MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Yersinia pestis Angola plasmid pMT-pPCP

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010158	TC	4	8	393	400	0 %	50 %	0 %	50 %	162417828
2	NC_010158	CG	3	6	622	627	0 %	0 %	50 %	50 %	162417828
3	NC_010158	TC	3	6	736	741	0 %	50 %	0 %	50 %	162417828
4	NC_010158	AC	3	6	2211	2216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010158	TG	3	6	3034	3039	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010158	CA	3	6	3453	3458	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010158	TG	3	6	3782	3787	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010158	AG	3	6	4617	4622	50 %	0 %	50 %	0 %	162417887
9	NC_010158	TC	3	6	4650	4655	0 %	50 %	0 %	50 %	162417887
10	NC_010158	AC	3	6	6236	6241	50 %	0 %	0 %	50 %	162417857
11	NC_010158	AG	3	6	6643	6648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010158	AT	3	6	6745	6750	50 %	50 %	0 %	0 %	162417902
13	NC_010158	AT	3	6	6889	6894	50 %	50 %	0 %	0 %	162417902
14	NC_010158	AT	3	6	7247	7252	50 %	50 %	0 %	0 %	162417902
15	NC_010158	GA	3	6	7352	7357	50 %	0 %	50 %	0 %	162417902
16	NC_010158	TC	3	6	7617	7622	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_010158	TG	3	6	7689	7694	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010158	GT	3	6	8101	8106	0 %	50 %	50 %	0 %	162417890
19	NC_010158	TC	4	8	10001	10008	0 %	50 %	0 %	50 %	162417912
20	NC_010158	CG	3	6	10230	10235	0 %	0 %	50 %	50 %	162417912
21	NC_010158	TC	3	6	10344	10349	0 %	50 %	0 %	50 %	162417912
22	NC_010158	AC	3	6	11819	11824	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010158	TG	3	6	12642	12647	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010158	CA	3	6	13061	13066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010158	TG	3	6	13390	13395	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010158	AG	3	6	14225	14230	50 %	0 %	50 %	0 %	162417849
27	NC_010158	TC	3	6	14258	14263	0 %	50 %	0 %	50 %	162417849
28	NC_010158	AC	3	6	15844	15849	50 %	0 %	0 %	50 %	162417846
29	NC_010158	AG	3	6	16251	16256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010158	AT	3	6	16353	16358	50 %	50 %	0 %	0 %	162417870
31	NC_010158	AT	3	6	16497	16502	50 %	50 %	0 %	0 %	162417870
32	NC_010158	AT	3	6	16855	16860	50 %	50 %	0 %	0 %	162417870
33	NC_010158	GA	3	6	16960	16965	50 %	0 %	50 %	0 %	162417870
34	NC_010158	TC	3	6	17225	17230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010158	TG	3	6	17297	17302	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010158	GT	3	6	17709	17714	0 %	50 %	50 %	0 %	162417863
37	NC_010158	TC	4	8	19609	19616	0 %	50 %	0 %	50 %	162417833
38	NC_010158	CG	3	6	19838	19843	0 %	0 %	50 %	50 %	162417833
39	NC_010158	TC	3	6	19952	19957	0 %	50 %	0 %	50 %	162417833
40	NC_010158	CG	3	6	21184	21189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_010158	CT	3	6	22318	22323	0 %	50 %	0 %	50 %	162417927
42	NC_010158	GC	4	8	22427	22434	0 %	0 %	50 %	50 %	162417927
43	NC_010158	AT	3	6	22987	22992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010158	AG	3	6	23351	23356	50 %	0 %	50 %	0 %	162417878
45	NC_010158	GC	3	6	23606	23611	0 %	0 %	50 %	50 %	162417878
46	NC_010158	CG	3	6	24070	24075	0 %	0 %	50 %	50 %	162417878
47	NC_010158	AG	3	6	24464	24469	50 %	0 %	50 %	0 %	162417878
48	NC_010158	CG	3	6	24590	24595	0 %	0 %	50 %	50 %	162417878
49	NC_010158	GA	3	6	24624	24629	50 %	0 %	50 %	0 %	162417878
50	NC_010158	AG	3	6	26371	26376	50 %	0 %	50 %	0 %	162417866
51	NC_010158	TG	3	6	26591	26596	0 %	50 %	50 %	0 %	162417866
52	NC_010158	GT	3	6	27689	27694	0 %	50 %	50 %	0 %	162417866
53	NC_010158	AG	3	6	29033	29038	50 %	0 %	50 %	0 %	162417843
54	NC_010158	AC	3	6	29985	29990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010158	TC	4	8	30950	30957	0 %	50 %	0 %	50 %	162417893
56	NC_010158	AG	3	6	31934	31939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010158	AG	3	6	32043	32048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010158	CT	3	6	32079	32084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_010158	AT	3	6	32182	32187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010158	CA	3	6	32222	32227	50 %	0 %	0 %	50 %	162417869
61	NC_010158	AG	3	6	32415	32420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010158	AG	3	6	32457	32462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010158	AG	3	6	33645	33650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010158	CT	3	6	33847	33852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010158	CT	3	6	34052	34057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010158	CG	4	8	34159	34166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010158	TG	3	6	34690	34695	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010158	TA	3	6	34943	34948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010158	GT	3	6	35451	35456	0 %	50 %	50 %	0 %	162417913
70	NC_010158	CG	4	8	38605	38612	0 %	0 %	50 %	50 %	162417832
71	NC_010158	CA	3	6	39251	39256	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010158	TA	3	6	40007	40012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010158	TG	3	6	40401	40406	0 %	50 %	50 %	0 %	162417905
74	NC_010158	AG	3	6	41928	41933	50 %	0 %	50 %	0 %	162417830
75	NC_010158	GC	3	6	42575	42580	0 %	0 %	50 %	50 %	162417929
76	NC_010158	TA	3	6	43682	43687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010158	GA	3	6	44207	44212	50 %	0 %	50 %	0 %	162417841
78	NC_010158	CG	3	6	44254	44259	0 %	0 %	50 %	50 %	162417841
79	NC_010158	TC	3	6	44525	44530	0 %	50 %	0 %	50 %	162417842
80	NC_010158	CT	3	6	45079	45084	0 %	50 %	0 %	50 %	162417900
81	NC_010158	CG	3	6	46014	46019	0 %	0 %	50 %	50 %	162417900
82	NC_010158	CG	3	6	46144	46149	0 %	0 %	50 %	50 %	162417900
83	NC_010158	TA	3	6	46694	46699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010158	TA	4	8	50156	50163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010158	AT	3	6	50184	50189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010158	AC	3	6	50401	50406	50 %	0 %	0 %	50 %	162417941
87	NC_010158	GT	3	6	51044	51049	0 %	50 %	50 %	0 %	162417876
88	NC_010158	CG	3	6	51098	51103	0 %	0 %	50 %	50 %	162417876
89	NC_010158	GT	3	6	51812	51817	0 %	50 %	50 %	0 %	162417876
90	NC_010158	AT	3	6	51921	51926	50 %	50 %	0 %	0 %	162417876
91	NC_010158	CG	3	6	52695	52700	0 %	0 %	50 %	50 %	162417881
92	NC_010158	CG	4	8	52789	52796	0 %	0 %	50 %	50 %	162417881
93	NC_010158	CT	3	6	53503	53508	0 %	50 %	0 %	50 %	162417881
94	NC_010158	AT	3	6	53754	53759	50 %	50 %	0 %	0 %	162417881
95	NC_010158	CT	3	6	55519	55524	0 %	50 %	0 %	50 %	162417932
96	NC_010158	GA	3	6	58447	58452	50 %	0 %	50 %	0 %	162417888
97	NC_010158	TA	3	6	58929	58934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010158	TC	3	6	59498	59503	0 %	50 %	0 %	50 %	162417924
99	NC_010158	GT	3	6	59585	59590	0 %	50 %	50 %	0 %	162417924
100	NC_010158	CT	3	6	59771	59776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_010158	TC	3	6	61845	61850	0 %	50 %	0 %	50 %	162417827
102	NC_010158	CT	3	6	63278	63283	0 %	50 %	0 %	50 %	162417827
103	NC_010158	TC	3	6	63528	63533	0 %	50 %	0 %	50 %	162417827
104	NC_010158	CG	3	6	65276	65281	0 %	0 %	50 %	50 %	162417886
105	NC_010158	GT	3	6	65648	65653	0 %	50 %	50 %	0 %	162417880
106	NC_010158	AC	3	6	66928	66933	50 %	0 %	0 %	50 %	162417931
107	NC_010158	AC	3	6	68421	68426	50 %	0 %	0 %	50 %	162417852
108	NC_010158	CT	3	6	69828	69833	0 %	50 %	0 %	50 %	162417852
109	NC_010158	CG	3	6	70024	70029	0 %	0 %	50 %	50 %	162417852
110	NC_010158	AG	3	6	70212	70217	50 %	0 %	50 %	0 %	162417852
111	NC_010158	CG	3	6	71328	71333	0 %	0 %	50 %	50 %	162417852
112	NC_010158	AT	3	6	72055	72060	50 %	50 %	0 %	0 %	162417852
113	NC_010158	GA	3	6	72066	72071	50 %	0 %	50 %	0 %	162417852
114	NC_010158	TG	3	6	72790	72795	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010158	GC	3	6	73417	73422	0 %	0 %	50 %	50 %	162417871
116	NC_010158	TA	3	6	75056	75061	50 %	50 %	0 %	0 %	162417871
117	NC_010158	GT	3	6	75180	75185	0 %	50 %	50 %	0 %	162417871
118	NC_010158	GT	3	6	75216	75221	0 %	50 %	50 %	0 %	162417871
119	NC_010158	CA	3	6	75556	75561	50 %	0 %	0 %	50 %	162417871
120	NC_010158	CA	3	6	75738	75743	50 %	0 %	0 %	50 %	162417871
121	NC_010158	AT	3	6	75998	76003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010158	AT	3	6	76193	76198	50 %	50 %	0 %	0 %	162417894
123	NC_010158	TC	3	6	76423	76428	0 %	50 %	0 %	50 %	162417894
124	NC_010158	GA	3	6	77688	77693	50 %	0 %	50 %	0 %	162417822
125	NC_010158	CG	3	6	77802	77807	0 %	0 %	50 %	50 %	162417822
126	NC_010158	GA	4	8	78029	78036	50 %	0 %	50 %	0 %	162417822
127	NC_010158	GA	3	6	78588	78593	50 %	0 %	50 %	0 %	162417895
128	NC_010158	GT	4	8	79206	79213	0 %	50 %	50 %	0 %	162417940
129	NC_010158	CA	3	6	79776	79781	50 %	0 %	0 %	50 %	162417940
130	NC_010158	GA	3	6	80243	80248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010158	TA	3	6	80609	80614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010158	CT	3	6	81155	81160	0 %	50 %	0 %	50 %	162417834
133	NC_010158	CA	3	6	81563	81568	50 %	0 %	0 %	50 %	162417834
134	NC_010158	TG	3	6	82038	82043	0 %	50 %	50 %	0 %	162417889
135	NC_010158	CG	3	6	84122	84127	0 %	0 %	50 %	50 %	162417899
136	NC_010158	CT	3	6	84636	84641	0 %	50 %	0 %	50 %	162417899
137	NC_010158	GT	3	6	85411	85416	0 %	50 %	50 %	0 %	162417899
138	NC_010158	AT	3	6	86142	86147	50 %	50 %	0 %	0 %	162417899
139	NC_010158	CT	3	6	86148	86153	0 %	50 %	0 %	50 %	162417899
140	NC_010158	TC	3	6	86316	86321	0 %	50 %	0 %	50 %	162417899
141	NC_010158	AG	3	6	86551	86556	50 %	0 %	50 %	0 %	162417911
142	NC_010158	AC	3	6	87055	87060	50 %	0 %	0 %	50 %	162417848
143	NC_010158	GT	3	6	87403	87408	0 %	50 %	50 %	0 %	162417848
144	NC_010158	GA	3	6	87613	87618	50 %	0 %	50 %	0 %	162417848
145	NC_010158	TA	3	6	87854	87859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010158	AT	3	6	87861	87866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010158	TG	3	6	89883	89888	0 %	50 %	50 %	0 %	162417839
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.