MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bartonella tribocorum CIP 105476 plasmid pBT01

Total Repeats: 301

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010160	GAG	2	6	335	340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163659860
2	NC_010160	TAT	2	6	344	349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659860
3	NC_010160	TTC	2	6	378	383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163659860
4	NC_010160	ATC	2	6	484	489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659860
5	NC_010160	AAG	2	6	548	553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163659860
6	NC_010160	TGA	2	6	639	644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163659860
7	NC_010160	TTA	2	6	951	956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010160	TAT	2	6	979	984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010160	AAC	2	6	1054	1059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163659861
10	NC_010160	CAC	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163659861
11	NC_010160	TTG	2	6	1254	1259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163659861
12	NC_010160	ATT	2	6	1319	1324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659861
13	NC_010160	CAA	2	6	1340	1345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163659861
14	NC_010160	AGC	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163659861
15	NC_010160	ATC	2	6	1477	1482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659861
16	NC_010160	AGG	2	6	1564	1569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163659861
17	NC_010160	AAT	2	6	1601	1606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163659861
18	NC_010160	TTG	2	6	1638	1643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163659861
19	NC_010160	TTA	2	6	1650	1655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659861
20	NC_010160	TGA	2	6	1733	1738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163659862
21	NC_010160	CGT	2	6	1962	1967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010160	TAT	2	6	2035	2040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010160	ACC	2	6	2092	2097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_010160	GAA	2	6	2200	2205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010160	ATG	2	6	2336	2341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163659863
26	NC_010160	GTT	2	6	2398	2403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163659863
27	NC_010160	GAT	2	6	2560	2565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163659863
28	NC_010160	TAG	2	6	2602	2607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163659863
29	NC_010160	ATT	2	6	2616	2621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659863
30	NC_010160	AAT	2	6	2625	2630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163659863
31	NC_010160	GGT	2	6	2685	2690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163659863
32	NC_010160	TAA	2	6	2816	2821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163659863
33	NC_010160	CCA	2	6	2876	2881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163659863
34	NC_010160	GCT	2	6	2902	2907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163659863
35	NC_010160	CAT	2	6	2909	2914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659863
36	NC_010160	GTT	2	6	2984	2989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163659863
37	NC_010160	CTT	2	6	3065	3070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010160	TCA	2	6	3073	3078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010160	AGA	2	6	3162	3167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010160	TCA	2	6	3256	3261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010160	AAT	2	6	3280	3285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010160	CAT	2	6	3376	3381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010160	CAT	2	6	3390	3395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010160	AAT	2	6	3453	3458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010160	AGA	2	6	3505	3510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163659864
46	NC_010160	GAA	2	6	3524	3529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163659864
47	NC_010160	TGC	2	6	3553	3558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163659864
48	NC_010160	GGT	2	6	3593	3598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163659864
49	NC_010160	CAA	2	6	3618	3623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163659864
50	NC_010160	GGA	2	6	3641	3646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163659864
51	NC_010160	TTA	2	6	3654	3659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659864
52	NC_010160	GGT	2	6	3668	3673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163659864
53	NC_010160	ATC	2	6	3712	3717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659864
54	NC_010160	AGA	2	6	3741	3746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163659864
55	NC_010160	GAA	2	6	3754	3759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163659864
56	NC_010160	AAT	2	6	3798	3803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163659864
57	NC_010160	GCA	2	6	3967	3972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163659865
58	NC_010160	CTT	2	6	4034	4039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163659865
59	NC_010160	TTG	2	6	4045	4050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163659865
60	NC_010160	ATT	2	6	4057	4062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659865
61	NC_010160	AAG	2	6	4115	4120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163659865
62	NC_010160	AGC	2	6	4543	4548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163659866
63	NC_010160	GAA	2	6	4592	4597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163659866
64	NC_010160	AAT	2	6	4957	4962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163659866
65	NC_010160	AAG	2	6	5028	5033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163659866
66	NC_010160	TCA	2	6	5105	5110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659866
67	NC_010160	CAA	2	6	5139	5144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163659866
68	NC_010160	TAC	2	6	5184	5189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659866
69	NC_010160	TGA	2	6	5197	5202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163659866
70	NC_010160	ACA	2	6	5234	5239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163659866
71	NC_010160	CAG	2	6	5481	5486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163659866
72	NC_010160	ATG	2	6	5512	5517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163659866
73	NC_010160	TTC	2	6	5529	5534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163659866
74	NC_010160	TTA	2	6	5543	5548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659866
75	NC_010160	GTA	2	6	5681	5686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010160	GTA	2	6	5693	5698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010160	TCT	2	6	5936	5941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010160	CAT	2	6	5982	5987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010160	TAA	2	6	6088	6093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010160	TTA	2	6	6118	6123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010160	GCA	2	6	6481	6486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010160	GTT	2	6	6510	6515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010160	AAT	2	6	6587	6592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010160	ATT	2	6	6790	6795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010160	GGC	2	6	6816	6821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010160	CAG	2	6	6830	6835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010160	AAG	2	6	7202	7207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010160	GAG	2	6	7247	7252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010160	CAT	2	6	7334	7339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010160	GAT	2	6	7427	7432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010160	ATG	2	6	7505	7510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010160	AAG	2	6	7525	7530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010160	GAC	2	6	7570	7575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163659867
94	NC_010160	TAA	2	6	7731	7736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163659867
95	NC_010160	ATG	2	6	7877	7882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163659867
96	NC_010160	ACG	2	6	8063	8068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163659867
97	NC_010160	CAT	3	9	8088	8096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659867
98	NC_010160	CAT	2	6	8112	8117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659867
99	NC_010160	CAT	2	6	8169	8174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659867
100	NC_010160	CGC	2	6	8356	8361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_010160	TAG	2	6	8452	8457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163659868
102	NC_010160	GCC	2	6	8459	8464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163659868
103	NC_010160	AAC	2	6	8639	8644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163659868
104	NC_010160	CAG	2	6	8683	8688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163659868
105	NC_010160	CAT	3	9	8797	8805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659868
106	NC_010160	CAT	2	6	8821	8826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659868
107	NC_010160	AGA	2	6	8987	8992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010160	CGC	2	6	9032	9037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_010160	ATC	2	6	9078	9083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659869
110	NC_010160	CAT	2	6	9143	9148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659869
111	NC_010160	CAT	3	9	9233	9241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659869
112	NC_010160	AAT	2	6	9576	9581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163659869
113	NC_010160	ACG	2	6	9613	9618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163659869
114	NC_010160	CAT	2	6	9662	9667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659869
115	NC_010160	ACC	2	6	9696	9701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163659869
116	NC_010160	CAT	2	6	9719	9724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659869
117	NC_010160	GTT	2	6	9866	9871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010160	CGC	2	6	9887	9892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_010160	ATT	2	6	9902	9907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659870
120	NC_010160	AAT	2	6	9925	9930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163659870
121	NC_010160	TGA	2	6	10226	10231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163659870
122	NC_010160	TTA	2	6	10346	10351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659870
123	NC_010160	CAT	3	9	10398	10406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659870
124	NC_010160	CAG	2	6	10412	10417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163659870
125	NC_010160	CAT	2	6	10422	10427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659870
126	NC_010160	GCC	2	6	10456	10461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163659870
127	NC_010160	CAT	2	6	10479	10484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659870
128	NC_010160	ATT	2	6	10522	10527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659870
129	NC_010160	CTT	2	6	10558	10563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163659870
130	NC_010160	AGA	2	6	10588	10593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010160	CGC	2	6	10632	10637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_010160	TTA	2	6	10694	10699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659871
133	NC_010160	ATT	2	6	10711	10716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163659871
134	NC_010160	TAA	2	6	10838	10843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163659871
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151	NC_010160	ATT	2	6	12548	12553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_010160	AGA	2	6	20277	20282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163659874
257	NC_010160	CTT	2	6	20390	20395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163659874
258	NC_010160	AGC	2	6	20444	20449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163659874
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260	NC_010160	TGT	2	6	20532	20537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163659874
261	NC_010160	TTG	2	6	20618	20623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163659874
262	NC_010160	TTG	2	6	20738	20743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163659874
263	NC_010160	TTG	2	6	20829	20834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163659874
264	NC_010160	CAT	2	6	20892	20897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659875
265	NC_010160	CAT	2	6	20923	20928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659875
266	NC_010160	TCA	2	6	20993	20998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659875
267	NC_010160	CAT	2	6	21049	21054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659875
268	NC_010160	AAC	2	6	21098	21103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163659875
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270	NC_010160	CAC	2	6	21183	21188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163659875
271	NC_010160	CAG	2	6	21357	21362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163659875
272	NC_010160	TTG	2	6	21430	21435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163659875
273	NC_010160	TAA	2	6	21564	21569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163659875
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275	NC_010160	CAT	2	6	21627	21632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163659875
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278	NC_010160	GGC	2	6	21892	21897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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280	NC_010160	AAC	2	6	22136	22141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_010160	TAA	2	6	22262	22267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_010160	TAA	2	6	22270	22275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_010160	GTT	2	6	22282	22287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
284	NC_010160	TAT	2	6	22298	22303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_010160	GAA	2	6	22312	22317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
286	NC_010160	CAT	2	6	22353	22358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_010160	TCG	2	6	22597	22602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163659876
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293	NC_010160	CTC	2	6	22944	22949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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301	NC_010160	CTC	2	6	23212	23217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163659877

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.