MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chloroflexus aurantiacus J-10-fl chromosome

Total Repeats: 61322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010175	TGA	2	6	634	639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845604
2	NC_010175	TCG	2	6	784	789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845604
3	NC_010175	CGG	2	6	872	877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845604
4	NC_010175	CTG	2	6	900	905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845604
5	NC_010175	GTC	2	6	962	967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845604
6	NC_010175	TCG	2	6	1001	1006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845604
7	NC_010175	GCA	2	6	1007	1012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845604
8	NC_010175	TTG	2	6	1231	1236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845604
9	NC_010175	CGG	2	6	1476	1481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845604
10	NC_010175	TAC	2	6	1664	1669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845604
11	NC_010175	TGC	2	6	1762	1767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845604
12	NC_010175	CCG	2	6	1960	1965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845605
13	NC_010175	CGC	2	6	2002	2007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845605
14	NC_010175	ATA	2	6	2046	2051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163845605
15	NC_010175	TGG	2	6	2080	2085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845605
16	NC_010175	GGC	2	6	2129	2134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845605
17	NC_010175	GCC	2	6	2147	2152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845605
18	NC_010175	ATC	3	9	2273	2281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845605
19	NC_010175	GTC	2	6	2351	2356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845605
20	NC_010175	CGG	2	6	2359	2364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845605
21	NC_010175	TGA	2	6	2395	2400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845605
22	NC_010175	TTG	2	6	2472	2477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845605
23	NC_010175	GAA	2	6	2557	2562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845605
24	NC_010175	GCG	2	6	2757	2762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845605
25	NC_010175	TCT	2	6	2772	2777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845605
26	NC_010175	GGT	2	6	2800	2805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845605
27	NC_010175	CAC	2	6	2829	2834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845605
28	NC_010175	GTC	2	6	2855	2860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845605
29	NC_010175	TGG	2	6	2897	2902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845605
30	NC_010175	GCC	2	6	3026	3031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845605
31	NC_010175	ACT	2	6	3099	3104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845605
32	NC_010175	GTT	2	6	3154	3159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845605
33	NC_010175	ACC	2	6	3238	3243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845605
34	NC_010175	CCG	2	6	3281	3286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845605
35	NC_010175	ACG	2	6	3309	3314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845605
36	NC_010175	CTC	2	6	3359	3364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163845605
37	NC_010175	GGT	2	6	3481	3486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845605
38	NC_010175	CGA	2	6	3532	3537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845605
39	NC_010175	GTT	2	6	3560	3565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845605
40	NC_010175	CTC	2	6	3588	3593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163845605
41	NC_010175	GAC	2	6	3602	3607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845605
42	NC_010175	CGA	2	6	3719	3724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845605
43	NC_010175	GAC	2	6	3779	3784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845605
44	NC_010175	TGC	2	6	3819	3824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845605
45	NC_010175	GCG	2	6	3825	3830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845605
46	NC_010175	GAG	2	6	4215	4220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163845606
47	NC_010175	CGA	2	6	4277	4282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845606
48	NC_010175	CAA	2	6	4286	4291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845606
49	NC_010175	TAC	2	6	4428	4433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845606
50	NC_010175	TGC	2	6	4568	4573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845606
51	NC_010175	CTG	2	6	4654	4659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845606
52	NC_010175	GAA	2	6	4694	4699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845606
53	NC_010175	GGA	2	6	4865	4870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163845606
54	NC_010175	GAC	2	6	4898	4903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845606
55	NC_010175	GCC	2	6	5010	5015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845606
56	NC_010175	TGG	2	6	5124	5129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845606
57	NC_010175	TGG	2	6	5337	5342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845606
58	NC_010175	CCG	2	6	5380	5385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845606
59	NC_010175	TGT	2	6	5438	5443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845606
60	NC_010175	ATG	2	6	5514	5519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845606
61	NC_010175	TAC	2	6	5580	5585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845606
62	NC_010175	GCC	2	6	5586	5591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845606
63	NC_010175	GAC	2	6	5646	5651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845606
64	NC_010175	CCG	2	6	5683	5688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845606
65	NC_010175	GAG	2	6	5988	5993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163845606
66	NC_010175	AGC	2	6	6351	6356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845607
67	NC_010175	TGT	2	6	6578	6583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845607
68	NC_010175	TGG	2	6	6590	6595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845607
69	NC_010175	TGG	2	6	6620	6625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845607
70	NC_010175	GGC	2	6	6653	6658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845607
71	NC_010175	GGA	2	6	6681	6686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163845607
72	NC_010175	TGG	2	6	6698	6703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845607
73	NC_010175	GTG	2	6	6712	6717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845607
74	NC_010175	AGC	2	6	6728	6733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845607
75	NC_010175	AGC	3	9	6758	6766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845607
76	NC_010175	GCA	2	6	6771	6776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845607
77	NC_010175	GTG	2	6	6784	6789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845607
78	NC_010175	GCC	2	6	6846	6851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845607
79	NC_010175	GCA	2	6	6912	6917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845607
80	NC_010175	TCG	2	6	6934	6939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845607
81	NC_010175	CGG	2	6	6956	6961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845607
82	NC_010175	AGG	2	6	7073	7078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163845607
83	NC_010175	ATC	2	6	7176	7181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845607
84	NC_010175	GCT	2	6	7273	7278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845607
85	NC_010175	GAT	2	6	7301	7306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845607
86	NC_010175	AAT	2	6	7413	7418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163845607
87	NC_010175	CCA	2	6	7545	7550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845607
88	NC_010175	TTC	2	6	7827	7832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845608
89	NC_010175	ATC	2	6	7865	7870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845608
90	NC_010175	GCA	2	6	7947	7952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845608
91	NC_010175	TTC	2	6	7962	7967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845608
92	NC_010175	ACC	3	9	7973	7981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845608
93	NC_010175	AGA	2	6	8113	8118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845608
94	NC_010175	TGC	2	6	8151	8156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845608
95	NC_010175	GTG	2	6	8191	8196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845608
96	NC_010175	CTG	2	6	8390	8395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845608
97	NC_010175	ATC	2	6	8400	8405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845608
98	NC_010175	CAA	2	6	8636	8641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845608
99	NC_010175	TTC	2	6	8741	8746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845608
100	NC_010175	ATC	2	6	8762	8767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845608
101	NC_010175	CGG	2	6	8780	8785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845608
102	NC_010175	TCG	2	6	8823	8828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845608
103	NC_010175	ATC	4	12	8915	8926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845608
104	NC_010175	TCG	2	6	9072	9077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845608
105	NC_010175	CCG	2	6	9418	9423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845609
106	NC_010175	GAT	2	6	9525	9530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845609
107	NC_010175	CAA	2	6	9864	9869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845609
108	NC_010175	GAT	2	6	10074	10079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845609
109	NC_010175	TGC	2	6	10111	10116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845609
110	NC_010175	CGG	2	6	10213	10218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845609
111	NC_010175	TGA	2	6	10256	10261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845609
112	NC_010175	GGC	2	6	10276	10281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845609
113	NC_010175	ACA	2	6	10301	10306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845609
114	NC_010175	GAC	2	6	10320	10325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845609
115	NC_010175	ACT	2	6	10335	10340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845609
116	NC_010175	CGG	2	6	10499	10504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845610
117	NC_010175	GCG	2	6	10517	10522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845610
118	NC_010175	CAT	2	6	10649	10654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845610
119	NC_010175	GTC	2	6	10676	10681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845610
120	NC_010175	TCG	2	6	10787	10792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845611
121	NC_010175	TTG	2	6	10829	10834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845611
122	NC_010175	CAC	2	6	11035	11040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845611
123	NC_010175	CGG	2	6	11095	11100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845611
124	NC_010175	CCG	2	6	11137	11142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845611
125	NC_010175	CGT	2	6	11153	11158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845611
126	NC_010175	AAT	2	6	11162	11167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163845611
127	NC_010175	TCA	2	6	11172	11177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845611
128	NC_010175	TTG	2	6	11279	11284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845611
129	NC_010175	CAA	2	6	11324	11329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163845611
130	NC_010175	GAC	2	6	11435	11440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845611
131	NC_010175	CAC	2	6	11488	11493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845611
132	NC_010175	GGT	2	6	11522	11527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845611
133	NC_010175	GTC	2	6	11529	11534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845611
134	NC_010175	AAT	2	6	11738	11743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163845612
135	NC_010175	ACC	2	6	11799	11804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845612
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138	NC_010175	GCC	2	6	11991	11996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845612
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142	NC_010175	TAC	2	6	12259	12264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845612
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145	NC_010175	GGC	2	6	13320	13325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845613
146	NC_010175	CTG	2	6	13399	13404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845613
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151	NC_010175	GTT	2	6	14096	14101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163845614
152	NC_010175	CTG	2	6	14292	14297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845614
153	NC_010175	GGC	2	6	14315	14320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845614
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159	NC_010175	CTG	2	6	14643	14648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163845614
160	NC_010175	TCT	2	6	14710	14715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163845614
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162	NC_010175	CGG	2	6	14817	14822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845614
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235	NC_010175	GAT	2	6	25420	25425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845621
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239	NC_010175	GGT	2	6	25611	25616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845621
240	NC_010175	CAT	2	6	25659	25664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845621
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243	NC_010175	TCA	2	6	25835	25840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845621
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246	NC_010175	GAG	2	6	25903	25908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163845621
247	NC_010175	AGC	2	6	25916	25921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163845621
248	NC_010175	TGA	2	6	25933	25938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163845621
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250	NC_010175	GTG	2	6	26030	26035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163845622
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252	NC_010175	GCG	2	6	26249	26254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163845622
253	NC_010175	GCC	2	6	26411	26416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163845622
254	NC_010175	GAA	2	6	26872	26877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163845623
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256	NC_010175	ATC	2	6	26945	26950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163845623
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281	NC_010175	CTC	2	6	28975	28980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163845625
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500	NC_010175	CAC	2	6	50047	50052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163845640

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