MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bartonella tribocorum CIP 105476 plasmid pBT01

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010160	AATA	2	8	102	109	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010160	AACA	2	8	232	239	75 %	0 %	0 %	25 %	163659860
3	NC_010160	TTTA	2	8	723	730	25 %	75 %	0 %	0 %	163659860
4	NC_010160	TATT	2	8	992	999	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010160	AGAA	2	8	1703	1710	75 %	0 %	25 %	0 %	163659862
6	NC_010160	TAAT	2	8	1867	1874	50 %	50 %	0 %	0 %	163659862
7	NC_010160	AATG	2	8	1934	1941	50 %	25 %	25 %	0 %	163659862
8	NC_010160	AATC	2	8	2003	2010	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010160	CTTT	2	8	2608	2615	0 %	75 %	0 %	25 %	163659863
10	NC_010160	GTAA	2	8	2767	2774	50 %	25 %	25 %	0 %	163659863
11	NC_010160	TTCA	2	8	4297	4304	25 %	50 %	0 %	25 %	163659866
12	NC_010160	TTCA	2	8	4405	4412	25 %	50 %	0 %	25 %	163659866
13	NC_010160	AGAA	2	8	4422	4429	75 %	0 %	25 %	0 %	163659866
14	NC_010160	TAGA	2	8	4435	4442	50 %	25 %	25 %	0 %	163659866
15	NC_010160	ATGA	2	8	4963	4970	50 %	25 %	25 %	0 %	163659866
16	NC_010160	AATC	2	8	5154	5161	50 %	25 %	0 %	25 %	163659866
17	NC_010160	ACAA	2	8	5858	5865	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010160	CAAA	2	8	5873	5880	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010160	ATTC	2	8	5911	5918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_010160	AATT	2	8	6102	6109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010160	TCAT	2	8	6440	6447	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_010160	GATT	2	8	6659	6666	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010160	GTTT	2	8	7067	7074	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010160	CATT	2	8	7408	7415	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010160	CTTT	2	8	7481	7488	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_010160	TTAT	2	8	7546	7553	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010160	TTTA	2	8	8370	8377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010160	ATAA	2	8	8582	8589	75 %	25 %	0 %	0 %	163659868
29	NC_010160	AAGA	2	8	10248	10255	75 %	0 %	25 %	0 %	163659870
30	NC_010160	GCCA	2	8	10924	10931	25 %	0 %	25 %	50 %	163659871
31	NC_010160	AAAG	2	8	11449	11456	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010160	TATT	2	8	11551	11558	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010160	AGTG	2	8	12298	12305	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010160	TTTG	2	8	12918	12925	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010160	TAAA	2	8	14391	14398	75 %	25 %	0 %	0 %	163659873
36	NC_010160	GAAT	2	8	15965	15972	50 %	25 %	25 %	0 %	163659873
37	NC_010160	GCAA	2	8	16388	16395	50 %	0 %	25 %	25 %	163659873
38	NC_010160	GCCC	2	8	16441	16448	0 %	0 %	25 %	75 %	163659873
39	NC_010160	AGCA	2	8	16729	16736	50 %	0 %	25 %	25 %	163659873
40	NC_010160	CAGA	2	8	16956	16963	50 %	0 %	25 %	25 %	163659873
41	NC_010160	TTCT	2	8	17125	17132	0 %	75 %	0 %	25 %	163659873
42	NC_010160	TCAC	2	8	17342	17349	25 %	25 %	0 %	50 %	163659873
43	NC_010160	GCAA	2	8	17390	17397	50 %	0 %	25 %	25 %	163659873
44	NC_010160	TAAT	2	8	19119	19126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010160	AATT	2	8	19472	19479	50 %	50 %	0 %	0 %	163659874
46	NC_010160	GATT	2	8	20049	20056	25 %	50 %	25 %	0 %	163659874
47	NC_010160	TGAT	2	8	20090	20097	25 %	50 %	25 %	0 %	163659874
48	NC_010160	CTTT	2	8	20102	20109	0 %	75 %	0 %	25 %	163659874
49	NC_010160	CAGT	2	8	20128	20135	25 %	25 %	25 %	25 %	163659874
50	NC_010160	CTTT	2	8	20250	20257	0 %	75 %	0 %	25 %	163659874
51	NC_010160	CATT	2	8	20412	20419	25 %	50 %	0 %	25 %	163659874
52	NC_010160	TGAA	2	8	20812	20819	50 %	25 %	25 %	0 %	163659874
53	NC_010160	ATTT	2	8	20865	20872	25 %	75 %	0 %	0 %	163659874
54	NC_010160	TTGG	2	8	21420	21427	0 %	50 %	50 %	0 %	163659875
55	NC_010160	AAAG	2	8	21503	21510	75 %	0 %	25 %	0 %	163659875
56	NC_010160	GTAA	2	8	21724	21731	50 %	25 %	25 %	0 %	163659875
57	NC_010160	TGTC	2	8	21862	21869	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_010160	ATTT	2	8	22012	22019	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010160	AAGA	2	8	22038	22045	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010160	ATGT	2	8	23088	23095	25 %	50 %	25 %	0 %	163659877
61	NC_010160	ATCA	2	8	23317	23324	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.