MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Acholeplasma laidlawii PG-8A chromosome

Total Repeats: 184

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010163	CTTAA	2	10	3282	3291	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_010163	TTATT	2	10	3341	3350	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010163	TTAAA	2	10	3439	3448	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010163	AAATA	2	10	3782	3791	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010163	TATAA	2	10	4457	4466	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010163	TTTAT	2	10	13163	13172	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010163	AAATA	2	10	20339	20348	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010163	TGTAA	2	10	20419	20428	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010163	TTAAG	2	10	36273	36282	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010163	AAATA	2	10	37061	37070	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010163	ATATG	2	10	39705	39714	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010163	AACAC	2	10	40754	40763	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_010163	AAAAC	2	10	51124	51133	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_010163	TTTAC	2	10	57064	57073	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_010163	GATAT	2	10	67508	67517	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010163	TTAAG	2	10	73192	73201	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010163	CAAAA	2	10	73480	73489	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_010163	AGTGC	2	10	74075	74084	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_010163	TCGTG	2	10	74527	74536	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_010163	GGGAG	2	10	75654	75663	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010163	CCGTA	2	10	76751	76760	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_010163	ATTGA	2	10	77011	77020	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010163	TAAAT	2	10	98504	98513	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010163	TTTTA	2	10	114828	114837	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010163	ATATT	3	15	120190	120204	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010163	TCAAT	2	10	124278	124287	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_010163	ATATA	2	10	140968	140977	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010163	GTATA	2	10	142885	142894	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010163	ATTAA	2	10	149506	149515	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010163	AAAAT	2	10	150616	150625	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010163	TTAAG	2	10	162605	162614	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010163	AGGAA	2	10	178134	178143	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010163	TATCA	2	10	191241	191250	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_010163	ATATA	2	10	204265	204274	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010163	TTTTA	2	10	248000	248009	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010163	AATTA	2	10	252521	252530	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010163	ATAAA	2	10	255010	255019	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010163	ATATA	2	10	255081	255090	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010163	TAAAT	2	10	256934	256943	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010163	TCTTA	2	10	257016	257025	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_010163	TCAAA	2	10	304059	304068	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_010163	AAATC	2	10	311418	311427	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_010163	TATAA	2	10	314909	314918	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010163	CGTAA	2	10	320566	320575	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_010163	TTTAC	2	10	323773	323782	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_010163	TAAAT	2	10	323991	324000	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010163	ACTAC	2	10	324976	324985	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_010163	TTAAA	2	10	330445	330454	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010163	AGGTG	2	10	338349	338358	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010163	GTTTT	2	10	350873	350882	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010163	AAATA	2	10	381177	381186	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010163	TTTTA	2	10	383460	383469	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010163	AAAGT	2	10	405939	405948	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010163	TGGTA	2	10	407433	407442	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010163	GGTTT	2	10	408220	408229	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010163	ATAAA	2	10	411690	411699	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010163	TTATG	2	10	418682	418691	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010163	ATTTT	2	10	444449	444458	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010163	TAAAA	2	10	449466	449475	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010163	TTTTA	2	10	464823	464832	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010163	TAAAA	2	10	482772	482781	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010163	AGCTT	2	10	482959	482968	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_010163	CATCA	2	10	482969	482978	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_010163	GATAA	2	10	499165	499174	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010163	TTTAT	2	10	508129	508138	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010163	ATAAA	2	10	526841	526850	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010163	TAGAA	2	10	534513	534522	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010163	TAAAA	2	10	535666	535675	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010163	ATTAT	2	10	538656	538665	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010163	ACCCT	2	10	540268	540277	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
71	NC_010163	AAAAC	2	10	540284	540293	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_010163	GCTAA	2	10	540296	540305	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_010163	GATAA	2	10	541570	541579	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010163	TAATT	2	10	541697	541706	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010163	TATAA	2	10	544609	544618	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010163	ATAAG	2	10	572844	572853	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010163	ATATA	2	10	590506	590515	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010163	GTAAG	2	10	606481	606490	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010163	TTTAT	2	10	628365	628374	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010163	AAATT	2	10	636172	636181	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010163	AATAG	2	10	644293	644302	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010163	ATAAA	2	10	655032	655041	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010163	AATGA	2	10	656335	656344	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010163	GTATT	2	10	664062	664071	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010163	CAAAT	2	10	664356	664365	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_010163	AGATA	2	10	664562	664571	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010163	AATAG	2	10	664594	664603	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010163	CGTAT	2	10	665452	665461	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_010163	ATCAC	2	10	676478	676487	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_010163	TATTT	2	10	695779	695788	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010163	AAAGT	2	10	715892	715901	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010163	ATTGA	2	10	716274	716283	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010163	AAATA	2	10	716596	716605	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010163	CATTT	2	10	719356	719365	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_010163	AACAA	2	10	740278	740287	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_010163	GAAAG	2	10	741855	741864	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010163	TATAT	2	10	776103	776112	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010163	TTAAT	2	10	786802	786811	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010163	TATAA	2	10	797690	797699	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010163	AATTA	2	10	801523	801532	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010163	TTGAT	2	10	806453	806462	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010163	ATAAA	2	10	814463	814472	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010163	TTTAA	2	10	816056	816065	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010163	CATAT	2	10	817799	817808	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_010163	TTTTC	2	10	818266	818275	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_010163	ATTTC	2	10	819645	819654	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_010163	TATAT	2	10	830730	830739	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010163	ATGAT	2	10	837845	837854	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010163	TAAAG	2	10	842266	842275	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010163	TTTAA	2	10	843251	843260	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010163	TTTTG	2	10	846535	846544	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010163	ATTAT	2	10	849170	849179	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010163	ACTAA	2	10	864143	864152	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_010163	AATAA	2	10	872280	872289	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010163	TATAT	2	10	905097	905106	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010163	TATAG	2	10	924977	924986	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010163	CTCAT	2	10	925612	925621	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_010163	TTATA	2	10	933107	933116	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010163	GATTA	2	10	939818	939827	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010163	ATATT	2	10	947556	947565	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010163	CTAAT	2	10	950972	950981	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_010163	TGTAG	2	10	955734	955743	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010163	ATTTA	2	10	960963	960972	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010163	ATTTA	2	10	961010	961019	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010163	TTATC	2	10	963021	963030	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_010163	CATAT	2	10	964628	964637	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_010163	AAAAT	2	10	968473	968482	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010163	TTTTA	2	10	995837	995846	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010163	AAAAG	2	10	1024678	1024687	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010163	TAATT	2	10	1034103	1034112	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010163	TTTTA	2	10	1055147	1055156	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010163	TTTTA	2	10	1062029	1062038	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010163	CATTA	2	10	1089832	1089841	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_010163	AATTT	2	10	1100620	1100629	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010163	CCTTT	2	10	1112256	1112265	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_010163	CATAT	2	10	1141569	1141578	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_010163	GAAAT	2	10	1149039	1149048	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010163	ATAAA	2	10	1150078	1150087	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010163	TATAT	2	10	1184489	1184498	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010163	AAATT	2	10	1184855	1184864	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010163	TTATA	2	10	1186730	1186739	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010163	TAAGT	2	10	1192302	1192311	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010163	TTCAA	2	10	1201411	1201420	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_010163	TACGG	2	10	1201672	1201681	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_010163	CTCCC	2	10	1202770	1202779	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
146	NC_010163	CACGA	2	10	1204107	1204116	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_010163	GCACT	2	10	1204559	1204568	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
148	NC_010163	TGTTT	2	10	1205152	1205161	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010163	TATAG	2	10	1210130	1210139	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_010163	TATAA	2	10	1449379	1449388	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_010163	AGAAA	2	10	1469269	1469278	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
184	NC_010163	TAATA	2	10	1491745	1491754	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.