MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acholeplasma laidlawii PG-8A chromosome

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010163	TAACAA	2	12	1733	1744	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_010163	AGAAGC	2	12	40611	40622	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_010163	AAGCGA	2	12	75792	75803	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_010163	CTGGAG	2	12	77651	77662	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_010163	ACTGCA	2	12	145682	145693	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010163	TAAAAT	2	12	186784	186795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010163	AATAGA	2	12	197994	198005	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010163	TGAACT	2	12	217396	217407	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_010163	GAAGCT	2	12	283681	283692	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_010163	TATTAG	2	12	284687	284698	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010163	TGCACA	2	12	304175	304186	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010163	AGAATA	2	12	352859	352870	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010163	GATAAG	2	12	357274	357285	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010163	TTTTAT	2	12	372035	372046	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010163	GGTAAA	2	12	407986	407997	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010163	CGTGAT	2	12	408532	408543	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010163	TAAAAA	2	12	421171	421182	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010163	TTTATT	2	12	442348	442359	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010163	TTTTTA	2	12	447203	447214	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010163	TTAAAG	2	12	512261	512272	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010163	TAATAG	2	12	603607	603618	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010163	TATCAA	2	12	611129	611140	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_010163	TTTTTG	2	12	628603	628614	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010163	ACTATA	2	12	656483	656494	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_010163	ATTGTA	2	12	663890	663901	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010163	ATTTGA	2	12	664248	664259	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010163	TAAGAT	2	12	665144	665155	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010163	AAAAAC	2	12	665527	665538	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_010163	TTTAAA	2	12	675564	675575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010163	AAATGA	2	12	711745	711756	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010163	GTAAAA	2	12	715682	715693	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010163	ATATAA	2	12	716684	716695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010163	AAAAGA	2	12	776142	776153	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010163	TAAAAA	2	12	785841	785852	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010163	CTTTAT	2	12	797592	797603	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_010163	TATAAA	2	12	818213	818224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010163	TAAAAA	2	12	827096	827107	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010163	ATAAAA	2	12	846199	846210	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010163	TTTATC	2	12	867857	867868	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010163	AAAATA	2	12	888433	888444	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010163	TCTTTT	2	12	929437	929448	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_010163	TCAAGT	2	12	962533	962544	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_010163	TTCTTT	2	12	964722	964733	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_010163	TTTTTA	2	12	987591	987602	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010163	TTTTTA	2	12	1026425	1026436	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010163	TAAATC	2	12	1031747	1031758	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_010163	GTAATC	2	12	1052459	1052470	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_010163	TCTTAT	2	12	1052539	1052550	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_010163	TTTAAT	2	12	1059373	1059384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010163	AAAAGA	2	12	1063713	1063724	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010163	AAATGA	2	12	1131740	1131751	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010163	ATATGA	2	12	1139925	1139936	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010163	ATGTAT	2	12	1142776	1142787	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010163	AAATAA	2	12	1150157	1150168	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010163	TATAAA	2	12	1196535	1196546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010163	CTCCAG	2	12	1200770	1200781	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010163	TCGCTT	2	12	1202630	1202641	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010163	TTTATG	2	12	1228931	1228942	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010163	TTTTAT	2	12	1245739	1245750	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010163	AATTAT	2	12	1255828	1255839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010163	TTTTAT	2	12	1260126	1260137	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010163	TTTGTT	2	12	1291591	1291602	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010163	ATAAAA	2	12	1291649	1291660	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010163	TATTTA	2	12	1303235	1303246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010163	TAATTT	2	12	1305787	1305798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010163	TGAAAA	2	12	1312958	1312969	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010163	TAAAAA	2	12	1341186	1341197	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010163	TTATAT	2	12	1389005	1389016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010163	TAGTTG	2	12	1389070	1389081	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010163	AAGGTA	2	12	1389100	1389111	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010163	TAAATA	2	12	1425235	1425246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010163	AATAAC	2	12	1434613	1434624	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_010163	TTTATA	2	12	1439240	1439251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010163	AATAAA	2	12	1444708	1444719	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010163	AAAAAG	2	12	1458598	1458609	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.