MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methylobacterium extorquens PA1 chromosome

Total Repeats: 5735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010172	CCGGC	3	15	345	359	0 %	0 %	40 %	60 %	163849458
2	NC_010172	GCCCG	2	10	448	457	0 %	0 %	40 %	60 %	163849458
3	NC_010172	TCGCC	2	10	474	483	0 %	20 %	20 %	60 %	163849458
4	NC_010172	ACCAC	2	10	1443	1452	40 %	0 %	0 %	60 %	163849458
5	NC_010172	GGGCC	2	10	4129	4138	0 %	0 %	60 %	40 %	163849460
6	NC_010172	CGCGC	2	10	4960	4969	0 %	0 %	40 %	60 %	163849463
7	NC_010172	ACGGA	2	10	5036	5045	40 %	0 %	40 %	20 %	163849463
8	NC_010172	ACCCG	2	10	5591	5600	20 %	0 %	20 %	60 %	163849463
9	NC_010172	GCCCT	2	10	5713	5722	0 %	20 %	20 %	60 %	163849463
10	NC_010172	GGCGA	2	10	6097	6106	20 %	0 %	60 %	20 %	163849463
11	NC_010172	GACGG	2	10	6157	6166	20 %	0 %	60 %	20 %	163849463
12	NC_010172	GCCGA	2	10	6481	6490	20 %	0 %	40 %	40 %	163849463
13	NC_010172	TCCAG	2	10	6975	6984	20 %	20 %	20 %	40 %	163849464
14	NC_010172	GGCGC	2	10	10980	10989	0 %	0 %	60 %	40 %	163849467
15	NC_010172	GATCG	2	10	11980	11989	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_010172	GCCAC	2	10	13701	13710	20 %	0 %	20 %	60 %	163849468
17	NC_010172	TCTGA	2	10	14539	14548	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_010172	TCTGC	2	10	15074	15083	0 %	40 %	20 %	40 %	163849471
19	NC_010172	GGGCC	2	10	15173	15182	0 %	0 %	60 %	40 %	163849471
20	NC_010172	GCCGG	2	10	16338	16347	0 %	0 %	60 %	40 %	163849472
21	NC_010172	CGGTC	2	10	16463	16472	0 %	20 %	40 %	40 %	163849472
22	NC_010172	AAGCG	2	10	17116	17125	40 %	0 %	40 %	20 %	163849473
23	NC_010172	CGCCC	2	10	17419	17428	0 %	0 %	20 %	80 %	163849474
24	NC_010172	GCGCC	2	10	17896	17905	0 %	0 %	40 %	60 %	163849474
25	NC_010172	GGCAT	2	10	18150	18159	20 %	20 %	40 %	20 %	163849474
26	NC_010172	GACGA	2	10	20181	20190	40 %	0 %	40 %	20 %	163849475
27	NC_010172	GCTCG	2	10	22329	22338	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_010172	CGCTC	2	10	22393	22402	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_010172	CGGTT	2	10	23361	23370	0 %	40 %	40 %	20 %	163849477
30	NC_010172	CCGCG	2	10	23455	23464	0 %	0 %	40 %	60 %	163849477
31	NC_010172	CCGCG	2	10	24608	24617	0 %	0 %	40 %	60 %	163849478
32	NC_010172	CGCCC	2	10	25874	25883	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
33	NC_010172	CGGGC	2	10	26210	26219	0 %	0 %	60 %	40 %	163849480
34	NC_010172	CGCTC	2	10	27137	27146	0 %	20 %	20 %	60 %	163849480
35	NC_010172	CGCGG	2	10	27729	27738	0 %	0 %	60 %	40 %	163849480
36	NC_010172	CCGGG	2	10	28593	28602	0 %	0 %	60 %	40 %	163849482
37	NC_010172	GCAGA	2	10	29627	29636	40 %	0 %	40 %	20 %	163849483
38	NC_010172	GCGCC	2	10	30100	30109	0 %	0 %	40 %	60 %	163849484
39	NC_010172	TGCGC	2	10	31797	31806	0 %	20 %	40 %	40 %	163849486
40	NC_010172	GCGAG	2	10	31853	31862	20 %	0 %	60 %	20 %	163849486
41	NC_010172	CGGTT	2	10	32900	32909	0 %	40 %	40 %	20 %	163849487
42	NC_010172	CGGCG	2	10	33393	33402	0 %	0 %	60 %	40 %	163849487
43	NC_010172	GTCGC	2	10	34105	34114	0 %	20 %	40 %	40 %	163849487
44	NC_010172	GGCCG	2	10	34248	34257	0 %	0 %	60 %	40 %	163849487
45	NC_010172	ACCGC	2	10	34387	34396	20 %	0 %	20 %	60 %	163849487
46	NC_010172	GGCAT	2	10	37364	37373	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_010172	CGCTG	2	10	41755	41764	0 %	20 %	40 %	40 %	163849493
48	NC_010172	GCGAA	2	10	45950	45959	40 %	0 %	40 %	20 %	163849495
49	NC_010172	CCGAC	2	10	49046	49055	20 %	0 %	20 %	60 %	163849497
50	NC_010172	CCGGG	2	10	49478	49487	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
51	NC_010172	GACAG	2	10	49503	49512	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_010172	TGCAA	2	10	54678	54687	40 %	20 %	20 %	20 %	163849504
53	NC_010172	CGGTC	2	10	55484	55493	0 %	20 %	40 %	40 %	163849505
54	NC_010172	GGCCC	2	10	56272	56281	0 %	0 %	40 %	60 %	163849505
55	NC_010172	CGGAG	2	10	57021	57030	20 %	0 %	60 %	20 %	163849505
56	NC_010172	GCCGC	2	10	58385	58394	0 %	0 %	40 %	60 %	163849507
57	NC_010172	CCGTC	2	10	59004	59013	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
58	NC_010172	GCTCG	2	10	61071	61080	0 %	20 %	40 %	40 %	163849509
59	NC_010172	GGTCC	2	10	61241	61250	0 %	20 %	40 %	40 %	163849509
60	NC_010172	GCGAC	2	10	63200	63209	20 %	0 %	40 %	40 %	163849511
61	NC_010172	CCCTG	2	10	63980	63989	0 %	20 %	20 %	60 %	163849512
62	NC_010172	GCCGG	2	10	64570	64579	0 %	0 %	60 %	40 %	163849512
63	NC_010172	AGGCG	2	10	64979	64988	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_010172	CATGC	2	10	65245	65254	20 %	20 %	20 %	40 %	163849513
65	NC_010172	CGACG	2	10	65894	65903	20 %	0 %	40 %	40 %	163849514
66	NC_010172	CCGCT	2	10	67622	67631	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
67	NC_010172	GCTAG	2	10	67779	67788	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_010172	CTGGC	2	10	68310	68319	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_010172	TGCCG	2	10	74690	74699	0 %	20 %	40 %	40 %	163849521
70	NC_010172	CGGCA	2	10	74804	74813	20 %	0 %	40 %	40 %	163849521
71	NC_010172	TTTCC	2	10	78044	78053	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_010172	ACGCG	2	10	81303	81312	20 %	0 %	40 %	40 %	163849526
73	NC_010172	GATGC	2	10	81649	81658	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_010172	ATATA	2	10	82126	82135	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010172	ATCAA	2	10	82309	82318	60 %	20 %	0 %	20 %	163849527
76	NC_010172	GGATG	2	10	82931	82940	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010172	CGGTA	2	10	84740	84749	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_010172	ATCGC	2	10	86334	86343	20 %	20 %	20 %	40 %	163849534
79	NC_010172	GACAT	2	10	86572	86581	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_010172	ACAGG	2	10	87314	87323	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_010172	GCCCA	2	10	89872	89881	20 %	0 %	20 %	60 %	163849538
82	NC_010172	CACCT	2	10	91957	91966	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
83	NC_010172	TCGGC	2	10	92046	92055	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
84	NC_010172	GGCTG	2	10	92493	92502	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
85	NC_010172	GCGCC	2	10	96102	96111	0 %	0 %	40 %	60 %	163849547
86	NC_010172	GACCT	2	10	97200	97209	20 %	20 %	20 %	40 %	163849549
87	NC_010172	ACGCC	2	10	97289	97298	20 %	0 %	20 %	60 %	163849549
88	NC_010172	CGAGG	2	10	97353	97362	20 %	0 %	60 %	20 %	163849549
89	NC_010172	CCGGC	2	10	97756	97765	0 %	0 %	40 %	60 %	163849549
90	NC_010172	GGCAA	2	10	98211	98220	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_010172	CGCTG	2	10	99397	99406	0 %	20 %	40 %	40 %	163849551
92	NC_010172	CGCGG	2	10	99520	99529	0 %	0 %	60 %	40 %	163849551
93	NC_010172	GGTTG	2	10	101205	101214	0 %	40 %	60 %	0 %	163849552
94	NC_010172	CCAGG	2	10	102754	102763	20 %	0 %	40 %	40 %	163849554
95	NC_010172	TGCGG	2	10	107310	107319	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
96	NC_010172	CCCTG	2	10	107713	107722	0 %	20 %	20 %	60 %	163849558
97	NC_010172	GCCGG	2	10	108303	108312	0 %	0 %	60 %	40 %	163849558
98	NC_010172	AGGCG	2	10	108712	108721	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_010172	GACAC	2	10	109125	109134	40 %	0 %	20 %	40 %	163849559
100	NC_010172	GCCCT	2	10	110809	110818	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
101	NC_010172	GGGCG	2	10	111053	111062	0 %	0 %	80 %	20 %	163849561
102	NC_010172	TGCTC	2	10	111817	111826	0 %	40 %	20 %	40 %	163849562
103	NC_010172	GCATG	2	10	112156	112165	20 %	20 %	40 %	20 %	163849562
104	NC_010172	CTGAC	2	10	113253	113262	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_010172	GACGT	2	10	114504	114513	20 %	20 %	40 %	20 %	163849564
106	NC_010172	CGTTC	2	10	115960	115969	0 %	40 %	20 %	40 %	163849565
107	NC_010172	CGCTG	2	10	116543	116552	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_010172	TTTCA	2	10	117208	117217	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_010172	TGCCG	2	10	118988	118997	0 %	20 %	40 %	40 %	163849567
110	NC_010172	TGGCG	2	10	119358	119367	0 %	20 %	60 %	20 %	163849567
111	NC_010172	TGCCC	2	10	121094	121103	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
112	NC_010172	GATCA	2	10	122250	122259	40 %	20 %	20 %	20 %	163849570
113	NC_010172	TGGGG	2	10	122838	122847	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010172	TTGGC	2	10	123742	123751	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_010172	TGCCC	2	10	124001	124010	0 %	20 %	20 %	60 %	163849573
116	NC_010172	AACCG	2	10	124352	124361	40 %	0 %	20 %	40 %	163849574
117	NC_010172	ACCGA	2	10	125355	125364	40 %	0 %	20 %	40 %	163849575
118	NC_010172	CGTGC	2	10	125864	125873	0 %	20 %	40 %	40 %	163849576
119	NC_010172	CACGC	2	10	125909	125918	20 %	0 %	20 %	60 %	163849576
120	NC_010172	CAGGC	2	10	128600	128609	20 %	0 %	40 %	40 %	163849578
121	NC_010172	ACGGC	2	10	128696	128705	20 %	0 %	40 %	40 %	163849578
122	NC_010172	CGTTG	2	10	128740	128749	0 %	40 %	40 %	20 %	163849578
123	NC_010172	GCTGG	2	10	129514	129523	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_010172	CCTCG	2	10	130290	130299	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
125	NC_010172	GCTGA	2	10	130910	130919	20 %	20 %	40 %	20 %	163849579
126	NC_010172	CGCGA	2	10	131720	131729	20 %	0 %	40 %	40 %	163849579
127	NC_010172	GGGCA	2	10	131996	132005	20 %	0 %	60 %	20 %	163849579
128	NC_010172	CGCGG	2	10	132298	132307	0 %	0 %	60 %	40 %	163849579
129	NC_010172	CGACC	2	10	132314	132323	20 %	0 %	20 %	60 %	163849579
130	NC_010172	GGCGG	2	10	132457	132466	0 %	0 %	80 %	20 %	163849579
131	NC_010172	GTGTG	2	10	132849	132858	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010172	AATTG	2	10	136153	136162	40 %	40 %	20 %	0 %	163849582
133	NC_010172	GCGAA	2	10	136238	136247	40 %	0 %	40 %	20 %	163849582
134	NC_010172	ATCTA	2	10	140891	140900	40 %	40 %	0 %	20 %	163849586
135	NC_010172	GCGTA	2	10	145157	145166	20 %	20 %	40 %	20 %	163849589
136	NC_010172	AGCCA	2	10	146513	146522	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_010172	GCGAC	2	10	147487	147496	20 %	0 %	40 %	40 %	163849591
138	NC_010172	TCCGC	2	10	150752	150761	0 %	20 %	20 %	60 %	163849591
139	NC_010172	GATTT	2	10	153762	153771	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010172	CCGTG	2	10	154661	154670	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
141	NC_010172	GACAG	2	10	156836	156845	40 %	0 %	40 %	20 %	163849596
142	NC_010172	TGCGT	2	10	156870	156879	0 %	40 %	40 %	20 %	163849596
143	NC_010172	CGGAG	2	10	160069	160078	20 %	0 %	60 %	20 %	163849600
144	NC_010172	ATATA	2	10	162046	162055	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010172	ACGAG	2	10	163397	163406	40 %	0 %	40 %	20 %	163849604
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147	NC_010172	TGACC	2	10	167482	167491	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
148	NC_010172	CCGAG	2	10	169177	169186	20 %	0 %	40 %	40 %	163849608
149	NC_010172	GGTCA	2	10	170298	170307	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
150	NC_010172	TCCGA	2	10	171703	171712	20 %	20 %	20 %	40 %	163849611
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153	NC_010172	CAGCG	2	10	175829	175838	20 %	0 %	40 %	40 %	163849615
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155	NC_010172	GCCCA	2	10	178137	178146	20 %	0 %	20 %	60 %	163849618
156	NC_010172	GGAAC	2	10	179840	179849	40 %	0 %	40 %	20 %	163849619
157	NC_010172	CACCT	2	10	180222	180231	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
158	NC_010172	TCGGC	2	10	180311	180320	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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160	NC_010172	CGATG	2	10	182373	182382	20 %	20 %	40 %	20 %	163849623
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162	NC_010172	CCGGT	2	10	184472	184481	0 %	20 %	40 %	40 %	163849625
163	NC_010172	TTCCC	2	10	184605	184614	0 %	40 %	0 %	60 %	163849625
164	NC_010172	TCCTG	2	10	185517	185526	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
165	NC_010172	ACATC	2	10	186438	186447	40 %	20 %	0 %	40 %	163849627
166	NC_010172	TATTT	2	10	186508	186517	20 %	80 %	0 %	0 %	163849627
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176	NC_010172	GAGTT	2	10	197745	197754	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
177	NC_010172	TGATC	2	10	198283	198292	20 %	40 %	20 %	20 %	163849637
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183	NC_010172	CGACC	2	10	200831	200840	20 %	0 %	20 %	60 %	163849639
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190	NC_010172	TTCGG	2	10	207419	207428	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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218	NC_010172	GCGCG	2	10	233208	233217	0 %	0 %	60 %	40 %	163849667
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220	NC_010172	GCTGC	2	10	235219	235228	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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240	NC_010172	CGAGG	2	10	253428	253437	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
241	NC_010172	CTCGC	2	10	254607	254616	0 %	20 %	20 %	60 %	163849687
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259	NC_010172	GTCGC	2	10	270810	270819	0 %	20 %	40 %	40 %	163849701
260	NC_010172	CGCGC	2	10	271433	271442	0 %	0 %	40 %	60 %	163849702
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262	NC_010172	CGGTT	2	10	272919	272928	0 %	40 %	40 %	20 %	163849703
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264	NC_010172	GTGCG	2	10	275657	275666	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
265	NC_010172	GAACA	2	10	276426	276435	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
266	NC_010172	CGGCG	2	10	278599	278608	0 %	0 %	60 %	40 %	163849705
267	NC_010172	CAGGA	2	10	278773	278782	40 %	0 %	40 %	20 %	163849706
268	NC_010172	CTTTT	2	10	279772	279781	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
269	NC_010172	GCCCC	2	10	282198	282207	0 %	0 %	20 %	80 %	163849709
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