MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010168	GTGCTC	2	12	18930	18941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010168	TCAGTG	2	12	50754	50765	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_010168	CTCCAG	2	12	150552	150563	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010168	TCGTTT	2	12	208734	208745	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_010168	CGCGCC	2	12	246710	246721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_010168	GATCAC	2	12	251900	251911	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010168	GCCCCG	2	12	340054	340065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_010168	CGACGT	2	12	355780	355791	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010168	GTGTGA	2	12	366394	366405	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010168	TCGGGT	3	18	384046	384063	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_010168	TGGTGT	2	12	392531	392542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010168	ATCCGA	2	12	417582	417593	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010168	ATGATC	2	12	513290	513301	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_010168	TTGATC	2	12	527767	527778	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010168	CTGAGC	3	18	609233	609250	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010168	GTGTGA	2	12	676456	676467	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010168	CTTTGT	2	12	696757	696768	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_010168	GACGGC	2	12	790450	790461	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010168	GATGTA	3	18	824190	824207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010168	TCGACG	2	12	834496	834507	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010168	AAATGG	2	12	876485	876496	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010168	GCGCTA	2	12	888089	888100	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010168	TCACAG	2	12	953726	953737	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010168	GGCTGC	2	12	986468	986479	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010168	CGAATT	2	12	1030198	1030209	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_010168	GTGAGT	2	12	1045425	1045436	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010168	GTCAAG	2	12	1090428	1090439	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_010168	GGCGTC	2	12	1243751	1243762	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010168	ATCCAA	2	12	1416979	1416990	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010168	CTCTTT	2	12	1680828	1680839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010168	CACACG	2	12	1696625	1696636	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010168	CGGAAA	2	12	1767274	1767285	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_010168	GGCGAC	2	12	1916831	1916842	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010168	CAATTC	2	12	1943085	1943096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010168	CACCAA	2	12	1944750	1944761	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010168	AGCGTT	2	12	1947268	1947279	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_010168	CAACTC	2	12	1947890	1947901	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010168	TGCAGT	2	12	2090402	2090413	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_010168	GAACAG	2	12	2115408	2115419	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010168	GCCGGT	2	12	2132061	2132072	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010168	TCGCAA	2	12	2147112	2147123	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010168	CGACCG	2	12	2214061	2214072	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010168	CTGGTT	2	12	2238499	2238510	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_010168	CTGACC	2	12	2316916	2316927	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010168	AAGACT	2	12	2331554	2331565	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_010168	TCCAGA	2	12	2347936	2347947	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010168	GATGCG	2	12	2389230	2389241	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_010168	TTTCAT	2	12	2441582	2441593	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_010168	TCGCCA	2	12	2452254	2452265	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010168	CAGCAA	2	12	2462292	2462303	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010168	TTGGGT	2	12	2513758	2513769	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010168	TTTCGT	2	12	2537865	2537876	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_010168	CAACAC	2	12	2621972	2621983	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_010168	TGCCGG	2	12	2639315	2639326	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010168	GCCGCA	2	12	2642245	2642256	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010168	GGCCTA	2	12	2819231	2819242	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010168	TTCGGA	2	12	2834740	2834751	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_010168	TCACCT	2	12	2836260	2836271	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_010168	CGTAGT	2	12	2874261	2874272	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_010168	GGTAGT	2	12	2874336	2874347	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010168	TGACAC	2	12	2966088	2966099	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010168	CGGGCC	2	12	2990831	2990842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_010168	ACGTCG	2	12	3061275	3061286	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.