MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Angola plasmid pMT-pPCP

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010158	CAGGAG	2	12	408	419	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	162417828
2	NC_010158	CAGGAG	2	12	10016	10027	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	162417912
3	NC_010158	CAGGAG	2	12	19624	19635	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	162417833
4	NC_010158	GCACTG	2	12	21890	21901	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	162417927
5	NC_010158	CGCGCC	2	12	26782	26793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417866
6	NC_010158	TGTGGT	2	12	28755	28766	0 %	50 %	50 %	0 %	162417843
7	NC_010158	GCTTAT	2	12	29656	29667	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	162417934
8	NC_010158	TGGATA	2	12	32842	32853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417825
9	NC_010158	AGGGTT	2	12	35765	35776	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	162417867
10	NC_010158	GCCACC	2	12	45298	45309	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	162417900
11	NC_010158	CGGCGT	2	12	49310	49321	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	162417903
12	NC_010158	GCAGCC	2	12	51742	51753	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	162417876
13	NC_010158	ACCGTT	2	12	54554	54565	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	162417872
14	NC_010158	CCGTAA	2	12	56060	56071	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	162417850
15	NC_010158	TGGCGC	2	12	56889	56900	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	162417851
16	NC_010158	ATCACT	2	12	59167	59178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417924
17	NC_010158	TGGGGA	2	12	64126	64137	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	162417827
18	NC_010158	AACTCG	2	12	67432	67443	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	162417844
19	NC_010158	CCGATA	2	12	71432	71443	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	162417852
20	NC_010158	CTGGCA	2	12	72987	72998	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	162417871
21	NC_010158	TTCAGC	2	12	73483	73494	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	162417871
22	NC_010158	GCTCCT	2	12	78009	78020	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	162417822
23	NC_010158	TGCTTG	2	12	78467	78478	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	162417895
24	NC_010158	TCGCCA	2	12	78533	78544	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	162417895
25	NC_010158	TGGGTT	2	12	80866	80877	0 %	50 %	50 %	0 %	162417879
26	NC_010158	CGCCAG	2	12	82722	82733	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	162417914
27	NC_010158	ACACGC	2	12	83582	83593	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	162417899
28	NC_010158	CGCCAG	2	12	87122	87133	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	162417848
29	NC_010158	CGTCCA	2	12	87664	87675	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	162417848
30	NC_010158	CATGTT	2	12	98722	98733	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	162417824
31	NC_010158	CGCTTT	2	12	102111	102122	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	162417930
32	NC_010158	ACCCCT	2	12	104446	104457	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	162417915
33	NC_010158	GTTATT	2	12	106674	106685	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	162417928
34	NC_010158	CCAGGA	2	12	111172	111183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417823
35	NC_010158	TCGGCT	2	12	113014	113025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417859

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.