MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 7247

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010168	CAAA	2	8	127	134	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010168	TGCT	2	8	286	293	0 %	50 %	25 %	25 %	163838770
3	NC_010168	TGCA	2	8	670	677	25 %	25 %	25 %	25 %	163838770
4	NC_010168	TGAT	2	8	823	830	25 %	50 %	25 %	0 %	163838770
5	NC_010168	CCGA	2	8	1447	1454	25 %	0 %	25 %	50 %	163838770
6	NC_010168	TCAA	2	8	1492	1499	50 %	25 %	0 %	25 %	163838770
7	NC_010168	AACC	2	8	1511	1518	50 %	0 %	0 %	50 %	163838770
8	NC_010168	GCTG	2	8	1675	1682	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010168	TTTC	2	8	2975	2982	0 %	75 %	0 %	25 %	163838771
10	NC_010168	CAAA	2	8	3104	3111	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010168	TGCG	2	8	3177	3184	0 %	25 %	50 %	25 %	163838772
12	NC_010168	TGAC	2	8	3237	3244	25 %	25 %	25 %	25 %	163838772
13	NC_010168	CAAT	2	8	3979	3986	50 %	25 %	0 %	25 %	163838772
14	NC_010168	GGAC	2	8	4187	4194	25 %	0 %	50 %	25 %	163838773
15	NC_010168	AGCA	2	8	4216	4223	50 %	0 %	25 %	25 %	163838773
16	NC_010168	TCAC	2	8	4812	4819	25 %	25 %	0 %	50 %	163838773
17	NC_010168	TATT	2	8	4827	4834	25 %	75 %	0 %	0 %	163838773
18	NC_010168	GCTC	2	8	5093	5100	0 %	25 %	25 %	50 %	163838773
19	NC_010168	GTAT	2	8	5814	5821	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010168	GAAT	2	8	5937	5944	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010168	TGAT	2	8	6863	6870	25 %	50 %	25 %	0 %	163838775
22	NC_010168	TGAC	2	8	7277	7284	25 %	25 %	25 %	25 %	163838775
23	NC_010168	GCAA	2	8	7539	7546	50 %	0 %	25 %	25 %	163838775
24	NC_010168	CCGG	2	8	8406	8413	0 %	0 %	50 %	50 %	163838776
25	NC_010168	GCAA	2	8	8842	8849	50 %	0 %	25 %	25 %	163838776
26	NC_010168	GTTC	2	8	10564	10571	0 %	50 %	25 %	25 %	163838776
27	NC_010168	CGCA	2	8	10659	10666	25 %	0 %	25 %	50 %	163838776
28	NC_010168	GCCC	2	8	10829	10836	0 %	0 %	25 %	75 %	163838777
29	NC_010168	CGGC	2	8	10874	10881	0 %	0 %	50 %	50 %	163838777
30	NC_010168	GTTT	2	8	11046	11053	0 %	75 %	25 %	0 %	163838777
31	NC_010168	GAAA	2	8	11501	11508	75 %	0 %	25 %	0 %	163838778
32	NC_010168	GTTT	2	8	12127	12134	0 %	75 %	25 %	0 %	163838779
33	NC_010168	TTGG	2	8	12657	12664	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010168	AGCC	2	8	14097	14104	25 %	0 %	25 %	50 %	163838781
35	NC_010168	CGAG	2	8	14770	14777	25 %	0 %	50 %	25 %	163838781
36	NC_010168	CCGC	2	8	15327	15334	0 %	0 %	25 %	75 %	163838782
37	NC_010168	CCAT	2	8	16238	16245	25 %	25 %	0 %	50 %	163838783
38	NC_010168	CTCG	2	8	16360	16367	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010168	CGAG	2	8	16482	16489	25 %	0 %	50 %	25 %	163838784
40	NC_010168	TGGA	2	8	16553	16560	25 %	25 %	50 %	0 %	163838784
41	NC_010168	GCCG	2	8	16692	16699	0 %	0 %	50 %	50 %	163838784
42	NC_010168	TCGC	2	8	18536	18543	0 %	25 %	25 %	50 %	163838786
43	NC_010168	CAAT	2	8	18835	18842	50 %	25 %	0 %	25 %	163838786
44	NC_010168	GCCA	2	8	18871	18878	25 %	0 %	25 %	50 %	163838786
45	NC_010168	ACCT	2	8	18983	18990	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010168	TGCT	2	8	19354	19361	0 %	50 %	25 %	25 %	163838787
47	NC_010168	AGCA	2	8	19462	19469	50 %	0 %	25 %	25 %	163838787
48	NC_010168	GCTT	2	8	19856	19863	0 %	50 %	25 %	25 %	163838788
49	NC_010168	TTCA	2	8	20278	20285	25 %	50 %	0 %	25 %	163838788
50	NC_010168	ATGA	2	8	21734	21741	50 %	25 %	25 %	0 %	163838789
51	NC_010168	GCCG	2	8	22427	22434	0 %	0 %	50 %	50 %	163838790
52	NC_010168	TTCC	2	8	24247	24254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_010168	GATT	2	8	24755	24762	25 %	50 %	25 %	0 %	163838793
54	NC_010168	TTCC	2	8	25044	25051	0 %	50 %	0 %	50 %	163838794
55	NC_010168	CAGC	2	8	26176	26183	25 %	0 %	25 %	50 %	163838794
56	NC_010168	CCGG	2	8	26385	26392	0 %	0 %	50 %	50 %	163838794
57	NC_010168	CTTG	2	8	28774	28781	0 %	50 %	25 %	25 %	163838796
58	NC_010168	GCCA	2	8	29496	29503	25 %	0 %	25 %	50 %	163838796
59	NC_010168	TCCA	2	8	29928	29935	25 %	25 %	0 %	50 %	163838796
60	NC_010168	ATTT	2	8	30306	30313	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010168	GCGG	2	8	30715	30722	0 %	0 %	75 %	25 %	163838797
62	NC_010168	GGTC	2	8	31577	31584	0 %	25 %	50 %	25 %	163838799
63	NC_010168	GCCT	2	8	31633	31640	0 %	25 %	25 %	50 %	163838799
64	NC_010168	ACCA	2	8	31750	31757	50 %	0 %	0 %	50 %	163838799
65	NC_010168	ACCA	2	8	31959	31966	50 %	0 %	0 %	50 %	163838799
66	NC_010168	TGAT	2	8	34882	34889	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010168	CAGC	2	8	35251	35258	25 %	0 %	25 %	50 %	163838803
68	NC_010168	CACC	2	8	35691	35698	25 %	0 %	0 %	75 %	163838803
69	NC_010168	TCAG	2	8	35811	35818	25 %	25 %	25 %	25 %	163838803
70	NC_010168	AGTT	2	8	35971	35978	25 %	50 %	25 %	0 %	163838803
71	NC_010168	CCAT	2	8	36276	36283	25 %	25 %	0 %	50 %	163838803
72	NC_010168	CTCG	2	8	37015	37022	0 %	25 %	25 %	50 %	163838804
73	NC_010168	CTCG	2	8	37612	37619	0 %	25 %	25 %	50 %	163838804
74	NC_010168	GCAG	2	8	37635	37642	25 %	0 %	50 %	25 %	163838804
75	NC_010168	GATC	2	8	37696	37703	25 %	25 %	25 %	25 %	163838804
76	NC_010168	GCCG	2	8	37853	37860	0 %	0 %	50 %	50 %	163838804
77	NC_010168	CCGA	2	8	38267	38274	25 %	0 %	25 %	50 %	163838805
78	NC_010168	CAAC	2	8	38647	38654	50 %	0 %	0 %	50 %	163838805
79	NC_010168	CGCC	2	8	38787	38794	0 %	0 %	25 %	75 %	163838805
80	NC_010168	GCCG	2	8	38844	38851	0 %	0 %	50 %	50 %	163838805
81	NC_010168	ACTG	2	8	39112	39119	25 %	25 %	25 %	25 %	163838805
82	NC_010168	CTCA	2	8	39157	39164	25 %	25 %	0 %	50 %	163838805
83	NC_010168	GTTC	2	8	39734	39741	0 %	50 %	25 %	25 %	163838806
84	NC_010168	AATT	2	8	39870	39877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010168	GGTA	2	8	39916	39923	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010168	GCGT	2	8	39976	39983	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_010168	TGGA	2	8	40120	40127	25 %	25 %	50 %	0 %	163838807
88	NC_010168	TCCA	2	8	40148	40155	25 %	25 %	0 %	50 %	163838807
89	NC_010168	TACC	2	8	40650	40657	25 %	25 %	0 %	50 %	163838808
90	NC_010168	GCCG	2	8	40797	40804	0 %	0 %	50 %	50 %	163838808
91	NC_010168	CGAT	2	8	40875	40882	25 %	25 %	25 %	25 %	163838808
92	NC_010168	CCAA	2	8	41621	41628	50 %	0 %	0 %	50 %	163838809
93	NC_010168	CGGC	2	8	41654	41661	0 %	0 %	50 %	50 %	163838809
94	NC_010168	GATC	2	8	41838	41845	25 %	25 %	25 %	25 %	163838809
95	NC_010168	CTGG	2	8	43389	43396	0 %	25 %	50 %	25 %	163838810
96	NC_010168	TGAT	2	8	44577	44584	25 %	50 %	25 %	0 %	163838812
97	NC_010168	CGAG	2	8	44752	44759	25 %	0 %	50 %	25 %	163838812
98	NC_010168	GTCC	2	8	45022	45029	0 %	25 %	25 %	50 %	163838812
99	NC_010168	CCAC	2	8	45261	45268	25 %	0 %	0 %	75 %	163838812
100	NC_010168	AGGC	2	8	45316	45323	25 %	0 %	50 %	25 %	163838812
101	NC_010168	TGAT	2	8	45706	45713	25 %	50 %	25 %	0 %	163838813
102	NC_010168	CAGC	2	8	45884	45891	25 %	0 %	25 %	50 %	163838813
103	NC_010168	AGTC	2	8	46016	46023	25 %	25 %	25 %	25 %	163838813
104	NC_010168	GCAT	2	8	47000	47007	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_010168	GAAT	2	8	47198	47205	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010168	CCGG	2	8	47742	47749	0 %	0 %	50 %	50 %	163838816
107	NC_010168	GAAA	2	8	48212	48219	75 %	0 %	25 %	0 %	163838816
108	NC_010168	GCCT	2	8	48949	48956	0 %	25 %	25 %	50 %	163838817
109	NC_010168	GCCA	2	8	49293	49300	25 %	0 %	25 %	50 %	163838817
110	NC_010168	TCGA	2	8	49771	49778	25 %	25 %	25 %	25 %	163838817
111	NC_010168	GCAA	2	8	49844	49851	50 %	0 %	25 %	25 %	163838817
112	NC_010168	AAAT	2	8	50347	50354	75 %	25 %	0 %	0 %	163838818
113	NC_010168	TTCC	2	8	50355	50362	0 %	50 %	0 %	50 %	163838818
114	NC_010168	TGCG	2	8	50486	50493	0 %	25 %	50 %	25 %	163838818
115	NC_010168	TGGC	2	8	50713	50720	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_010168	CCCA	2	8	50927	50934	25 %	0 %	0 %	75 %	163838819
117	NC_010168	GTCG	2	8	51016	51023	0 %	25 %	50 %	25 %	163838819
118	NC_010168	ATCG	2	8	51636	51643	25 %	25 %	25 %	25 %	163838820
119	NC_010168	ACCA	2	8	51892	51899	50 %	0 %	0 %	50 %	163838820
120	NC_010168	GCCG	2	8	52162	52169	0 %	0 %	50 %	50 %	163838821
121	NC_010168	TCGG	2	8	52170	52177	0 %	25 %	50 %	25 %	163838821
122	NC_010168	GCTG	2	8	53674	53681	0 %	25 %	50 %	25 %	163838823
123	NC_010168	CTGG	2	8	54139	54146	0 %	25 %	50 %	25 %	163838823
124	NC_010168	ATCG	2	8	54418	54425	25 %	25 %	25 %	25 %	163838824
125	NC_010168	AGCA	2	8	54497	54504	50 %	0 %	25 %	25 %	163838824
126	NC_010168	GGCG	2	8	55345	55352	0 %	0 %	75 %	25 %	163838825
127	NC_010168	ACTT	2	8	55552	55559	25 %	50 %	0 %	25 %	163838826
128	NC_010168	TCAA	2	8	55968	55975	50 %	25 %	0 %	25 %	163838827
129	NC_010168	GCCG	2	8	56312	56319	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_010168	ACCC	2	8	56568	56575	25 %	0 %	0 %	75 %	163838828
131	NC_010168	GCCA	2	8	56734	56741	25 %	0 %	25 %	50 %	163838828
132	NC_010168	CAAG	2	8	56745	56752	50 %	0 %	25 %	25 %	163838828
133	NC_010168	GCAA	2	8	57824	57831	50 %	0 %	25 %	25 %	163838830
134	NC_010168	TTTG	2	8	57978	57985	0 %	75 %	25 %	0 %	163838830
135	NC_010168	TTGT	2	8	58604	58611	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010168	GTAG	2	8	59039	59046	25 %	25 %	50 %	0 %	163838831
137	NC_010168	GCAA	2	8	59310	59317	50 %	0 %	25 %	25 %	163838831
138	NC_010168	ACGA	2	8	59327	59334	50 %	0 %	25 %	25 %	163838831
139	NC_010168	TTGA	2	8	59397	59404	25 %	50 %	25 %	0 %	163838832
140	NC_010168	TGGT	2	8	59617	59624	0 %	50 %	50 %	0 %	163838832
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142	NC_010168	CTGG	2	8	61645	61652	0 %	25 %	50 %	25 %	163838836
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