MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylobacterium extorquens PA1 chromosome

Total Repeats: 2927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010172	TGGG	2	8	1796	1803	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010172	CGGG	2	8	1832	1839	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_010172	ATCC	2	8	7227	7234	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010172	AGCG	2	8	14258	14265	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010172	CCGA	2	8	14552	14559	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_010172	CGGT	2	8	17296	17303	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_010172	TGTT	2	8	18354	18361	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010172	TGAT	2	8	22463	22470	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010172	CCGC	2	8	25670	25677	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_010172	TGCA	2	8	25968	25975	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010172	TCCT	2	8	25992	25999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010172	CGGT	2	8	26105	26112	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010172	CCGG	2	8	26116	26123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_010172	GGGC	2	8	32301	32308	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_010172	GCTA	2	8	34754	34761	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010172	TGTT	2	8	37615	37622	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010172	GGTG	2	8	54657	54664	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010172	CTTA	2	8	62494	62501	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010172	AGCC	2	8	62606	62613	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010172	CGGA	2	8	62721	62728	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010172	GAGG	2	8	62847	62854	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010172	CCGG	2	8	63884	63891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010172	ACTC	2	8	66599	66606	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010172	TGAG	2	8	66856	66863	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010172	AAAC	2	8	66987	66994	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_010172	TTCC	2	8	67722	67729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010172	ATCC	2	8	67871	67878	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010172	GTCG	2	8	67938	67945	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010172	GGTG	2	8	68494	68501	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010172	TCGC	2	8	68594	68601	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010172	GGAA	2	8	69686	69693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010172	GACT	2	8	73025	73032	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_010172	CATC	2	8	73138	73145	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010172	AGGG	2	8	73806	73813	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010172	CATC	2	8	74184	74191	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010172	CCCT	2	8	74196	74203	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_010172	AGCA	2	8	75372	75379	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010172	GGCC	2	8	76009	76016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010172	GCCG	2	8	76099	76106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_010172	ACGC	2	8	76898	76905	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_010172	CTGT	2	8	78096	78103	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_010172	TCAA	2	8	80125	80132	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_010172	ACTG	2	8	80524	80531	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010172	GAGT	2	8	80893	80900	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010172	ACAA	2	8	80989	80996	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_010172	GCAC	2	8	81694	81701	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010172	TGGC	2	8	81974	81981	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010172	TTCT	2	8	82082	82089	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_010172	GCTG	2	8	82782	82789	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_010172	TGCT	2	8	83038	83045	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_010172	TGCC	2	8	84779	84786	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_010172	GACC	2	8	86592	86599	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_010172	GCTG	2	8	86712	86719	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010172	GCCG	2	8	87675	87682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010172	ACCC	2	8	87865	87872	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
56	NC_010172	AGCC	2	8	87979	87986	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010172	AGCG	2	8	88555	88562	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_010172	AGCC	2	8	90535	90542	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_010172	CTGC	2	8	95119	95126	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010172	GAAG	2	8	96547	96554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010172	GGCC	2	8	97993	98000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_010172	CGGC	2	8	98072	98079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_010172	CTTC	2	8	105282	105289	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010172	TCCT	2	8	105349	105356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010172	GAGG	2	8	107501	107508	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010172	GCAG	2	8	109661	109668	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_010172	GTCG	2	8	110593	110600	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_010172	CATC	2	8	110783	110790	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010172	GTTC	2	8	111487	111494	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_010172	ACTG	2	8	113164	113171	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_010172	GGCT	2	8	113172	113179	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_010172	GGCT	2	8	113264	113271	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010172	GCCG	2	8	116504	116511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_010172	ATGC	2	8	117242	117249	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_010172	AACA	2	8	117262	117269	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_010172	TTCA	2	8	117430	117437	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_010172	TGCG	2	8	117766	117773	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_010172	GTTT	2	8	118362	118369	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010172	CTCG	2	8	118560	118567	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_010172	CGGC	2	8	118571	118578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_010172	CCCG	2	8	118632	118639	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_010172	CCGC	2	8	118671	118678	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83	NC_010172	TCGC	2	8	119643	119650	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_010172	AAGC	2	8	120074	120081	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_010172	CTCG	2	8	120308	120315	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_010172	ATCC	2	8	120532	120539	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_010172	GGGC	2	8	123532	123539	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_010172	ACCG	2	8	126466	126473	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010172	GTCA	2	8	126544	126551	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_010172	CTAT	2	8	126613	126620	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_010172	AGGC	2	8	128298	128305	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_010172	GCCG	2	8	128512	128519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_010172	TCAC	2	8	129598	129605	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_010172	ATCG	2	8	129814	129821	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_010172	CAGG	2	8	130209	130216	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_010172	GCCT	2	8	132655	132662	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_010172	TGGG	2	8	132679	132686	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010172	CGCT	2	8	132832	132839	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_010172	ACTT	2	8	135884	135891	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010172	GCAC	2	8	136986	136993	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_010172	TTTG	2	8	137027	137034	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010172	TTCT	2	8	137355	137362	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_010172	CACG	2	8	137571	137578	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_010172	CCGC	2	8	137865	137872	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
105	NC_010172	CGGG	2	8	137967	137974	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_010172	GGGC	2	8	137997	138004	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
107	NC_010172	CTGC	2	8	138035	138042	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_010172	CAGC	2	8	138631	138638	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_010172	ACCG	2	8	138685	138692	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_010172	ACCG	2	8	138817	138824	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_010172	GGCG	2	8	139519	139526	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_010172	CAAC	2	8	139680	139687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_010172	GCCA	2	8	139783	139790	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_010172	GCTC	2	8	139826	139833	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_010172	TCAG	2	8	140070	140077	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_010172	AATC	2	8	140400	140407	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_010172	GTTC	2	8	141889	141896	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_010172	ACAA	2	8	142438	142445	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_010172	CGAC	2	8	142451	142458	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_010172	GCTT	2	8	142692	142699	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_010172	GGCT	2	8	144613	144620	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_010172	TTGC	2	8	146114	146121	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_010172	AGGC	2	8	146212	146219	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_010172	ACGA	2	8	146232	146239	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_010172	TCAT	2	8	146647	146654	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_010172	CACG	2	8	146776	146783	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_010172	GTGA	2	8	151367	151374	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010172	GCCT	2	8	151710	151717	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_010172	GGCG	2	8	151754	151761	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_010172	AATG	2	8	151787	151794	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010172	ATCG	2	8	153268	153275	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_010172	GGTC	2	8	154382	154389	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_010172	CACC	2	8	154734	154741	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
134	NC_010172	CAGT	2	8	158519	158526	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_010172	GTTG	2	8	158884	158891	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010172	GAGC	2	8	159094	159101	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_010172	TGGC	2	8	161894	161901	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_010172	TTCT	2	8	162002	162009	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_010172	GCTG	2	8	162702	162709	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_010172	GCCT	2	8	162877	162884	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_010172	CTGA	2	8	162912	162919	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_010172	CGGC	2	8	168681	168688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_010172	GGCT	2	8	168866	168873	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_010172	GCGG	2	8	169401	169408	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
145	NC_010172	CTGT	2	8	170172	170179	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_010172	TCAG	2	8	170272	170279	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_010172	CGGC	2	8	170991	170998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_010172	GCCA	2	8	176393	176400	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_010172	ACGA	2	8	177681	177688	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_010172	CGAG	2	8	177807	177814	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_010172	CAGC	2	8	178016	178023	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_010172	AGCC	2	8	178800	178807	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_010172	GAGC	2	8	182732	182739	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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192	NC_010172	GGAT	2	8	259956	259963	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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368	NC_010172	CTGC	2	8	588368	588375	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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496	NC_010172	GCTC	2	8	831342	831349	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
497	NC_010172	GCGG	2	8	831529	831536	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
498	NC_010172	GGAC	2	8	832467	832474	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
499	NC_010172	CGAG	2	8	832481	832488	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
500	NC_010172	GATG	2	8	832538	832545	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding

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