MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Angola plasmid pMT-pPCP

Total Repeats: 202

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010158	TCGC	2	8	328	335	0 %	25 %	25 %	50 %	162417828
2	NC_010158	CATT	2	8	382	389	25 %	50 %	0 %	25 %	162417828
3	NC_010158	GCTG	2	8	895	902	0 %	25 %	50 %	25 %	162417828
4	NC_010158	CTCA	2	8	1390	1397	25 %	25 %	0 %	50 %	162417939
5	NC_010158	TCAG	2	8	1641	1648	25 %	25 %	25 %	25 %	162417939
6	NC_010158	CAGA	2	8	1840	1847	50 %	0 %	25 %	25 %	162417939
7	NC_010158	CTGT	2	8	4632	4639	0 %	50 %	25 %	25 %	162417887
8	NC_010158	GAAA	2	8	4732	4739	75 %	0 %	25 %	0 %	162417887
9	NC_010158	TCTT	2	8	5506	5513	0 %	75 %	0 %	25 %	162417933
10	NC_010158	ATGA	2	8	6984	6991	50 %	25 %	25 %	0 %	162417902
11	NC_010158	AATC	2	8	6993	7000	50 %	25 %	0 %	25 %	162417902
12	NC_010158	TACA	2	8	7457	7464	50 %	25 %	0 %	25 %	162417902
13	NC_010158	TCCT	2	8	7808	7815	0 %	50 %	0 %	50 %	162417838
14	NC_010158	CTGT	2	8	8947	8954	0 %	50 %	25 %	25 %	162417910
15	NC_010158	TAAT	2	8	9261	9268	50 %	50 %	0 %	0 %	162417840
16	NC_010158	AACG	2	8	9612	9619	50 %	0 %	25 %	25 %	162417840
17	NC_010158	TCGC	2	8	9936	9943	0 %	25 %	25 %	50 %	162417912
18	NC_010158	CATT	2	8	9990	9997	25 %	50 %	0 %	25 %	162417912
19	NC_010158	GCTG	2	8	10503	10510	0 %	25 %	50 %	25 %	162417912
20	NC_010158	CTCA	2	8	10998	11005	25 %	25 %	0 %	50 %	162417858
21	NC_010158	TCAG	2	8	11249	11256	25 %	25 %	25 %	25 %	162417858
22	NC_010158	CAGA	2	8	11448	11455	50 %	0 %	25 %	25 %	162417858
23	NC_010158	CTGT	2	8	14240	14247	0 %	50 %	25 %	25 %	162417849
24	NC_010158	GAAA	2	8	14340	14347	75 %	0 %	25 %	0 %	162417849
25	NC_010158	TCTT	2	8	15114	15121	0 %	75 %	0 %	25 %	162417922
26	NC_010158	ATGA	2	8	16592	16599	50 %	25 %	25 %	0 %	162417870
27	NC_010158	AATC	2	8	16601	16608	50 %	25 %	0 %	25 %	162417870
28	NC_010158	TACA	2	8	17065	17072	50 %	25 %	0 %	25 %	162417870
29	NC_010158	TCCT	2	8	17416	17423	0 %	50 %	0 %	50 %	162417831
30	NC_010158	CTGT	2	8	18555	18562	0 %	50 %	25 %	25 %	162417865
31	NC_010158	TAAT	2	8	18869	18876	50 %	50 %	0 %	0 %	162417829
32	NC_010158	AACG	2	8	19220	19227	50 %	0 %	25 %	25 %	162417829
33	NC_010158	TCGC	2	8	19544	19551	0 %	25 %	25 %	50 %	162417833
34	NC_010158	CATT	2	8	19598	19605	25 %	50 %	0 %	25 %	162417833
35	NC_010158	GCTG	2	8	20111	20118	0 %	25 %	50 %	25 %	162417833
36	NC_010158	CTCA	2	8	20606	20613	25 %	25 %	0 %	50 %	162417864
37	NC_010158	TCAG	2	8	20857	20864	25 %	25 %	25 %	25 %	162417864
38	NC_010158	CAGA	2	8	21056	21063	50 %	0 %	25 %	25 %	162417864
39	NC_010158	CCCA	2	8	21468	21475	25 %	0 %	0 %	75 %	162417862
40	NC_010158	GCGA	2	8	22906	22913	25 %	0 %	50 %	25 %	162417927
41	NC_010158	GTGG	2	8	24001	24008	0 %	25 %	75 %	0 %	162417878
42	NC_010158	GCCA	2	8	24184	24191	25 %	0 %	25 %	50 %	162417878
43	NC_010158	ATCA	2	8	25538	25545	50 %	25 %	0 %	25 %	162417925
44	NC_010158	GCGT	2	8	25760	25767	0 %	25 %	50 %	25 %	162417925
45	NC_010158	TGCG	2	8	26124	26131	0 %	25 %	50 %	25 %	162417925
46	NC_010158	CGAG	2	8	27117	27124	25 %	0 %	50 %	25 %	162417866
47	NC_010158	AGCG	2	8	27292	27299	25 %	0 %	50 %	25 %	162417866
48	NC_010158	GCCA	2	8	27336	27343	25 %	0 %	25 %	50 %	162417866
49	NC_010158	TGCG	2	8	27482	27489	0 %	25 %	50 %	25 %	162417866
50	NC_010158	AGCC	2	8	28677	28684	25 %	0 %	25 %	50 %	162417843
51	NC_010158	TCGT	2	8	31030	31037	0 %	50 %	25 %	25 %	162417893
52	NC_010158	TGTT	2	8	31731	31738	0 %	75 %	25 %	0 %	162417918
53	NC_010158	GCGT	2	8	31795	31802	0 %	25 %	50 %	25 %	162417918
54	NC_010158	GTTT	2	8	32210	32217	0 %	75 %	25 %	0 %	162417869
55	NC_010158	CTGG	2	8	35844	35851	0 %	25 %	50 %	25 %	162417867
56	NC_010158	TCAT	2	8	36070	36077	25 %	50 %	0 %	25 %	162417867
57	NC_010158	CCCA	2	8	36540	36547	25 %	0 %	0 %	75 %	162417909
58	NC_010158	TACC	2	8	36568	36575	25 %	25 %	0 %	50 %	162417909
59	NC_010158	TTAC	2	8	37057	37064	25 %	50 %	0 %	25 %	162417909
60	NC_010158	TGAG	2	8	37081	37088	25 %	25 %	50 %	0 %	162417901
61	NC_010158	GATT	2	8	38986	38993	25 %	50 %	25 %	0 %	162417832
62	NC_010158	GTAA	2	8	40681	40688	50 %	25 %	25 %	0 %	162417905
63	NC_010158	CTGG	2	8	41843	41850	0 %	25 %	50 %	25 %	162417853
64	NC_010158	CTTT	2	8	41881	41888	0 %	75 %	0 %	25 %	162417830
65	NC_010158	AATT	2	8	42802	42809	50 %	50 %	0 %	0 %	162417907
66	NC_010158	GATT	2	8	42933	42940	25 %	50 %	25 %	0 %	162417907
67	NC_010158	GTTG	2	8	42942	42949	0 %	50 %	50 %	0 %	162417907
68	NC_010158	TTCA	2	8	42997	43004	25 %	50 %	0 %	25 %	162417907
69	NC_010158	TGCT	2	8	43206	43213	0 %	50 %	25 %	25 %	162417907
70	NC_010158	GATG	2	8	44541	44548	25 %	25 %	50 %	0 %	162417842
71	NC_010158	TATT	2	8	45191	45198	25 %	75 %	0 %	0 %	162417900
72	NC_010158	CCTG	2	8	45382	45389	0 %	25 %	25 %	50 %	162417900
73	NC_010158	GATT	2	8	46156	46163	25 %	50 %	25 %	0 %	162417900
74	NC_010158	CTGG	2	8	47593	47600	0 %	25 %	50 %	25 %	162417908
75	NC_010158	AGAA	2	8	47858	47865	75 %	0 %	25 %	0 %	162417908
76	NC_010158	TTGC	2	8	47971	47978	0 %	50 %	25 %	25 %	162417908
77	NC_010158	GCTG	2	8	48054	48061	0 %	25 %	50 %	25 %	162417908
78	NC_010158	GACA	2	8	48956	48963	50 %	0 %	25 %	25 %	162417903
79	NC_010158	TCCG	2	8	49435	49442	0 %	25 %	25 %	50 %	162417903
80	NC_010158	TGAG	2	8	49543	49550	25 %	25 %	50 %	0 %	162417903
81	NC_010158	ACAA	2	8	49867	49874	75 %	0 %	0 %	25 %	162417877
82	NC_010158	TGCG	2	8	50539	50546	0 %	25 %	50 %	25 %	162417941
83	NC_010158	TCGG	2	8	50608	50615	0 %	25 %	50 %	25 %	162417941
84	NC_010158	TGAT	2	8	50857	50864	25 %	50 %	25 %	0 %	162417941
85	NC_010158	GCAC	2	8	51895	51902	25 %	0 %	25 %	50 %	162417876
86	NC_010158	TAAG	2	8	52214	52221	50 %	25 %	25 %	0 %	162417876
87	NC_010158	GGCG	2	8	52352	52359	0 %	0 %	75 %	25 %	162417881
88	NC_010158	TCAT	2	8	52497	52504	25 %	50 %	0 %	25 %	162417881
89	NC_010158	TGAT	2	8	53028	53035	25 %	50 %	25 %	0 %	162417881
90	NC_010158	ATGG	2	8	53473	53480	25 %	25 %	50 %	0 %	162417881
91	NC_010158	CTGA	2	8	53543	53550	25 %	25 %	25 %	25 %	162417881
92	NC_010158	TACT	2	8	53736	53743	25 %	50 %	0 %	25 %	162417881
93	NC_010158	GATG	2	8	53885	53892	25 %	25 %	50 %	0 %	162417872
94	NC_010158	CTTC	2	8	54385	54392	0 %	50 %	0 %	50 %	162417872
95	NC_010158	AGCC	2	8	54505	54512	25 %	0 %	25 %	50 %	162417872
96	NC_010158	AGCA	2	8	55447	55454	50 %	0 %	25 %	25 %	162417932
97	NC_010158	CTGC	2	8	55459	55466	0 %	25 %	25 %	50 %	162417932
98	NC_010158	GAGC	2	8	55752	55759	25 %	0 %	50 %	25 %	162417850
99	NC_010158	GCTT	2	8	55780	55787	0 %	50 %	25 %	25 %	162417850
100	NC_010158	CCGT	2	8	55834	55841	0 %	25 %	25 %	50 %	162417850
101	NC_010158	ATTC	2	8	55898	55905	25 %	50 %	0 %	25 %	162417850
102	NC_010158	TCTG	2	8	57492	57499	0 %	50 %	25 %	25 %	162417851
103	NC_010158	CTAT	2	8	58371	58378	25 %	50 %	0 %	25 %	162417888
104	NC_010158	GCCA	2	8	58612	58619	25 %	0 %	25 %	50 %	162417835
105	NC_010158	GGTT	2	8	58812	58819	0 %	50 %	50 %	0 %	162417835
106	NC_010158	TTGA	2	8	58865	58872	25 %	50 %	25 %	0 %	162417835
107	NC_010158	ACTG	2	8	59541	59548	25 %	25 %	25 %	25 %	162417924
108	NC_010158	ACTG	2	8	60020	60027	25 %	25 %	25 %	25 %	162417856
109	NC_010158	TGAT	2	8	60067	60074	25 %	50 %	25 %	0 %	162417856
110	NC_010158	TGCG	2	8	60264	60271	0 %	25 %	50 %	25 %	162417868
111	NC_010158	TCGC	2	8	60297	60304	0 %	25 %	25 %	50 %	162417868
112	NC_010158	CGGG	2	8	60534	60541	0 %	0 %	75 %	25 %	162417827
113	NC_010158	GATG	2	8	61031	61038	25 %	25 %	50 %	0 %	162417827
114	NC_010158	CTTG	2	8	61193	61200	0 %	50 %	25 %	25 %	162417827
115	NC_010158	TGCG	2	8	61723	61730	0 %	25 %	50 %	25 %	162417827
116	NC_010158	GCTT	2	8	61868	61875	0 %	50 %	25 %	25 %	162417827
117	NC_010158	TTCG	2	8	61901	61908	0 %	50 %	25 %	25 %	162417827
118	NC_010158	TGGC	2	8	61968	61975	0 %	25 %	50 %	25 %	162417827
119	NC_010158	AGGA	2	8	63408	63415	50 %	0 %	50 %	0 %	162417827
120	NC_010158	GGCA	2	8	63881	63888	25 %	0 %	50 %	25 %	162417827
121	NC_010158	CAAC	2	8	64327	64334	50 %	0 %	0 %	50 %	162417827
122	NC_010158	TAAC	2	8	65030	65037	50 %	25 %	0 %	25 %	162417827
123	NC_010158	GACT	2	8	65085	65092	25 %	25 %	25 %	25 %	162417886
124	NC_010158	ACGC	2	8	66128	66135	25 %	0 %	25 %	50 %	162417880
125	NC_010158	ATCT	2	8	66242	66249	25 %	50 %	0 %	25 %	162417931
126	NC_010158	CGAA	2	8	66270	66277	50 %	0 %	25 %	25 %	162417931
127	NC_010158	AGTT	2	8	66986	66993	25 %	50 %	25 %	0 %	162417931
128	NC_010158	TGGT	2	8	67281	67288	0 %	50 %	50 %	0 %	162417844
129	NC_010158	AGGC	2	8	67420	67427	25 %	0 %	50 %	25 %	162417844
130	NC_010158	AGTC	2	8	67901	67908	25 %	25 %	25 %	25 %	162417852
131	NC_010158	GTGG	2	8	68259	68266	0 %	25 %	75 %	0 %	162417852
132	NC_010158	TCGT	2	8	68367	68374	0 %	50 %	25 %	25 %	162417852
133	NC_010158	CCTG	2	8	68482	68489	0 %	25 %	25 %	50 %	162417852
134	NC_010158	CCGT	2	8	68838	68845	0 %	25 %	25 %	50 %	162417852
135	NC_010158	CGCA	2	8	69018	69025	25 %	0 %	25 %	50 %	162417852
136	NC_010158	CTTC	2	8	69065	69072	0 %	50 %	0 %	50 %	162417852
137	NC_010158	GCGT	2	8	69368	69375	0 %	25 %	50 %	25 %	162417852
138	NC_010158	TCAA	2	8	69574	69581	50 %	25 %	0 %	25 %	162417852
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140	NC_010158	GCAG	2	8	71559	71566	25 %	0 %	50 %	25 %	162417852
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.