MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 2059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010168	TCGCC	2	10	222	231	0 %	20 %	20 %	60 %	163838770
2	NC_010168	AATCA	2	10	327	336	60 %	20 %	0 %	20 %	163838770
3	NC_010168	TTCGG	2	10	4201	4210	0 %	40 %	40 %	20 %	163838773
4	NC_010168	GCGCA	2	10	5337	5346	20 %	0 %	40 %	40 %	163838774
5	NC_010168	CGGCC	2	10	7314	7323	0 %	0 %	40 %	60 %	163838775
6	NC_010168	CTTTG	2	10	13344	13353	0 %	60 %	20 %	20 %	163838780
7	NC_010168	TGGTC	2	10	16906	16915	0 %	40 %	40 %	20 %	163838784
8	NC_010168	AGATC	2	10	17980	17989	40 %	20 %	20 %	20 %	163838785
9	NC_010168	CAGCG	2	10	20185	20194	20 %	0 %	40 %	40 %	163838788
10	NC_010168	TCGCA	2	10	22598	22607	20 %	20 %	20 %	40 %	163838790
11	NC_010168	GGCGA	2	10	22871	22880	20 %	0 %	60 %	20 %	163838790
12	NC_010168	AGCGT	2	10	23909	23918	20 %	20 %	40 %	20 %	163838792
13	NC_010168	TCTGC	2	10	24885	24894	0 %	40 %	20 %	40 %	163838794
14	NC_010168	ATGGC	2	10	27515	27524	20 %	20 %	40 %	20 %	163838795
15	NC_010168	GTCCG	2	10	27902	27911	0 %	20 %	40 %	40 %	163838795
16	NC_010168	GCCAG	2	10	28694	28703	20 %	0 %	40 %	40 %	163838796
17	NC_010168	CGCAA	2	10	32108	32117	40 %	0 %	20 %	40 %	163838799
18	NC_010168	GTGCC	2	10	33379	33388	0 %	20 %	40 %	40 %	163838801
19	NC_010168	CACAG	2	10	35529	35538	40 %	0 %	20 %	40 %	163838803
20	NC_010168	AAAGC	2	10	36568	36577	60 %	0 %	20 %	20 %	163838803
21	NC_010168	CACAA	2	10	40894	40903	60 %	0 %	0 %	40 %	163838808
22	NC_010168	CAGCA	2	10	41744	41753	40 %	0 %	20 %	40 %	163838809
23	NC_010168	AGTCC	2	10	41808	41817	20 %	20 %	20 %	40 %	163838809
24	NC_010168	AGCCA	2	10	42079	42088	40 %	0 %	20 %	40 %	163838809
25	NC_010168	CGATC	2	10	42336	42345	20 %	20 %	20 %	40 %	163838809
26	NC_010168	TGGTT	2	10	44887	44896	0 %	60 %	40 %	0 %	163838812
27	NC_010168	CAATT	2	10	48432	48441	40 %	40 %	0 %	20 %	163838817
28	NC_010168	CCCAG	2	10	50613	50622	20 %	0 %	20 %	60 %	163838818
29	NC_010168	CCGGT	2	10	51510	51519	0 %	20 %	40 %	40 %	163838820
30	NC_010168	GCCAA	2	10	56444	56453	40 %	0 %	20 %	40 %	163838828
31	NC_010168	GTTCG	2	10	57051	57060	0 %	40 %	40 %	20 %	163838829
32	NC_010168	CACGG	2	10	57604	57613	20 %	0 %	40 %	40 %	163838830
33	NC_010168	GAACC	2	10	60012	60021	40 %	0 %	20 %	40 %	163838833
34	NC_010168	AACTC	2	10	62774	62783	40 %	20 %	0 %	40 %	163838838
35	NC_010168	TGCGC	2	10	65553	65562	0 %	20 %	40 %	40 %	163838839
36	NC_010168	GAAAC	2	10	67014	67023	60 %	0 %	20 %	20 %	163838840
37	NC_010168	AACTA	2	10	68615	68624	60 %	20 %	0 %	20 %	163838843
38	NC_010168	CGCAC	2	10	70005	70014	20 %	0 %	20 %	60 %	163838846
39	NC_010168	TGGCC	2	10	76011	76020	0 %	20 %	40 %	40 %	163838853
40	NC_010168	GCCAA	2	10	78337	78346	40 %	0 %	20 %	40 %	163838857
41	NC_010168	CTGCG	2	10	78971	78980	0 %	20 %	40 %	40 %	163838857
42	NC_010168	TGAGT	2	10	81373	81382	20 %	40 %	40 %	0 %	163838861
43	NC_010168	ATTGC	2	10	86674	86683	20 %	40 %	20 %	20 %	163838869
44	NC_010168	GTCGA	2	10	86878	86887	20 %	20 %	40 %	20 %	163838870
45	NC_010168	TGCTG	2	10	89584	89593	0 %	40 %	40 %	20 %	163838871
46	NC_010168	TGCCG	2	10	89892	89901	0 %	20 %	40 %	40 %	163838871
47	NC_010168	GGGGT	2	10	91917	91926	0 %	20 %	80 %	0 %	163838873
48	NC_010168	AGTTG	2	10	92775	92784	20 %	40 %	40 %	0 %	163838874
49	NC_010168	CGGCT	2	10	98196	98205	0 %	20 %	40 %	40 %	163838883
50	NC_010168	GCACT	2	10	100418	100427	20 %	20 %	20 %	40 %	163838885
51	NC_010168	GAACC	2	10	101954	101963	40 %	0 %	20 %	40 %	163838886
52	NC_010168	AGTGA	2	10	102226	102235	40 %	20 %	40 %	0 %	163838887
53	NC_010168	TGGCT	2	10	102574	102583	0 %	40 %	40 %	20 %	163838887
54	NC_010168	AGTTT	2	10	107159	107168	20 %	60 %	20 %	0 %	163838892
55	NC_010168	TCGAC	2	10	110219	110228	20 %	20 %	20 %	40 %	163838895
56	NC_010168	TTTTA	2	10	112905	112914	20 %	80 %	0 %	0 %	163838897
57	NC_010168	CGGCT	2	10	113046	113055	0 %	20 %	40 %	40 %	163838897
58	NC_010168	GCTGA	2	10	114202	114211	20 %	20 %	40 %	20 %	163838900
59	NC_010168	GTCGA	2	10	114341	114350	20 %	20 %	40 %	20 %	163838901
60	NC_010168	TGCAT	2	10	115419	115428	20 %	40 %	20 %	20 %	163838902
61	NC_010168	GGCCG	2	10	117519	117528	0 %	0 %	60 %	40 %	163838903
62	NC_010168	CGGCC	2	10	119210	119219	0 %	0 %	40 %	60 %	163838904
63	NC_010168	CTGTT	2	10	122201	122210	0 %	60 %	20 %	20 %	163838908
64	NC_010168	AGCGA	2	10	122349	122358	40 %	0 %	40 %	20 %	163838908
65	NC_010168	ACCGG	2	10	123087	123096	20 %	0 %	40 %	40 %	163838909
66	NC_010168	AACGC	2	10	126580	126589	40 %	0 %	20 %	40 %	163838912
67	NC_010168	AGGGA	2	10	128662	128671	40 %	0 %	60 %	0 %	163838913
68	NC_010168	CGTGC	2	10	130686	130695	0 %	20 %	40 %	40 %	163838915
69	NC_010168	GTGCG	2	10	131304	131313	0 %	20 %	60 %	20 %	163838916
70	NC_010168	CATCG	2	10	136972	136981	20 %	20 %	20 %	40 %	163838923
71	NC_010168	CAGGC	2	10	137569	137578	20 %	0 %	40 %	40 %	163838923
72	NC_010168	TTCCC	2	10	141304	141313	0 %	40 %	0 %	60 %	163838927
73	NC_010168	GATCT	2	10	142635	142644	20 %	40 %	20 %	20 %	163838928
74	NC_010168	TGCAG	2	10	146410	146419	20 %	20 %	40 %	20 %	163838932
75	NC_010168	AATTC	2	10	147015	147024	40 %	40 %	0 %	20 %	163838933
76	NC_010168	AATAG	2	10	147449	147458	60 %	20 %	20 %	0 %	163838933
77	NC_010168	AGCTG	2	10	151155	151164	20 %	20 %	40 %	20 %	163838939
78	NC_010168	GAGCG	2	10	152104	152113	20 %	0 %	60 %	20 %	163838939
79	NC_010168	ATTGA	2	10	152466	152475	40 %	40 %	20 %	0 %	163838940
80	NC_010168	GCCGG	2	10	155462	155471	0 %	0 %	60 %	40 %	163838945
81	NC_010168	TCGAA	2	10	155882	155891	40 %	20 %	20 %	20 %	163838945
82	NC_010168	CTGCG	2	10	157986	157995	0 %	20 %	40 %	40 %	163838949
83	NC_010168	CAGCG	2	10	161257	161266	20 %	0 %	40 %	40 %	163838952
84	NC_010168	TCGAC	2	10	162309	162318	20 %	20 %	20 %	40 %	163838953
85	NC_010168	TCAGC	2	10	162448	162457	20 %	20 %	20 %	40 %	163838954
86	NC_010168	ATCGA	2	10	165493	165502	40 %	20 %	20 %	20 %	163838960
87	NC_010168	GGCTG	2	10	168096	168105	0 %	20 %	60 %	20 %	163838963
88	NC_010168	ACCAC	2	10	168248	168257	40 %	0 %	0 %	60 %	163838963
89	NC_010168	TCGGC	2	10	168365	168374	0 %	20 %	40 %	40 %	163838963
90	NC_010168	GCCGG	2	10	170393	170402	0 %	0 %	60 %	40 %	163838965
91	NC_010168	CCAAC	2	10	170801	170810	40 %	0 %	0 %	60 %	163838966
92	NC_010168	TTCGG	2	10	171247	171256	0 %	40 %	40 %	20 %	163838966
93	NC_010168	GCTTT	2	10	174919	174928	0 %	60 %	20 %	20 %	163838972
94	NC_010168	GTTCG	2	10	177506	177515	0 %	40 %	40 %	20 %	163838976
95	NC_010168	CGCGC	2	10	180091	180100	0 %	0 %	40 %	60 %	163838978
96	NC_010168	TTGCC	2	10	183661	183670	0 %	40 %	20 %	40 %	163838980
97	NC_010168	GGCAA	2	10	185738	185747	40 %	0 %	40 %	20 %	163838981
98	NC_010168	CTGGC	2	10	186992	187001	0 %	20 %	40 %	40 %	163838982
99	NC_010168	AGCCA	2	10	189913	189922	40 %	0 %	20 %	40 %	163838987
100	NC_010168	GAATG	2	10	192498	192507	40 %	20 %	40 %	0 %	163838991
101	NC_010168	CTTGG	2	10	193384	193393	0 %	40 %	40 %	20 %	163838992
102	NC_010168	TTGGT	2	10	193569	193578	0 %	60 %	40 %	0 %	163838992
103	NC_010168	CAAGT	2	10	193653	193662	40 %	20 %	20 %	20 %	163838992
104	NC_010168	GCAGC	2	10	193824	193833	20 %	0 %	40 %	40 %	163838992
105	NC_010168	GGCTG	2	10	194280	194289	0 %	20 %	60 %	20 %	163838992
106	NC_010168	AAGCC	2	10	195313	195322	40 %	0 %	20 %	40 %	163838994
107	NC_010168	GCTGT	2	10	199301	199310	0 %	40 %	40 %	20 %	163839000
108	NC_010168	CGTCG	2	10	202106	202115	0 %	20 %	40 %	40 %	163839004
109	NC_010168	TGGAT	2	10	203385	203394	20 %	40 %	40 %	0 %	163839005
110	NC_010168	CCGCA	2	10	205632	205641	20 %	0 %	20 %	60 %	163839007
111	NC_010168	GCGCC	2	10	206933	206942	0 %	0 %	40 %	60 %	163839009
112	NC_010168	GTTCG	2	10	211432	211441	0 %	40 %	40 %	20 %	163839014
113	NC_010168	GCACA	2	10	215482	215491	40 %	0 %	20 %	40 %	163839018
114	NC_010168	TGCCT	2	10	218948	218957	0 %	40 %	20 %	40 %	163839023
115	NC_010168	TGCGG	2	10	218966	218975	0 %	20 %	60 %	20 %	163839023
116	NC_010168	CTTTT	2	10	219946	219955	0 %	80 %	0 %	20 %	163839026
117	NC_010168	GATGC	2	10	220119	220128	20 %	20 %	40 %	20 %	163839026
118	NC_010168	CTTTG	2	10	224241	224250	0 %	60 %	20 %	20 %	163839029
119	NC_010168	GCCGC	2	10	224646	224655	0 %	0 %	40 %	60 %	163839030
120	NC_010168	CTCGG	2	10	224663	224672	0 %	20 %	40 %	40 %	163839030
121	NC_010168	TCTGA	2	10	229386	229395	20 %	40 %	20 %	20 %	163839034
122	NC_010168	CCGGA	2	10	229585	229594	20 %	0 %	40 %	40 %	163839034
123	NC_010168	CAACG	2	10	232421	232430	40 %	0 %	20 %	40 %	163839037
124	NC_010168	AAAAC	2	10	233877	233886	80 %	0 %	0 %	20 %	163839039
125	NC_010168	CCGAT	2	10	234141	234150	20 %	20 %	20 %	40 %	163839039
126	NC_010168	GTTTG	2	10	234350	234359	0 %	60 %	40 %	0 %	163839039
127	NC_010168	GTTCA	2	10	235130	235139	20 %	40 %	20 %	20 %	163839041
128	NC_010168	TCCGT	2	10	236103	236112	0 %	40 %	20 %	40 %	163839041
129	NC_010168	TGGCC	2	10	236569	236578	0 %	20 %	40 %	40 %	163839041
130	NC_010168	TGGGT	2	10	238892	238901	0 %	40 %	60 %	0 %	163839044
131	NC_010168	ACCGA	2	10	241573	241582	40 %	0 %	20 %	40 %	163839049
132	NC_010168	CCAAA	2	10	244952	244961	60 %	0 %	0 %	40 %	163839055
133	NC_010168	AAAGA	2	10	245665	245674	80 %	0 %	20 %	0 %	163839056
134	NC_010168	GGGCA	2	10	245737	245746	20 %	0 %	60 %	20 %	163839056
135	NC_010168	GGCAA	2	10	248429	248438	40 %	0 %	40 %	20 %	163839060
136	NC_010168	CTGCT	2	10	248460	248469	0 %	40 %	20 %	40 %	163839060
137	NC_010168	TTGCT	2	10	248793	248802	0 %	60 %	20 %	20 %	163839061
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142	NC_010168	GTGCT	2	10	263713	263722	0 %	40 %	40 %	20 %	163839079
143	NC_010168	CGGAT	2	10	265184	265193	20 %	20 %	40 %	20 %	163839081
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147	NC_010168	GCCGA	2	10	270598	270607	20 %	0 %	40 %	40 %	163839091
148	NC_010168	CGCAG	2	10	270816	270825	20 %	0 %	40 %	40 %	163839092
149	NC_010168	GCTGG	2	10	271348	271357	0 %	20 %	60 %	20 %	163839092
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151	NC_010168	CAGCG	2	10	274886	274895	20 %	0 %	40 %	40 %	163839097
152	NC_010168	GTCGA	2	10	277291	277300	20 %	20 %	40 %	20 %	163839100
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155	NC_010168	CGTGG	2	10	291178	291187	0 %	20 %	60 %	20 %	163839114
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165	NC_010168	GATGG	2	10	303834	303843	20 %	20 %	60 %	0 %	163839127
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198	NC_010168	CGTTG	2	10	359520	359529	0 %	40 %	40 %	20 %	163839191
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202	NC_010168	GCTGA	2	10	371234	371243	20 %	20 %	40 %	20 %	163839194
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250	NC_010168	TAGCT	2	10	436358	436367	20 %	40 %	20 %	20 %	163839282
251	NC_010168	CAGTG	2	10	438055	438064	20 %	20 %	40 %	20 %	163839284
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254	NC_010168	GAAGA	2	10	442925	442934	60 %	0 %	40 %	0 %	163839290
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258	NC_010168	AAGTG	2	10	449379	449388	40 %	20 %	40 %	0 %	163839298
259	NC_010168	TTTCG	2	10	450521	450530	0 %	60 %	20 %	20 %	163839299
260	NC_010168	AGTGA	2	10	450918	450927	40 %	20 %	40 %	0 %	163839299
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499	NC_010168	AAAGC	2	10	823743	823752	60 %	0 %	20 %	20 %	163839722
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