MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 45940

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010159	CTG	2	6	305	310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418840
2	NC_010159	TTG	2	6	387	392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418840
3	NC_010159	TGT	2	6	484	489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418840
4	NC_010159	TAA	2	6	501	506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418840
5	NC_010159	CTT	2	6	626	631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162418840
6	NC_010159	TCA	2	6	867	872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418440
7	NC_010159	TTG	2	6	885	890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418440
8	NC_010159	CTG	2	6	899	904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418440
9	NC_010159	TAA	2	6	934	939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418440
10	NC_010159	GTG	2	6	957	962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162418440
11	NC_010159	CTT	2	6	979	984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162418440
12	NC_010159	AGC	2	6	1051	1056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418440
13	NC_010159	CGT	2	6	1060	1065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418440
14	NC_010159	GTT	2	6	1072	1077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418440
15	NC_010159	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418440
16	NC_010159	ACA	3	9	1457	1465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419901
17	NC_010159	CAA	2	6	1506	1511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419901
18	NC_010159	GCG	2	6	1878	1883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419901
19	NC_010159	TGG	2	6	2036	2041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419901
20	NC_010159	ATG	2	6	2065	2070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419901
21	NC_010159	ATG	2	6	2086	2091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419901
22	NC_010159	ATT	2	6	2139	2144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419901
23	NC_010159	TCT	2	6	2181	2186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419901
24	NC_010159	TGC	2	6	2344	2349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419901
25	NC_010159	ACA	2	6	2354	2359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419901
26	NC_010159	CTG	2	6	2418	2423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419901
27	NC_010159	GCG	2	6	2537	2542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419510
28	NC_010159	TGG	2	6	2649	2654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419510
29	NC_010159	CTG	3	9	2657	2665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419510
30	NC_010159	GCC	2	6	2787	2792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419510
31	NC_010159	ACC	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419510
32	NC_010159	ATT	2	6	2874	2879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419510
33	NC_010159	ATG	2	6	2895	2900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419510
34	NC_010159	GCG	2	6	2906	2911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419510
35	NC_010159	TCA	2	6	3030	3035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419510
36	NC_010159	GCG	2	6	3125	3130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419510
37	NC_010159	AAT	2	6	3183	3188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419510
38	NC_010159	TGA	2	6	3207	3212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419510
39	NC_010159	CCT	2	6	3223	3228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162419510
40	NC_010159	GCA	2	6	3376	3381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419510
41	NC_010159	TGG	2	6	3451	3456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419510
42	NC_010159	CAC	2	6	3475	3480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419510
43	NC_010159	AAC	2	6	3534	3539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419510
44	NC_010159	TGA	3	9	3540	3548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419510
45	NC_010159	TCC	2	6	3741	3746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162419510
46	NC_010159	GTT	2	6	3814	3819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419510
47	NC_010159	TGC	2	6	3905	3910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419510
48	NC_010159	ACC	2	6	3921	3926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419510
49	NC_010159	CAG	2	6	3959	3964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419510
50	NC_010159	TGT	2	6	4014	4019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419989
51	NC_010159	GTT	2	6	4030	4035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419989
52	NC_010159	TTG	2	6	4046	4051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419989
53	NC_010159	CCA	2	6	4066	4071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419989
54	NC_010159	GAT	2	6	4107	4112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419989
55	NC_010159	GTT	2	6	4153	4158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419989
56	NC_010159	CAG	3	9	4190	4198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419989
57	NC_010159	TGG	2	6	4202	4207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419989
58	NC_010159	ATC	2	6	4286	4291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419989
59	NC_010159	GAT	2	6	4396	4401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419989
60	NC_010159	TGG	2	6	4533	4538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419989
61	NC_010159	TGC	2	6	4545	4550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419989
62	NC_010159	TAA	2	6	4595	4600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419989
63	NC_010159	CAA	2	6	4628	4633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419989
64	NC_010159	TCA	2	6	4722	4727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419989
65	NC_010159	GAA	2	6	4736	4741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162419989
66	NC_010159	GTA	2	6	4753	4758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419989
67	NC_010159	CTT	2	6	4769	4774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419989
68	NC_010159	GCG	2	6	4778	4783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419989
69	NC_010159	TGG	2	6	4893	4898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419989
70	NC_010159	TTC	2	6	4901	4906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419989
71	NC_010159	CTG	2	6	4956	4961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419989
72	NC_010159	CAG	2	6	4964	4969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419989
73	NC_010159	GCT	2	6	5045	5050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419989
74	NC_010159	CTT	3	9	5251	5259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419989
75	NC_010159	TCA	2	6	5314	5319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419989
76	NC_010159	GCG	2	6	5360	5365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419989
77	NC_010159	GGA	2	6	5391	5396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162419989
78	NC_010159	TGC	2	6	5426	5431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419989
79	NC_010159	GAT	2	6	5520	5525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419989
80	NC_010159	GTC	2	6	5993	5998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419440
81	NC_010159	AGG	2	6	6046	6051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162419440
82	NC_010159	TGG	2	6	6111	6116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419440
83	NC_010159	TGG	2	6	6130	6135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419440
84	NC_010159	CTT	2	6	6139	6144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419440
85	NC_010159	CGC	2	6	6208	6213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419440
86	NC_010159	TAT	2	6	6367	6372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419440
87	NC_010159	CGT	2	6	6564	6569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419440
88	NC_010159	ATT	2	6	6579	6584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419440
89	NC_010159	TTA	2	6	6599	6604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419440
90	NC_010159	CTT	2	6	6634	6639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419440
91	NC_010159	ACC	2	6	6769	6774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419440
92	NC_010159	ATT	2	6	6782	6787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419440
93	NC_010159	GGT	2	6	6853	6858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419440
94	NC_010159	GGC	3	9	6895	6903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419440
95	NC_010159	TCG	2	6	6993	6998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419440
96	NC_010159	TTG	2	6	7016	7021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419440
97	NC_010159	ATT	2	6	7060	7065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419440
98	NC_010159	TAT	3	9	7108	7116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419440
99	NC_010159	ACC	2	6	7118	7123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419440
100	NC_010159	GAT	2	6	7186	7191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419440
101	NC_010159	CGG	2	6	7233	7238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419440
102	NC_010159	ATT	2	6	7276	7281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419440
103	NC_010159	GGT	2	6	7411	7416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419440
104	NC_010159	GAT	2	6	7495	7500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419440
105	NC_010159	CGT	2	6	7506	7511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419440
106	NC_010159	ACC	2	6	7985	7990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420591
107	NC_010159	AGA	2	6	8089	8094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420591
108	NC_010159	AAT	2	6	8105	8110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420591
109	NC_010159	TGC	2	6	8136	8141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420591
110	NC_010159	TGG	2	6	8366	8371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420036
111	NC_010159	GCA	2	6	8445	8450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420036
112	NC_010159	TGC	2	6	8493	8498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420036
113	NC_010159	GAT	2	6	8545	8550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420036
114	NC_010159	CGC	2	6	8722	8727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420036
115	NC_010159	CAA	3	9	8731	8739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162420036
116	NC_010159	CGC	2	6	8777	8782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420036
117	NC_010159	AGC	2	6	8816	8821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420036
118	NC_010159	ATT	2	6	8874	8879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162420036
119	NC_010159	GAT	3	9	8950	8958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420036
120	NC_010159	AGC	2	6	8967	8972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420036
121	NC_010159	ATC	2	6	9007	9012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420036
122	NC_010159	TGC	2	6	9099	9104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420036
123	NC_010159	ATT	2	6	9126	9131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162420036
124	NC_010159	TTA	2	6	9139	9144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162420036
125	NC_010159	CGG	2	6	9188	9193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420036
126	NC_010159	CTT	2	6	9255	9260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420036
127	NC_010159	ATT	2	6	9502	9507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421578
128	NC_010159	GAT	2	6	9593	9598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421578
129	NC_010159	CAT	2	6	9669	9674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421578
130	NC_010159	TTG	2	6	9724	9729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421578
131	NC_010159	ATC	3	9	9851	9859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421578
132	NC_010159	AGG	2	6	9891	9896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162421578
133	NC_010159	GCA	2	6	9957	9962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421578
134	NC_010159	ATG	2	6	9986	9991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421578
135	NC_010159	CAT	2	6	10012	10017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421578
136	NC_010159	AAT	2	6	10148	10153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421578
137	NC_010159	GCC	2	6	10219	10224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421578
138	NC_010159	GCG	2	6	10235	10240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421578
139	NC_010159	AAT	2	6	10245	10250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421578
140	NC_010159	GCC	2	6	10263	10268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421578
141	NC_010159	TGG	2	6	10284	10289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421578
142	NC_010159	TAG	2	6	10315	10320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421578
143	NC_010159	CAA	2	6	10326	10331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421578
144	NC_010159	CAA	2	6	10393	10398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421578
145	NC_010159	CAA	2	6	10450	10455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421578
146	NC_010159	AAT	2	6	10463	10468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421578
147	NC_010159	CAT	3	9	10573	10581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421578
148	NC_010159	TCG	2	6	10693	10698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421578
149	NC_010159	TAA	2	6	10764	10769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421578
150	NC_010159	TGG	2	6	10839	10844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421578
151	NC_010159	GTC	2	6	10996	11001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418549
152	NC_010159	TGA	2	6	11082	11087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418549
153	NC_010159	TGT	2	6	11088	11093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418549
154	NC_010159	TCA	2	6	11106	11111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418549
155	NC_010159	TAA	2	6	11136	11141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418549
156	NC_010159	CCA	2	6	11408	11413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418549
157	NC_010159	TAA	2	6	11417	11422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418549
158	NC_010159	GGC	2	6	11660	11665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418549
159	NC_010159	ATA	2	6	12117	12122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419929
160	NC_010159	CGA	2	6	18168	18173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420022
161	NC_010159	ACC	2	6	18301	18306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420022
162	NC_010159	TCG	2	6	18314	18319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420022
163	NC_010159	GCT	2	6	18543	18548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420022
164	NC_010159	CAT	2	6	18714	18719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420022
165	NC_010159	AGA	2	6	18810	18815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420022
166	NC_010159	GGC	2	6	18816	18821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420022
167	NC_010159	GAC	2	6	18856	18861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420022
168	NC_010159	TTC	2	6	18916	18921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420022
169	NC_010159	GAC	2	6	19027	19032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420022
170	NC_010159	GTT	2	6	19045	19050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420022
171	NC_010159	TAT	2	6	19125	19130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162420022
172	NC_010159	CGT	2	6	19309	19314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420544
173	NC_010159	TGT	2	6	19499	19504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420544
174	NC_010159	TAA	2	6	19684	19689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420544
175	NC_010159	GCG	2	6	19731	19736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420544
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178	NC_010159	TCA	2	6	19960	19965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420127
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182	NC_010159	ATT	2	6	20748	20753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421614
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236	NC_010159	ATC	2	6	26444	26449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420510
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240	NC_010159	AGA	2	6	27652	27657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420098
241	NC_010159	TGA	2	6	27666	27671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420098
242	NC_010159	AGA	2	6	27704	27709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420098
243	NC_010159	GCA	2	6	27752	27757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420098
244	NC_010159	GTA	2	6	27803	27808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420098
245	NC_010159	GAA	2	6	27904	27909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420098
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247	NC_010159	AGA	2	6	27987	27992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420098
248	NC_010159	TGA	2	6	28062	28067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420098
249	NC_010159	GAT	2	6	28072	28077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420098
250	NC_010159	ATT	2	6	28381	28386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421654
251	NC_010159	CAG	2	6	28455	28460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421654
252	NC_010159	TGA	2	6	28577	28582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421654
253	NC_010159	TGG	2	6	28588	28593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421654
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257	NC_010159	CGG	2	6	29116	29121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421654
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500	NC_010159	GCA	2	6	51138	51143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419160

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