MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 40023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010168	AGA	2	6	425	430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838770
2	NC_010168	AAG	2	6	439	444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838770
3	NC_010168	TGA	2	6	452	457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838770
4	NC_010168	GAA	2	6	465	470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838770
5	NC_010168	ACC	2	6	488	493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838770
6	NC_010168	GAA	2	6	735	740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838770
7	NC_010168	TCA	2	6	754	759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838770
8	NC_010168	ACC	2	6	795	800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838770
9	NC_010168	AAG	2	6	853	858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838770
10	NC_010168	AAG	2	6	865	870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838770
11	NC_010168	TCA	2	6	919	924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838770
12	NC_010168	CCA	2	6	936	941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838770
13	NC_010168	AGC	2	6	943	948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838770
14	NC_010168	GAA	2	6	960	965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838770
15	NC_010168	GCC	2	6	1010	1015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838770
16	NC_010168	GAC	2	6	1080	1085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838770
17	NC_010168	TCA	2	6	1222	1227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838770
18	NC_010168	GCA	2	6	1254	1259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838770
19	NC_010168	CGA	2	6	1301	1306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838770
20	NC_010168	TGG	2	6	1415	1420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838770
21	NC_010168	CGC	2	6	1479	1484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838770
22	NC_010168	GCA	2	6	1526	1531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838770
23	NC_010168	AGC	2	6	1884	1889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838771
24	NC_010168	GGC	2	6	2013	2018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838771
25	NC_010168	GAA	2	6	2152	2157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838771
26	NC_010168	TTG	2	6	2461	2466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838771
27	NC_010168	GGC	2	6	2584	2589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838771
28	NC_010168	GCG	2	6	2645	2650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838771
29	NC_010168	ACC	2	6	2659	2664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838771
30	NC_010168	GCG	2	6	2884	2889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838771
31	NC_010168	GAA	2	6	2899	2904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838771
32	NC_010168	ATT	2	6	2927	2932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163838771
33	NC_010168	ATG	2	6	3004	3009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838771
34	NC_010168	GAT	2	6	3034	3039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838771
35	NC_010168	TCA	2	6	3129	3134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838772
36	NC_010168	TTC	2	6	3247	3252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838772
37	NC_010168	CGA	2	6	3256	3261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838772
38	NC_010168	CGT	2	6	3331	3336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838772
39	NC_010168	TTG	2	6	3371	3376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838772
40	NC_010168	TGG	2	6	3382	3387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838772
41	NC_010168	CGG	2	6	3469	3474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838772
42	NC_010168	TGA	2	6	3504	3509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838772
43	NC_010168	GGC	2	6	3512	3517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838772
44	NC_010168	GCT	2	6	3688	3693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838772
45	NC_010168	GCT	2	6	3769	3774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838772
46	NC_010168	GAA	2	6	3797	3802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838772
47	NC_010168	GAA	2	6	3866	3871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838772
48	NC_010168	CGG	2	6	3988	3993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838772
49	NC_010168	AGC	2	6	4030	4035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838773
50	NC_010168	CGG	2	6	4416	4421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838773
51	NC_010168	GAT	2	6	4428	4433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838773
52	NC_010168	TGC	2	6	4435	4440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838773
53	NC_010168	CAG	2	6	4532	4537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838773
54	NC_010168	CCA	2	6	4570	4575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838773
55	NC_010168	TGC	2	6	4607	4612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838773
56	NC_010168	GCT	2	6	4616	4621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838773
57	NC_010168	AAC	2	6	4645	4650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163838773
58	NC_010168	AAG	2	6	4741	4746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838773
59	NC_010168	CGC	2	6	4757	4762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838773
60	NC_010168	AGC	2	6	4841	4846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838773
61	NC_010168	CTA	2	6	4994	4999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838773
62	NC_010168	GAT	2	6	5052	5057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838773
63	NC_010168	GCG	2	6	5275	5280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838774
64	NC_010168	GCC	2	6	5308	5313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838774
65	NC_010168	ATG	2	6	5405	5410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838774
66	NC_010168	TTG	2	6	5525	5530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838774
67	NC_010168	GTG	2	6	5677	5682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838774
68	NC_010168	CCA	2	6	6038	6043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838775
69	NC_010168	TGA	2	6	6081	6086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838775
70	NC_010168	GAA	2	6	6142	6147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838775
71	NC_010168	ACC	2	6	6248	6253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838775
72	NC_010168	GTT	2	6	6265	6270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838775
73	NC_010168	TGG	2	6	6336	6341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838775
74	NC_010168	GAT	2	6	6352	6357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838775
75	NC_010168	GGT	2	6	6414	6419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838775
76	NC_010168	GGC	2	6	6451	6456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838775
77	NC_010168	GGT	2	6	6457	6462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838775
78	NC_010168	TGG	2	6	6474	6479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838775
79	NC_010168	GAC	2	6	6531	6536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838775
80	NC_010168	GCA	2	6	6659	6664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838775
81	NC_010168	CAG	2	6	6712	6717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838775
82	NC_010168	GAA	2	6	6784	6789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838775
83	NC_010168	GAA	2	6	7116	7121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838775
84	NC_010168	CAT	2	6	7122	7127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838775
85	NC_010168	CGA	2	6	7155	7160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838775
86	NC_010168	GCG	2	6	7369	7374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838775
87	NC_010168	GGT	2	6	7420	7425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838775
88	NC_010168	TGG	2	6	7484	7489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838775
89	NC_010168	TTG	3	9	7741	7749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838775
90	NC_010168	TTG	2	6	7778	7783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838775
91	NC_010168	GCC	2	6	7809	7814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838775
92	NC_010168	CGA	2	6	7875	7880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838775
93	NC_010168	ACC	2	6	7984	7989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838775
94	NC_010168	ACC	2	6	8000	8005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838775
95	NC_010168	TGC	2	6	8012	8017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838775
96	NC_010168	CGG	2	6	8042	8047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838775
97	NC_010168	ATC	2	6	8242	8247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838776
98	NC_010168	TTG	2	6	8321	8326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838776
99	NC_010168	ACG	2	6	8393	8398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838776
100	NC_010168	ACC	2	6	8465	8470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838776
101	NC_010168	TGC	2	6	8583	8588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838776
102	NC_010168	ACG	2	6	8681	8686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838776
103	NC_010168	CTG	2	6	8731	8736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838776
104	NC_010168	CTC	2	6	8745	8750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163838776
105	NC_010168	CCG	2	6	8782	8787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838776
106	NC_010168	AGA	2	6	8850	8855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838776
107	NC_010168	GCT	2	6	8856	8861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838776
108	NC_010168	GGA	2	6	8991	8996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163838776
109	NC_010168	CGG	2	6	9099	9104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838776
110	NC_010168	TCG	3	9	9152	9160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838776
111	NC_010168	TTG	2	6	9254	9259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838776
112	NC_010168	CTT	2	6	9345	9350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838776
113	NC_010168	GTG	2	6	9464	9469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838776
114	NC_010168	CGA	2	6	9492	9497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838776
115	NC_010168	GAA	2	6	9652	9657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838776
116	NC_010168	TGA	2	6	9684	9689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838776
117	NC_010168	GTC	2	6	9763	9768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838776
118	NC_010168	GGT	2	6	9781	9786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838776
119	NC_010168	GAC	2	6	9868	9873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838776
120	NC_010168	GTC	2	6	9874	9879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838776
121	NC_010168	GCT	2	6	9912	9917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838776
122	NC_010168	TTC	2	6	9919	9924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838776
123	NC_010168	TTG	2	6	10009	10014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838776
124	NC_010168	CGA	2	6	10218	10223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838776
125	NC_010168	TGA	2	6	10272	10277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838776
126	NC_010168	CGC	2	6	10350	10355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838776
127	NC_010168	AGA	2	6	10368	10373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838776
128	NC_010168	GAA	2	6	10426	10431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838776
129	NC_010168	TTG	2	6	10478	10483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838776
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132	NC_010168	GAA	2	6	10690	10695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838776
133	NC_010168	GAG	2	6	10759	10764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163838776
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161	NC_010168	GCG	2	6	13761	13766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838781
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253	NC_010168	ATT	2	6	20313	20318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163838788
254	NC_010168	TCG	2	6	20321	20326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838788
255	NC_010168	ATG	2	6	20349	20354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838788
256	NC_010168	GTT	2	6	20453	20458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838788
257	NC_010168	CGG	3	9	20519	20527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838788
258	NC_010168	CGT	2	6	20663	20668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838788
259	NC_010168	GAC	3	9	20922	20930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838788
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261	NC_010168	TGA	2	6	21208	21213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838789
262	NC_010168	CGC	2	6	21262	21267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838789
263	NC_010168	GCA	2	6	21402	21407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838789
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265	NC_010168	GTG	2	6	21434	21439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838789
266	NC_010168	TGA	2	6	21466	21471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838789
267	NC_010168	CTG	2	6	21488	21493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838789
268	NC_010168	CAT	2	6	21526	21531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838789
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270	NC_010168	TGA	2	6	21619	21624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838789
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273	NC_010168	GAT	2	6	21802	21807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838789
274	NC_010168	TTC	2	6	22088	22093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838789
275	NC_010168	TTC	2	6	22112	22117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838789
276	NC_010168	CGG	2	6	22147	22152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838789
277	NC_010168	TCG	2	6	22237	22242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838789
278	NC_010168	AAG	2	6	22380	22385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838790
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282	NC_010168	TCC	2	6	22839	22844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163838790
283	NC_010168	CCG	2	6	22971	22976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838790
284	NC_010168	AGA	2	6	22981	22986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838790
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500	NC_010168	GGC	2	6	40142	40147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838807

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