG	2	6	22511	22516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010175	AGA	2	6	22540	22545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010175	CCT	2	6	22556	22561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_010175	CAC	2	6	22591	22596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_010175	CAC	2	6	22606	22611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_010175	CGT	2	6	22675	22680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010175	TCG	2	6	22761	22766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010175	CCA	2	6	22867	22872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_010175	GAC	2	6	22981	22986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010175	CGT	2	6	23011	23016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010175	GCA	2	6	23178	23183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010175	GCG	2	6	23256	23261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010175	CCA	2	6	23459	23464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_010175	CTA	2	6	32261	32266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010175	CAC	2	6	32274	32279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_010175	GCT	2	6	32359	32364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010175	GTT	2	6	32371	32376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010175	CAA	2	6	32492	32497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_010175	ACA	2	6	32529	32534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010175	AGG	2	6	33030	33035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010175	ATA	2	6	33747	33752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010175	TGC	2	6	33775	33780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010175	CAC	2	6	33851	33856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_010175	AAC	2	6	33886	33891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010175	ACA	2	6	33916	33921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010175	GGC	2	6	33931	33936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010175	CCT	2	6	33995	34000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_010175	CAT	2	6	34001	34006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010175	AGA	2	6	34009	34014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010175	GAG	2	6	34016	34021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010175	ACT	2	6	34504	34509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010175	TCA	2	6	34607	34612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010175	CTC	2	6	36390	36395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_010175	ACA	2	6	36691	36696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010175	CAT	2	6	36818	36823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_010175	CAC	2	6	36824	36829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_010175	TAT	2	6	38914	38919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010175	TGC	2	6	38926	38931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_010175	GAG	2	6	38958	38963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010175	TCA	2	6	39004	39009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010175	CAA	2	6	39044	39049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010175	GAC	2	6	39115	39120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010175	GCA	2	6	39238	39243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010175	ACG	2	6	39261	39266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_010175	GAC	2	6	39351	39356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_010175	AAG	2	6	39373	39378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010175	GAA	2	6	39388	39393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010175	CAT	2	6	39455	39460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010175	TGT	2	6	39464	39469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010175	CAT	2	6	40686	40691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_010175	CAA	2	6	40748	40753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_010175	GAT	2	6	40794	40799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010175	GCA	2	6	40881	40886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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