MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella suis ATCC 23445 chromosome I

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010169	ACGGTT	2	12	34835	34846	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_010169	GCATCG	2	12	73547	73558	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010169	GAGCCG	2	12	73585	73596	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010169	ATGCCG	2	12	75937	75948	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010169	TTTTGC	2	12	94828	94839	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_010169	GCTTTT	2	12	103606	103617	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_010169	TGAGCG	2	12	143183	143194	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010169	GCCGAG	2	12	159244	159255	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010169	GGGGAA	2	12	166457	166468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010169	TCTGGC	2	12	182948	182959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010169	AGCCGG	2	12	239058	239069	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010169	CGGTGC	2	12	239848	239859	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010169	CAAGGC	2	12	239968	239979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010169	CAGGTG	2	12	242865	242876	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010169	CTCCCG	2	12	270753	270764	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_010169	CACGCG	2	12	276301	276312	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_010169	ACGCGC	2	12	276422	276433	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010169	GGCACA	2	12	303387	303398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010169	CGATCT	2	12	327528	327539	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010169	CTGAAA	2	12	349129	349140	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_010169	CTGTCT	2	12	360747	360758	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010169	CTGCAC	2	12	408571	408582	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010169	TCGATA	2	12	442994	443005	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010169	TTTAAC	2	12	450984	450995	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_010169	CGTTTT	2	12	524716	524727	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_010169	ACGGTC	2	12	544814	544825	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010169	TTACGT	2	12	575103	575114	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_010169	TTTTCG	2	12	604763	604774	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_010169	CAGTTC	2	12	607008	607019	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010169	TGGTCG	2	12	611878	611889	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_010169	GTTCTG	2	12	671180	671191	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_010169	ATTGAA	2	12	771237	771248	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010169	CTTTTC	2	12	787224	787235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010169	TCGCGC	2	12	827868	827879	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010169	GAAATT	2	12	919745	919756	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010169	AGACGC	2	12	954155	954166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010169	TGCCGG	2	12	999998	1000009	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010169	AACCCC	2	12	1000607	1000618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_010169	GCTGAT	2	12	1018102	1018113	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010169	TTTCCT	2	12	1029449	1029460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010169	GGATGG	2	12	1029629	1029640	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010169	CGCCAG	2	12	1030022	1030033	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010169	TATTTT	2	12	1037473	1037484	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010169	CCTGAT	2	12	1109858	1109869	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010169	CCAGCC	2	12	1116192	1116203	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_010169	TTGGCC	2	12	1134453	1134464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010169	TTTTCC	2	12	1162295	1162306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010169	CAAAAA	2	12	1200782	1200793	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_010169	TGAATT	2	12	1256306	1256317	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010169	GCCGAC	2	12	1260669	1260680	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010169	CCGGCA	2	12	1279555	1279566	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_010169	AGTCGA	2	12	1280307	1280318	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_010169	CAGCGC	2	12	1293474	1293485	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_010169	CGGGTT	2	12	1293541	1293552	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_010169	CGTTTC	2	12	1313043	1313054	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010169	CACCGC	2	12	1314096	1314107	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_010169	AAAACA	2	12	1314285	1314296	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_010169	TCGGCG	2	12	1341460	1341471	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010169	AATCGA	2	12	1342332	1342343	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_010169	ACCCAG	2	12	1342420	1342431	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010169	AAAGCG	2	12	1353177	1353188	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_010169	ATAGCC	2	12	1353427	1353438	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010169	AAGAAA	2	12	1356093	1356104	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010169	CCGCGC	2	12	1405146	1405157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_010169	GTAAAA	2	12	1423474	1423485	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010169	GCATTT	2	12	1429450	1429461	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_010169	GATCGC	2	12	1433055	1433066	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010169	GCGCAT	2	12	1447542	1447553	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010169	ATGCCA	2	12	1457478	1457489	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010169	CTGAAA	2	12	1468398	1468409	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_010169	AAGGAA	2	12	1489744	1489755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010169	GCTCTG	2	12	1491825	1491836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010169	GCAATC	2	12	1552495	1552506	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010169	AAAAGC	2	12	1564334	1564345	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_010169	CTGCCG	2	12	1611631	1611642	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_010169	AGAAAC	2	12	1657956	1657967	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_010169	AACTCA	2	12	1674089	1674100	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010169	CGTGGC	2	12	1779285	1779296	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010169	TTCTTT	2	12	1878226	1878237	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_010169	GGAAAC	2	12	1902236	1902247	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_010169	ATCGAG	2	12	1914614	1914625	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_010169	TCTTTG	2	12	1915967	1915978	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.