MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bartonella tribocorum CIP 105476 plasmid pBT01

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010160	TTA	2	6	951	956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010160	TAT	2	6	979	984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010160	CGT	2	6	1962	1967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010160	TAT	2	6	2035	2040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010160	ACC	2	6	2092	2097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_010160	GAA	2	6	2200	2205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010160	CTT	2	6	3065	3070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010160	TCA	2	6	3073	3078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010160	AGA	2	6	3162	3167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010160	TCA	2	6	3256	3261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010160	AAT	2	6	3280	3285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010160	CAT	2	6	3376	3381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010160	CAT	2	6	3390	3395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010160	AAT	2	6	3453	3458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010160	GTA	2	6	5681	5686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010160	GTA	2	6	5693	5698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010160	TCT	2	6	5936	5941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010160	CAT	2	6	5982	5987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010160	TAA	2	6	6088	6093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010160	TTA	2	6	6118	6123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010160	GCA	2	6	6481	6486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010160	GTT	2	6	6510	6515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010160	AAT	2	6	6587	6592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010160	ATT	2	6	6790	6795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010160	GGC	2	6	6816	6821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010160	CAG	2	6	6830	6835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010160	AAG	2	6	7202	7207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010160	GAG	2	6	7247	7252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010160	CAT	2	6	7334	7339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010160	GAT	2	6	7427	7432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010160	ATG	2	6	7505	7510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010160	AAG	2	6	7525	7530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010160	CGC	2	6	8356	8361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_010160	AGA	2	6	8987	8992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010160	CGC	2	6	9032	9037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_010160	GTT	2	6	9866	9871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010160	CGC	2	6	9887	9892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_010160	AGA	2	6	10588	10593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010160	CGC	2	6	10632	10637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_010160	GTT	2	6	11482	11487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010160	ATA	2	6	11564	11569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010160	CTT	2	6	11645	11650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010160	TAT	2	6	11676	11681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010160	GTT	2	6	11702	11707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010160	TTG	2	6	11817	11822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010160	CAT	2	6	11955	11960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010160	ATT	2	6	12128	12133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010160	ATG	2	6	12230	12235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010160	TAT	2	6	12540	12545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010160	ATT	2	6	12548	12553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010160	ATT	2	6	12578	12583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010160	AAC	2	6	12612	12617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010160	CTT	2	6	12791	12796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010160	ATT	2	6	12861	12866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010160	ATG	3	9	12893	12901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010160	TTG	2	6	12969	12974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010160	GGT	2	6	13009	13014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010160	AGG	2	6	13018	13023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010160	AGC	2	6	13544	13549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010160	TAA	2	6	13582	13587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010160	TTG	2	6	18589	18594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010160	ATA	2	6	18598	18603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010160	ATG	2	6	18643	18648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010160	TTA	2	6	18726	18731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010160	AGT	2	6	18854	18859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010160	GTT	2	6	19053	19058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010160	ATA	2	6	19085	19090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010160	GGC	2	6	21892	21897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010160	GCC	2	6	21988	21993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_010160	AAC	2	6	22136	22141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010160	TAA	2	6	22262	22267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010160	TAA	2	6	22270	22275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010160	GTT	2	6	22282	22287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010160	TAT	2	6	22298	22303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010160	GAA	2	6	22312	22317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010160	CAT	2	6	22353	22358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010160	TCA	2	6	22894	22899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010160	CTC	2	6	22944	22949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.