MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Angola plasmid pMT-pPCP

Total Repeats: 322

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010158	TGG	2	6	1913	1918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010158	CGT	2	6	1944	1949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010158	TGA	2	6	1958	1963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010158	CAG	2	6	2096	2101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010158	ACA	2	6	2116	2121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010158	GAT	2	6	2241	2246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010158	GTT	2	6	2381	2386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010158	GTC	2	6	2399	2404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010158	TGT	2	6	2536	2541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010158	ACA	3	9	2933	2941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010158	CGA	2	6	3017	3022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010158	GGC	2	6	3026	3031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010158	GAA	2	6	3060	3065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010158	GCG	2	6	3408	3413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010158	GCA	2	6	3878	3883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010158	GCA	2	6	4076	4081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010158	AAG	2	6	4108	4113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010158	CAG	2	6	4155	4160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010158	ATG	2	6	4167	4172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010158	TGC	2	6	4188	4193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010158	ATT	2	6	4309	4314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010158	ATT	2	6	4794	4799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010158	GAC	2	6	6545	6550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010158	ATT	2	6	6567	6572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010158	ATT	2	6	6588	6593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010158	ATA	2	6	6622	6627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010158	TCC	2	6	7629	7634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_010158	GGA	2	6	7643	7648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010158	AGG	2	6	7660	7665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010158	TGT	2	6	7735	7740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010158	CAC	2	6	8534	8539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_010158	CAA	2	6	8585	8590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010158	CCG	2	6	8604	8609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_010158	TGG	2	6	8715	8720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010158	CAA	2	6	8799	8804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010158	TGC	2	6	9070	9075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010158	AAT	2	6	9187	9192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010158	TGG	2	6	11521	11526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010158	CGT	2	6	11552	11557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010158	TGA	2	6	11566	11571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010158	CAG	2	6	11704	11709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010158	ACA	2	6	11724	11729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010158	GAT	2	6	11849	11854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010158	GTT	2	6	11989	11994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010158	GTC	2	6	12007	12012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010158	TGT	2	6	12144	12149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010158	ACA	3	9	12541	12549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010158	CGA	2	6	12625	12630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010158	GGC	2	6	12634	12639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010158	GAA	2	6	12668	12673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010158	GCG	2	6	13016	13021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010158	GCA	2	6	13486	13491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010158	GCA	2	6	13684	13689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010158	AAG	2	6	13716	13721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010158	CAG	2	6	13763	13768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010158	ATG	2	6	13775	13780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010158	TGC	2	6	13796	13801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010158	ATT	2	6	13917	13922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010158	ATT	2	6	14402	14407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010158	GAC	2	6	16153	16158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010158	ATT	2	6	16175	16180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010158	ATT	2	6	16196	16201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010158	ATA	2	6	16230	16235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010158	TCC	2	6	17237	17242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_010158	GGA	2	6	17251	17256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010158	AGG	2	6	17268	17273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010158	TGT	2	6	17343	17348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010158	CAC	2	6	18142	18147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_010158	CAA	2	6	18193	18198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010158	CCG	2	6	18212	18217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_010158	TGG	2	6	18323	18328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010158	CAA	2	6	18407	18412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010158	TGC	2	6	18678	18683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010158	AAT	2	6	18795	18800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010158	TGG	2	6	21129	21134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010158	CGT	2	6	21160	21165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010158	TAT	2	6	23004	23009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010158	GGT	2	6	23071	23076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010158	GCT	2	6	24957	24962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010158	GCG	2	6	25198	25203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010158	TCG	2	6	25208	25213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010158	TCT	2	6	25230	25235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010158	CCA	2	6	25241	25246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_010158	CCA	2	6	25257	25262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_010158	CCA	2	6	25273	25278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_010158	AAC	2	6	29426	29431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010158	ACA	2	6	29436	29441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010158	AGA	2	6	29448	29453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010158	TAT	2	6	29726	29731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010158	CGG	2	6	29847	29852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010158	CTG	2	6	30017	30022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010158	CTT	2	6	30143	30148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010158	GTT	2	6	30155	30160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010158	ATG	2	6	30279	30284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010158	GGC	2	6	30469	30474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010158	AGA	2	6	30562	30567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010158	TGC	2	6	30655	30660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010158	TAT	2	6	30761	30766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010158	TAT	2	6	30865	30870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010158	TCT	2	6	30924	30929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010158	ACT	2	6	30934	30939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010158	ATT	2	6	31899	31904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010158	AAT	2	6	31919	31924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010158	AGA	2	6	31947	31952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010158	ATA	2	6	32050	32055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010158	AGG	2	6	32115	32120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010158	TGA	2	6	32498	32503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010158	CCA	2	6	32533	32538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_010158	AAC	3	9	33720	33728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010158	GTT	2	6	34023	34028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010158	CAC	2	6	34082	34087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_010158	TTC	2	6	34453	34458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010158	ATC	2	6	34566	34571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010158	CGC	2	6	34592	34597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_010158	ATC	2	6	34606	34611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010158	GAC	2	6	34629	34634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010158	TCG	2	6	34645	34650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010158	TTC	2	6	34741	34746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010158	ATC	2	6	34812	34817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010158	ATA	2	6	34890	34895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010158	TAA	2	6	34898	34903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010158	TTG	2	6	35251	35256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010158	CTT	2	6	36084	36089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_010158	TTG	2	6	36163	36168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010158	ATA	2	6	36172	36177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010158	CCA	2	6	37372	37377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_010158	GCC	2	6	37388	37393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_010158	ATT	2	6	37530	37535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010158	TTC	2	6	37542	37547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010158	ATG	2	6	37611	37616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010158	GCT	2	6	37619	37624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_010158	CTG	2	6	37632	37637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010158	TTA	2	6	37667	37672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010158	TGA	2	6	37703	37708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010158	CGA	2	6	37709	37714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010158	GAG	2	6	37737	37742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010158	GTT	2	6	37743	37748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010158	AGA	2	6	37754	37759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010158	TGA	2	6	37785	37790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010158	ACT	2	6	39295	39300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_010158	GAA	2	6	39326	39331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_010158	TAA	2	6	105167	105172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_010158	GAT	2	6	105201	105206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_010158	AGA	2	6	105320	105325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_010158	GCA	2	6	105381	105386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_010158	GAA	2	6	105468	105473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
284	NC_010158	ACA	2	6	105478	105483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_010158	AAG	2	6	105693	105698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
286	NC_010158	TTG	2	6	105703	105708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_010158	CAC	2	6	105845	105850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
288	NC_010158	CAC	2	6	105913	105918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
289	NC_010158	ATC	2	6	106164	106169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_010158	CAT	2	6	107644	107649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_010158	CTG	2	6	108166	108171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_010158	CGT	2	6	108281	108286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_010158	TTG	2	6	109381	109386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
294	NC_010158	CGG	2	6	109436	109441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_010158	GAA	2	6	109528	109533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
296	NC_010158	CGG	2	6	109604	109609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
297	NC_010158	CGG	2	6	109619	109624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_010158	ATC	2	6	109697	109702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_010158	CGC	2	6	109723	109728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
300	NC_010158	GCG	2	6	109738	109743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
301	NC_010158	CGC	2	6	109779	109784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
302	NC_010158	GCG	2	6	109789	109794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
303	NC_010158	CAG	2	6	110608	110613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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305	NC_010158	TCC	2	6	110674	110679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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310	NC_010158	GGA	2	6	110990	110995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
311	NC_010158	GCC	2	6	111530	111535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
312	NC_010158	CGC	2	6	111585	111590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
313	NC_010158	GCG	2	6	111595	111600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
314	NC_010158	GGT	2	6	111631	111636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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321	NC_010158	GCC	2	6	114543	114548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
322	NC_010158	GGC	2	6	114562	114567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.