MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Angola plasmid pMT-pPCP

Total Repeats: 1114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010158	GCC	2	6	215	220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417828
2	NC_010158	CGC	2	6	229	234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417828
3	NC_010158	CTG	2	6	238	243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417828
4	NC_010158	GAC	2	6	448	453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417828
5	NC_010158	CTT	2	6	605	610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417828
6	NC_010158	TGG	2	6	611	616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417828
7	NC_010158	AGC	2	6	970	975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417828
8	NC_010158	TGA	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417828
9	NC_010158	CAT	2	6	1062	1067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417828
10	NC_010158	TGA	2	6	1107	1112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417828
11	NC_010158	GAA	2	6	1253	1258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417939
12	NC_010158	TCA	2	6	1270	1275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417939
13	NC_010158	CGG	2	6	1314	1319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417939
14	NC_010158	CAG	3	9	1518	1526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417939
15	NC_010158	ACG	2	6	1574	1579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417939
16	NC_010158	TCA	2	6	1611	1616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417939
17	NC_010158	TGA	2	6	1618	1623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417939
18	NC_010158	GAA	2	6	1649	1654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417939
19	NC_010158	TTC	2	6	1664	1669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417939
20	NC_010158	GCA	2	6	1760	1765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417939
21	NC_010158	TAC	2	6	2721	2726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417882
22	NC_010158	AAT	2	6	2799	2804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417882
23	NC_010158	ATC	2	6	4393	4398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417887
24	NC_010158	GAT	2	6	4588	4593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417887
25	NC_010158	TAA	2	6	4656	4661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417887
26	NC_010158	TAG	2	6	4725	4730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417887
27	NC_010158	TAT	2	6	4769	4774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417887
28	NC_010158	CAA	2	6	4889	4894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417933
29	NC_010158	TAT	2	6	4895	4900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417933
30	NC_010158	CCT	2	6	5171	5176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162417933
31	NC_010158	ATA	2	6	5190	5195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417933
32	NC_010158	CTA	2	6	5314	5319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417933
33	NC_010158	CAA	2	6	5387	5392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417933
34	NC_010158	ACG	2	6	5403	5408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417933
35	NC_010158	TTA	2	6	5482	5487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417933
36	NC_010158	ACC	2	6	5853	5858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417933
37	NC_010158	TAA	2	6	5966	5971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417857
38	NC_010158	CGC	2	6	5977	5982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417857
39	NC_010158	AAT	2	6	5998	6003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417857
40	NC_010158	GCA	2	6	6062	6067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417857
41	NC_010158	CTG	2	6	6166	6171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417857
42	NC_010158	GAA	2	6	6196	6201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417857
43	NC_010158	GAA	2	6	6665	6670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417902
44	NC_010158	GCA	2	6	6720	6725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417902
45	NC_010158	GAA	2	6	6832	6837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417902
46	NC_010158	CAG	2	6	7114	7119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417902
47	NC_010158	GGT	2	6	7155	7160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417902
48	NC_010158	TAA	2	6	7172	7177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417902
49	NC_010158	ATT	2	6	7298	7303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417902
50	NC_010158	ATG	2	6	7336	7341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417902
51	NC_010158	TTA	2	6	7391	7396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417902
52	NC_010158	ATG	2	6	7471	7476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417902
53	NC_010158	AGG	2	6	7484	7489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162417902
54	NC_010158	TGC	2	6	7541	7546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417902
55	NC_010158	CGG	2	6	7576	7581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417902
56	NC_010158	GCT	2	6	7901	7906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417838
57	NC_010158	CTG	2	6	7919	7924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417838
58	NC_010158	TTC	2	6	7974	7979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417838
59	NC_010158	CAT	2	6	7983	7988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417838
60	NC_010158	ATC	2	6	8008	8013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417838
61	NC_010158	CGA	2	6	8202	8207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417890
62	NC_010158	TCT	2	6	8379	8384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417890
63	NC_010158	GTC	2	6	8399	8404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417890
64	NC_010158	CAG	2	6	8864	8869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417910
65	NC_010158	CAA	2	6	9019	9024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417910
66	NC_010158	CCT	2	6	9374	9379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162417840
67	NC_010158	CCA	2	6	9404	9409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417840
68	NC_010158	AGG	2	6	9428	9433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162417840
69	NC_010158	ATA	2	6	9569	9574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417840
70	NC_010158	GCC	2	6	9823	9828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417912
71	NC_010158	CGC	2	6	9837	9842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417912
72	NC_010158	CTG	2	6	9846	9851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417912
73	NC_010158	GAC	2	6	10056	10061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417912
74	NC_010158	CTT	2	6	10213	10218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417912
75	NC_010158	TGG	2	6	10219	10224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417912
76	NC_010158	AGC	2	6	10578	10583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417912
77	NC_010158	TGA	2	6	10633	10638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417912
78	NC_010158	CAT	2	6	10670	10675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417912
79	NC_010158	TGA	2	6	10715	10720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417912
80	NC_010158	GAA	2	6	10861	10866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417858
81	NC_010158	TCA	2	6	10878	10883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417858
82	NC_010158	CGG	2	6	10922	10927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417858
83	NC_010158	CAG	3	9	11126	11134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417858
84	NC_010158	ACG	2	6	11182	11187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417858
85	NC_010158	TCA	2	6	11219	11224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417858
86	NC_010158	TGA	2	6	11226	11231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417858
87	NC_010158	GAA	2	6	11257	11262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417858
88	NC_010158	TTC	2	6	11272	11277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417858
89	NC_010158	GCA	2	6	11368	11373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417858
90	NC_010158	TAC	2	6	12329	12334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417923
91	NC_010158	AAT	2	6	12407	12412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417923
92	NC_010158	ATC	2	6	14001	14006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417849
93	NC_010158	GAT	2	6	14196	14201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417849
94	NC_010158	TAA	2	6	14264	14269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417849
95	NC_010158	TAG	2	6	14333	14338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417849
96	NC_010158	TAT	2	6	14377	14382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417849
97	NC_010158	CAA	2	6	14497	14502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417922
98	NC_010158	TAT	2	6	14503	14508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417922
99	NC_010158	CCT	2	6	14779	14784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162417922
100	NC_010158	ATA	2	6	14798	14803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417922
101	NC_010158	CTA	2	6	14922	14927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417922
102	NC_010158	CAA	2	6	14995	15000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417922
103	NC_010158	ACG	2	6	15011	15016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417922
104	NC_010158	TTA	2	6	15090	15095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417922
105	NC_010158	ACC	2	6	15461	15466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417922
106	NC_010158	TAA	2	6	15574	15579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417846
107	NC_010158	CGC	2	6	15585	15590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417846
108	NC_010158	AAT	2	6	15606	15611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417846
109	NC_010158	GCA	2	6	15670	15675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417846
110	NC_010158	CTG	2	6	15774	15779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417846
111	NC_010158	GAA	2	6	15804	15809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417846
112	NC_010158	GAA	2	6	16273	16278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417870
113	NC_010158	GCA	2	6	16328	16333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417870
114	NC_010158	GAA	2	6	16440	16445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417870
115	NC_010158	CAG	2	6	16722	16727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417870
116	NC_010158	GGT	2	6	16763	16768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417870
117	NC_010158	TAA	2	6	16780	16785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417870
118	NC_010158	ATT	2	6	16906	16911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417870
119	NC_010158	ATG	2	6	16944	16949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417870
120	NC_010158	TTA	2	6	16999	17004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417870
121	NC_010158	ATG	2	6	17079	17084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417870
122	NC_010158	AGG	2	6	17092	17097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162417870
123	NC_010158	TGC	2	6	17149	17154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417870
124	NC_010158	CGG	2	6	17184	17189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417870
125	NC_010158	GCT	2	6	17509	17514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417831
126	NC_010158	CTG	2	6	17527	17532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417831
127	NC_010158	TTC	2	6	17582	17587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417831
128	NC_010158	CAT	2	6	17591	17596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417831
129	NC_010158	ATC	2	6	17616	17621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417831
130	NC_010158	CGA	2	6	17810	17815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417863
131	NC_010158	TCT	2	6	17987	17992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417863
132	NC_010158	GTC	2	6	18007	18012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417863
133	NC_010158	CAG	2	6	18472	18477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417865
134	NC_010158	CAA	2	6	18627	18632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417865
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138	NC_010158	ATA	2	6	19177	19182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417829
139	NC_010158	GCC	2	6	19431	19436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417833
140	NC_010158	CGC	2	6	19445	19450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417833
141	NC_010158	CTG	2	6	19454	19459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417833
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144	NC_010158	TGG	2	6	19827	19832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417833
145	NC_010158	AGC	2	6	20186	20191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417833
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148	NC_010158	TGA	2	6	20323	20328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417833
149	NC_010158	GAA	2	6	20469	20474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417864
150	NC_010158	TCA	2	6	20486	20491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417864
151	NC_010158	CGG	2	6	20530	20535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417864
152	NC_010158	CAG	3	9	20734	20742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417864
153	NC_010158	ACG	2	6	20790	20795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417864
154	NC_010158	TCA	2	6	20827	20832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417864
155	NC_010158	TGA	2	6	20834	20839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417864
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157	NC_010158	TTC	2	6	20880	20885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417864
158	NC_010158	GCA	2	6	20976	20981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417864
159	NC_010158	ACA	2	6	21227	21232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417862
160	NC_010158	TGG	2	6	21258	21263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417862
161	NC_010158	GCT	2	6	21273	21278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417862
162	NC_010158	ACG	2	6	21320	21325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417862
163	NC_010158	TCA	2	6	21335	21340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417862
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243	NC_010158	GCC	2	6	28357	28362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417843
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248	NC_010158	CAA	2	6	28548	28553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417843
249	NC_010158	GTG	2	6	28639	28644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417843
250	NC_010158	ACC	2	6	28733	28738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417843
251	NC_010158	GCA	2	6	28743	28748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417843
252	NC_010158	CTT	2	6	28749	28754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417843
253	NC_010158	ACA	3	9	28776	28784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417843
254	NC_010158	TTG	2	6	28850	28855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162417843
255	NC_010158	TGA	2	6	29124	29129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417843
256	NC_010158	CAC	2	6	29178	29183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417843
257	NC_010158	CCA	2	6	29205	29210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417843
258	NC_010158	CTT	2	6	29250	29255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417843
259	NC_010158	TGT	2	6	29305	29310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162417843
260	NC_010158	GAT	2	6	29328	29333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417843
261	NC_010158	CAG	2	6	29590	29595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417934
262	NC_010158	GCC	3	9	31064	31072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417893
263	NC_010158	GTC	2	6	31322	31327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417918
264	NC_010158	TCT	2	6	31378	31383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417918
265	NC_010158	GCA	2	6	31423	31428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417918
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268	NC_010158	CAG	2	6	31607	31612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417918
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270	NC_010158	CCA	2	6	32218	32223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417869
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272	NC_010158	CAA	2	6	32663	32668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417825
273	NC_010158	CTG	2	6	32770	32775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417825
274	NC_010158	CAT	2	6	32876	32881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417825
275	NC_010158	GTT	2	6	32904	32909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162417825
276	NC_010158	TCG	2	6	32932	32937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417825
277	NC_010158	TGA	2	6	33056	33061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417825
278	NC_010158	TTC	2	6	33172	33177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417825
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280	NC_010158	TCA	2	6	33415	33420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417825
281	NC_010158	GGC	2	6	33430	33435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417825
282	NC_010158	CCA	2	6	33456	33461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417825
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284	NC_010158	AGA	2	6	33485	33490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417825
285	NC_010158	AGG	2	6	33520	33525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162417825
286	NC_010158	CAT	2	6	33527	33532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417825
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289	NC_010158	GAA	2	6	33582	33587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417825
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366	NC_010158	ACC	2	6	44587	44592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417842
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495	NC_010158	TGA	2	6	54784	54789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417932
496	NC_010158	AAC	2	6	54806	54811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417932
497	NC_010158	CAT	2	6	54838	54843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417932
498	NC_010158	CAA	2	6	55063	55068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417932
499	NC_010158	CCG	2	6	55120	55125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417932
500	NC_010158	CCA	3	9	55146	55154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417932

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