MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Yersinia pestis Angola plasmid pMT-pPCP

Total Repeats: 286

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010158	AACG	2	8	4	11	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010158	TCGC	2	8	328	335	0 %	25 %	25 %	50 %	162417828
3	NC_010158	CATT	2	8	382	389	25 %	50 %	0 %	25 %	162417828
4	NC_010158	GCTG	2	8	895	902	0 %	25 %	50 %	25 %	162417828
5	NC_010158	CTCA	2	8	1390	1397	25 %	25 %	0 %	50 %	162417939
6	NC_010158	TCAG	2	8	1641	1648	25 %	25 %	25 %	25 %	162417939
7	NC_010158	CAGA	2	8	1840	1847	50 %	0 %	25 %	25 %	162417939
8	NC_010158	TCAG	2	8	2544	2551	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010158	ACAG	2	8	2559	2566	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010158	AACA	2	8	2928	2935	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010158	CTCA	2	8	3425	3432	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010158	TGTA	2	8	4218	4225	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010158	ATTT	2	8	4322	4329	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010158	CTGT	2	8	4632	4639	0 %	50 %	25 %	25 %	162417887
15	NC_010158	GAAA	2	8	4732	4739	75 %	0 %	25 %	0 %	162417887
16	NC_010158	TCTT	2	8	5506	5513	0 %	75 %	0 %	25 %	162417933
17	NC_010158	ATGA	2	8	6984	6991	50 %	25 %	25 %	0 %	162417902
18	NC_010158	AATC	2	8	6993	7000	50 %	25 %	0 %	25 %	162417902
19	NC_010158	TACA	2	8	7457	7464	50 %	25 %	0 %	25 %	162417902
20	NC_010158	TCCT	2	8	7808	7815	0 %	50 %	0 %	50 %	162417838
21	NC_010158	ACAG	2	8	8567	8574	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_010158	ACGA	2	8	8664	8671	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_010158	TGCC	2	8	8674	8681	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010158	CTGT	2	8	8947	8954	0 %	50 %	25 %	25 %	162417910
25	NC_010158	ACAA	2	8	9204	9211	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_010158	TAAT	2	8	9261	9268	50 %	50 %	0 %	0 %	162417840
27	NC_010158	AACG	2	8	9612	9619	50 %	0 %	25 %	25 %	162417840
28	NC_010158	TCGC	2	8	9936	9943	0 %	25 %	25 %	50 %	162417912
29	NC_010158	CATT	2	8	9990	9997	25 %	50 %	0 %	25 %	162417912
30	NC_010158	GCTG	2	8	10503	10510	0 %	25 %	50 %	25 %	162417912
31	NC_010158	CTCA	2	8	10998	11005	25 %	25 %	0 %	50 %	162417858
32	NC_010158	TCAG	2	8	11249	11256	25 %	25 %	25 %	25 %	162417858
33	NC_010158	CAGA	2	8	11448	11455	50 %	0 %	25 %	25 %	162417858
34	NC_010158	TCAG	2	8	12152	12159	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010158	ACAG	2	8	12167	12174	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_010158	AACA	2	8	12536	12543	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010158	CTCA	2	8	13033	13040	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010158	TGTA	2	8	13826	13833	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010158	ATTT	2	8	13930	13937	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010158	CTGT	2	8	14240	14247	0 %	50 %	25 %	25 %	162417849
41	NC_010158	GAAA	2	8	14340	14347	75 %	0 %	25 %	0 %	162417849
42	NC_010158	TCTT	2	8	15114	15121	0 %	75 %	0 %	25 %	162417922
43	NC_010158	ATGA	2	8	16592	16599	50 %	25 %	25 %	0 %	162417870
44	NC_010158	AATC	2	8	16601	16608	50 %	25 %	0 %	25 %	162417870
45	NC_010158	TACA	2	8	17065	17072	50 %	25 %	0 %	25 %	162417870
46	NC_010158	TCCT	2	8	17416	17423	0 %	50 %	0 %	50 %	162417831
47	NC_010158	ACAG	2	8	18175	18182	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010158	ACGA	2	8	18272	18279	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_010158	TGCC	2	8	18282	18289	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010158	CTGT	2	8	18555	18562	0 %	50 %	25 %	25 %	162417865
51	NC_010158	ACAA	2	8	18812	18819	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010158	TAAT	2	8	18869	18876	50 %	50 %	0 %	0 %	162417829
53	NC_010158	AACG	2	8	19220	19227	50 %	0 %	25 %	25 %	162417829
54	NC_010158	TCGC	2	8	19544	19551	0 %	25 %	25 %	50 %	162417833
55	NC_010158	CATT	2	8	19598	19605	25 %	50 %	0 %	25 %	162417833
56	NC_010158	GCTG	2	8	20111	20118	0 %	25 %	50 %	25 %	162417833
57	NC_010158	CTCA	2	8	20606	20613	25 %	25 %	0 %	50 %	162417864
58	NC_010158	TCAG	2	8	20857	20864	25 %	25 %	25 %	25 %	162417864
59	NC_010158	CAGA	2	8	21056	21063	50 %	0 %	25 %	25 %	162417864
60	NC_010158	CCCA	2	8	21468	21475	25 %	0 %	0 %	75 %	162417862
61	NC_010158	GCGA	2	8	22906	22913	25 %	0 %	50 %	25 %	162417927
62	NC_010158	TACT	2	8	22996	23003	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010158	GTGG	2	8	24001	24008	0 %	25 %	75 %	0 %	162417878
64	NC_010158	GCCA	2	8	24184	24191	25 %	0 %	25 %	50 %	162417878
65	NC_010158	ACCT	2	8	24784	24791	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010158	TTGC	2	8	24928	24935	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_010158	CTTC	2	8	24987	24994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_010158	CACG	2	8	25063	25070	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010158	ATCA	2	8	25538	25545	50 %	25 %	0 %	25 %	162417925
70	NC_010158	GCGT	2	8	25760	25767	0 %	25 %	50 %	25 %	162417925
71	NC_010158	TGCG	2	8	26124	26131	0 %	25 %	50 %	25 %	162417925
72	NC_010158	CGAG	2	8	27117	27124	25 %	0 %	50 %	25 %	162417866
73	NC_010158	AGCG	2	8	27292	27299	25 %	0 %	50 %	25 %	162417866
74	NC_010158	GCCA	2	8	27336	27343	25 %	0 %	25 %	50 %	162417866
75	NC_010158	TGCG	2	8	27482	27489	0 %	25 %	50 %	25 %	162417866
76	NC_010158	AGCC	2	8	28677	28684	25 %	0 %	25 %	50 %	162417843
77	NC_010158	TAAG	2	8	29487	29494	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010158	CCTG	2	8	29917	29924	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_010158	GAAA	2	8	30385	30392	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010158	CAAG	2	8	30787	30794	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_010158	TCGT	2	8	31030	31037	0 %	50 %	25 %	25 %	162417893
82	NC_010158	TGTT	2	8	31731	31738	0 %	75 %	25 %	0 %	162417918
83	NC_010158	GCGT	2	8	31795	31802	0 %	25 %	50 %	25 %	162417918
84	NC_010158	GTTT	2	8	32210	32217	0 %	75 %	25 %	0 %	162417869
85	NC_010158	ACCA	2	8	32445	32452	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_010158	AATG	2	8	33769	33776	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010158	TGAA	2	8	34034	34041	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010158	TGGT	2	8	34189	34196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010158	CAAC	2	8	34414	34421	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_010158	TTAT	2	8	35265	35272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010158	CTGG	2	8	35844	35851	0 %	25 %	50 %	25 %	162417867
92	NC_010158	TCAT	2	8	36070	36077	25 %	50 %	0 %	25 %	162417867
93	NC_010158	CCCA	2	8	36540	36547	25 %	0 %	0 %	75 %	162417909
94	NC_010158	TACC	2	8	36568	36575	25 %	25 %	0 %	50 %	162417909
95	NC_010158	TTAC	2	8	37057	37064	25 %	50 %	0 %	25 %	162417909
96	NC_010158	TGAG	2	8	37081	37088	25 %	25 %	50 %	0 %	162417901
97	NC_010158	CCAG	2	8	37354	37361	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_010158	GATT	2	8	38986	38993	25 %	50 %	25 %	0 %	162417832
99	NC_010158	GCTG	2	8	39589	39596	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010158	GTAA	2	8	40681	40688	50 %	25 %	25 %	0 %	162417905
101	NC_010158	TATT	2	8	40789	40796	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010158	CTGG	2	8	41843	41850	0 %	25 %	50 %	25 %	162417853
103	NC_010158	CTTT	2	8	41881	41888	0 %	75 %	0 %	25 %	162417830
104	NC_010158	AATT	2	8	42802	42809	50 %	50 %	0 %	0 %	162417907
105	NC_010158	GATT	2	8	42933	42940	25 %	50 %	25 %	0 %	162417907
106	NC_010158	GTTG	2	8	42942	42949	0 %	50 %	50 %	0 %	162417907
107	NC_010158	TTCA	2	8	42997	43004	25 %	50 %	0 %	25 %	162417907
108	NC_010158	TGCT	2	8	43206	43213	0 %	50 %	25 %	25 %	162417907
109	NC_010158	TTAT	3	12	43496	43507	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010158	TAAA	2	8	43651	43658	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010158	GATG	2	8	44541	44548	25 %	25 %	50 %	0 %	162417842
112	NC_010158	TATT	2	8	45191	45198	25 %	75 %	0 %	0 %	162417900
113	NC_010158	CCTG	2	8	45382	45389	0 %	25 %	25 %	50 %	162417900
114	NC_010158	GATT	2	8	46156	46163	25 %	50 %	25 %	0 %	162417900
115	NC_010158	AGTA	3	12	46680	46691	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010158	CGAG	2	8	47218	47225	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_010158	CTGG	2	8	47593	47600	0 %	25 %	50 %	25 %	162417908
118	NC_010158	AGAA	2	8	47858	47865	75 %	0 %	25 %	0 %	162417908
119	NC_010158	TTGC	2	8	47971	47978	0 %	50 %	25 %	25 %	162417908
120	NC_010158	GCTG	2	8	48054	48061	0 %	25 %	50 %	25 %	162417908
121	NC_010158	GACA	2	8	48956	48963	50 %	0 %	25 %	25 %	162417903
122	NC_010158	TCCG	2	8	49435	49442	0 %	25 %	25 %	50 %	162417903
123	NC_010158	TGAG	2	8	49543	49550	25 %	25 %	50 %	0 %	162417903
124	NC_010158	ACAA	2	8	49867	49874	75 %	0 %	0 %	25 %	162417877
125	NC_010158	TGCG	2	8	50539	50546	0 %	25 %	50 %	25 %	162417941
126	NC_010158	TCGG	2	8	50608	50615	0 %	25 %	50 %	25 %	162417941
127	NC_010158	TGAT	2	8	50857	50864	25 %	50 %	25 %	0 %	162417941
128	NC_010158	GCAC	2	8	51895	51902	25 %	0 %	25 %	50 %	162417876
129	NC_010158	TAAG	2	8	52214	52221	50 %	25 %	25 %	0 %	162417876
130	NC_010158	CCTA	2	8	52224	52231	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_010158	GGCG	2	8	52352	52359	0 %	0 %	75 %	25 %	162417881
132	NC_010158	TCAT	2	8	52497	52504	25 %	50 %	0 %	25 %	162417881
133	NC_010158	TGAT	2	8	53028	53035	25 %	50 %	25 %	0 %	162417881
134	NC_010158	ATGG	2	8	53473	53480	25 %	25 %	50 %	0 %	162417881
135	NC_010158	CTGA	2	8	53543	53550	25 %	25 %	25 %	25 %	162417881
136	NC_010158	TACT	2	8	53736	53743	25 %	50 %	0 %	25 %	162417881
137	NC_010158	GATG	2	8	53885	53892	25 %	25 %	50 %	0 %	162417872
138	NC_010158	CTTC	2	8	54385	54392	0 %	50 %	0 %	50 %	162417872
139	NC_010158	AGCC	2	8	54505	54512	25 %	0 %	25 %	50 %	162417872
140	NC_010158	AGCA	2	8	55447	55454	50 %	0 %	25 %	25 %	162417932
141	NC_010158	CTGC	2	8	55459	55466	0 %	25 %	25 %	50 %	162417932
142	NC_010158	GTAA	2	8	55589	55596	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010158	GAGC	2	8	55752	55759	25 %	0 %	50 %	25 %	162417850
144	NC_010158	GCTT	2	8	55780	55787	0 %	50 %	25 %	25 %	162417850
145	NC_010158	CCGT	2	8	55834	55841	0 %	25 %	25 %	50 %	162417850
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284	NC_010158	AAGA	2	8	112450	112457	75 %	0 %	25 %	0 %	162417935
285	NC_010158	CGGA	2	8	112771	112778	25 %	0 %	50 %	25 %	162417859
286	NC_010158	GACT	2	8	112807	112814	25 %	25 %	25 %	25 %	162417859

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.