MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Angola plasmid pMT-pPCP

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010158	AACG	2	8	4	11	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010158	TCAG	2	8	2544	2551	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_010158	ACAG	2	8	2559	2566	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_010158	AACA	2	8	2928	2935	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010158	CTCA	2	8	3425	3432	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_010158	TGTA	2	8	4218	4225	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010158	ATTT	2	8	4322	4329	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010158	ACAG	2	8	8567	8574	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010158	ACGA	2	8	8664	8671	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010158	TGCC	2	8	8674	8681	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010158	ACAA	2	8	9204	9211	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_010158	TCAG	2	8	12152	12159	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010158	ACAG	2	8	12167	12174	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010158	AACA	2	8	12536	12543	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_010158	CTCA	2	8	13033	13040	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_010158	TGTA	2	8	13826	13833	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010158	ATTT	2	8	13930	13937	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010158	ACAG	2	8	18175	18182	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010158	ACGA	2	8	18272	18279	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_010158	TGCC	2	8	18282	18289	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_010158	ACAA	2	8	18812	18819	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_010158	TACT	2	8	22996	23003	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_010158	ACCT	2	8	24784	24791	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010158	TTGC	2	8	24928	24935	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010158	CTTC	2	8	24987	24994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010158	CACG	2	8	25063	25070	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010158	TAAG	2	8	29487	29494	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010158	CCTG	2	8	29917	29924	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010158	GAAA	2	8	30385	30392	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010158	CAAG	2	8	30787	30794	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010158	ACCA	2	8	32445	32452	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010158	AATG	2	8	33769	33776	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010158	TGAA	2	8	34034	34041	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010158	TGGT	2	8	34189	34196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010158	CAAC	2	8	34414	34421	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010158	TTAT	2	8	35265	35272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010158	CCAG	2	8	37354	37361	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010158	GCTG	2	8	39589	39596	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010158	TATT	2	8	40789	40796	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010158	TTAT	3	12	43496	43507	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010158	TAAA	2	8	43651	43658	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010158	AGTA	3	12	46680	46691	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010158	CGAG	2	8	47218	47225	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010158	CCTA	2	8	52224	52231	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010158	GTAA	2	8	55589	55596	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010158	TAAT	2	8	72502	72509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010158	ACGA	2	8	72751	72758	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010158	TCTT	2	8	72858	72865	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_010158	TAAG	2	8	72880	72887	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010158	AGCG	2	8	75924	75931	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_010158	TTGG	2	8	76038	76045	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010158	GTAG	3	12	76735	76746	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010158	TTAT	2	8	76747	76754	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010158	CGAG	2	8	80106	80113	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_010158	TACT	2	8	80130	80137	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_010158	GGTT	2	8	80327	80334	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010158	GAAA	2	8	80628	80635	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010158	GAAG	2	8	80654	80661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010158	TATT	2	8	82426	82433	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010158	TCGT	2	8	87835	87842	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010158	AGTA	2	8	87877	87884	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010158	TAGG	2	8	90371	90378	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010158	GAAA	2	8	90771	90778	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010158	GATG	2	8	91330	91337	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010158	ATCA	2	8	91969	91976	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_010158	CACT	2	8	92351	92358	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010158	GAAA	2	8	92625	92632	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010158	AGGG	2	8	92642	92649	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010158	GATA	2	8	96537	96544	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010158	GCAA	2	8	96638	96645	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_010158	CAGG	2	8	96689	96696	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_010158	TGGC	2	8	96966	96973	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010158	GCCA	2	8	97118	97125	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_010158	CATA	2	8	100247	100254	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_010158	ATCT	2	8	103611	103618	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_010158	CGTT	2	8	104995	105002	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_010158	CTGC	2	8	105154	105161	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010158	GAAA	2	8	105335	105342	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010158	AGAA	2	8	105675	105682	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010158	TTTG	2	8	105867	105874	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010158	AGGC	2	8	105981	105988	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_010158	AATG	2	8	107590	107597	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010158	TCGC	2	8	110855	110862	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_010158	CTGC	2	8	111567	111574	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.