MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella suis ATCC 23445 chromosome I

Total Repeats: 262

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010169	CCAGT	2	10	15678	15687	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_010169	GCGTC	2	10	24575	24584	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_010169	CATGC	2	10	26931	26940	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_010169	CATGC	2	10	28347	28356	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_010169	CGAAA	2	10	28545	28554	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_010169	CGGAG	2	10	31523	31532	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_010169	CCGTG	2	10	40665	40674	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_010169	TAAAG	2	10	50811	50820	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010169	TGAAA	2	10	51928	51937	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010169	CGGAG	2	10	72837	72846	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_010169	GGCGC	2	10	74074	74083	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12	NC_010169	GATGC	2	10	75989	75998	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_010169	AAATA	2	10	78871	78880	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010169	AAGGC	2	10	83845	83854	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_010169	TCTGG	2	10	83990	83999	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_010169	TCGAT	2	10	89584	89593	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_010169	TTCCA	2	10	95861	95870	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_010169	CGGTT	2	10	96233	96242	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_010169	GAACC	2	10	96285	96294	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_010169	GCACC	2	10	107169	107178	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_010169	TTTGT	2	10	107662	107671	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010169	ATGGA	2	10	123211	123220	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010169	ACAGC	2	10	159192	159201	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_010169	CGGAG	2	10	162527	162536	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_010169	ACAAA	2	10	162594	162603	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_010169	CTGCC	2	10	167158	167167	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_010169	TGAAA	2	10	168530	168539	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010169	CGTGT	2	10	169427	169436	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_010169	TTTTA	2	10	171234	171243	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010169	TGAAT	2	10	182016	182025	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010169	AAAGC	2	10	193135	193144	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_010169	GGCGC	2	10	204885	204894	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
33	NC_010169	TTTCG	2	10	213768	213777	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_010169	TCAGG	2	10	216838	216847	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_010169	CTTGG	2	10	224883	224892	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_010169	GGCAG	2	10	230261	230270	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_010169	GGGGC	2	10	238952	238961	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
38	NC_010169	CGCTG	2	10	239783	239792	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_010169	CACGT	2	10	241244	241253	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_010169	ATAGA	2	10	257469	257478	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010169	ATTCT	2	10	267597	267606	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_010169	TGCGC	2	10	268159	268168	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_010169	CAACC	2	10	268952	268961	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
44	NC_010169	CGGCG	2	10	269316	269325	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
45	NC_010169	TCTGT	2	10	274819	274828	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_010169	AAATC	2	10	276360	276369	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_010169	AAGGG	2	10	276390	276399	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010169	GGGGC	2	10	287119	287128	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
49	NC_010169	ATTCT	2	10	306470	306479	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_010169	TGGCT	2	10	323119	323128	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_010169	AAAAG	2	10	329093	329102	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010169	GTTTC	2	10	339014	339023	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_010169	CAGCT	2	10	344624	344633	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_010169	TCTTT	2	10	348445	348454	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_010169	CGTGG	2	10	365717	365726	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
56	NC_010169	CCAAG	2	10	367797	367806	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_010169	GCCTG	2	10	404684	404693	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_010169	ACGCG	2	10	404698	404707	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_010169	CCGGC	2	10	404718	404727	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
60	NC_010169	ACAAA	2	10	408521	408530	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_010169	CGAAA	2	10	421970	421979	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_010169	CCGGG	2	10	423064	423073	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63	NC_010169	ACAAA	2	10	423275	423284	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_010169	AGCGA	2	10	426364	426373	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_010169	GAAAA	2	10	431299	431308	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010169	AGGCT	2	10	440027	440036	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_010169	GGGTT	2	10	445834	445843	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010169	AATGT	2	10	445911	445920	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010169	AAAAG	2	10	450485	450494	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010169	ACCGC	2	10	451615	451624	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
71	NC_010169	GTTTT	2	10	451636	451645	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010169	AACGC	2	10	469502	469511	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_010169	CGGCA	2	10	486593	486602	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_010169	AGGGC	2	10	493923	493932	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
75	NC_010169	TGCCG	2	10	493984	493993	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_010169	CGGAA	2	10	502488	502497	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_010169	TTTTA	2	10	503201	503210	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010169	AAATT	2	10	505168	505177	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010169	ATGAA	2	10	505189	505198	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010169	ACAGG	2	10	512342	512351	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_010169	TGCGC	2	10	522306	522315	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
82	NC_010169	CCGCA	2	10	534373	534382	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
83	NC_010169	TGCCA	2	10	540003	540012	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_010169	AGTTT	2	10	564730	564739	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010169	ATAGT	2	10	564857	564866	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010169	TTTGC	2	10	578979	578988	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_010169	AAAGA	2	10	579002	579011	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010169	ACTGA	2	10	583404	583413	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_010169	CGGGC	2	10	607269	607278	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
90	NC_010169	CGGGC	2	10	608785	608794	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_010169	AGGCG	2	10	608865	608874	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
92	NC_010169	GGGCA	2	10	608986	608995	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
93	NC_010169	TGCCA	2	10	609379	609388	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_010169	TTGGA	2	10	609812	609821	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010169	TAAAA	2	10	636370	636379	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010169	GAACG	2	10	643118	643127	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_010169	ACCGG	2	10	644841	644850	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_010169	TTTGC	2	10	647400	647409	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_010169	ATGGC	2	10	683645	683654	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_010169	TGCGA	2	10	713977	713986	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_010169	ACAAA	2	10	714161	714170	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_010169	AAGAT	2	10	721453	721462	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010169	CAAAG	2	10	722023	722032	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_010169	TCTTT	2	10	724765	724774	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_010169	AACTG	2	10	726674	726683	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_010169	TCACA	2	10	739168	739177	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_010169	CATGC	2	10	751217	751226	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_010169	ACAAA	2	10	762708	762717	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_010169	CAAGA	2	10	762736	762745	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_010169	ATGCC	2	10	769503	769512	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_010169	TTTGT	2	10	780336	780345	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010169	ACAAA	2	10	782223	782232	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_010169	CTTGT	2	10	788348	788357	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_010169	CTTGA	2	10	792661	792670	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_010169	ATGCC	2	10	798986	798995	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_010169	ATTGG	2	10	807972	807981	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010169	GTAAA	2	10	828873	828882	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010169	TGAAG	2	10	839774	839783	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010169	GGCAG	2	10	850709	850718	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
120	NC_010169	GCGCG	2	10	850759	850768	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
121	NC_010169	CGATT	2	10	858642	858651	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_010169	GAGCT	2	10	863180	863189	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_010169	GGGCA	2	10	864955	864964	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_010169	GACAG	2	10	867796	867805	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_010169	AGCTT	2	10	899503	899512	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_010169	GACAG	2	10	931503	931512	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_010169	GGTGC	2	10	938205	938214	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_010169	CATCT	2	10	947462	947471	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_010169	TTGCC	2	10	948901	948910	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_010169	GCAGG	2	10	956757	956766	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
131	NC_010169	TTCCT	2	10	963548	963557	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_010169	CGCTG	2	10	963583	963592	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_010169	AAAAC	2	10	986771	986780	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_010169	TTGCG	2	10	1000188	1000197	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_010169	TGCAG	2	10	1000208	1000217	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_010169	AAATA	2	10	1005581	1005590	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010169	ATGAA	2	10	1015394	1015403	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010169	ACAAA	2	10	1017258	1017267	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_010169	ACAAA	2	10	1022160	1022169	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_010169	TCGGT	2	10	1029608	1029617	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_010169	TTTTA	2	10	1035513	1035522	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010169	CGTGG	2	10	1036180	1036189	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
143	NC_010169	AGGGC	2	10	1042236	1042245	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
144	NC_010169	AAAAG	2	10	1046583	1046592	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010169	AAAAT	2	10	1046766	1046775	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010169	AGCGA	2	10	1058058	1058067	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_010169	ACGAA	2	10	1066501	1066510	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_010169	CTCAT	2	10	1069831	1069840	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
149	NC_010169	AAGAA	2	10	1070022	1070031	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010169	GCACA	2	10	1075065	1075074	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
151	NC_010169	GTTTT	2	10	1076168	1076177	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010169	ACGCA	2	10	1088000	1088009	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
153	NC_010169	CCGAC	2	10	1103672	1103681	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
154	NC_010169	TCAAT	2	10	1103759	1103768	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
155	NC_010169	CCTGC	2	10	1110767	1110776	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
156	NC_010169	GCCCG	2	10	1116268	1116277	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
157	NC_010169	GGTCC	2	10	1122335	1122344	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
158	NC_010169	ATTGA	2	10	1129403	1129412	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
159	NC_010169	AAAAG	2	10	1133922	1133931	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_010169	CGAGC	2	10	1134150	1134159	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
162	NC_010169	GTTTT	2	10	1142206	1142215	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
163	NC_010169	TTTGT	2	10	1148772	1148781	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
164	NC_010169	TTTTC	2	10	1213332	1213341	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
165	NC_010169	CCCTT	2	10	1236688	1236697	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
166	NC_010169	TTTGT	2	10	1246147	1246156	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
167	NC_010169	CCTCT	2	10	1250071	1250080	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
168	NC_010169	ACAAA	2	10	1256530	1256539	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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170	NC_010169	TCTTT	2	10	1261644	1261653	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
171	NC_010169	GGCGG	2	10	1267304	1267313	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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177	NC_010169	CCCTG	2	10	1352603	1352612	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
178	NC_010169	CCATT	2	10	1352963	1352972	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
179	NC_010169	GTACG	2	10	1357861	1357870	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
180	NC_010169	ACAAA	2	10	1361197	1361206	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
181	NC_010169	CTGCC	2	10	1361276	1361285	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
182	NC_010169	CACTA	2	10	1363089	1363098	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
183	NC_010169	CATTT	2	10	1365551	1365560	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
184	NC_010169	TTTGT	2	10	1370645	1370654	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
185	NC_010169	AATCA	2	10	1406210	1406219	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
186	NC_010169	CTTTG	2	10	1426855	1426864	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
187	NC_010169	TGAAT	2	10	1428208	1428217	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_010169	AAGCA	2	10	1437767	1437776	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
190	NC_010169	ATCGG	2	10	1439523	1439532	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
191	NC_010169	ATAAA	2	10	1447129	1447138	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_010169	GGGAC	2	10	1448643	1448652	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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194	NC_010169	AATGA	2	10	1460263	1460272	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
195	NC_010169	TCCTT	2	10	1480133	1480142	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
196	NC_010169	TTGCC	2	10	1480187	1480196	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
197	NC_010169	TGAGG	2	10	1483005	1483014	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
198	NC_010169	GCGCA	2	10	1485388	1485397	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
199	NC_010169	ACCGA	2	10	1490910	1490919	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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201	NC_010169	AATGG	2	10	1510715	1510724	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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209	NC_010169	GATTG	2	10	1588784	1588793	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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211	NC_010169	TCAAA	2	10	1592613	1592622	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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222	NC_010169	CGGAG	2	10	1633581	1633590	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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243	NC_010169	ACAAA	2	10	1761773	1761782	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
244	NC_010169	GCCAT	2	10	1778377	1778386	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
245	NC_010169	CCGCA	2	10	1778772	1778781	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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255	NC_010169	CCTGT	2	10	1902190	1902199	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
256	NC_010169	TGTGC	2	10	1905331	1905340	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
257	NC_010169	CCCGG	2	10	1906949	1906958	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
258	NC_010169	ACCCG	2	10	1907337	1907346	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
259	NC_010169	CGGAT	2	10	1907362	1907371	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
260	NC_010169	CGACC	2	10	1914850	1914859	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
261	NC_010169	GGCTT	2	10	1917920	1917929	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
262	NC_010169	GGATG	2	10	1923002	1923011	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.